导读:本文包含了蛋白质的标记与定量论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献，主要关键词:糖尿病肾病,早期,尿液,蛋白质组学
蛋白质的标记与定量论文文献综述
覃保瑜,刘红,黄鸿,姚彦冰,方丹[1]（2019）在《非标记定量蛋白质组技术筛选早期糖尿病肾病大鼠的尿蛋白标志物》一文中研究指出目的利用非标记定量蛋白质组技术筛选早期糖尿病肾病(DN)大鼠的尿蛋白标志物。方法将16只大鼠随机均分为正常对照组和糖尿病模型组,采用链脲佐菌素建立糖尿病模型。将糖尿病大鼠成模前、成模后1周、成模后24周分别设为非糖尿病(ND)期、正常白蛋白尿(NA)期、微量白蛋白尿(MA)期,收集各期尿液标本。将尿标本超滤离心和浓缩后,十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳粗分离尿样品的蛋白,行液相色谱-电喷雾电离串联质谱,以非标记定量蛋白质组技术筛选出差异表达的尿蛋白。采用酶联免疫吸附法对感兴趣的尿蛋白作确认。对比MA期糖尿病大鼠和正常对照组大鼠的光镜下肾组织结构。结果与NA期比较,MA期表达显着上调的蛋白质共15个,表达显着下调的蛋白质共12个。选取尿胎球蛋白A进行确认,糖尿病大鼠MA期的尿胎球蛋白A/尿肌酐水平均高于NA期、ND期(均P<0.05)。光镜下MA期大鼠肾组织呈早期DN病理改变。结论应用非标记定量蛋白质组技术可筛选出早期DN大鼠的差异表达尿蛋白,其中尿胎球蛋白A或可作为早期DN的诊断标志物。(本文来源于《广西医学》期刊2019年16期）
潘丽萍,孙会姗,贾红彦,杜博平,魏荣荣[2]（2019）在《非标记定量蛋白质组学鉴别结核性胸腔积液和恶性胸腔积液特异蛋白分子标识的研究》一文中研究指出目的研究结核性胸腔积液和恶性胸腔积液的差异蛋白谱,寻找能够实现结核性胸腔积液和恶性胸腔积液鉴别诊断的特异蛋白分子标识。方法募集结核性胸腔积液(TBPE)患者以及年龄性别匹配的恶性胸腔积液(MPE)患者各5例,应用非标记(Lable-free)定量蛋白质组学技术检测胸腔积液蛋白表达谱。Western blot验证定量蛋白组学检测准确性,ELISA技术验证组间差异蛋白表达,两组间差异分析采用t检验。受试者工作特征曲线(ROC)分析差异蛋白鉴别诊断结核性胸腔积液和恶性胸腔积液的意义。(本文来源于《中华医学会结核病学分会2019年全国结核病学术大会论文汇编》期刊2019-06-12）
安东,袁正伟[3]（2019）在《利用同位素标记相对和绝对定量技术筛查神经管畸形胚胎孕鼠血清差异蛋白质谱》一文中研究指出目的筛查神经管畸形相关血清标记物,为阐明神经管畸形的发病机制提供理论依据。方法应用维甲酸在大鼠神经管闭合的关键期(孕10 d,E10)给药,建立脊柱裂大鼠模型,选取致畸早期孕11、13 d (E11、E13)显性脊柱裂胚胎孕鼠和正常胚胎孕鼠血清各5例,应用同位素标记相对和绝对定量技术(iTRAQ)和液相色谱质谱鉴定技术分析2组蛋白质,定量信息以蛋白的丰度比差异倍数1.5倍以上(P <0.05)为差异蛋白质。结果质谱共得到谱图157 422张,鉴定出390种蛋白质,发现E11维甲酸致畸组与正常对照组差异蛋白40种,E13维甲酸致畸组与正常对照组差异蛋白26种。结论筛选出致畸早期大量神经管畸形和正常孕鼠血清差异蛋白,差异蛋白通过直接或间接相互作用,促进或抑制神经管畸形的发生与发展。(本文来源于《中国医科大学学报》期刊2019年04期）
