糖基多样性论文-袁帅

糖基多样性论文-袁帅

导读:本文包含了糖基多样性论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献,主要关键词:糖基转移酶,糖苷酶,糖基化,虎眼万年青

糖基多样性论文文献综述

袁帅[1](2018)在《虎眼万年青属糖基转移酶的挖掘及其在糖苷多样性中的应用》一文中研究指出天然产物的糖基化修饰在动物、植物及微生物中广泛存在。经糖基化修饰后的小分子化合物往往具有较好的药理活性、较高的生物利用度及较小的毒副作用。在生物体中,糖基化过程由具有不同功能的糖基转移酶来完成。通过深入研究各种糖基转移酶的功能及性质,突出其优点从而实现以合成生物学技术制备天然糖苷产物。本文围绕从虎眼万年青属(Ornithogalum)植物中克隆得到的糖基转移酶基因OcUGT1和OsUGT1展开探索,对其进行功能鉴定、酶学特征分析等研究。我们发现OcUGT1不仅可以利用UDP-糖实现经典的糖基化反应,同时还能在不添加UDP或UDP-糖的条件下利用廉价糖苷发生转糖反应实现糖基化。此外,OcUGT1还可以催化叁种可逆反应,即UDP-糖合成反应、糖基或符元交换反应和水解反应。OsUGT1作为橙酮糖基转移酶,可以特异性地催化硫磺菊素发生糖基化反应,且同样具有转糖及水解活性。该结果的发现表明OcUGT1和OsUGT1兼具糖基转移酶及糖苷酶双重活性,拓宽了糖基转移酶的应用前景,且其多种活性的验证为后续利用合成生物学技术实现小分子糖苷的规模化制备打下坚实的基础。1.虎眼万年青Ornithogalum caudatum中多功能黄酮糖基转移酶OcUGT1的分离及功能鉴定糖基转移酶作为一种双向生物催化剂可以催化多种小分子化合物的糖基化反应。然而在糖苷合成的过程中,糖基转移酶的应用往往受限于其需要昂贵的NDP-糖或NDP作为底物参与反应。在此,为了鉴定参与天然产物糖基化过程的糖基转移酶,我们从虎眼万年青中得到了黄酮糖基转移酶OcUGT1,它可以在不需要额外添加NDP-糖或NDP的情况下,利用糖苷实现转糖反应。此外,OcUGT1还展现出了额外五种功能,包括经典的糖基化反应和叁种可逆反应,即NDP-糖合成反应、糖交换和苷元交换反应,以及水解反应。以上结果表明OcUGT1兼具糖基转移酶和糖苷酶活性。2.通过OcUGT1催化糖基化和转糖反应生物合成7,8-二羟基黄酮糖苷OcUGT1可以通过糖基化和转糖反应催化7,8-二羟基黄酮的C-8位发生糖基化。OcUGT1催化7,8-二羟基黄酮糖基化反应形成两个单糖苷,7,8-二羟基黄酮-7-O-β-D-葡萄糖苷和7,8-二羟基黄酮-8-O-β-D-葡萄糖苷以及一个二糖苷7,8-二羟基黄酮-7,8-O-β-D-二葡萄糖苷。通过分子间转糖反应,同样可以催化形成两个单糖苷。3.OcUGT1催化睾酮与备选供体底物间的糖基化反应睾酮-17-O-β-D-葡萄糖苷是睾酮-17-O-β-D-葡萄糖-3'-乙酰这个具有抗肿瘤活性化合物的前体物质。我们已利用糖基转移酶催化睾酮和UDP-葡萄糖发生反应,通过生物合成方式获得睾酮糖苷。然而在此过程中对于昂贵的UDP-葡萄糖较低的利用度往往限制了乙酰化睾酮糖苷成药性的研究。因此,发现可替换的廉价糖基供体之于睾酮糖苷生物合成过程的研究是极为迫切的。虎眼万年青来源的黄酮糖基转移酶OcUGT1作为一种生物催化剂,可以催化睾酮与多种糖基供体间发生反应。实验结果表明,OcUGT1可以催化睾酮与UDP-葡萄糖经糖基化反应形成睾酮-17-O-β-D-葡萄糖苷和一个二糖苷。同时,睾酮与邻硝基苯基-β-D-吡喃葡萄糖苷及对硝基苯基-β-D-吡喃葡萄糖苷通过转糖反应,也可得到相应糖苷产物。4.桑多斯虎眼万年青Ornithogalum saundersiae中橙酮糖基转移酶的发掘及功能鉴定橙酮糖苷具有多种生物活性。然而关于糖基转移酶催化橙酮糖基化反应的报道却很有限。我们从桑多斯虎眼万年青中分离得到的OsUGT1,通过保守结构域分析表明OsUGT1属于黄酮糖基转移酶的进化分支,但却并未与已知的黄酮糖基转移酶成簇,这也暗示着其作为一个新的分支催化橙酮类化合物发生糖基化反应。体外酶催化反应结果表明OsUGT1可以催化硫磺菊素形成相应单糖苷,同时其还可以催化黄酮类化合物的糖基化反应。此外,OsUGT1还具有糖苷酶活性,具有分子间转糖和水解功能。(本文来源于《北京协和医学院》期刊2018-05-01)

