张欣:鸡源大肠杆菌多位点序列分型分析论文

张欣:鸡源大肠杆菌多位点序列分型分析论文

本文主要研究内容

作者张欣(2019)在《鸡源大肠杆菌多位点序列分型分析》一文中研究指出:鸡大肠杆菌病是由禽致病性大肠杆菌引起。临床表现为败血症、气囊炎、腹膜炎、肝周炎、心包炎、眼球炎、关节炎等,发病率为11%-69%,死亡率为3.8%-72.9%,对养禽业带来了巨大的损失。大肠杆菌致病菌株多,其疾病病变复杂。因此,该病及时诊断和菌株的准确分型,对鸡大肠杆菌病的控制具有重要意义。从病鸡内脏器官和鸡舍空气分离菌株,观察菌落、菌体形态,提取分离株DNA,进行16S rDNA扩增,经测序比对对分离株鉴定。同时,观察病鸡剖检病变,并采集病料制作常规石蜡切片,进行组织病理学观察。结果显示分离株在营养琼脂上菌落呈圆形凸起、光滑、湿润、半透明、灰白色;伊红美蓝琼脂板上菌落呈金属色光泽,圆形棕色菌落;革兰染色阴性两极着色的短杆菌。与GeneBank大肠杆菌同源性为98.2%-99.3%。经序列分析结合菌体菌落形态,共鉴定65株大肠杆菌,其中42株来源临床,23株来源环境。病鸡剖检发现肝脏肿大、有纤维素性渗出、气囊浑浊、腹腔内有卵黄样物质;组织观察发现肝外膜增厚,表面覆盖纤维性伪膜,在血管周围及汇管区,炎性细胞增多;心肌外膜增厚,表面有大量纤维性渗出,炎性细胞浸润,心肌纤维排列紊乱,个别心肌纤维断裂。病理变化结合大肠杆菌的分离鉴定,对鸡大肠杆菌病进行诊断。对65株大肠杆菌进行多位点序列分型,同时对毒力基因、血清型、药敏进行分析,并探讨基因型与致病基因、血清型、耐药间的关系。结果显示65株大肠杆菌分为32个序列型(sequence types,ST)。其中已知ST为13个,新ST为19个。32个ST型在数据库中属于9个同源复合体和2个独特型。通过UPGMA分为5个群,14个单独型。鸡舍空气分离株以ST-21为主,肛拭子分离株以nST-8为主,成年病鸡分离株以ST-88为主,病雏鸡分离株以nST-11为主,不同来源的ST型除个别菌株有交叉外,其余均不相同,说明不同来源的分离株其主要的ST型不同,大肠杆菌ST型的种类、优势型与其寄生的环境和宿主日龄不同有关。22株大肠杆菌血清型共有9种、ST型有14种。其中鸡舍空气分离株有3种血清型7种ST型;成年病鸡分离株有6种血清型8个ST型。成年病鸡分离株血清型包含鸡舍空气分离株血清型,但基因型只有个别有交叉。从结果上可以看出ST型分辨力更高,更精细。23株大肠杆菌(14种ST型)对6类12种抗生素进行耐药分析。其中林可胺类(Lincosamides,LINs)耐药率最高,达100%,β-内酰胺类(Beta-Lactams antibiotics,BLs)为95.65%,四环素类(Tetracycline,TCs)为91.30%,对氨基糖苷类(Aminoglycoside antibitics,AGs)和大环内酯类(Macrolides antibiotics,MALs)为86.96%,喹诺酮类(Quinolione,QLs)最低,为82.61%。形成18种耐药谱。65株大肠杆菌的glgP、menA、fimC、fimH检出率为100%,evgA检出率为95.40%,traB检出率为33.80%。65株分离株形成有3个毒力谱,以glgP-menA-evgA-fimC-fimH毒力谱为主。

