导读:本文包含了鸟嘌呤胞嘧啶碱基对论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献，主要关键词:密度泛函理论,几何和电子结构,成键性质,金属-碱基复合物
鸟嘌呤胞嘧啶碱基对论文文献综述
候海丽[1]（2019）在《鸟嘌呤-尿嘧啶碱基对与铜银金相互作用的密度泛函理论研究》一文中研究指出最近研究人员制备了双核二价汞离子介入的碱基对复合物T-Hg_2~(Ⅱ)-A,并对其进行了实验表征。它们特殊的光学和离子加载特性意味着即将进入金属离子与碱基对复合物的多应用性时代。本文利用密度泛函理论对GUM_2~(—/0/2+)(G=鸟嘌呤,U=尿嘧啶,M=Cu,Ag和Au)和GUAu_n(n=1-10)的几何和电子结构,成键特性以及质子转移过程进行了研究。论文的主要研究内容如下:1.不同价态双核金属与鸟嘌呤-尿嘧啶碱基对:GUM_2~(—/0)(G=鸟嘌呤,U=尿嘧啶,M=Cu,Ag和Au)的密度泛函理论研究金属介入碱基对在超分子化学和纳米技术中已经受到相当多的关注。本文采用密度泛函理论研究了双核金属与鸟嘌呤尿嘧啶的中性与阴离子的电子结构和成键性质。在GUM_2~(—/0)中,鸟嘌呤与尿嘧啶异构体相互作用形成稳定的氢键,M_2更倾向与K-N9H鸟嘌呤中的N原子相互作用。在阴离子复合物中,M_2之间表现为弱相互作用并与尿嘧啶形成非常规氢键N-H???M和C-H???M。通过键级分析和AIM分析,结果表明在GUM_2中N···M之间为弱相互作用,M-M之间表现为强烈的单键。随后通过模拟光电子能谱发现中性的GUCu_2和GUAg_2可以稳定存在,而中性的GUAu_2的结构较不稳定,这还有待于进一步通过实验来验证这一理论。2.双核金属介入鸟嘌呤-尿嘧啶碱基对:GUM_2~(2+)(M=Cu,Ag和Au)离子的理论研究拥有d~(10)-d~(10)闭壳层相互作用的双核金属介入碱基对具有显着的稳定性。用密度泛函理论研究了GUM_2~(2+)(G=鸟嘌呤,U=尿嘧啶,M=Cu,Ag和Au)离子最低能量结构的几何结构和成键模式。在这些双核金属介入碱基对的低能量异构体中,尿嘧啶的2-氧-4-羟基-反式-N1H异构体是从尿嘧啶的标准互变异构物通过氢原子转移得到的。M_2~(2+)正离子仍然是一个完整的单元,并通过两组紧密线性的N-M-O单元与G···U配体相互作用,而摇摆碱基对(G-U)之间的氢键则完全被这些复合物中的M-N或M-O相互作用所取代。分子中的原子(AIM)和化学键自然轨道(EDA-NOCV)的计算真正揭示了GUM_2~(2+)阳离子中的σ相互作用主要部分是△E_(Orb)。得到金属-配体相互作用的瞬时相互作用能△E_(int)和键离解能(BDEs)随着键强度Cu≈Au>Ag的变化趋势而变化。3.金团簇与鸟嘌呤尿嘧啶碱基对:GUAu_n(n=1-10)的密度泛函理论研究本章主要研究金团簇与G···U配体相互作用的电子结构,并基于密度泛函理论建立了一个简单模型。在GUAu_n低能异构体中,当n≤4(除n=2),金团簇易与N3形成弱相互作用,并且与鸟嘌呤尿嘧啶处于共平面;当4<n≤10(除n=9),金团簇易与N7形成弱相互作用,与鸟嘌呤尿嘧啶形成一个二面角。本文还通过键长分析和电子结合能表明当Au原子团簇与G···U配体处于同平面时,表现出较强的亲电性质。通过理论研究旨在为科学实验做出理论支撑。(本文来源于《山西大学》期刊2019-06-01）