皮闻森,刘家明,黄山虎[4]（2019）在《运用无标记定量蛋白质组学技术分析AURKB介导骨肉瘤恶性表型的分子机制》一文中研究指出目的通过无标记定量蛋白质组学技术检测沉默Aurora-B(AURKB)的骨肉瘤(OS)细胞蛋白表达水平的变化,找出关键的差异蛋白,并对AURKB促进OS恶性表型的潜在分子机制进行分析预测。方法根据编码AURKB基因的人mRNA序列(NM004217),在线设计针对AURKB mRNA的shRNA(invitrogen.com/rnai),构建重组慢病毒载体,获得Lv-shAURKB和阴性对照慢病毒(Lv-negative)。分别转染143BOS细胞,筛选稳定细胞株。运用无标记定量蛋白组学技术分析差异表达的蛋白,使用pheatmap软件包构建聚类分析热图,使用ggplot2软件构建火山图,运用Blast2GO v.4和KOBAS分别进行GO功能分析和KEGG通路富集分析,并使用STRING分析构建PPI网络。结果筛选的差异蛋白有105个。GO功能分析结果显示:差异蛋白主要参与单生物体细胞器组织和细胞骨架组织的生物学过程(BP);发挥RNA结合和肌动蛋白依赖性ATP酶活性的分子功能;主要定位于细胞质和膜界限的细胞器。KEGG通路富集分析显示:差异蛋白富集的主要信号通路为肌动蛋白细胞骨架的调节。PPI网络图中枢纽蛋白包括ACTN4、TPR和ACLY。结论 Rho/ROCH-ACTN4信号通路、TRP/ERK/NF-κβ信号通路和PI3K/Akt-(SREBP-1)-ACLY/FASN信号通路可能在AURKB介导的OS恶性表型中发挥重要作用。(本文来源于《重庆医学》期刊2019年08期）
马维兴[5]（2018）在《稳定同位素标记氨基酸细胞培养技术在冷激细菌定量蛋白质组学的应用研究》一文中研究指出本课题用相对定量蛋白质组学的方法,对经过2周冷激后的副溶血性弧菌和迟钝爱德华氏菌的蛋白质组发生的具体变化进行比对,并对变化可能产生的潜在危害从定量蛋白质组学的层面进行分析。使用的技术是稳定同位素标记氨基酸细胞培养技术结合高分辨同位素比质谱(SILAC-MS),与传统化学方法或非标记方法相比,SILAC-MS最大限度地降低了误差,结果更加精确。同时用mRNA水平定量分析和基因时间过程表达分析作为定量蛋白质组分析的辅助认证手段。另外,对细胞低温损伤修复也进行了研究,并尝试开发稳定同位素标记培养基的最优配方。副溶血性弧菌的定量蛋白质组分析中,共鉴定1182个蛋白质,其中定量601个蛋白质(根据表达变化大于50%的规则,51个蛋白质表达明显上调,129个蛋白质表达明显下调)。其中过氧化氢酶、芳香族氨基酸氨基转移酶和16S rRNA甲基转移酶上调表达排前叁位,但同时发现其对应的基因表达与蛋白质表达出现变化不一致的情况。谷氨酰胺合成酶、天冬酰胺合成酶、多核苷酸磷酸化酶以及与磷酸戊糖途径相关的一些关键酶类冷激后表达都发生了上调,磷酸葡萄糖转移酶系统活跃。而与DNA合成、糖酵解、叁羧酸循环、转录和翻译相关的蛋白质表达下调。并发现冷激后副溶血性弧菌血清学反应异常。迟钝爱德华氏菌的定量蛋白质组分析中,共鉴定1391个蛋白质,其中定量898个蛋白质(根据表达变化大于50%的规则,72个蛋白质表达明显上调,164个蛋白质表达明显下调)。