定量蛋白质组论文-余萍,董超,姚春馨,丁玉梅,周晓罡

定量蛋白质组论文-余萍,董超,姚春馨,丁玉梅,周晓罡

导读:本文包含了定量蛋白质组论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献,主要关键词:蛋白质组学,马铃薯晚疫病菌,分泌蛋白,氮饥饿

定量蛋白质组论文文献综述

余萍,董超,姚春馨,丁玉梅,周晓罡[1](2019)在《基于Label free定量蛋白质组学技术对马铃薯晚疫病菌氮饥饿条件下分泌蛋白组初步分析》一文中研究指出【目的】探讨氮源是否影响马铃薯晚疫病菌分泌蛋白的致病性。【方法】应用蛋白质组学Label-free技术,对受氮饥饿处理24 h和未处理的马铃薯晚疫病菌分泌蛋白进行鉴定,并对其鉴定蛋白进行生物信息学分析。【结果】共发现61个蛋白质的表达量存在显着差异,其中41个蛋白质表达量上调,20个蛋白质表达量下调。经生物信息学分析表明它们95%定位于细胞核、细胞质、线粒体和分泌型,主要参与碳代谢、氨基酸的生物合成和核糖体代谢,参与的生物过程主要是细胞过程、代谢过程和细胞成分组织或生物起源。【结论】氮源提高致病性蛋白的分泌,影响马铃薯晚疫病菌的致病性。(本文来源于《西南农业学报》期刊2019年10期)

李蕾,薛明,胡家,李静宜[2](2019)在《iTRAQ定量蛋白质组分析中多级质谱采集策略对比分析》一文中研究指出目的比较二级和叁级质谱两种碎裂模式对基于同位素标记定量的蛋白质组学技术准确度的影响。方法采集斑马鱼在氧气浓度5%条件下,0,24,48 h取样斑马鱼脑组织蛋白样品,提取蛋白质进行i TRAQ标记,高p H值反相柱分离成15个组分,分别采用纳升液相色谱分离肽段,串级质谱(MS2)或叁级质谱(MS3)两种方法碎裂肽段,利用MaxQuant定量蛋白质组分析软件,获得报告离子强度信息。结果 MS2碎裂和MS3碎裂分别鉴定到7 624个和6 940个蛋白质; MS3碎裂获得的差异蛋白质数量明显多于MS2,分别为173和641个,相同的蛋白质,MS3的差异比值距离1∶1的距离更远。虽然MS3鉴定的谱图数较低,但鉴定到的肽段和蛋白质数目降低不明显。结论对基于i TRAQ标记的定量蛋白质组研究策略,MS3质谱分析提供更为显着的差异分析结果,是更优的选择。(本文来源于《山西医科大学学报》期刊2019年11期)

何敬,彭斌,易斌[3](2019)在《年龄相关性听力减退小鼠耳蜗核iTRAQ定量蛋白质组学研究》一文中研究指出目的研究年龄相关性听力减退小鼠耳蜗核蛋白质组学随增龄产生的差异,探讨低级听觉中枢在老年性耳聋发病机理中的作用。方法运用脑干电反应测听(ABR)检测2月龄及12月龄C57BL/6J小鼠的听阈,结合同位素标记的相对与绝对定量(iTRAQ)和Q Exactive质谱及生物信息学等多重技术分析两组之间耳蜗核差异蛋白。结果两组中总共鉴定到5 919个蛋白质,39 269个唯一肽段。符合表达差异倍数大于1.2倍且P<0.05筛选标准的差异表达蛋白质70个。其中上调差异表达蛋白44个,下调差异表达蛋白26个。结论 iTRAQ定量蛋白质组学技术可有效地运用于组织蛋白鉴定和相对与绝对定量;采用该技术获得了年龄相关性听力减退小鼠耳蜗核蛋白质组差异表达图谱;深层次研究这些蛋白的分子机制将有助于阐明老年性耳聋尤其是中枢性老年性耳聋的发病机理及发现潜在的标志物,为老年性耳聋的诊断和治疗提供新的分子靶位。(本文来源于《中国耳鼻咽喉颅底外科杂志》期刊2019年05期)

