噬菌体随机十二肽库论文-潘超,肖长虹,高燕,赵晓峰,李凯芹

噬菌体随机十二肽库论文-潘超,肖长虹,高燕,赵晓峰,李凯芹

导读:本文包含了噬菌体随机十二肽库论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献,主要关键词:类风湿关节炎,噬菌体随机十二肽库,叁水白虎汤,全细胞差减筛选

噬菌体随机十二肽库论文文献综述

潘超,肖长虹,高燕,赵晓峰,李凯芹[1](2014)在《噬菌体随机十二肽库淘选叁水白虎汤作用于类风湿关节炎滑膜细胞的靶点研究》一文中研究指出目的:利用噬菌体随机十二肽库淘选出与叁水白虎汤(SSBH)作用的类风湿关节炎滑膜成纤维细胞(RASFs)特异性结合的多肽,寻找SSBH治疗类风湿关节炎的蛋白靶点。方法:以SSBH处理过的RASFs为靶细胞,生理盐水(NS)处理的RASFs为吸附细胞,全细胞差减筛选法对噬菌体十二肽库进行3轮淘选,挑取单克隆、扩增纯化噬菌体,并初步鉴定噬菌体克隆的亲和力,阳性克隆测序后进行生物学分析。结果:3轮淘选后,随机挑选32个噬菌体克隆进行DNA序列分析,展示SGVYKVAYDWQH十二肽的噬菌体被富集约为56%(18/32)。结论:从噬菌体肽库筛选到SSBH作用RASFs的特异性结合短肽,并分析出相关作用蛋白。(本文来源于《中国免疫学杂志》期刊2014年04期)

王筱蒙,邱郑,张芳,王旻[2](2014)在《噬菌体展示随机十五肽库的构建》一文中研究指出为了满足药物筛选的需要,本实验以pCANTAB 5E噬菌粒为载体,构建表达于丝状噬菌体尾丝蛋白P3N末端的随机十五肽库。通过自行设计引物与模板,人工合成编码随机十五肽的寡核苷酸片段及含有酶切位点的引物。通过PCR技术进行模板扩增获得编码随机十五肽的基因。将扩增后的目的基因经过SfiΙ,NotΙ两个限制性内切酶双酶切后,与经同样双酶切的5'去磷酸化的噬菌粒载体连接,将重组产物电转入大肠埃希菌TG1感受态细胞。集合菌落后进行库容和多样性检验。所建肽库库容可达5×108。随机挑取20个克隆测序,其核苷酸序列及推断出的氨基酸序列均随机。成功构建了库容量与多样性都满足筛选要求的噬菌体展示随机十五肽库。(本文来源于《中国药科大学学报》期刊2014年02期)

刘振中,姜笃银,蔡景龙,宗宪磊,张基勋[3](2012)在《应用噬菌体随机十二肽库筛选TGF-beta1相关模拟肽》一文中研究指出目的应用噬菌体随机12肽库生物筛选获得TGF-betal噬菌体模拟肽。方法以人TGF-betal单克隆抗体为靶,进行4轮生物淘选,随机挑取单克隆噬菌体,ELISA法检测单克隆噬菌体的结合力。对结合力较好的单克隆噬菌体提取噬菌体DNA,进行测序,并进行行序列分析。结果经过4轮生物淘选,特异性噬菌体模拟肽获得了富集,ELISA检测结果显示获得的一些噬菌体模拟肽具有较好的结合力,测序获得10个与促进成纤维细胞增殖或抑制细胞增殖有关的碱基序列。结论从噬菌体随机十二肽库中可淘选到与TGF-betal相关的噬菌体模拟肽,可能用于防治瘢痕疙瘩。(本文来源于《2012昆山国际外科感染伤口防治研讨会论文汇编》期刊2012-06-16)

