杜文丽:基于Illumina HiSeq 2500测序技术对高温胁迫下苦瓜叶片转录组特性分析论文

杜文丽:基于Illumina HiSeq 2500测序技术对高温胁迫下苦瓜叶片转录组特性分析论文

本文主要研究内容

作者杜文丽,陈中钐,许端祥,高山,温庆放(2019)在《基于Illumina HiSeq 2500测序技术对高温胁迫下苦瓜叶片转录组特性分析》一文中研究指出:高温胁迫时影响苦瓜作物产量及地域分布的重要限制因子,但由于其在非生物胁迫逆境方面的生物学信息研究进展较慢,这在一定程度上制约了苦瓜分子育种及品种改良工作。利用Illumina HiSeqTM2500高通量测序平台对高温胁迫处理前后的苦瓜叶片进行转录组测序,结果组装获得平均长度为700.75 bp共89 757条有效Unigene,N50长度达到1 239 bp;有48 662条Unigene获得注释信息,占全部Unigene的54.2%,与未处理的对照相比,共有2 254差异表达基因,其中672个上调,1 582下调表达。有27 116条Unigene能够注释到GO数据库,获得包含于细胞组分、分子功能和生物学过程三大类内共135 967个GO的功能注释,并且差异表达基因的GO功能注释分类情况大致与之相似。进一步筛选到可能与高温胁迫相关的基因,包括HSP,HSF等家族基因。本研究是首次对高温胁迫下的苦瓜叶片转录组进行分析,为进一步开展苦瓜耐高温分子生物学层面研究提供大量参考信息。

Abstract

gao wen xie pai shi ying xiang ku gua zuo wu chan liang ji de yu fen bu de chong yao xian zhi yin zi ,dan you yu ji zai fei sheng wu xie pai ni jing fang mian de sheng wu xue xin xi yan jiu jin zhan jiao man ,zhe zai yi ding cheng du shang zhi yao le ku gua fen zi yo chong ji pin chong gai liang gong zuo 。li yong Illumina HiSeqTM2500gao tong liang ce xu ping tai dui gao wen xie pai chu li qian hou de ku gua xie pian jin hang zhuai lu zu ce xu ,jie guo zu zhuang huo de ping jun chang du wei 700.75 bpgong 89 757tiao you xiao Unigene,N50chang du da dao 1 239 bp;you 48 662tiao Unigenehuo de zhu shi xin xi ,zhan quan bu Unigenede 54.2%,yu wei chu li de dui zhao xiang bi ,gong you 2 254cha yi biao da ji yin ,ji zhong 672ge shang diao ,1 582xia diao biao da 。you 27 116tiao Unigeneneng gou zhu shi dao GOshu ju ku ,huo de bao han yu xi bao zu fen 、fen zi gong neng he sheng wu xue guo cheng san da lei nei gong 135 967ge GOde gong neng zhu shi ,bing ju cha yi biao da ji yin de GOgong neng zhu shi fen lei qing kuang da zhi yu zhi xiang shi 。jin yi bu shai shua dao ke neng yu gao wen xie pai xiang guan de ji yin ,bao gua HSP,HSFdeng jia zu ji yin 。ben yan jiu shi shou ci dui gao wen xie pai xia de ku gua xie pian zhuai lu zu jin hang fen xi ,wei jin yi bu kai zhan ku gua nai gao wen fen zi sheng wu xue ceng mian yan jiu di gong da liang can kao xin xi 。

论文参考文献

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  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自分子植物育种的杜文丽,陈中钐,许端祥,高山,温庆放,发表于刊物分子植物育种2019年02期论文,是一篇关于苦瓜论文,高温胁迫论文,测序论文,差异表达基因论文,分子植物育种2019年02期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自分子植物育种2019年02期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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