罗霞,陆捷,邓玲艳,程黎明[4](2019)在《关于蛋白质电泳中单克隆蛋白定量及报告标准化的建议解读》一文中研究指出国际临床化学与检验医学联合会(International Federation of Clinical Chemistry and Laboratory Medicine,IFCC)、美国病理家学会(the College of American Pathologists,CAP)和澳大利亚皇家病理学院质量保证计划(the Royal College of Pathologists of Australasia Quality Assurance Programs,RCPAQAP)的调查结果显示,实验室关于蛋白质电泳中单克隆蛋白定量和报告标准化势在必行。该文介绍了加拿大单克隆丙种球蛋白病工作组(Monoclonal Gammopathy Working Group,MGWG)和澳大利亚-新西兰蛋白质电泳报告标准化工作组关于单克隆蛋白术语、电泳检测技术、单克隆蛋白分离及定量中存在的若干问题、蛋白质电泳中存在的干扰以及报告标准化的建议,呼吁国内同行重视蛋白质电泳报告的标准化问题,提高蛋白质电泳报告质量,降低临床差错风险。(本文来源于《临床检验杂志》期刊2019年10期)

江娜,孙漫红,李世东[5](2019)在《粉红螺旋聚孢霉67-1乙酰化定量蛋白质组学研究》一文中研究指出粉红螺旋聚孢霉(Clonostachys rosea,异名:粉红粘帚霉,Gliocladium roseum)是一类具有重要生防潜力的生防真菌,可防治由核盘菌、镰刀菌等引起的多种植物病害。粉红螺旋聚孢霉67-1是笔者实验室前期分离得到的一株高效菌株,其生防菌剂在田间显示出了良好的防病效果。研究粉红螺旋聚孢霉的寄生分子机制是应用其防治植物病害的科学基础,对生防菌剂的生产和应用都具有重要意义。为研究蛋白质乙酰化修饰介导和调控粉红螺旋聚孢霉寄生核盘菌菌核,笔者构建了67-1乙酰化定量蛋白质组。在PDA平板上接种67-1,长出一层菌丝后,铺满大豆核盘菌共同培养,8h、24h、48h后收集67-1菌丝,以67-1纯培养为对照,3次生物学重复。收集样品后,提取蛋白质并酶解,而后通过TMT标记和乙酰化富集技术以及高分辨率液相色谱-质谱联用的定量蛋白质组学研究策略进行定量蛋白质组学研究。结果显示,67-1中共有740个蛋白、1 448个位点发生了乙酰化修饰。用蛋白定量组进行归一化以去除蛋白表达量对修饰信号造成的影响,结果显示67-1寄生过程中有大量赖氨酸位点的乙酰化修饰水平发生改变。随后,对可定量蛋白质进行系统的生物信息学分析,包括蛋白注释、功能分类、功能富集及基于功能富集的聚类分析、蛋白互作网络分析,笔者筛选出了31个目的蛋白用于进行乙酰化蛋白及修饰位点功能的深入研究,为进一步从蛋白质翻译后修饰角度阐释粉红螺旋聚孢霉67-1寄生核盘菌机理奠定基础。(本文来源于《中国植物保护学会2019年学术年会论文集》期刊2019-10-23)

