导读:本文包含了家族转录因子及其靶基因论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献，主要关键词:光皮桦,miR166,Bl,HDZⅢ,表达分析
家族转录因子及其靶基因论文文献综述
刘文哲[1]（2016）在《光皮桦miR166及其靶基因HD-ZIP Ⅲ转录因子家族成员鉴定与分析》一文中研究指出光皮桦(Betula luminifera)是主要分布在我国南方的珍贵用材树种,材性优良,是林木遗传育种研究的良好材料。miR166在植物顶端分生组织发育、维管组织的形成、胚的发育中具有重要作用,其对靶基因HD-ZIP Ⅲ转录因子的调控是维管组织发育的重要途径。鉴定miR166及HD-ZIP Ⅲ转录因子基因家族成员,并研究其功能,可为光皮桦木材形成机制和遗传改良提供重要的理论基础。本研究以光皮桦为材料,对miR166及其靶基因HD-ZIP Ⅲ的家族成员进行了鉴定,并通过表达及转基因分析对其功能进行了研究,获得以下主要结果。1.根据光皮桦转录组及部分基因组数据,鉴定并克隆得到8个miR166前体序列,命名为BlmiR166a~BlmiR166g,序列长为0.3Kb~2.4Kb。对8个miR166和靶基因Bl HDZ Ⅲ进行了基因结构、顺式作用元件与系统进化等生物信息学分析,结果显示BlmiR166b、BlmiR166c与BlmiR166e含有1个内含子,其它miR166在基因组上则不含内含子。5个靶基因除了Bl HDZ1有19个外显子,其他Bl HD-ZIP Ⅲ基因都由18个外显子组成。对所有基因的顺式元件统计显示,光启动元件出现次数最多。系统进化分析表明,光皮桦8个miR166成熟体全部在同一个分支,而在前体序列比对中,8个pre-miR166分布在3个不同的亚组。2.组织表达特性分析表明,在所有miR166中,只有BlmiR166a和BlmiR166h在韧皮部表达量高,可能与其含有维管束发育相关元件有关;而BlmiR166d、BlmiR166e的表达十分相似,都是在芽中有高丰度的转录水平;BlmiR166b、BlmiR166c和BlmiR166f的表达较为相似,在雄花中表达量高;BlmiR166g则是在芽、雌花、雄花等组织都有表达。我们发现所有Bl HD-ZIP Ⅲ基因在韧皮部、种子和根中表达量都很低。Bl HDZ2和Bl HDZ5的表达情况相似,在木质部中的表达量远高于其他组织,暗示其参与了木质部的发育。Bl HDZ3和Bl HDZ4在茎中的表达丰度很高,且成熟茎段的明显高于幼嫩茎段。Bl HDZ1则在顶端分生组织中表达丰度高,表明其参与到了分生组织的发育中。此外,发现部分miR166与HD-ZIP Ⅲ间的表达呈现负调控。如BlmiR166a和BlmiR166h在木质部中几乎不表达而在韧皮部中表达量高,而靶基因Bl HDZ2和Bl HDZ5的表达正好相反。这表明这些基因在木质部与韧皮部的生长发育中存在负调控关系。3.Bl HD-ZIP Ⅲ基因在不同激素处理下的表达情况进行研究发现,5个Bl HD-ZIP Ⅲ基因在0.1m M浓度的IAA处理下都明显的受到诱导调控,其表达量与对照相比显着上调。这暗示Bl HDZⅢ基因与激素IAA参与了调控木质部的发育。Bl HDZ1、Bl HDZ3和Bl HDZ4分别在IAA、ET和GA的诱导下上调明显,可能与所含激素类相关顺式元件有关。Bl HDZ2和Bl HDZ5只有在0.1m M IAA处理下表达量有所增加,而在其他激素处理下变化不大。4.构建了5个Bl HDZⅢ基因的超表达载体并利用农杆菌介导法转化拟南芥,在分子水平进行了目的基因和报告基因的PCR检测,成功将Bl HDZ1、Bl HDZ2、Bl HDZ4和Bl HDZ5转到拟南芥中,其中Bl HDZ1和Bl HDZ5得到T2代各8个株系,Bl HDZ2和Bl HDZ4得到T2代各2个株系。发现与拟南芥野生型相比,Bl HDZ4和Bl HDZ5在表型性状上有一定的差异,这些基因的具体功能还有待于后续的深入研究。(本文来源于《浙江农林大学》期刊2016-05-28）
