导读:本文包含了亚硫酸氢盐测序法论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献，主要关键词:重亚硫酸氢盐测序法,Wnt信号通路抑制基因,基因甲基化,急性早幼粒细胞白血病
亚硫酸氢盐测序法论文文献综述
晏建国,付海英,沈建箴,周华蓉,张媛媛[1]（2016）在《重亚硫酸氢盐测序法检测Wnt信号通路抑制基因在急性早幼粒细胞白血病细胞中甲基化变化》一文中研究指出目的:应用重亚硫酸氢盐测序法(bisulfite sequencing PCR,BSP)检测急性早幼粒细胞白血病细胞株(NB4)Wnt信号通路抑制基因启动子区CPG岛的甲基化状态,筛选NB4细胞中高甲基化的Wnt信号通路抑制基因,并探讨BSP法作为定量研究基因甲基化方法的优缺点。方法:以NB4细胞为研究对象,20例健康人单个核细胞为对照;常规提取DNA并用亚硫酸氢盐处理,然后用PCR扩增目标序列,应用重亚硫酸氢盐测序法(BSP)分析在NB4细胞中Wnt信号通路抑制基因基因的甲基化状态。并通过与甲基化特异性PCR(methylation specific PCR,M SP)、焦磷酸测序技术(pyrosequencing)比较、评价BSP法检测NB4细胞Wnt信号通路抑制基因甲基化状态的优缺点。结果:BSP产物克隆测序检测NB4细胞Wnt信号通路抑制基因甲基化发生率分别为:WIF-1基因95.26%,DKK3基因86%,SFRP1基因81.67%,SFRP2基因95.71%,SFRP4基因85%,SFRP5基因95%;20例健康人单个核细胞为对照组中Wnt信号通路抑制基因甲基化发生率分别为:WIF-1基因1.5%,DKK3基因4.2%,SFRP1基因0%,SFRP2基因0.9%,SFRP4基因2.5%,SFRP5基因1.75%。与正常人M NC相比,NB4细胞的Wnt信号通路相关抑制基因启动子甲基化率明显增高。结论:急性早幼粒细胞株NB4细胞中存在Wnt信号通路多个抑制基因高甲基化状态。此类基因异常甲基化有可能成为急性早幼粒细胞白血病的早期诊断指标和治疗靶点。(本文来源于《中国实验血液学杂志》期刊2016年05期）
廖静,鲁文清,刘渠,谢显清,李小峰[2]（2016）在《亚硫酸氢盐测序法检测上皮钙黏蛋白甲基化的优化探讨》一文中研究指出目的探讨改进的亚硫酸氢盐测序法在上皮钙黏蛋白甲基化检测中的可行性。方法提取雄性F344大鼠肾脏组织基因组DNA,亚硫酸氢盐化学转化,通过PCR扩增上皮钙黏蛋白基因启动子区特定的序列,以蓝白克隆斑筛选和测序。结果雄性F344大鼠肾脏上皮钙黏蛋白基因启动子区CpG岛的26个CpG位点均未发生甲基化。结论改进后亚硫酸氢盐测序法能明显减少非特异性扩增,提高PCR效率,更适于基因甲基化状态的检测。(本文来源于《检验医学与临床》期刊2016年06期）
陈静[3]（2015）在《染色体免疫共沉淀结合重亚硫酸氢盐测序技术分析UHRF1在肿瘤细胞中结合DNA序列的特征》一文中研究指出DNA甲基化是一种重要的表观遗传修饰,是基因组DNA可逆的分子标记,对基因印记、基因沉默、X染色体失活、细胞重编程、肿瘤发生等都起着重要的调控作用。UHRF1是一种可同时识别DNA甲基化和组蛋白修饰、并具有泛素化作用的多功能蛋白质,已被证明参与多种生物学调控的过程,如DNA甲基化的维持、细胞周期调控,尤其是在肿瘤的发生发展过程中起到不可忽视的作用。目前,已经证明UHRF1可以结合在异染色质区域,参与异染色质的形成,也可结合在常染色质区域,参与DNA甲基化的维持和基因表达的调控。