刘振中,姜笃银,蔡景龙,宗宪磊,张基勋[4](2011)在《应用噬菌体随机十二肽库筛选TGF-beta1相关模拟肽》一文中研究指出目的应用噬菌体随机12肽库生物筛选获得TGF-beta1噬菌体模拟肽。方法以人TGF-beta1单克隆抗体为靶,进行4轮生物淘选,随机挑取单克隆噬菌体,ELISA法检测单克隆噬菌体的结合力。对结合力较好的单克隆噬菌体提取噬菌体DNA,进行测序,并进行行序列分析。结果经过4轮生物淘选,特异性噬菌体模拟肽获得了富集,ELISA检测结果显示获得的一些噬菌体模拟肽具有较好的结合力,测序获得10个与促进成纤维细胞增殖或抑制细胞增殖有关的碱基序列。结论从噬菌体随机十二肽库中可淘选到与TGF-beta1相关的噬菌体模拟肽,可能用于防治瘢痕疙瘩。(本文来源于《急慢性创面治疗新技术专题系列研讨会之感染创面综合治疗论坛论文汇编》期刊2011-10-21)

刘振中,姜笃银,蔡景龙,宗宪磊,张基勋[5](2011)在《应用噬菌体随机十二肽库筛选TGF-β1相关模拟肽的实验研究》一文中研究指出目的应用噬菌体随机12肽库生物筛选获得转化生长因子-β1(TGF-β1)噬菌体模拟肽。方法以人TGF-β1单克隆抗体为靶,进行4轮生物淘选,随机挑取单克隆噬菌体,ELISA法检测单克隆噬菌体的结合力。对结合力较好的单克隆噬菌体提取噬菌体DNA,进行测序,行序列分析。结果经过4轮生物淘选,特异性噬菌体模拟肽获得了富集,ELISA检测结果显示,获得的一些噬菌体模拟肽具有较好的结合力,测序获得10个与促进成纤维细胞增殖或抑制细胞增殖有关的碱基序列。结论从噬菌体随机十二肽库中可淘选到与TGF-β1相关的噬菌体模拟肽。(本文来源于《山东大学学报(医学版)》期刊2011年08期)

李许锋,罗敏,邹建军,岑东芝,何克菲[6](2011)在《随机十二肽噬菌体展示文库筛选血型B抗原模拟多肽的实验研究》一文中研究指出目的:筛选出替代血型B抗原的模拟多肽,用多肽抗原替代糖类抗原。方法:抗血型B抗原的单克隆抗体作为固相筛选靶分子,对随机十二肽噬菌体展示文库进行生物淘选(bio-panning),经包被-结合-洗脱-扩增等循环3轮,对筛选的克隆ELISA鉴定,并通过剂量依赖实验验证其结合特异性。最后提取DNA测序,确定模拟肽氨基酸序列。结果:3轮筛选结束,得到2个亲和力较强的十二肽序列TKNMLSL-PVGPG和HSLKHTQMSYSS。结论:经过生物筛选得到模拟多肽序列,利用噬菌体展示技术筛选糖类抗原的模拟肽具有可行性,为糖类抗原的研究提供一种新思路。(本文来源于《中华肿瘤防治杂志》期刊2011年02期)

余明军,孙学军,禄韶英,张文杰[7](2010)在《噬菌体随机十二肽库淘选及鉴定胃癌特异性结合肽》一文中研究指出目的利用噬菌体展示随机十二肽库淘选出与胃癌BGC823细胞特异性结合的多肽,为寻找胃癌早期诊断和治疗的标志物打下基础。方法以胃癌细胞BGC823为靶细胞,胃黏膜永生化上皮细胞GES为吸附细胞,在常温下对噬菌体随机十二肽库进行叁轮消减淘选,挑取单克隆、扩增纯化噬菌体,并经ELISA和免疫组化法初步鉴定噬菌体克隆亲和力;测序阳性克隆,合成荧光素FITC标记多肽,鉴定其与胃癌细胞和胃癌组织的亲和力及特异性。结果叁轮淘选后,经ELISA法初步鉴定,随机挑选的20个单克隆中11号(GC-11)多肽对BGC823细胞亲和力最高。细胞、组织免疫荧光实验进一步证明,荧光素标记的多肽FITC-GC-11对BGC823细胞和胃癌组织具有高亲和力。结论利用噬菌体随机十二肽库成功淘选出与胃癌细胞BGC823和胃癌组织具有较高亲和力的多肽GC-11。(本文来源于《中国普外基础与临床杂志》期刊2010年10期)