即使迟钝爱德华氏菌不是嗜冷菌,但是与DNA合成(DNA回旋酶、ATP合酶、DNA拓扑异构酶和DNA错配修复蛋白)、转录(RNA聚合酶和转录修复偶联因子)、糖酵解(果糖1,6-二磷酸酶和3-磷酸甘油醛脱氢酶)、乙醛酸循环(乙醛酸羟基丙酮还原酶)、毒力(氢化酶、乳酸通透酶和外膜蛋白A)和抗逆性(DNA饥饿/固定相保护蛋白和通用应激蛋白)相关蛋白质发生了明显上调;即使本研究中的迟钝爱德华氏菌ATCC 15947在水产行业中是不致病或条件致病菌,但是与溶血素激活(对哺乳动物有致病性)和糖异生相关的蛋白质依然发生了明显的上调。另外,膜蛋白中的氨基酸组成也因低温而发生了改变。根据质谱结果,副溶血性弧菌和迟钝爱德华氏菌在长时间冷激之后,与菌体的抗逆性提升和菌体自我环境适应能力提升的蛋白质表达都会上调,我们认为这些蛋白质的上调与造成水产品和人类健康的潜在风险应该具有一定的关联性。多数下调的蛋白质,都能达到使菌体能量储存和自我保护的目的,从而应对不利的外界环境。本研究通过蛋白质组相对定量手段,呈现了经冷激后的副溶血性弧菌和迟钝爱德华氏菌的蛋白质组发生的具体变化倍数,并对变化可能产生的潜在风险从蛋白质组水平上进行了初步分析,为今后的蛋白质组分析提供参考依据。细胞低温损伤修复时,TCBC(选择性培养基)中加入丙酮酸盐可以增强副溶血性弧菌修复能力,丙酮酸盐浓度为0.5%时,修复效率最高,达到52%;在TSA(非选择性培养基)中加入过氧化氢酶可以增强迟钝爱德华氏菌修复能力,过氧化氢酶浓度为50 U/mL时,修复效率最高,达到26%。稳定同位素培养基研制时,两种菌都以(NH_4)_2SO_4和NH_4Cl作为唯一氮源,葡萄糖和乙酸钠作为碳源,其他成分包括KH_2PO_4、K_2HPO_4、MgSO_4和NaCl保持不变,设计五因素四水平正交试验。通过直观分析、方差分析和效应曲线发现:副溶血性弧菌最优配方是3 g/L(NH_4)_2SO_4、2 g/L NH_4Cl和10 g/L葡萄糖,~(15)N标记培养基和未做标记培养基为2 g/L NH_4Cl、10 g/L葡萄糖、0.6 g/L KH_2PO_4、0.9g/L K_2HPO_4、0.2 g/L MgSO_4和20 g/L NaCl;迟钝爱德华氏菌最优配方是3 g/L(NH_4)_2SO_4,3 g/L NH_4Cl和10 g/L葡萄糖,~(15)N标记培养基和未做标记培养基为3g/L(NH_4)_2SO_4或3 g/L NH_4Cl、10 g/L葡萄糖、0.6 g/L KH_2PO_4、0.9 g/L K_2HPO_4、0.2 g/L MgSO_4和20 g/L NaCl。(本文来源于《青岛科技大学》期刊2018-11-29）
翟兴月,王庆辉,赵冠华,李伟,佟长青[6]（2019）在《非标记定量蛋白质组方法分析鲟鱼肽抗D-半乳糖导致的小鼠衰老作用的研究》一文中研究指出为了研究鲟鱼肽抗衰老作用机制,利用非标记定量蛋白质组方法对去除高丰度蛋白后的灌胃鲟鱼肽小鼠血清进行蛋白质组分析。分析结果表明,从去除高丰度蛋白后的血清中共获得442种蛋白,其参与21个生理过程,具有7类分子功能,存在于10个细胞组分中。将模型组与治疗组进行t-test分析,得到3个差异表达蛋白质。在进行生物信息学分析时,通过扩大筛选范围,又增加了6种蛋白质,其中二磷酸甘油酸变位酶(AC:P15327)、载脂蛋白D(AC:P51910)、黄素还原酶(AC:Q923D2)和过氧化物酶-2(AC:Q61171)的上调以及巯基氧化酶1(AC:Q8BND5)的下调可以提高机体清除自由基的能力。这些数据表明,鲟鱼肽抗衰老能力是通过提高机体清除自由基的作用来发挥的。(本文来源于《食品工业科技》期刊2019年03期）
