本文主要研究内容
作者苏水秀,吴建华,方颖（2019）在《β3整合素/Talin F3复合物拉伸分子动力学模拟》一文中研究指出：目的血小板上β3整合素作为膜上重要的信号分子,以独特的转导通路双向传递跨膜信号,在血小板凝止血功能的发挥中起着重要的作用。通常在Inside-out通路中,Talin在PIP3激酶的作用下与β3整合素结合,并桥接actin以力-化学偶联的调控机制诱导整合素的活化。研究β3整合素与Talin F3复合物在不同受力状态下的构象变化和力学稳定性,揭示其分子动力学机制,对深入了解Talin介导的整合素活化的结构基础有重要意义。方法从晶体结构（PDB:1MK7）出发,构建整合素β3/Talin F3复合物的分子体系,利用VMD软件添加水框,采用周期性边界条件、CHARMM22力场,以NAMD 2.13软件对体系施行热平衡、恒速度拉伸分子动力学模拟;选取拉伸过程中对应的不同受力构象进行恒力拉伸模拟,分析比较不同拉伸情况下的构象稳定性、氢键网络变化。结果恒速拉伸过程中,复合物表现出两种不同的解离状态,其在断裂力、断裂时间和断裂方式上存在明显差异,氢键Asp740-Arg359在抗拉力解离过程中发挥了关键作用。在小于60 PN的低力拉伸下,复合物表现为逆锁键,解离概率随力的增加而降低,氢键数目、结合面SASA值则逐步上升,当力大于60 PN,表现为滑移键,其中残基Ala742、Asn744、Tyr747在力稳定性调控中扮演重要角色。结论:整合素β3/Talin F3复合物结合亲和力存在双相力依赖特性,不同的恒力可以诱导出具有不同亲和力的复合物构象,适当力的施加有利于提高β3整合素与Talin的结合亲和力。
Abstract
mu de xie xiao ban shang β3zheng ge su zuo wei mo shang chong yao de xin hao fen zi ,yi du te de zhuai dao tong lu shuang xiang chuan di kua mo xin hao ,zai xie xiao ban ning zhi xie gong neng de fa hui zhong qi zhao chong yao de zuo yong 。tong chang zai Inside-outtong lu zhong ,Talinzai PIP3ji mei de zuo yong xia yu β3zheng ge su jie ge ,bing qiao jie actinyi li -hua xue ou lian de diao kong ji zhi you dao zheng ge su de huo hua 。yan jiu β3zheng ge su yu Talin F3fu ge wu zai bu tong shou li zhuang tai xia de gou xiang bian hua he li xue wen ding xing ,jie shi ji fen zi dong li xue ji zhi ,dui shen ru le jie Talinjie dao de zheng ge su huo hua de jie gou ji chu you chong yao yi yi 。fang fa cong jing ti jie gou （PDB:1MK7）chu fa ,gou jian zheng ge su β3/Talin F3fu ge wu de fen zi ti ji ,li yong VMDruan jian tian jia shui kuang ,cai yong zhou ji xing bian jie tiao jian 、CHARMM22li chang ,yi NAMD 2.13ruan jian dui ti ji shi hang re ping heng 、heng su du la shen fen zi dong li xue mo ni ;shua qu la shen guo cheng zhong dui ying de bu tong shou li gou xiang jin hang heng li la shen mo ni ,fen xi bi jiao bu tong la shen qing kuang xia de gou xiang wen ding xing 、qing jian wang lao bian hua 。jie guo heng su la shen guo cheng zhong ,fu ge wu biao xian chu liang chong bu tong de jie li zhuang tai ,ji zai duan lie li 、duan lie shi jian he duan lie fang shi shang cun zai ming xian cha yi ,qing jian Asp740-Arg359zai kang la li jie li guo cheng zhong fa hui le guan jian zuo yong 。zai xiao yu 60 PNde di li la shen xia ,fu ge wu biao xian wei ni suo jian ,jie li gai lv sui li de zeng jia er jiang di ,qing jian shu mu 、jie ge mian SASAzhi ze zhu bu shang sheng ,dang li da yu 60 PN,biao xian wei hua yi jian ,ji zhong can ji Ala742、Asn744、Tyr747zai li wen ding xing diao kong zhong ban yan chong yao jiao se 。jie lun :zheng ge su β3/Talin F3fu ge wu jie ge qin he li cun zai shuang xiang li yi lai te xing ,bu tong de heng li ke yi you dao chu ju you bu tong qin he li de fu ge wu gou xiang ,kuo dang li de shi jia you li yu di gao β3zheng ge su yu Talinde jie ge qin he li 。
论文参考文献
论文详细介绍
论文作者分别是来自医用生物力学的苏水秀,吴建华,方颖，发表于刊物医用生物力学2019年S1期论文，是一篇关于分子动力学模拟论文,整合素论文,结合亲和力论文,医用生物力学2019年S1期论文的文章。本文可供学术参考使用，各位学者可以免费参考阅读下载，文章观点不代表本站观点，资料来自医用生物力学2019年S1期论文网站，若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权，请联系我们删除。
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