宗宪磊,蔡景龙,姜笃银,付小兵,盛志勇[8](2009)在《应用噬菌体随机十二肽库筛选hFGF-7相关模拟肽》一文中研究指出目的应用噬菌体随机十二肽库生物淘选具有刺激表皮细胞增殖作用的人成纤维细胞生长因子-7(hFGF-7)噬菌体模拟肽。方法以hFGF-7单克隆抗体为靶,进行4轮生物淘选噬菌体随机十二肽库;随机挑取单克隆噬菌体,应用ELISA方法检测单克隆噬菌体的结合力,对结合力较好的单克隆噬菌体提取噬菌体DNA,进行测序,并行序列分析。结果经过4轮生物淘选,特异性噬菌体模拟肽获得了富集,ELISA检测结果显示获得的一些噬菌体模拟肽具有较好的结合力,测序获得11个与促进细胞分裂、增殖或抑制细胞增殖有关的碱基序列。结论从噬菌体随机十二肽库中可淘选到与hFGF-7相关的噬菌体模拟肽,其中部分噬菌体模拟肽可能会促进表皮细胞增殖,期望将来可应用于促进创面愈合。(本文来源于《山东大学学报(医学版)》期刊2009年11期)

魏骏飞,顾园,赵夕,诸欣平[9](2009)在《利用噬菌体随机十二肽库筛选旋毛虫副肌球蛋白抗原表位》一文中研究指出副肌球蛋白(Pmy)是多种无脊椎动物主要的结构蛋白,在抗寄生虫感染的保护性免疫方面发挥重要的作用。本实验室已通过免疫筛选旋毛虫成虫cDNA文库,获得副肌球蛋白基因(Gen Bank登录号:EF429310),并证实原核表达的重组蛋白具有较好的免疫学活性及免疫保护性。目前,研制有效的抗旋毛虫病疫苗是预防该病的重要措施。表位疫苗是疫苗研制的发展方向,它安全、无毒、引发的免疫应答针对性增强、并摆(本文来源于《中国动物学会寄生虫学专业委员会第十二次全国学术会议暨第叁次国际寄生虫学学术研讨会论文摘要集》期刊2009-10-23)

