导读:本文包含了等位特异性论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献，主要关键词:聚合酶,基因多态性,SNP,等位基因特异性引物延伸法
等位特异性论文文献综述
陈载鑫,何丹,谢岭平,李柳燕,许红丽[1]（2019）在《两种聚合酶在等位基因特异性引物延伸法检测SNP中的应用比较》一文中研究指出目的比较TaqTMHotStarDNA聚合酶和TspTMPlatinum DNA聚合酶在等位基因特异性引物延伸法检测SNP中的应用效果。方法取120例抗血栓治疗患者全血进行DNA提取、多重PCR扩增,将产物分2份,1份用TaqTMHotStarDNA聚合酶进行等位基因特异性引物延伸,1份用TspTMPlatinum DNA聚合酶进行等位基因特异性引物延伸,然后进行杂交反应,用Luminex 200系统检测CYP2C19基因多态性,同时将所有样本送第叁方进行基因测序。结果 TaqTMHotStarDNA聚合酶组检测结果与测序结果完全一致,TspTMPlatinum DNA聚合酶则会出现一些偏差,说明TaqTMHotStarDNA聚合酶参与的检测结果分辨率明显高于TspTMPlatinum DNA聚合酶参与的检测结果。结论两种聚合酶在等位基因特异性引物延伸法检测SNP中均可以取得一定的检测结果,但是为了结果的可靠性建议在检测过程中使用TaqTMHotStarDNA聚合酶。(本文来源于《泰山医学院学报》期刊2019年11期）
李娟,王丹丹,孔冉冉,田洪岭,张福生[2]（2019）在《汾远2号远志的rDNA ITS等位基因特异性PCR鉴别研究》一文中研究指出目的设计出鉴别汾远2号远志的特异性PCR引物,建立快速鉴别汾远2号远志的方法。方法利用植物核糖体DNA(r DNA)的内部转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)通用型引物扩增远志样品,并对所有样品进行双向测定,采用DNAMAN软件对远志样品r DNA ITS序列进行比对,找到汾远2号远志(Polygala tenuifolia,简称FY2)的等位基因差异位点,并利用NCBI网上已有的远志序列以及作者测序得到的卵叶远志(P. sibirica)序列和FY2序列比对,进行等位基因差异位点的验证。最后根据FY2的碱基差异位点,采用Primer 5. 0软件设计特异性PCR引物,用于FY2的特异性PCR鉴别。结果测序所得的序列与NCBI中远志的相似度高达99. 36%。找到了两个FY2的等位基因差异位点,第123位点为T,其余样品均为A,第553位点为T,其余样品均为C。设计了4对特异性PCR引物对FY2进行特异性PCR扩增,在约463 bp处出现单一的扩增条带,而其他远志及卵叶远志则无相应的扩增条带。结论等位基因特异性PCR能有效地从远志和卵叶远志药材中鉴别出汾远2号远志,具有准确、高效、灵敏、简便的特点。(本文来源于《山西医科大学学报》期刊2019年08期）
陈露露,黄光元,张丹丹,夏志辉[3]（2019）在《基于不等长引物等位特异性PCR的SNP检测方法》一文中研究指出为开发一种便捷的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)的检测方法,本研究以水稻的6种SNP变异形式(A/T, A/G, A/C, T/G, T/C, G/C)为研究对象,在下游引物为共用引物的情况下,首先设计两条长度相差20个核苷酸但3'末端分别与SNP两个等位差异碱基配对的常规上游引物。另外我们还评估在两条上游引物3'端的第2位或第3位碱基引入了错配碱基后观察对特异性的影响。结果表明,经3%的琼脂糖凝胶电泳后,不等长引物等位特异性PCR能区分不同的纯合子及杂合子,未引入错配碱基的引物只检测出A/T,C/G变异类型的SNP;而引物中引入错配碱基的等位PCR具有更高的检出效率,能检测出6种类型中的5种SNP。因此,本研究开发了一种成本低、操作简单、准确度高的SNP检测方法。(本文来源于《分子植物育种》期刊2019年13期）