那么,肿瘤细胞中异常高表达的UHRF1在染色体上的结合有无DNA序列特异性,UHRF1结合区域的DNA甲基化状态有无特征?针对上述问题,我们建立了研究染色体蛋白修饰与DNA甲基化和DNA序列关系的新方法—染色质免疫沉淀结合重亚硫酸氢盐测序技术(Chromatin Immunoprecipitation Followed by Bisulfite Sequencing, ChIP-BS-seq),将染色体免疫共沉淀技术与重亚硫酸氢盐测序技术相结合,在全基因组范围内检测同一个DNA分子上的染色体蛋白质结合和DNA甲基化水平。然后我们利用该技术直接探究UHRF1蛋白在染色体上结合序列的特征和DNA甲基化状态,再用ChIP-qPCR和重亚硫酸氢盐测序技术对结果进行验证。我们发现UHRF1结合的DNA80%位于重复序列区域,但在基因组中广泛分布,其ChIP富集峰(Peak)在3’UTR、外显子、启动子和重复序列的Observed/Expected值分别为1.7、2.2、1.4和1.6,说明UHRF1在细胞内优先结合在这些区域,其中位于基因区域的Peak占56.3%,覆盖923个基因；所有Peak中CpG内的C所占比例为1.01%,高于全基因组中CpG的频率,说明UHRF1倾向于结合在CpG二核苷酸处；但结合结构域序列分析显示除了重复序列以外,UHRF1没有结合的特征序列；3'UTR、外显子、启动子区域Peak的平均DNA甲基化水平均在0.7以上,说明UHRF1倾向于结合在DNA甲基化水平较高的位置；进一步分析发现与对照相比,UHRF1结合DNA序列的甲基化水平符合其维持DNA甲基化的功能推测；而且Peak与组蛋白修饰H3K9me3的谱式有较多重合。因此,我们利用ChIP-BS-seq技术第一次在肿瘤细胞内直接证明了UHRF1确实主要定位于重复序列,但也广泛分布在基因组中,结合没有序列特征,但倾向于结合高甲基化的DNA片段,并且参与重复序列和单拷贝基因DNA甲基化的维持和修复。本文的结果为进一步探究UHRF1在肿瘤细胞内的调控作用提供了更深入的信息,为UHRF1作为病人诊断和预后的生物标记提供了理论基础。(本文来源于《华东师范大学》期刊2015-04-01）
汪艳杰,龙鸿,姚家玲[4]（2011）在《亚硫酸氢钠测序法检测水稻FIE基因CpG岛甲基化状态》一文中研究指出建立了适用于水稻基因组特定基因甲基化检测的亚硫酸氢钠测序法,并利用此方法对FIE2A基因CpG岛部分片段的甲基化差异进行了研究。采用CTAB法提取水稻叶片和胚乳细胞的基因组DNA,经亚硫酸氢钠化学修饰后,针对已修饰的FIE基因序列设计特异引物并结合巢式PCR扩增,TA载体克隆、测序,最后对测序结果进行分析。结果表明巢式PCR能够增加特异性产物的产生,FIE基因CpG岛在对称的CG和CNG位点甲基化水平较高,而在非对称CNN位点甲基化水平最低,此外在叶片中的平均甲基化水平较高。由此表明本研究建立的亚硫酸氢钠测序法适用于水稻基因组特定基因甲基化状态的检测。(本文来源于《植物科学学报》期刊2011年01期）
储成风,汪存利,习海涛,刘亚,陶勇[5]（2007）在《亚硫酸氢盐测序法检测小鼠胚胎Oct4启动子区甲基化》一文中研究指出应用亚硫酸氢盐测序技术,以昆明小白鼠几种不同时期体内胚为研究对象,对其单拷贝基因Oct4启动子区进行甲基化检测。基因组经低熔点琼脂糖包埋、亚硫酸氢盐修饰后,运用巢式PCR对处理后的DNA进行两轮扩增,扩增产物通过琼脂糖凝胶电泳检测和单克隆测序进行分析。结果表明,亚硫酸氢盐测序法是一项敏感而有效的DNA甲基化检测手段。(本文来源于《安徽农业大学学报》期刊2007年04期）