杨海捷[10](2007)在《从噬菌体展示随机七、十二肽库筛选内毒素结合肽及其生物学活性研究》一文中研究指出研究背景和目的:脓毒血症是临床ICU病人死亡的重要原因。据统计,在美国每年有650–750,000住院病人发展为脓毒血症,在欧洲有同样的发生率,发展中国家发生率更高。尽管医疗水平和措施不断加强,但这并没有降低脓毒血症的发病率和死亡率。脓毒血症的发病机制是侵入体内的致病微生物释放的活性成分内毒素(即LPS,lipopolysaccharide)激活单核巨噬细胞和血管内皮细胞,启动了宿主体内失控性炎症反应。如果失控的炎症因子水平持续升高,患者会经历全身炎症反应综合征、中毒性休克、多器官功能衰竭甚至死亡。LPS(lipopolysaccharide)是引起脓毒症休克的主要致病因子。LPS可通过间接或直接两条途径激活组织细胞炎症。目前针对脓毒血症防治措施主要包括:拮抗炎症介质的生物学活性,抑制炎症介质的表达,阻断炎症反应的启动等方面。在过去的十几年中,人们尝试了多种拮抗措施控制炎症反应,包括单克隆抗体等方法,如抑制炎症介质的活性如白介素-6、肿瘤坏死因子α等,或者阻断信号通路后来减轻炎症反应,但效果甚微。近年来,人们逐渐认识到如何在早期就对炎症反应的启动实施有效的阻抑,才是控制炎症反应的最合理的途径。因此探索LPS激活失控性炎症反应中所参与的全面的分子机理,寻找中和或拮抗LPS制剂并把失控性炎症反应控制在早期环节是目前活跃的方向。其中结合噬菌体展示肽库筛选和改造肽制剂来拮抗LPS具有诱人的前景。噬菌体展示肽库技术是利用生物分子间的相互作用来筛选功能分子,它在研究蛋白质间相互作用、寻找酶和受体的激动剂和拮抗剂、研制新型诊断试剂和疫苗以及在抗肿瘤药物研究中都有重要价值。噬菌体展示肽库技术具有高库容、高效方便及灵活的筛选技术等特点,使其在许多方面占有重要地位。随着筛选靶标范围的扩展及相应的更加完善的筛选方法的建立,噬菌体展示肽库技术将会有更广泛的应用,在功能基因组学、基因疫苗研究、药物设计、寻找新配体及肿瘤导向治疗方面日益显示出强大的优势。在DNA改组、定向进化领域它也是非常有用的工具。本课题采用噬菌体展示技术,筛选与LPS结合的多肽,结合生物信息学推测与LPS相互作用分子位点,从蛋白结构数据库和文献数据库验证,体外活性实验证实。为内毒素血症的防治探索新的技术途径。主要技术方法:制备兔抗LPS多克隆抗体供筛选过程检测用。筛选实验采用经典的亲和富集法,以LPS为靶分子,对噬菌体随机七、十二肽库进行4轮亲和筛选,获得与LPS结合的噬菌体克隆。应用结合实验和克隆斑抑制实验进一步确证。挑选出结合力强的克隆,将获得的噬菌体克隆进行DNA测序,根据噬菌体克隆基因中所插入的外源DNA序列推导出呈现的外源多肽氨基酸序列。应用DNASTAR软件及其它生物信息网络软件如BLAST软件将多肽序列比较分析,进行蛋白结构数据库和文献数据库检索。对获得的多肽采用FMOC固相合成法化学合成。通过ELISA法与PMB B (polymyxin B,)对比进行了相对亲和力测试实验。体外试验:以人单核巨噬细胞株U937细胞为模型。首先通过生长曲线法和流式细胞实验观察合成肽对细胞生长影响。活性实验中根据实验设计方案,U937细胞被分为对照组、LPS组,及P11组干预组(分为小、中、大剂量组)。进行了流式细胞检测分析(FACS)异硫氰酸荧光素标记的LPS(FITC-LPS)与U937细胞的结合。RT-PCR和检测U937细胞肿瘤坏死因子α(TNF-α)mRNA转录情况,ELISA检测细胞培养上清液测定肿瘤坏死因子α的含量。结果:1.制备了兔抗LPS多克隆抗体,以供筛选过程检测用,为内毒素结合肽噬菌体克隆的筛选奠定了基础。2.采用亲和筛选方法,以LPS为靶分子,经过4轮筛选,从噬菌体随机7、12肽库中获得了可与LPS结合的噬菌体克隆。3.从获得LPS结合克隆中挑取160个噬菌体克隆,进行结合实验。根据结合实验结果挑选19(七肽库选了12个,十二肽库选了7个)个结合力最强的克隆进行DNA序列测序及生物信息学分析。十二肽库筛选到的共有核心序列为CGGAGGCGGACTCTTATGAATCCACT ,七肽库筛选到的共有核心序列为CGGAGGCGGATTCTCATGAAA,根据上述19个噬菌体克隆基因中插入的外源DNA序列推导出呈现的多肽序列,这19个噬菌体克隆融合多肽的核心序列为HWQWPHWSPPP,命名为P11肽。用筛选的肽的全氨基酸序列检索专利数据库,未发现申请保护这段氨基酸序列的专利。经BLAST检索发现有908个蛋白质与筛选的多肽有匹配位点。这些蛋白按照功能可分为七组:炎症反应形成相关,促凝血相关,细胞凋亡相关,细胞骨架重构相关,细胞能量代谢障碍相关,胞内信号转导有关,及功能未明蛋白207条。有些结果验证了一些与LPS相互作用的蛋白,如清道夫受体、巨噬细胞甘露糖受体、热休克蛋白60、白介素27受体等,也检索到一些以前不知道与LPS相互作用的蛋白分子,如层粘蛋白受体和锌指蛋白等。4.采用FMOC固相合成法成功合成了LPS结合肽HWQWPHWSPPP-NH2,并在其C端加NH2修饰以增强其稳定性。多肽纯度超过99%,得到的多肽纯品进行质谱分析测定分子量为1453.8,与理论值1453.6相符,说明合成的多肽结构正确,纯度合乎测试要求,可用于生物学活性的检测与评价。5.亲和ELISA检测结果显示P11与LPS有亲和力,在相同的质量浓度下,P11与LPS的亲合力比PMB低。6 .通过生长曲线和流式细胞学分析检测结果,P11肽对U937细胞生长无显着影响。利用新鲜人外周血分离单核细胞、U937细胞,通过流式细胞仪观察到P11具有阻止FITC-LPS体外结合作用。7.细胞因子生成抑制实验发现,高浓度P11(10μg/ml)可显着抑制LPS诱导U937细胞TNFαmRNA转录和蛋白的表达。结论:1.本研究成功的从噬菌体随机7、12肽库中筛选获得了可与LPS结合的噬菌体克隆。2.筛选获得与LPS结合的噬菌体克隆展示肽的核心序列为HWQWPHWSPPP。检索可发现与体内相关蛋白质同源匹配位点。3.应用FMOC固相法成功合成11肽HWQWPHWSPPP-NH2,命名为P11,结果证明P11对U937细胞生长无显着影响,具有抑制LPS诱导U937分泌TNFα的活性。上述研究结果说明从肽库中筛选内毒素结合肽是可行的。以这些多肽为先导物设计开发或者进一步开展定向进化研究来开发靶向LPS的抗炎多肽是可能的。这为探索内毒素血症的防治提供了新的途径。(本文来源于《第叁军医大学》期刊2007-11-01)