尹彦力,沙君雪,张悠然,谭佳丽,孙敬[6](2019)在《应用iTRAQ定量蛋白质组学技术分析Sip毒素蛋白处理后的大猿叶甲差异蛋白》一文中研究指出Sip毒素蛋白(secreted insecticidal protein, Sip)是苏云金芽胞杆菌(Bacillus thuringiensis, Bt)杀虫家族中的分泌型杀虫蛋白,对鞘翅目幼虫表现出毒性。大猿叶甲(Colaphellus bowringi)是常见的十字花科害虫,Sip蛋白对大猿叶甲具有较高的杀虫活性。本实验运用同位素相对标记与绝对定量技术(isotope relative labeling and absolute quantification technique, iTRAQ)分析Sip蛋白处理后大猿叶甲的差异蛋白,同时对其进行功能注释、富集分析。通过ProteinpilotTMV4.5软件进行定量分析,在基因本体数据库(Gene Ontology, GO)、蛋白相邻类的聚簇数据库(Cluster of Orthologous Groups of proteins, COG)对其进行功能注释,并对其进行KEGG通路分析,同时对所有显着性差异表达蛋白进行GO及KEGG通路分析。与对照组比对后,在实验组中鉴定出具有定量信息的蛋白质47个,包含27个上调蛋白和20个下调蛋白。通过GO、COG功能注释和KEGG分析,发现这些差异蛋白主要涉及结合和催化活性等分子功能;主要参与细胞进程和代谢进程等生物过程;预测到这些差异性蛋白可能有的功能为翻译后修饰,蛋白质周转,伴侣、翻译,核糖体结构和生物合成等。通过富集分析,发现这些差异蛋白主要有核核小体、非包膜细胞器、细胞内非包膜细胞器、核小体、核糖体、COPI包膜囊泡、蛋白质-DNA复合物、分泌颗粒、核染色质、高尔基体堆等生物学功能。本研究发现,在经过Sip毒素蛋白处理后,Bt毒素常见的一些受体发生了差异性表达,如钙黏蛋白(cadherin),氨肽酶N (aminopeptidase N, APN),碱式磷酸酶(alkaline phosphatase, Alp),G蛋白(G-protein)。本研究结果为Sip毒素作用机理的研究提供参考,并为Sip毒素的蛋白质组学研究提供科学参考。(本文来源于《农业生物技术学报》期刊2019年10期)

覃保瑜,刘红,黄鸿,姚彦冰,方丹[7](2019)在《非标记定量蛋白质组技术筛选早期糖尿病肾病大鼠的尿蛋白标志物》一文中研究指出目的利用非标记定量蛋白质组技术筛选早期糖尿病肾病(DN)大鼠的尿蛋白标志物。方法将16只大鼠随机均分为正常对照组和糖尿病模型组,采用链脲佐菌素建立糖尿病模型。将糖尿病大鼠成模前、成模后1周、成模后24周分别设为非糖尿病(ND)期、正常白蛋白尿(NA)期、微量白蛋白尿(MA)期,收集各期尿液标本。将尿标本超滤离心和浓缩后,十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳粗分离尿样品的蛋白,行液相色谱-电喷雾电离串联质谱,以非标记定量蛋白质组技术筛选出差异表达的尿蛋白。采用酶联免疫吸附法对感兴趣的尿蛋白作确认。对比MA期糖尿病大鼠和正常对照组大鼠的光镜下肾组织结构。结果与NA期比较,MA期表达显着上调的蛋白质共15个,表达显着下调的蛋白质共12个。选取尿胎球蛋白A进行确认,糖尿病大鼠MA期的尿胎球蛋白A/尿肌酐水平均高于NA期、ND期(均P<0.05)。光镜下MA期大鼠肾组织呈早期DN病理改变。结论应用非标记定量蛋白质组技术可筛选出早期DN大鼠的差异表达尿蛋白,其中尿胎球蛋白A或可作为早期DN的诊断标志物。(本文来源于《广西医学》期刊2019年16期)

付伟,陈倩,安博,张明,曲峻[8](2019)在《LC-MS/MS技术在蛋白质药物定量分析中的应用》一文中研究指出近年来,蛋白质药物已经成为全球制药业的研发热点。建立灵敏、准确、高通量的蛋白质药物定量分析方法,是进行蛋白质药物研究的关键前提,也是蛋白质药物研究的难点。随着液相色谱串联质谱技术(LC-MS/MS)的发展,其在蛋白质药物定量分析中起着越来越重要的作用。本文首先综述了蛋白质药物的分类,然后比较了LC-MS/MS技术与传统配体结合测定方法(LBA)在蛋白质药物分析中的优缺点,以及分析了LC-MS/MS技术在蛋白质药物定量分析中的常见问题、解决方法、应用方向等。最后预测,短时间内LC-MS/MS不会完全取代传统的LBA方法,随着LC-MS/MS技术和生物化学技术的充分结合,蛋白质药物分析将会得到飞速的发展。(本文来源于《中国医院药学杂志》期刊2019年16期)