李敏[7]（2018）在《非标记定量蛋白质组学研究胰高血糖素在结直肠癌中的作用机制》一文中研究指出目的:在全世界范围内,结直肠癌(Colorectal cancer,CRC)占据癌症发病率和死亡率第叁位。目前在临床上,面临着个性化诊治、预测治疗结果和评估疾病预后等问题,因此,急需新颖和具体的生物标志物来提高疾病早期诊断的效果和改善患者预后。需要进一步研究生物标志物在结直肠癌进展中的机制和生物学功能。方法:在本研究中,通过非标记质谱(massspectrometry,MS)方法,进行结直肠癌和匹配的正常粘膜组织蛋白质组学分析,以寻找参与结直肠癌的发生发展的新靶点。通过蛋白质印迹和免疫组织化学验证差异表达的蛋白质。使用实时细胞分析仪和全内反射荧光显微镜研究细胞增殖迁移和细胞膜下l00nm内荧光变化,研究胰高血糖素在结直肠癌发生发展中的作用。结果:在六对结直肠癌组织中,共鉴定出169个显着差异表达的蛋白质。膜联蛋白 4(AnnexinA4,ANXA4),磷酸甘油酸激酶 l(phosphoglycerate kinase 1,PGK)和鸟苷叁磷酸结合核蛋白(RAs-relatedNuclear,RAN)在结直肠癌组织中上调,比正常结直肠癌症组织表达高1.95,2.27和2.22倍。鸟苷叁磷酸合成酶a亚基(ATP synthase subunit alpha，A-TP5A),钙网蛋白(calreticulin，CALR),钙调素依赖性蛋白激酶II(calmodulin-dependent protein kinase II,CAMKII)和胰高血糖素(Glucagon,GCG)的表达在结直肠癌中显着降低癌症组织相比蛋白表达高2.00,1.76,1.84和1.92倍(P<0.05)。此外,通过使用实时细胞检测技术,研究发现胰高血糖素抑制结直肠癌细胞的增殖和迁移,在给予胰高血糖素药物50h后,相比对照组,胰高血糖素抑制结直肠癌细胞增殖 2.1 倍(SW480),1.4 倍(CT26);迁移 1.4 倍(SW480),1.9 倍(CT26),腺苷酸环化酶(adenylate cyclase,AC)抑制剂(2'5'-dideoxyadenosine,DDA)减轻了胰高血糖素对结直肠癌细胞抑制作用,进一步通过全内角反射荧光实验发现胰高血糖素激活AC,进一步激活钙库操作性钙离子通道(The store-operated Ca2+ entry,SOCE)并刺激结直肠癌细胞中的基质相互作用分子(stromal interactionmolecules,STIM1)易位,产生与环匹阿尼酸(cyclic adenosine monophosphate,CPA)类似的效应。结论:在结直肠癌进展中,胰高血糖素主要参与了第二信使cAMP/Ca2+信号转导途径,抑制结直肠癌细胞增殖和迁移,因此可能被用作治疗结直肠癌的新靶点。(本文来源于《滨州医学院》期刊2018-05-25）