戴豪杨,白雪,王建蒙,柴圆,付绍印[4]（2019）在《等位基因特异性表达形成机制及其应用的研究进展》一文中研究指出基因作为遗传信息的介质,决定了生物的性状表现。基因序列变异的发生是生物体适应环境变化的必然趋势。在二倍体生物中等位基因是一对控制着相对性状的基因,因此,等位基因特异性表达效应根据细胞类型和发育阶段的不同而变化,表现出不同个体之间的差异。等位基因差异表达对基因的表达起到重要的调控作用,并最终可能与生物的表型多态性联系起来。等位基因特异性表达分析已经在动物研究中得到广泛应用,有助于提高鉴定调控遗传变异的能力。对等位基因特异性表达的形成机制及其应用研究进展进行了综述,以期为进一步揭示等位基因特异性表达的遗传学机制,以及加快其在动物生产中的应用提供理论依据。(本文来源于《畜牧与饲料科学》期刊2019年06期）
解会群,赵玉姣,查良平,程铭恩,彭华胜[5]（2019）在《何首乌等位基因特异性PCR鉴别方法研究》一文中研究指出目的建立一种快速鉴别何首乌真伪的方法。方法通过何首乌及其混伪品的psb A-trn H基因序列,寻找SNP位点并设计特异性引物,对来自于不同产地的何首乌及其3个同属混伪品进行PCR扩增,优化反应体系条件,并对此方法进行考察。结果建立了何首乌特异性PCR的方法,在退火温度48℃、循环次数30时仅有何首乌能扩增得到191 bp的特异性条带,伪品则无。结论等位基因特异性PCR鉴别何首乌真伪方法简单、可靠。(本文来源于《中草药》期刊2019年04期）
李书亚,郜艳敏,胡亚赛,郝敏,齐浩[6]（2018）在《额外的错配碱基提高T4 DNA连接酶等位特异性连接（英文）》一文中研究指出连接是一种主要的DNA处理过程。由于较低的商业成本以及核酸底物识别的灵活性,T4DNA连接酶被广泛应用于生物分子工程,特别是特定核酸序列的等位特异性连接检测。本文评估了在T4 DNA连接酶介导的连接反应中,引入额外的错配碱基对所产生的影响。设计了超过150组DNA/DNA或DNA/RNA带有的额外错配碱基对的组合。结果发现,引入额外的错配碱基对后,T4 DNA连接酶在DNA/DNA连接中特异性可提高60倍以上,而在DNA/RNA连接中特异性只能提高2倍。在等位特异性连接中,有的错配碱基对可使T4 DNA连接酶的特异性提高600多倍。(本文来源于《中国生物化学与分子生物学报》期刊2018年08期）
董婧,逯晓萍,张坤明,薛春雷,张瑞霞[7]（2018）在《高丹草杂种及其亲本转录组SNP及等位基因特异性表达分析》一文中研究指出为探究高丹草杂种及其亲本间单核苷酸变异与其杂种优势形成的关系,以高丹草杂种及其亲本的根、茎和叶组织为试验材料,采用Illumina Hiseq 2000进行转录组测序。对平均长度达58 122 160 bp的各测序样品序列信息进行检测后,均检测到不少于58 000个SNP位点,位于基因内的SNP个数显着多于位于基因间的SNP个数, SNP发生频率为1/741bp,平均转换颠换比为1.00∶1.53。在所有变异类型中,C/T和G/A发生频率最高。经过筛选得到198(21%)个极显着偏向性等位基因表达偏向性SNP,其中65%偏向父本白壳苏丹草,并且很多在白壳苏丹草中具有高水平基因表达的转录本,在高丹草杂种中的等位基因表达也偏向白壳苏丹草。在3种组织中,分别有79%、78%和82%转录本的2个亲本等位基因表现出相对平衡的表达水平,说明与顺式作用相比,反式作用可能更多地影响了等位基因的特异性表达。选择6个极显着偏向性等位基因表达偏向性SNP-unigene进行qRT-PCR验证,这些基因的差异基因表达模式与RNA-Seq分析结果一致。本研究采用Illumina测序技术研究等位基因表达,为高丹草杂种优势分析提供了依据,也为其他饲草作物的相关研究提供了理论参考。(本文来源于《作物学报》期刊2018年12期）
