何沛:3种试剂盒对烟丝DNA提取及其微生物群落多样性分析效果的比较论文

何沛:3种试剂盒对烟丝DNA提取及其微生物群落多样性分析效果的比较论文

本文主要研究内容

作者何沛,杨俊誉,苏代发,肖炜,刘志华,崔晓龙(2019)在《3种试剂盒对烟丝DNA提取及其微生物群落多样性分析效果的比较》一文中研究指出:筛选能高效提取烟丝DNA,并能获取其微生物群落多样性较高的试剂盒。选择3种不同的试剂盒提取烟丝DNA,比较DNA的纯度和浓度,并将提取的DNA进行原核生物16S rRNA基因V3~V4区和真菌ITS2区的PCR扩增及高通量扩增子测序,进而比较烟丝样品微生物群落多样性和结构差异。结果表明:(1)DNeasy?PowerPlant?Pro Kit植物基因组提取试剂盒(P)提取的烟丝DNA浓度为(103.67±1.7) ng/μL,显著高于其他试剂盒(P<0.01),且3种试剂盒提取的DNA纯度均达到合格水平。(2)3种试剂盒提取的DNA样本均能反映样本中原核生物群落多样性与结构,从门分类水平看,试剂盒P检测到11个门类,E.Z.N.A.TMHP Plant DNA Kit植物基因组提取试剂盒(M)检测到8个门类,DNeasy?PowerSoil?Kit土壤基因组提取试剂盒(S)检测到5个门类;从属分类水平看,试剂盒P检测到83个属,试剂盒S检测到71个属,试剂盒M检测到69个属。(3)3种试剂盒均能检测到Unclassified类群、子囊菌门Ascomycota、接合菌门Zygomycota和Others等4个真菌门类,但试剂盒P检测到的类群比例最高;在属分类水平上,试剂盒P检测出30个属,试剂盒S检测出20个属,试剂盒M检测出11个属。DNeasy?PowerPlant?Pro Kit植物基因组提取试剂盒(P)能有效提取烟丝及其所含微生物的总DNA,并能检测出更高的烟丝微生物群落多样性,推荐该试剂盒用于烟丝样品中微生物群落多样性与结构的分析。

Abstract

shai shua neng gao xiao di qu yan si DNA,bing neng huo qu ji wei sheng wu qun la duo yang xing jiao gao de shi ji he 。shua ze 3chong bu tong de shi ji he di qu yan si DNA,bi jiao DNAde chun du he nong du ,bing jiang di qu de DNAjin hang yuan he sheng wu 16S rRNAji yin V3~V4ou he zhen jun ITS2ou de PCRkuo zeng ji gao tong liang kuo zeng zi ce xu ,jin er bi jiao yan si yang pin wei sheng wu qun la duo yang xing he jie gou cha yi 。jie guo biao ming :(1)DNeasy?PowerPlant?Pro Kitzhi wu ji yin zu di qu shi ji he (P)di qu de yan si DNAnong du wei (103.67±1.7) ng/μL,xian zhe gao yu ji ta shi ji he (P<0.01),ju 3chong shi ji he di qu de DNAchun du jun da dao ge ge shui ping 。(2)3chong shi ji he di qu de DNAyang ben jun neng fan ying yang ben zhong yuan he sheng wu qun la duo yang xing yu jie gou ,cong men fen lei shui ping kan ,shi ji he Pjian ce dao 11ge men lei ,E.Z.N.A.TMHP Plant DNA Kitzhi wu ji yin zu di qu shi ji he (M)jian ce dao 8ge men lei ,DNeasy?PowerSoil?Kittu rang ji yin zu di qu shi ji he (S)jian ce dao 5ge men lei ;cong shu fen lei shui ping kan ,shi ji he Pjian ce dao 83ge shu ,shi ji he Sjian ce dao 71ge shu ,shi ji he Mjian ce dao 69ge shu 。(3)3chong shi ji he jun neng jian ce dao Unclassifiedlei qun 、zi nang jun men Ascomycota、jie ge jun men Zygomycotahe Othersdeng 4ge zhen jun men lei ,dan shi ji he Pjian ce dao de lei qun bi li zui gao ;zai shu fen lei shui ping shang ,shi ji he Pjian ce chu 30ge shu ,shi ji he Sjian ce chu 20ge shu ,shi ji he Mjian ce chu 11ge shu 。DNeasy?PowerPlant?Pro Kitzhi wu ji yin zu di qu shi ji he (P)neng you xiao di qu yan si ji ji suo han wei sheng wu de zong DNA,bing neng jian ce chu geng gao de yan si wei sheng wu qun la duo yang xing ,tui jian gai shi ji he yong yu yan si yang pin zhong wei sheng wu qun la duo yang xing yu jie gou de fen xi 。

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  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自中国农学通报的何沛,杨俊誉,苏代发,肖炜,刘志华,崔晓龙,发表于刊物中国农学通报2019年21期论文,是一篇关于烟丝论文,提取试剂盒论文,高通量测序论文,微生物群落多样性论文,中国农学通报2019年21期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自中国农学通报2019年21期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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