余焙佳,蔡理,赵晓峰,陈恩生,左芳芳[8]（2018）在《叁水白虎汤干预类风湿关节炎滑膜成纤维细胞的全蛋白TMT标记定量蛋白质组学研究》一文中研究指出目标:利用TMT标记定量蛋白质组学技术,对经叁水白虎汤处理后的人类风湿滑膜成纤维细胞(h-RASFs)样本中包含定量信息的蛋白质进行了系统的生物信息学分析,以期对叁水白虎汤(SSBH)的蛋白质组学研究及作用机制探讨提供参考方向。方法:将h-RASFs分为10%SSBH、20%SSBH、20%NS叁组,每组重复3次。利用蛋白提取技术分别提取各组总蛋白,通过将TMT标记、高效液相色谱分级技术以及基于质谱的定量蛋白质组学技术的有机结合,对h-RASFs样本进行蛋白组学定量,并对包含定量信息的蛋白质进行蛋白功能分类、富集分析及聚类分析。结果:(1)本项研究一共鉴定到5403个蛋白质,其中4371个蛋白质包含定量信息。以1.2倍为变化阈值,p<0.05为标准,在定量到的蛋白质中,20SSBH/NS比较组中147个蛋白表达发生上调,379个蛋白表达发生下调(其他比较组差异蛋白结果见表1);(2)G0功能分类:20%SSBH与20%NS相比,差异表达蛋白在连接、催化活性、转运蛋白活性、结构分子活性、分子转导活性、信号传感器活性及转录因子活性,蛋白质结合等分子功能分布情况中,下调蛋白较上调蛋白分布多,而上调蛋白还涉及核酸结合转录因子活性的功能,下调蛋白则涉及电子载体活性、抗氧化活性的功能。(3)GO分子功能富集:20%SSBH与20%NS相比,上调蛋白在染色体组织、细胞周期、染色体分离、从RNA聚合酶Ⅱ启动子转录延伸、正常调控DNA模板转录延长以及来自RNA聚合酶Ⅱ启动子的转录延伸的正调控等富集程度较高,而下调蛋白在呼吸电子传输链、电子传输链、氧化磷酸化、ATP合成耦合电子传递、线粒体ATP合成耦合电子传递及ATP代谢过程等代谢过程中富集程度高。(4)KEGG富集分析:20%SSBH与20%NS相比,上调蛋白在基础转录因子通路和核糖体通路中富集程度较高,而下调蛋白在氧化磷酸化、阿尔茨海默病、帕金森病、非酒精性脂肪肝病(NAFLD)、亨廷顿病等通路富集程度高。结论:利用TMT标记定量蛋白质组学技术,能充分有效地分析叁水白虎汤对类风湿关节炎滑膜成纤维细胞干预过程中所涉及的特异性肽段、蛋白,并揭示它对这些蛋白的影响,可获得较为丰富的生物学信息,能为更深入的蛋白质组学研究和机制探讨提供方向。(本文来源于《第十六届中国中西医结合风湿病学术年会论文集》期刊2018-03-30）
姜翠翠,吕晓磊,吴迪,李杨,董宇升[9]（2018）在《稳定同位素标记试剂DiART在蛋白质组中的定量特征研究》一文中研究指出等重同位素标记方法,如同位素标记相对和绝对定量(iTRAQ),可以对肽段进行化学标记,之后通过质谱分析得到的报告离子的强度信息而实现对肽段的定量.目前,这种标记技术在定量蛋白质组学研究中有广泛应用.DiART也是一种等重同位素标记方法,且与iTRAQ的定量原理类似,但是其化学结构组成与iTRAQ有所不同,因而其定量特征有其独特表现.本研究通过对DiART标记的简单蛋白样品、复杂蛋白样品以及复杂样品中目标蛋白的定量情况进行了分析,从而对DiART的定量特征进行了研究,并同时与iTRAQ进行了比较.结果表明,DiART方法在定量稳定性、准确性及动态范围方面均更具优势.(本文来源于《中国科学:生命科学》期刊2018年02期）