崔琰[2]（2009）在《小麦成熟胚脱分化过程中WRKY、bZIP家族转录因子及其靶基因的表达谱分析》一文中研究指出转录因子对基因的表达调控起着重要的作用。愈伤组织的再生能力取决于脱分化的过程。为研究小麦成熟胚脱分化的分子机理,本研究以豫麦18为材料,利用Affymetrix wheat GeneChip?基因芯片技术在转录水平上研究了转录因子及其靶基因在小麦成熟胚脱分化中的表达变化。2,4-D处理离体小麦成熟胚0、2、6、12、24和72h后提取RNA,做芯片杂交。以0 h的基因表达信号值为对照,检测脱分化过程中基因的差异表达。结果表明,在含有61127个探针组,代表了55085个基因的小麦基因组表达谱上,发生有意义表达变化的基因共约有15000个。在这些有意义变化的基因中着重对有意义变化的转录因子及其靶基因作了深入分析。共检测到42类转录因子家族,初步确认有425个相关基因在脱分化过程中发挥作用。对这42类转录因子家族中的2类转录因子家族及其靶基因又做了进一步的分析。结果如下:(1) WRKY家族转录因子及其靶基因本文研究了7个WRKY家族转录因子及它们调控的28个下游基因。根据它们在芯片上的总体表达情况可知,WRKY27在脱分化过程中表达变化可能影响其下游基因DFL-1的表达从而影响脱分化过程前期的激素信号转导;WRKY33基因及其下游基因可能在脱分化初期的信号传导中有重要作用;WRKY2、WRKY3和WRKY18及其共同的下游PR1基因的表达情况表明水杨酸代谢可能参与了小麦成熟胚脱分化过程。(2) bZIP家族转录因子及其靶基因bZIP蛋白与种子贮藏基因表达、光形态发生及器官建成的控制相关,植物bZIP蛋白还参与了植物对脱落酸、光、厌氧生活及发育信号的反应。本文研究了7个bZIP家族转录因子及它们调控的32个靶基因。在这些数据中,我们发现这一家族的7个转录因子大都表现为下调趋势。在bZIP靶基因中,有6个基因表达上调(2～10倍),11个基因表达下调(1～20),3个基因在不同时点中有上调的下调,12个基因在成熟胚脱分化过程中表达差异不明显。bZIP家族转录因子基因下调表达趋势,表明其控制的靶蛋白在脱分化过程中可能起负调控作用。为了验证基因芯片结果的可靠性,对基因WRKY2、CA744619、BJ290016和BQ170258做了半定量RT-PCR分析,结果表明:它们的表达变化与基因芯片结果基本一致。(本文来源于《河南农业大学》期刊2009-06-01）
耿华春[3]（2008）在《小麦成熟胚脱分化过程中转录因子家族及其靶基因的表达谱分析》一文中研究指出为研究小麦成熟胚脱分化的分子机理,本研究以豫麦18为材料,利用Affymetrix wheat GeneChip?基因芯片技术在转录水平上研究了转录因子及其靶基因在小麦成熟胚脱分化中的表达变化。以小麦成熟胚脱分化起始0点为对照,研究了在2,4-D分别诱导0、2、6、12、24和72h时这些基因的表达变化,将那些与0点比值大于2或小于0.5,即表达变化两倍以上的基因视为有意义的差异表达基因。结果表明,在含有61127个探针组,代表了55085个基因的小麦基因组表达谱上,发生有意义表达变化的基因共约有15000个。在这些有意义变化的基因中着重对有意义变化的转录因子及其靶基因作了深入分析。共检测到42类转录因子家族,初步确认有425个相关基因在脱分化过程中发挥作用,其中上调表达的转录因子有139个;下调表达的转录因子有232个;上下调表达的转录因子有54个。对这42类转录因子家族中的3类转录因子家族及其靶基因又做了进一步的分析。结果如下:(1) MYB家族转录因子及其靶基因本文研究了12个MYB家族转录因子及它们调控的27个下游基因。根据它们在芯片上的总体表达情况可知,MYBST1负调控Lhcb5,在小麦成熟胚脱分化信号响应期起作用;MYB4-like通过负调控4cl1和C4h在小麦成熟胚脱分化信号传导期起主要作用;MYB2通过负调控Adh1和Rd22在小麦成熟胚脱分化信号响应期和愈伤组织形成期发挥作用。