Abstract

ji da chang gan jun bing shi you qin zhi bing xing da chang gan jun yin qi 。lin chuang biao xian wei bai xie zheng 、qi nang yan 、fu mo yan 、gan zhou yan 、xin bao yan 、yan qiu yan 、guan jie yan deng ,fa bing lv wei 11%-69%,si wang lv wei 3.8%-72.9%,dui yang qin ye dai lai le ju da de sun shi 。da chang gan jun zhi bing jun zhu duo ,ji ji bing bing bian fu za 。yin ci ,gai bing ji shi zhen duan he jun zhu de zhun que fen xing ,dui ji da chang gan jun bing de kong zhi ju you chong yao yi yi 。cong bing ji nei zang qi guan he ji she kong qi fen li jun zhu ,guan cha jun la 、jun ti xing tai ,di qu fen li zhu DNA,jin hang 16S rDNAkuo zeng ,jing ce xu bi dui dui fen li zhu jian ding 。tong shi ,guan cha bing ji pou jian bing bian ,bing cai ji bing liao zhi zuo chang gui dan la qie pian ,jin hang zu zhi bing li xue guan cha 。jie guo xian shi fen li zhu zai ying yang qiong zhi shang jun la cheng yuan xing tu qi 、guang hua 、shi run 、ban tou ming 、hui bai se ;yi gong mei lan qiong zhi ban shang jun la cheng jin shu se guang ze ,yuan xing zong se jun la ;ge lan ran se yin xing liang ji zhao se de duan gan jun 。yu GeneBankda chang gan jun tong yuan xing wei 98.2%-99.3%。jing xu lie fen xi jie ge jun ti jun la xing tai ,gong jian ding 65zhu da chang gan jun ,ji zhong 42zhu lai yuan lin chuang ,23zhu lai yuan huan jing 。bing ji pou jian fa xian gan zang zhong da 、you qian wei su xing shen chu 、qi nang hun zhuo 、fu qiang nei you luan huang yang wu zhi ;zu zhi guan cha fa xian gan wai mo zeng hou ,biao mian fu gai qian wei xing wei mo ,zai xie guan zhou wei ji hui guan ou ,yan xing xi bao zeng duo ;xin ji wai mo zeng hou ,biao mian you da liang qian wei xing shen chu ,yan xing xi bao jin run ,xin ji qian wei pai lie wen luan ,ge bie xin ji qian wei duan lie 。bing li bian hua jie ge da chang gan jun de fen li jian ding ,dui ji da chang gan jun bing jin hang zhen duan 。dui 65zhu da chang gan jun jin hang duo wei dian xu lie fen xing ,tong shi dui du li ji yin 、xie qing xing 、yao min jin hang fen xi ,bing tan tao ji yin xing yu zhi bing ji yin 、xie qing xing 、nai yao jian de guan ji 。jie guo xian shi 65zhu da chang gan jun fen wei 32ge xu lie xing (sequence types,ST)。ji zhong yi zhi STwei 13ge ,xin STwei 19ge 。32ge STxing zai shu ju ku zhong shu yu 9ge tong yuan fu ge ti he 2ge du te xing 。tong guo UPGMAfen wei 5ge qun ,14ge chan du xing 。ji she kong qi fen li zhu yi ST-21wei zhu ,gang shi zi fen li zhu yi nST-8wei zhu ,cheng nian bing ji fen li zhu yi ST-88wei zhu ,bing chu ji fen li zhu yi nST-11wei zhu ,bu tong lai yuan de STxing chu ge bie jun zhu you jiao cha wai ,ji yu jun bu xiang tong ,shui ming bu tong lai yuan de fen li zhu ji zhu yao de STxing bu tong ,da chang gan jun STxing de chong lei 、you shi xing yu ji ji sheng de huan jing he su zhu ri ling bu tong you guan 。22zhu da chang gan jun xie qing xing gong you 9chong 、STxing you 14chong 。ji zhong ji she kong qi fen li zhu you 3chong xie qing xing 7chong STxing ;cheng nian bing ji fen li zhu you 6chong xie qing xing 8ge STxing 。cheng nian bing ji fen li zhu xie qing xing bao han ji she kong qi fen li zhu xie qing xing ,dan ji yin xing zhi you ge bie you jiao cha 。cong jie guo shang ke yi kan chu STxing fen bian li geng gao ,geng jing xi 。23zhu da chang gan jun (14chong STxing )dui 6lei 12chong kang sheng su jin hang nai yao fen xi 。ji zhong lin ke an lei (Lincosamides,LINs)nai yao lv zui gao ,da 100%,β-nei xian an lei (Beta-Lactams antibiotics,BLs)wei 95.65%,si huan su lei (Tetracycline,TCs)wei 91.30%,dui an ji tang gan lei (Aminoglycoside antibitics,AGs)he da huan nei zhi lei (Macrolides antibiotics,MALs)wei 86.96%,kui nuo tong lei (Quinolione,QLs)zui di ,wei 82.61%。xing cheng 18chong nai yao pu 。65zhu da chang gan jun de glgP、menA、fimC、fimHjian chu lv wei 100%,evgAjian chu lv wei 95.40%,traBjian chu lv wei 33.80%。65zhu fen li zhu xing cheng you 3ge du li pu ,yi glgP-menA-evgA-fimC-fimHdu li pu wei zhu 。

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  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自河北工程大学的张欣,发表于刊物河北工程大学2019-07-08论文,是一篇关于鸡大肠杆菌论文,多位点序列分型论文,血清型论文,耐药性论文,毒力基因论文,河北工程大学2019-07-08论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自河北工程大学2019-07-08论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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