郝世佳[8]（2018）在《人类N-RAS等位基因特异性Taqman Q-PCR的初步研究》一文中研究指出西妥昔单抗和帕尼单抗是表皮生长因子受体抑制剂,此类靶向治疗药物的出现,有效抑制了结直肠癌的发生发展,但西妥昔单抗和帕尼单抗的治疗受到EGFR下游RAS基因的影响,RAS突变型能自动活化通路并转导下游信号,所以只有RAS野生型患者才能对EGFR单抗的治疗产生良好效果。RAS突变中N-RAS突变仅占约2%,不容易受到研究重视,因此本文对N-RAS的突变检测进行研究。本文先通过N-RAS常见的17种突变位点,构建了N-RAS突变型和野生型的质粒,提取质粒后通过电泳观察条带颜色,颜色较亮,用nanodrop检测质粒浓度结果为40ng/μL。测序验证显示模板DNA序列与合成序列一致。采用Taqman探针荧光定量PCR技术,使用Primer Express 3.0软件设计野生型和突变型引物及探针,经过PCR反应体系优化后得出最佳反应体系的条件,引物终浓度为0.4μΜ/μL,探针终浓度为0.2μΜ/μL,模板DNA终浓度为1ng/μL,并以此建立单引物荧光定量PCR反应体系。单引物体系构建完成后分别用单引物验证其特异性,2号外显子12号密码子野生型模板荧光定量PCR的Ct值分别为:20.5456,20.0395,17.3253,17.5611,2号外显子13号密码子野生型模板荧光定量PCR的Ct值分别为26.2657,23.3040,26.7295,3号外显子61号密码子野生型模板荧光定量PCR的Ct值分别为27.2140,26.9111,21.9652,20.6787。在构建好的多引物体系中,,2号外显子12、13号外显子混合野生型模板荧光定量PCR的Ct值为18.027,3号外显子61号密码子野生型模板荧光定量PCR的Ct值为30.4719,以野生型Ct值为标准,进行突变型的荧光定量PCR,可根据Ct值的不同区分野生型和突变型。多引物体系进行以突变型DNA模板100%、10%、1%、0.1%、0系列浓度梯度进行灵敏度检测,数据结果显示可检测突变下限低于5%。通过已经构建的单引物荧光定量PCR突变检测体系,进一步构建多引物单引物荧光定量PCR突变检测体系,单引物荧光定量PCR体系用于多引物荧光定量PCR显示结果较好,所以采用引物终浓度为0.4μmol/μL,探针终浓度为0.2μM/μL,模板DNA终浓度为1ng/μL的PCR反应体系。(本文来源于《齐鲁工业大学》期刊2018-05-15）
王琼[9]（2018）在《通过等位基因特异性表达研究鸡转录组调控模式》一文中研究指出等位基因特异性表达(ASE)是一种来自父母双方的等位基因表达水平不一致的现象,表现为基因转录出的mRNA全部或大部分来自其中一个等位基因。利用等位基因特异性表达分析可以探索转录组中基因印记、性染色体剂量补偿和基因顺反调控等机制。印记现象是等位基因特异性表达的一种特殊情况,是指一些基因总是特定地表达来自父亲或者来自母亲的等位基因的一种亲源特异性的表达方式。剂量补偿效应指的是在生物基因组中,使性连锁基因在两种性别中有相等或近乎相等的有效剂量的遗传效应。真核生物转录水平的调控涉及顺式作用和反式作用,顺式作用元件组成基因转录的调控区,如启动子、增强子、沉默子、绝缘子,它们会导致等位基因有不同的mRNA表达量水平;反式作用因子能直接或间接识别或结合在各类顺式作用元件核心序列上,参与调控靶基因转录效率的蛋白质,也称转录因子,能够同时对两个等位基因产生影响。为了研究鸡基因组中这些机制,我们用白来航和科尼什作为实验材料,构建了四个家系:白来航和科尼什内部分别进行近交产生两个纯系,并且两品种进行杂交产生两个正反交家系。四个家系得到的后代提取大脑、肝脏和胸肌的RNA分别进行转录组测序,正反交家系的四个亲本提取DNA进行基因组重测序。通过重测序数据筛选出亲本之间的SNP,利用这些SNP鉴定后代RNA-seq中的reads来源于哪个亲本,再根据不同的研究目的进行一系列的统计检验以及验证实验。我们得到以下结论:在我们的筛选条件下,1日龄的鸡的大脑组织中,不存在基因印记现象;鸟类剂量补偿相对于哺乳动物来说相对微弱,能够容忍常染色体和性染色体之间剂量的不平衡以及雌雄个体之间Z染色体上基因剂量的不平衡,公鸡两条Z染色体上的等位基因表达量基本持平,不存在一条性染色体失活的现象;在叁个组织中,能够表达的基因中大部分表达量都是保守的,受到反式调控的基因要多于受到顺式调控的基因,在同时受到两种类型调控的基因中,大部分基因受两种类型调控方式的作用方向是相反的,说明在鸡的进化中,基因的表达量总是趋向于相互补偿从而达到平衡,受反式调控的基因序列较为保守,受到更为严格的选择。(本文来源于《中国农业大学》期刊2018-05-01）
