本文主要研究内容
作者吴欣桐,洪培伟（2019）在《基于信息学分析的帕金森病额叶基因表达谱研究》一文中研究指出：目的采用生物信息学方法分析帕金森病(Parkinson disease,PD)患者额叶组织的基因表达谱,来探索PD抑郁相关的机制。方法从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库中使用"Parkinson disease"进行检索,并限定组织来源为人类(Homo sapiens)及检测方法为表达谱芯片(Expression profiling by array),获取2019年3月20日前GEO数据库中的所有生物信息数据。使用ImaGEO(Integrative Gene Expression Meta-Analysis from GEO database)、DAVID(the Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery)、STRING在线工具及Cytoscape 3.6.1软件进行数据分析。结果根据检索条件,获得了2个数据集,共45个样本(PD组24个,健康对照组21个)。与健康对照组相比,PD组的额叶中总共有236个基因表达存在差异,其中146个基因表达水平增高,90个基因表达水平下降。根据基因本体论分析及京都基因和基因组数据库分析,该差异基因主要富集在突触后膜、细胞膜成分、突触后膜密集区、髓鞘等结构。差异基因参与了和PD发生有关的多巴胺能、谷氨酸能及γ-氨基丁酸能等神经突触的生物过程、抑郁的发生过程和多条信号通路(如:丝裂原激活蛋白激酶信号通路、p53信号通路及Wnt信号通路);其中关键蛋白是NFKBIA、NRXN1和RPL35A。结论 PD患者额叶的基因表达与PD抑郁发生有关。该研究为进一步理解PD抑郁的发病机制提供了理论依据。
Abstract
mu de cai yong sheng wu xin xi xue fang fa fen xi pa jin sen bing (Parkinson disease,PD)huan zhe e xie zu zhi de ji yin biao da pu ,lai tan suo PDyi yu xiang guan de ji zhi 。fang fa cong Gene Expression Omnibus(GEO)shu ju ku zhong shi yong "Parkinson disease"jin hang jian suo ,bing xian ding zu zhi lai yuan wei ren lei (Homo sapiens)ji jian ce fang fa wei biao da pu xin pian (Expression profiling by array),huo qu 2019nian 3yue 20ri qian GEOshu ju ku zhong de suo you sheng wu xin xi shu ju 。shi yong ImaGEO(Integrative Gene Expression Meta-Analysis from GEO database)、DAVID(the Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery)、STRINGzai xian gong ju ji Cytoscape 3.6.1ruan jian jin hang shu ju fen xi 。jie guo gen ju jian suo tiao jian ,huo de le 2ge shu ju ji ,gong 45ge yang ben (PDzu 24ge ,jian kang dui zhao zu 21ge )。yu jian kang dui zhao zu xiang bi ,PDzu de e xie zhong zong gong you 236ge ji yin biao da cun zai cha yi ,ji zhong 146ge ji yin biao da shui ping zeng gao ,90ge ji yin biao da shui ping xia jiang 。gen ju ji yin ben ti lun fen xi ji jing dou ji yin he ji yin zu shu ju ku fen xi ,gai cha yi ji yin zhu yao fu ji zai tu chu hou mo 、xi bao mo cheng fen 、tu chu hou mo mi ji ou 、sui qiao deng jie gou 。cha yi ji yin can yu le he PDfa sheng you guan de duo ba an neng 、gu an suan neng ji γ-an ji ding suan neng deng shen jing tu chu de sheng wu guo cheng 、yi yu de fa sheng guo cheng he duo tiao xin hao tong lu (ru :si lie yuan ji huo dan bai ji mei xin hao tong lu 、p53xin hao tong lu ji Wntxin hao tong lu );ji zhong guan jian dan bai shi NFKBIA、NRXN1he RPL35A。jie lun PDhuan zhe e xie de ji yin biao da yu PDyi yu fa sheng you guan 。gai yan jiu wei jin yi bu li jie PDyi yu de fa bing ji zhi di gong le li lun yi ju 。
论文参考文献
论文详细介绍
论文作者分别是来自华西医学的吴欣桐,洪培伟，发表于刊物华西医学2019年10期论文，是一篇关于帕金森病论文,额叶论文,非运动症状论文,抑郁论文,生物信息学论文,华西医学2019年10期论文的文章。本文可供学术参考使用，各位学者可以免费参考阅读下载，文章观点不代表本站观点，资料来自华西医学2019年10期论文网站，若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权，请联系我们删除。