王庆辉,李欣遥,孙悦,李伟,佟长青[10]（2018）在《非标记定量蛋白质组方法分析牡蛎多糖抗D-半乳糖导致的小鼠衰老作用》一文中研究指出目的研究牡蛎多糖抗衰老作用机制。方法利用非标记定量蛋白质组方法分析牡蛎多糖抗衰老作用机制。将去除高丰度蛋白后的小鼠血清样本经酶解后进行LC-MS/MS分析,利用Maxquant软件(版本号1.3.0.5)查库,进行LFQ非标定量分析。结果本研究共鉴定到4 624个肽段,541个蛋白质。将模型组与牡蛎多糖治疗组进行t-test分析,得到20个差异表达蛋白质。对在小鼠数据库中查找到的19个差异蛋白质进行分析,发现这些差异蛋白质参与15个生物过程、具有8类分子功能、存在于5个细胞组分中(Level 2)。这些差异表达蛋白质中,peroxiredoxin-2(AC:Q61171)和malate dehydrogenase(AC:P14152)的上调以及xanthine dehydrogenase/oxidase(AC:Q00519)的下调可以提高机体清除自由基的能力,降低NO数量。结论牡蛎多糖是通过提高机体清除自由基的能力来发挥其抗衰老作用的。(本文来源于《中国海洋药物》期刊2018年01期）
蛋白质的标记与定量论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
目的研究结核性胸腔积液和恶性胸腔积液的差异蛋白谱,寻找能够实现结核性胸腔积液和恶性胸腔积液鉴别诊断的特异蛋白分子标识。方法募集结核性胸腔积液(TBPE)患者以及年龄性别匹配的恶性胸腔积液(MPE)患者各5例,应用非标记(Lable-free)定量蛋白质组学技术检测胸腔积液蛋白表达谱。Western blot验证定量蛋白组学检测准确性,ELISA技术验证组间差异蛋白表达,两组间差异分析采用t检验。受试者工作特征曲线(ROC)分析差异蛋白鉴别诊断结核性胸腔积液和恶性胸腔积液的意义。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
蛋白质的标记与定量论文参考文献
[1].覃保瑜,刘红,黄鸿,姚彦冰,方丹.非标记定量蛋白质组技术筛选早期糖尿病肾病大鼠的尿蛋白标志物[J].广西医学.2019
[2].潘丽萍,孙会姗,贾红彦,杜博平,魏荣荣.非标记定量蛋白质组学鉴别结核性胸腔积液和恶性胸腔积液特异蛋白分子标识的研究[C].中华医学会结核病学分会2019年全国结核病学术大会论文汇编.2019
[3].安东,袁正伟.利用同位素标记相对和绝对定量技术筛查神经管畸形胚胎孕鼠血清差异蛋白质谱[J].中国医科大学学报.2019
[4].皮闻森,刘家明,黄山虎.运用无标记定量蛋白质组学技术分析AURKB介导骨肉瘤恶性表型的分子机制[J].重庆医学.2019
[5].马维兴.稳定同位素标记氨基酸细胞培养技术在冷激细菌定量蛋白质组学的应用研究[D].青岛科技大学.2018
[6].翟兴月,王庆辉,赵冠华,李伟,佟长青.非标记定量蛋白质组方法分析鲟鱼肽抗D-半乳糖导致的小鼠衰老作用的研究[J].食品工业科技.2019
[7].李敏.非标记定量蛋白质组学研究胰高血糖素在结直肠癌中的作用机制[D].滨州医学院.2018
[8].余焙佳,蔡理,赵晓峰,陈恩生,左芳芳.叁水白虎汤干预类风湿关节炎滑膜成纤维细胞的全蛋白TMT标记定量蛋白质组学研究[C].第十六届中国中西医结合风湿病学术年会论文集.2018
[9].姜翠翠,吕晓磊,吴迪,李杨,董宇升.稳定同位素标记试剂DiART在蛋白质组中的定量特征研究[J].中国科学:生命科学.2018
[10].王庆辉,李欣遥,孙悦,李伟,佟长青.非标记定量蛋白质组方法分析牡蛎多糖抗D-半乳糖导致的小鼠衰老作用[J].中国海洋药物.2018