李敏杰,刁玲,寇莉,李重杲,陆文聪[2]（2015）在《羟基自由基和鸟嘌呤-胞嘧啶碱基对反应的密度泛函理论研究（英文）》一文中研究指出为了解决年龄衰老、基因突变和癌症等问题,理解DNA的氧化损伤机理非常重要.本文利用密度泛函方法和极化连续介质模型在液相条件下研究了羟基自由基夺取鸟嘌呤-胞嘧啶(GC)碱基对上5个氢原子的反应机理.研究结果表明,所有的脱氢反应路径都是放热过程,热力学上五个脱氢反应路径形成自由基的稳定性顺序是(H2b-GC)·>(GC-H4b)·>(GC-H6)·>(GC-H5)·~(H8-GC)·,其中H2b反应路径的能量变化最大,说明该反应平衡时的转化率最高.动力学上,相对于反应复合物的局部反应能垒大小顺序是H2b<H4b<H5<H6<H8,可以看出在H2b夺取路径中能垒最小,表明了该反应能在室温下迅速完成,和实验结果一致.综合考虑热力学和动力学方面的分析,发现H2b夺取反应最容易进行,次之是H4b夺取反应,然后是H6和H5.而H8的夺取反应很难发生,和实验观察到的8位加成产物现象一致.(本文来源于《物理化学学报》期刊2015年06期）
林月霞,王红艳,高思敏,吴颖曦,李汝虎[3]（2013）在《B型DNA中鸟嘌呤-胞嘧啶碱基对内双质子转移反应》一文中研究指出采用ONIOM(M06-2X/6-31G*:PM3)方法研究了单个鸟嘌呤-胞嘧啶(GC)碱基对和含GC碱基对的四种排序的DNA叁聚体(dATGCAT,dGCGCGC,dTAGCTA,dCGGCCG)的双质子转移反应.通过分析其双质子转移方式、质子转移过程中各结构的能量和氢键变化,总结出环境因素对GC碱基对双质子转移机理的影响.气相中,dCGGCCG叁聚体中发生分步双质子转移,其它四种模型中均发生协同双质子转移.分析发现质子转移方式受上下相邻碱基对的静电相互作用和质子接受位的质子亲和势影响,dATGCAT和dGCGCGC排序有助于质子H4a转移,而dTAGCTA和dCGGCCG排序有助于质子H1转移,胞嘧啶的N3位较高的质子亲和势有助于质子H1转移.水溶剂中,上下相邻碱基对的静电相互作用被减弱,水溶剂稳定了分步转移过程中的单质子转移产物,因此分步转移机理占据优势,五种模型中均出现分步双质子转移,在此过程中能量变化趋势相似.溶剂效应有利于单质子转移,却增加了双质子转移反应的反应能.(本文来源于《物理化学学报》期刊2013年06期）
鸟嘌呤胞嘧啶碱基对论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
为了解决年龄衰老、基因突变和癌症等问题,理解DNA的氧化损伤机理非常重要.本文利用密度泛函方法和极化连续介质模型在液相条件下研究了羟基自由基夺取鸟嘌呤-胞嘧啶(GC)碱基对上5个氢原子的反应机理.研究结果表明,所有的脱氢反应路径都是放热过程,热力学上五个脱氢反应路径形成自由基的稳定性顺序是(H2b-GC)·>(GC-H4b)·>(GC-H6)·>(GC-H5)·~(H8-GC)·,其中H2b反应路径的能量变化最大,说明该反应平衡时的转化率最高.动力学上,相对于反应复合物的局部反应能垒大小顺序是H2b<H4b<H5<H6<H8,可以看出在H2b夺取路径中能垒最小,表明了该反应能在室温下迅速完成,和实验结果一致.综合考虑热力学和动力学方面的分析,发现H2b夺取反应最容易进行,次之是H4b夺取反应,然后是H6和H5.而H8的夺取反应很难发生,和实验观察到的8位加成产物现象一致.
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
鸟嘌呤胞嘧啶碱基对论文参考文献
[1].候海丽.鸟嘌呤-尿嘧啶碱基对与铜银金相互作用的密度泛函理论研究[D].山西大学.2019
[2].李敏杰,刁玲,寇莉,李重杲,陆文聪.羟基自由基和鸟嘌呤-胞嘧啶碱基对反应的密度泛函理论研究（英文）[J].物理化学学报.2015
[3].林月霞,王红艳,高思敏,吴颖曦,李汝虎.B型DNA中鸟嘌呤-胞嘧啶碱基对内双质子转移反应[J].物理化学学报.2013