方阳,牛毓龙,刘程程,林江依,李旭锋[2](2017)在《通过进化模块审视拟南芥尿苷二磷酸葡糖基转移酶功能多样性》一文中研究指出属于糖基转移酶(GTs)家族1的尿苷二磷酸(UDP)-糖基转移酶(UGT)在转移拟南芥中的糖基的转移和糖基化次级代谢物中起重要作用.重建的系统发育树对这个多基因家族的进化关系和功能提供了新的见解和研究.通过综合分析系统发育谱和重建的系统发育树,我们系统地分析了112个拟南芥UGTs.在我们的工作中,我们检测到五个不同的进化保守模块,大多数UGTs分为同一模块,表明拟南芥UGTs在进化过程中是相当保守的.接下来收集拟南芥UGT的底物,并将它们映射到直向同源组,揭示UGT在结合特异性底物中的进化关系.通过扫描271不同物种,还预测一些未报告的蛋白质与拟南芥UGTs密切相关.(本文来源于《四川大学学报(自然科学版)》期刊2017年06期)

刘凡[3](2017)在《多样性导向糖基转移酶的结构生物学研究》一文中研究指出目的将N-端含有His-tag标签的具底物杂泛性的芒果C-糖基转移酶Mi CGTb通过Ni-柱进行初步纯化,然后再通过多级HPLC分离得到高纯度蛋白。通过对不同序列长度的蛋白的结晶条件(包括温度、缓冲液、p H、蛋白浓度、沉淀剂等)的筛选,最终确定适合进行结构研究的蛋白序列长度,得到没有底物(受体或供体)结合的糖基转移酶的晶体结构,并初步确定其催化活性中心。方法1将来源为芒果的已知序列的C-糖基转移酶MiCGTb基因通过设计引物克隆扩增连接到p ET28载体上,其C-糖基转移酶Mi CGTb的N-端含有His-tag标签和TEV酶切位点,构建的p ET28-Mi CGTb载体在RIPL宿主中表达,IPTG的终浓度为0.2m M,30℃诱导表达,经Ni-柱进行初步纯化,通过阴离子交换柱再次纯化,最终分离得到高纯度的目的蛋白2将来源为芒果的已知序列的C-糖基转移酶Mi CGTb基因通过蛋白混乱度系统分析,分别将其N-端和C-端的7个和5个氨基酸截去,之后通过设计引物克隆扩增连接到p ET28载体上,截短后的C-糖基转移酶Mi CGTb(JMi CGTb)的N-端含有His-tag标签和TEV酶切位点,构建的p ET28-JMi CGTb载体在RIPL宿主中表达,IPTG的终浓度为0.2m M,30℃诱导表达,经Ni-柱进行初步纯化,通过阴离子交换柱再次纯化,最终分离得到高纯度的目的蛋白3构建的p ET28-JMi CGTb载体在B834表达宿主中表达,获得含有稀有元素硒的蛋白,用于异常散射实验获得实验数据4使用初筛结晶试剂盒筛选蛋白结晶的条件,初筛试剂盒为HamptonⅠ、HamptonⅡ、CRYO1和CRYO 2两个产品的试剂盒,互相弥补彼此之间缺失的结晶条件。初筛和复筛均是采用的16孔悬滴法,经过大量的初筛、复筛以及条件优化最终得到了相对较好的JMi CGTb晶体。结果1优化MiCGTb C-糖基转移酶的表达菌株,采用不同的表达宿主,得到高表达Mi CGTb的菌株2通过采用不同的纯化手段,最终获得高纯度的C-糖基转移酶Mi CGTb可溶性蛋白3获得C-糖基转移酶Mi CGTb的单晶以及X-Ray衍射数据结论1获得高表达的截短的C-糖基转移酶Mi CGTb表达菌株2获得高纯度的截短的C-糖基转移酶Mi CGTb蛋白3获得截短的C-糖基转移酶Mi CGTb蛋白质单晶4获得一组6埃的C-糖基转移酶Mi CGTb蛋白质单晶X-Ray衍射扫描数据。(本文来源于《华北理工大学》期刊2017-06-02)