噬菌体随机十二肽库论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

为了满足药物筛选的需要,本实验以pCANTAB 5E噬菌粒为载体,构建表达于丝状噬菌体尾丝蛋白P3N末端的随机十五肽库。通过自行设计引物与模板,人工合成编码随机十五肽的寡核苷酸片段及含有酶切位点的引物。通过PCR技术进行模板扩增获得编码随机十五肽的基因。将扩增后的目的基因经过SfiΙ,NotΙ两个限制性内切酶双酶切后,与经同样双酶切的5'去磷酸化的噬菌粒载体连接,将重组产物电转入大肠埃希菌TG1感受态细胞。集合菌落后进行库容和多样性检验。所建肽库库容可达5×108。随机挑取20个克隆测序,其核苷酸序列及推断出的氨基酸序列均随机。成功构建了库容量与多样性都满足筛选要求的噬菌体展示随机十五肽库。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

噬菌体随机十二肽库论文参考文献

[1].潘超,肖长虹,高燕,赵晓峰,李凯芹.噬菌体随机十二肽库淘选叁水白虎汤作用于类风湿关节炎滑膜细胞的靶点研究[J].中国免疫学杂志.2014

[2].王筱蒙,邱郑,张芳,王旻.噬菌体展示随机十五肽库的构建[J].中国药科大学学报.2014

[3].刘振中,姜笃银,蔡景龙,宗宪磊,张基勋.应用噬菌体随机十二肽库筛选TGF-beta1相关模拟肽[C].2012昆山国际外科感染伤口防治研讨会论文汇编.2012

[4].刘振中,姜笃银,蔡景龙,宗宪磊,张基勋.应用噬菌体随机十二肽库筛选TGF-beta1相关模拟肽[C].急慢性创面治疗新技术专题系列研讨会之感染创面综合治疗论坛论文汇编.2011

[5].刘振中,姜笃银,蔡景龙,宗宪磊,张基勋.应用噬菌体随机十二肽库筛选TGF-β1相关模拟肽的实验研究[J].山东大学学报(医学版).2011

[6].李许锋,罗敏,邹建军,岑东芝,何克菲.随机十二肽噬菌体展示文库筛选血型B抗原模拟多肽的实验研究[J].中华肿瘤防治杂志.2011

[7].余明军,孙学军,禄韶英,张文杰.噬菌体随机十二肽库淘选及鉴定胃癌特异性结合肽[J].中国普外基础与临床杂志.2010

[8].宗宪磊,蔡景龙,姜笃银,付小兵,盛志勇.应用噬菌体随机十二肽库筛选hFGF-7相关模拟肽[J].山东大学学报(医学版).2009

[9].魏骏飞,顾园,赵夕,诸欣平.利用噬菌体随机十二肽库筛选旋毛虫副肌球蛋白抗原表位[C].中国动物学会寄生虫学专业委员会第十二次全国学术会议暨第叁次国际寄生虫学学术研讨会论文摘要集.2009

[10].杨海捷.从噬菌体展示随机七、十二肽库筛选内毒素结合肽及其生物学活性研究[D].第叁军医大学.2007

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