乐梦真,吴新程,曾慧红,朱清仙[9](2019)在《IgA肾病大鼠肠黏膜定量蛋白质组学分析》一文中研究指出为观察肠黏膜蛋白谱的变化对黏膜源性IgA肾病发病机制及病情程度的影响,本研究拟用BSA-LPS-CCL4方法建立IgA肾病模型,并建立TLR4敲除模型,即用TLR4基因敲除鼠进行上述IgA肾病建模。SD大鼠随机分为正常组、IgA肾病组和TLR4敲除组。建模后取血液和24h尿液做肾功能生化分析,H-E染色观察肾组织病理学变化,免疫荧光染色观察肾组织IgA沉积,采用TMT定量技术对回肠黏(本文来源于《中国解剖学会2019年年会论文文摘汇编》期刊2019-08-18)

施先锋,别之龙,王希波,程菲,曹海顺[10](2019)在《基于定量蛋白质组学解析西瓜嫁接苗耐冷性的分子机制》一文中研究指出目的与意义:西瓜是一种重要的喜温经济作物。低温是西瓜生产的主要环境限制因素之一。砧木嫁接是提高西瓜耐冷性的有效途径。然而,其分子机制知之甚少。本研究通过植株表型、光合作用及膜损伤程度等指标证实南瓜砧木嫁接提高了西瓜耐冷性,采用基于iTRAQ技术的蛋白质组学方法鉴定了低温处理2 d后西瓜嫁接苗的蛋白质,分(本文来源于《中国瓜菜》期刊2019年08期)

定量蛋白质组论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

目的比较二级和叁级质谱两种碎裂模式对基于同位素标记定量的蛋白质组学技术准确度的影响。方法采集斑马鱼在氧气浓度5%条件下,0,24,48 h取样斑马鱼脑组织蛋白样品,提取蛋白质进行i TRAQ标记,高p H值反相柱分离成15个组分,分别采用纳升液相色谱分离肽段,串级质谱(MS2)或叁级质谱(MS3)两种方法碎裂肽段,利用MaxQuant定量蛋白质组分析软件,获得报告离子强度信息。结果 MS2碎裂和MS3碎裂分别鉴定到7 624个和6 940个蛋白质; MS3碎裂获得的差异蛋白质数量明显多于MS2,分别为173和641个,相同的蛋白质,MS3的差异比值距离1∶1的距离更远。虽然MS3鉴定的谱图数较低,但鉴定到的肽段和蛋白质数目降低不明显。结论对基于i TRAQ标记的定量蛋白质组研究策略,MS3质谱分析提供更为显着的差异分析结果,是更优的选择。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

定量蛋白质组论文参考文献

[1].余萍,董超,姚春馨,丁玉梅,周晓罡.基于Labelfree定量蛋白质组学技术对马铃薯晚疫病菌氮饥饿条件下分泌蛋白组初步分析[J].西南农业学报.2019

[2].李蕾,薛明,胡家,李静宜.iTRAQ定量蛋白质组分析中多级质谱采集策略对比分析[J].山西医科大学学报.2019

[3].何敬,彭斌,易斌.年龄相关性听力减退小鼠耳蜗核iTRAQ定量蛋白质组学研究[J].中国耳鼻咽喉颅底外科杂志.2019

[4].罗霞,陆捷,邓玲艳,程黎明.关于蛋白质电泳中单克隆蛋白定量及报告标准化的建议解读[J].临床检验杂志.2019

[5].江娜,孙漫红,李世东.粉红螺旋聚孢霉67-1乙酰化定量蛋白质组学研究[C].中国植物保护学会2019年学术年会论文集.2019

[6].尹彦力,沙君雪,张悠然,谭佳丽,孙敬.应用iTRAQ定量蛋白质组学技术分析Sip毒素蛋白处理后的大猿叶甲差异蛋白[J].农业生物技术学报.2019

[7].覃保瑜,刘红,黄鸿,姚彦冰,方丹.非标记定量蛋白质组技术筛选早期糖尿病肾病大鼠的尿蛋白标志物[J].广西医学.2019

[8].付伟,陈倩,安博,张明,曲峻.LC-MS/MS技术在蛋白质药物定量分析中的应用[J].中国医院药学杂志.2019

[9].乐梦真,吴新程,曾慧红,朱清仙.IgA肾病大鼠肠黏膜定量蛋白质组学分析[C].中国解剖学会2019年年会论文文摘汇编.2019

[10].施先锋,别之龙,王希波,程菲,曹海顺.基于定量蛋白质组学解析西瓜嫁接苗耐冷性的分子机制[J].中国瓜菜.2019

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