(2) AP2_EREBP家族转录因子及其靶基因AP2亚族中的BBM和ANT基因可以维持细胞分生能力并调节细胞增殖、器官生长和愈伤组织形成。在小麦基因芯片上没有找到直接描述为这两个基因的相关基因,但描述为AP2亚族转录因子的基因有10个。根据小麦成熟胚脱分化时期划分的生理生化特点可知,24h之后为愈伤组织形成主要时期。在芯片上从24h开始大量表达上调的基因有3个,它们分别是gb:BJ277744、gb:CA651253和gb:CK200155。根据它们的表达情况可知,gb:CK200155基因有可能是BBM和ANT基因的同源基因,其在小麦成熟胚脱分化的愈伤组织形成期上调表达幅度达对照的79倍,其在愈伤组织形成期的作用有待进一步利用基因敲除或RNA干扰等方法做功能验证。(3) MADS家族转录因子及其靶基因本文研究了小麦脱分化中的32个MADS家族转录因子及其2个靶基因。根据它们在小麦基因芯片中的表达情况可知,它们主要在脱分化信号传导期和愈伤组织形成期起一定的作用。有关它们详细的功能还有待进一步的研究。(本文来源于《河南农业大学》期刊2008-06-01）
家族转录因子及其靶基因论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
转录因子对基因的表达调控起着重要的作用。愈伤组织的再生能力取决于脱分化的过程。为研究小麦成熟胚脱分化的分子机理,本研究以豫麦18为材料,利用Affymetrix wheat GeneChip?基因芯片技术在转录水平上研究了转录因子及其靶基因在小麦成熟胚脱分化中的表达变化。2,4-D处理离体小麦成熟胚0、2、6、12、24和72h后提取RNA,做芯片杂交。以0 h的基因表达信号值为对照,检测脱分化过程中基因的差异表达。结果表明,在含有61127个探针组,代表了55085个基因的小麦基因组表达谱上,发生有意义表达变化的基因共约有15000个。在这些有意义变化的基因中着重对有意义变化的转录因子及其靶基因作了深入分析。共检测到42类转录因子家族,初步确认有425个相关基因在脱分化过程中发挥作用。对这42类转录因子家族中的2类转录因子家族及其靶基因又做了进一步的分析。结果如下:(1) WRKY家族转录因子及其靶基因本文研究了7个WRKY家族转录因子及它们调控的28个下游基因。根据它们在芯片上的总体表达情况可知,WRKY27在脱分化过程中表达变化可能影响其下游基因DFL-1的表达从而影响脱分化过程前期的激素信号转导;WRKY33基因及其下游基因可能在脱分化初期的信号传导中有重要作用;WRKY2、WRKY3和WRKY18及其共同的下游PR1基因的表达情况表明水杨酸代谢可能参与了小麦成熟胚脱分化过程。(2) bZIP家族转录因子及其靶基因bZIP蛋白与种子贮藏基因表达、光形态发生及器官建成的控制相关,植物bZIP蛋白还参与了植物对脱落酸、光、厌氧生活及发育信号的反应。本文研究了7个bZIP家族转录因子及它们调控的32个靶基因。在这些数据中,我们发现这一家族的7个转录因子大都表现为下调趋势。在bZIP靶基因中,有6个基因表达上调(2～10倍),11个基因表达下调(1～20),3个基因在不同时点中有上调的下调,12个基因在成熟胚脱分化过程中表达差异不明显。bZIP家族转录因子基因下调表达趋势,表明其控制的靶蛋白在脱分化过程中可能起负调控作用。为了验证基因芯片结果的可靠性,对基因WRKY2、CA744619、BJ290016和BQ170258做了半定量RT-PCR分析,结果表明:它们的表达变化与基因芯片结果基本一致。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
家族转录因子及其靶基因论文参考文献
[1].刘文哲.光皮桦miR166及其靶基因HD-ZIPⅢ转录因子家族成员鉴定与分析[D].浙江农林大学.2016
[2].崔琰.小麦成熟胚脱分化过程中WRKY、bZIP家族转录因子及其靶基因的表达谱分析[D].河南农业大学.2009
[3].耿华春.小麦成熟胚脱分化过程中转录因子家族及其靶基因的表达谱分析[D].河南农业大学.2008