蒋培基,王德良,徐东东,黄承雪,郭刚刚[10]（2018）在《基于竞争性等位基因特异性PCR技术的麦芽品种纯度定性和定量检测》一文中研究指出利用测序技术筛选和确认4个可以区分7种大麦麦芽的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)位点,并建立区分图谱。同时,利用竞争性等位基因特异性聚合酶链式反应检测技术对预混样品进行定量测试,其检测的结果与真实性之间相对误差小于3%。该技术的建立对大麦麦芽纯度检测提供方法,对大麦麦芽SNP指纹数据库的完善提供了数据支持。(本文来源于《食品科学》期刊2018年24期）
等位特异性论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
目的设计出鉴别汾远2号远志的特异性PCR引物,建立快速鉴别汾远2号远志的方法。方法利用植物核糖体DNA(r DNA)的内部转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)通用型引物扩增远志样品,并对所有样品进行双向测定,采用DNAMAN软件对远志样品r DNA ITS序列进行比对,找到汾远2号远志(Polygala tenuifolia,简称FY2)的等位基因差异位点,并利用NCBI网上已有的远志序列以及作者测序得到的卵叶远志(P. sibirica)序列和FY2序列比对,进行等位基因差异位点的验证。最后根据FY2的碱基差异位点,采用Primer 5. 0软件设计特异性PCR引物,用于FY2的特异性PCR鉴别。结果测序所得的序列与NCBI中远志的相似度高达99. 36%。找到了两个FY2的等位基因差异位点,第123位点为T,其余样品均为A,第553位点为T,其余样品均为C。设计了4对特异性PCR引物对FY2进行特异性PCR扩增,在约463 bp处出现单一的扩增条带,而其他远志及卵叶远志则无相应的扩增条带。结论等位基因特异性PCR能有效地从远志和卵叶远志药材中鉴别出汾远2号远志,具有准确、高效、灵敏、简便的特点。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
等位特异性论文参考文献
[1].陈载鑫,何丹,谢岭平,李柳燕,许红丽.两种聚合酶在等位基因特异性引物延伸法检测SNP中的应用比较[J].泰山医学院学报.2019
[2].李娟,王丹丹,孔冉冉,田洪岭,张福生.汾远2号远志的rDNAITS等位基因特异性PCR鉴别研究[J].山西医科大学学报.2019
[3].陈露露,黄光元,张丹丹,夏志辉.基于不等长引物等位特异性PCR的SNP检测方法[J].分子植物育种.2019
[4].戴豪杨,白雪,王建蒙,柴圆,付绍印.等位基因特异性表达形成机制及其应用的研究进展[J].畜牧与饲料科学.2019
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[8].郝世佳.人类N-RAS等位基因特异性TaqmanQ-PCR的初步研究[D].齐鲁工业大学.2018
[9].王琼.通过等位基因特异性表达研究鸡转录组调控模式[D].中国农业大学.2018
[10].蒋培基,王德良,徐东东,黄承雪,郭刚刚.基于竞争性等位基因特异性PCR技术的麦芽品种纯度定性和定量检测[J].食品科学.2018
标签：聚合酶; 基因多态性; SNP; 等位基因特异性引物延伸法;