陈立军,王玮,于利人,倪虹,呼文亮[6]（2006）在《亚硫酸氢盐-基因组测序法在检测基因异常甲基化中的应用》一文中研究指出目的:介绍一种准确、敏感的检测多个标本、多个CG二核苷酸甲基化状态的方法。即亚硫酸氢盐-基因组测序法(BisulfiteGenomicSequencing,BGS)。方法:单链DNA的胞嘧啶可被亚硫酸氢盐修饰转变成尿嘧啶,而5'甲基胞嘧啶仍保持不变。这种修饰处理可在甲基化和非甲基化基因组DNA间产生DNA序列差异,而这种DNA序列差异可通过BGS法较为灵敏地筛查出。利用该原理检测肝癌细胞AFP基因启动子区CG二核苷酸甲基化状态。结果:在癌细胞中发现两种异常甲基化,即高度甲基化及部分甲基化。结论:BGS法在基因甲基化检测中将有很大的应用潜能,为探讨肿瘤发生机制提供了新的分子分析方向。(本文来源于《中国肿瘤临床》期刊2006年22期）
张莉君,王先良,孙晞,徐顺清[7]（2006）在《改进的亚硫酸氢钠测序法检测HepG2 RASSF1A基因CpG岛甲基化状态》一文中研究指出目的改进亚硫酸氢钠测序法,并检验改进后方法在甲基化检测中的可行性。方法提取人肝癌细胞株HepG2基因组DNA,亚硫酸氢钠化学修饰,针对修饰后Ras相关家族1A基因(RASSF1A)启动子序列设计特异引物并结合沉降PCR扩增,T-A载体克隆、测序。结果HepG2细胞RASSF1A基因启动子CpG岛的16个CpG位点均被甲基化。结论改进后亚硫酸氢钠测序法能明显减少非特异性扩增,提高PCR效率,更适于基因甲基化状态的检测。(本文来源于《华中科技大学学报(医学版)》期刊2006年03期）
亚硫酸氢盐测序法论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
目的探讨改进的亚硫酸氢盐测序法在上皮钙黏蛋白甲基化检测中的可行性。方法提取雄性F344大鼠肾脏组织基因组DNA,亚硫酸氢盐化学转化,通过PCR扩增上皮钙黏蛋白基因启动子区特定的序列,以蓝白克隆斑筛选和测序。结果雄性F344大鼠肾脏上皮钙黏蛋白基因启动子区CpG岛的26个CpG位点均未发生甲基化。结论改进后亚硫酸氢盐测序法能明显减少非特异性扩增,提高PCR效率,更适于基因甲基化状态的检测。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
亚硫酸氢盐测序法论文参考文献
[1].晏建国,付海英,沈建箴,周华蓉,张媛媛.重亚硫酸氢盐测序法检测Wnt信号通路抑制基因在急性早幼粒细胞白血病细胞中甲基化变化[J].中国实验血液学杂志.2016
[2].廖静,鲁文清,刘渠,谢显清,李小峰.亚硫酸氢盐测序法检测上皮钙黏蛋白甲基化的优化探讨[J].检验医学与临床.2016
[3].陈静.染色体免疫共沉淀结合重亚硫酸氢盐测序技术分析UHRF1在肿瘤细胞中结合DNA序列的特征[D].华东师范大学.2015
[4].汪艳杰,龙鸿,姚家玲.亚硫酸氢钠测序法检测水稻FIE基因CpG岛甲基化状态[J].植物科学学报.2011
[5].储成风,汪存利,习海涛,刘亚,陶勇.亚硫酸氢盐测序法检测小鼠胚胎Oct4启动子区甲基化[J].安徽农业大学学报.2007
[6].陈立军,王玮,于利人,倪虹,呼文亮.亚硫酸氢盐-基因组测序法在检测基因异常甲基化中的应用[J].中国肿瘤临床.2006
[7].张莉君,王先良,孙晞,徐顺清.改进的亚硫酸氢钠测序法检测HepG2RASSF1A基因CpG岛甲基化状态[J].华中科技大学学报(医学版).2006
标签：重亚硫酸氢盐测序法; Wnt信号通路抑制基因; 基因甲基化; 急性早幼粒细胞白血病;