李敏[4](2017)在《苦荞苯丙氨酸解氨酶(PAL)基因遗传多样性及荞麦提取物抑制非酶糖基化反应的研究》一文中研究指出苦荞(Fagopyrm tatarium)是蓼科荞麦属的药食兼用作物,是荞麦的一个栽培种。苦荞中富含黄酮类化合物,苯丙氨酸解氨酶(PAL)是苦荞黄酮合成途径中的第一个酶,研究其基因的多样性可为挑选高黄酮优质苦荞种质资源奠定基础。根据Genbank网站中公布的苦荞苯丙氨酸解氨酶的基因序列,设计3对引物,PCR扩增67份苦荞材料PAL基因序列,对其进行多样性分析。结果表明:供试的67份苦荞材料的PAL基因序列长度为2011 bp,其中,变异位点为160个,占序列总长度的7.9%,简约信息位点为33个,占序列总长度的1.64%。利用软件比对材料的苯丙氨酸解氨酶基因序列,共检测到46个SNP,频率为1SNP/43.7bp。在PAL基因单核苷酸变异中,发生转换是23个,颠换是23个。转换与颠换的比值为1:1。分析各地区苦荞种质资源的遗传多样性中,不同来源的苦荞材料间的遗传距离分布于0.002-0.016之间,来源于四川组的苦荞材料种内平均遗传距离最大(0.016),内蒙古组的最小(0.002)。四川地区的材料与其它地区来源的材料间的遗传距离位于0.010-0.014之间,而其他地区间的遗传距离为0.004-0.013。67份苦荞材料的平均π值和θ值分别为0.0034和0.0143。其中,四川材料的π值为0.0148。依据遗传距离及分析核苷酸多样性,均发现四川地区的苦荞存在丰富的遗传多样性,这可能与中国西南部地区作为苦荞起源地具有一定的关联性。依据PAL序列构建系统发育树:本研究通过邻接法构建系统发育树,将67份苦荞种质资源分为7组,这些聚类结果显示多数的苦荞材料PAL序列之间差异较小,分类与地理来源没有关系。仅西藏地区的5份材料单独聚为一组,比对结果发现其材料中具有较多的碱基转换与碱基颠换的情况,说明西藏的材料中可能是苦荞PAL基因中稀有的SNP,是该基因中新的突变位点。苦荞已经成为公认的健康食品。尤其含有丰富的黄酮类化合物,对糖尿病及其并发症有重要的防治效益。本研究以BSA-GO反应体系模拟体外非酶糖基化反应,比较荞麦提取物和芦丁、槲皮素、异槲皮素等黄酮类化合物对非酶糖基化终产物AGEs的抑制效果。结果证明:抑制效果为荞麦2#醇提物>荞麦1#醇提物>盐酸二甲双胍>荞麦水提物。抑制率最高的是荞麦2#醇提物,且荞麦醇提取物对AGEs的抑制作用与叁种黄酮类化合物(芦丁、槲皮素和异槲皮素)无明显差异。由此可知荞麦的乙醇提取物抑制AGEs形成的能力远高于市售的盐酸二甲双胍药物,有望开发出一种高效、无毒副作用的降糖药物,或作为一种食品添加剂用于糖尿病人的专用食品中,提高荞麦的利用价值。(本文来源于《山西大学》期刊2017-06-01)

陈传道,章跃陵[5](2011)在《两种不同策略研究对虾血蓝蛋白糖基多样性》一文中研究指出生物信息学分析表明,血蓝蛋白存在N-糖基化和O-糖基化位点。本研究采用糖组学、凝集实验、溶血实验等方法,运用分子筛-离子交换-ConA凝集素层析和亲和层析-ConA凝集素层析两种不同的策略对凡纳滨对虾血蓝蛋白的糖基多样性进行了积极的探索。结果表明,2种策略所纯化的血蓝蛋白ConA特异性成分的糖含量显着高于ConA非特异性成分的含量。尤其是血蓝蛋白ConA特异性成分的细菌凝集活性、红细胞凝血活性和溶血活性均明显强于其非特异性成分。由此提示,对虾血蓝蛋白糖基修饰多样性可能是其功能多样性的分子基础之一。(本文来源于《渔业科技创新与发展方式转变——2011年中国水产学会学术年会论文摘要集》期刊2011-11-15)

糖基多样性论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

属于糖基转移酶(GTs)家族1的尿苷二磷酸(UDP)-糖基转移酶(UGT)在转移拟南芥中的糖基的转移和糖基化次级代谢物中起重要作用.重建的系统发育树对这个多基因家族的进化关系和功能提供了新的见解和研究.通过综合分析系统发育谱和重建的系统发育树,我们系统地分析了112个拟南芥UGTs.在我们的工作中,我们检测到五个不同的进化保守模块,大多数UGTs分为同一模块,表明拟南芥UGTs在进化过程中是相当保守的.接下来收集拟南芥UGT的底物,并将它们映射到直向同源组,揭示UGT在结合特异性底物中的进化关系.通过扫描271不同物种,还预测一些未报告的蛋白质与拟南芥UGTs密切相关.

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

糖基多样性论文参考文献

[1].袁帅.虎眼万年青属糖基转移酶的挖掘及其在糖苷多样性中的应用[D].北京协和医学院.2018

[2].方阳,牛毓龙,刘程程,林江依,李旭锋.通过进化模块审视拟南芥尿苷二磷酸葡糖基转移酶功能多样性[J].四川大学学报(自然科学版).2017

[3].刘凡.多样性导向糖基转移酶的结构生物学研究[D].华北理工大学.2017

[4].李敏.苦荞苯丙氨酸解氨酶(PAL)基因遗传多样性及荞麦提取物抑制非酶糖基化反应的研究[D].山西大学.2017

[5].陈传道,章跃陵.两种不同策略研究对虾血蓝蛋白糖基多样性[C].渔业科技创新与发展方式转变——2011年中国水产学会学术年会论文摘要集.2011

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