导读:本文包含了新疆分离株论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献，主要关键词:新疆,布鲁氏菌病,临床分离株,遗传进化
新疆分离株论文文献综述
李博,岳锡宏,崔步云,黎唯,刘志国[1]（2019）在《多位点序列分型在新疆人间布鲁氏菌病临床分离株遗传进化研究中的应用》一文中研究指出目的探讨多位点序列分型(MLST)技术在新疆人间布鲁氏菌病分离株遗传进化研究中的应用价值,了解分离株的种群结构和遗传进化关系。方法采用MLST对2015、2016年分离自新疆7个地州的24株人间布鲁氏菌病分离株和3株布鲁氏菌标准参考菌株进行分析,统计各菌株序列型(STs),运用BioNumerics软件构建菌株最小进化树,分析菌株间遗传关系;收集过往研究的186株全国不同地区布鲁氏菌分离株MLST结果,分析各ST型分布特点。结果 24株人间布鲁氏菌分离株全部为ST8型,3株标准参考菌株(羊种16M、牛种544A、猪种1330S)分别为ST7型、ST1型、ST14型;24株人间布鲁氏菌分离株的9个MLST位点变异完全相同,分离株种群结构单一。ST8型菌是我国主要流行的布鲁氏菌,且以北方流行为主;MLST能较好的区分布鲁氏菌种别,但不能有效区分生物型别。结论 ST8型菌(羊种3型)是新疆人间布鲁氏菌病的主要流行菌株,MLST技术可作为人间布鲁氏菌种群结构和遗传进化关系研究的补充手段。(本文来源于《中国人兽共患病学报》期刊2019年05期）
周婷婷,冯凯,汪丽,张雪静,古丽米热[2]（2019）在《马链球菌马亚种新疆分离株的分离及耐药性和进化分析》一文中研究指出为了解新疆马链球菌马亚种流行株的分子特性和遗传变异情况,对2017年采集的病马淋巴组织进行病原分离培养、生化鉴定和药敏试验,并对该分离菌株的SeM基因进行了PCR扩增和测序分析。同时,将该分离株与本实验室2013—2017年分离的10个分离株的SeM基因与国外分离株构建系统进化树。结果表明,成功分离鉴定了马链球菌马亚种ZZM17-1株,该菌株对阿莫西林、环丙沙星、克林霉素、多西环素、庆大霉素、左氧氟沙星、四环素、磺胺甲恶唑、利福平、诺氟沙星、土霉素、头孢噻呋、磺胺嘧啶钠和恩诺沙星等14种药物敏感,对青霉素和氨苄西林表现明显的耐药。基于SeM的系统进化树表明新疆地区马链球菌马亚种分离株分别属于Ⅰ群和Ⅳ群。该结果丰富了国内马链球菌马亚种的基因数据,为本地区开展马腺疫的防治提供了理论依据。(本文来源于《中国兽医科学》期刊2019年06期）
张奇文,凌晨,马勋,杜冬冬,钱凌霄[3]（2018）在《单核细胞增多性李斯特菌新疆分离株lmo0159基因克隆及生物信息学》一文中研究指出采用PCR方法对lmo0159基因进行扩增、克隆及序列测定,通过应用在线EXPASTY Proteomic、SOSUI、SMART、SignalP、TMHMM、SOPMA及ProtFun等程序,同时结合DNAMAN和DNAStar生物信息学软件,对LM90SB2菌株lmo0159基因进行序列分析,并对其编码蛋白质的空间结构和功能预测。结果表明,分离株LM90SB2的lmo0159基因序列全长为2 070 bp,包含1 851 bp开放阅读框,共编码617个氨基酸;序列同源比对显示,LM90SB2菌株lmo0159基因核苷酸和氨基酸序列与4b型参考菌株同源性均较高,分别为99.1%～100.0%和99.7%～100.0%。系统进化树显示,LM90SB2菌株lmo0159基因核苷酸序列与LM3、LM9、LM11、LM12、F2365、LM188、NSTN、H34、hs2008、LL195和2306等菌株聚为同一支,说明它们的亲缘关系比较近。lmo0159蛋白质是一种偏酸性、稳定、亲水性蛋白质,其二级结构是混合型,其中无规则卷曲最多,无跨膜区域,无信号肽区域,但含有1个胶原蛋白结合域和3个Cna B结构域。功能分析显示,lmo0159蛋白质在氨基酸生物合成、酶代谢、脂肪酸代谢、免疫应答和胁迫应答等方面的几率均较高。本研究成功克隆LM90SB2 lmo0159基因,为进一步研究LM90SB2的lmo0159基因功能提供了帮助。(本文来源于《基因组学与应用生物学》期刊2018年12期）
马鑫,苏静,孟卫卫,刘斌[4]（2018）在《新疆食源性金黄色葡萄球菌分离株的分子分型与耐药性分析》一文中研究指出目的建立新疆食源性金黄色葡萄球菌PFGE分型和耐药数据库,了解金黄色葡萄球菌分离株的分子分型特征及抗生素的耐药状况。方法按照《食品安全国家标准金黄色葡萄球菌检验》GB 4789.10-2010分离食品及食源性疾病暴发中金黄色葡萄球菌,采用脉冲场凝胶电泳法(pulse field gel electrophoresis,PFGE)分子分型和微量肉汤稀释法(MIC)测定分离株药物敏感性。结果 147株食源性金黄色葡萄球菌中109株来自常规监测、38株来自食源性疾病暴发事件,147株菌相似度67.4%～100.0%,经聚类分析分为102个PFGE带型;耐药率居前叁位是青霉素81.0%(119/147)、红霉素45.6%(67/147)和四环素21.1%(31/147);多重耐药率21.8%(32/147)。结论新疆地区食源性金黄色葡萄球菌PFGE分型数据库存在差异明显的多个基因型,揭示了不同来源金黄色葡萄球菌菌株之间的亲缘性和耐药特征,为进一步预警和控制新疆食源性疾病暴发提供支持。(本文来源于《疾病预防控制通报》期刊2018年06期）
李红欢,钱凌霄,杜冬冬,张奇文,李庆辉[5]（2018）在《单增李斯特菌新疆分离株lmo2192基因克隆及生物信息学分析》一文中研究指出试验旨在对单增李斯特菌新疆绵羊脑炎临床分离株LM90SB2的lmo2192基因进行克隆及生物信息学分析。根据GenBank中lmo2192基因序列(登录号:CAD00270)设计特异性引物,利用PCR方法对lmo2192基因进行扩增,回收目的基因,连接到pMD19-T载体上进行克隆,筛选阳性菌进行测序,测序后对lmo2192基因核苷酸序列进行分析,预测其编码蛋白质的二级结构、叁级结构,对其进行同源性比对及遗传变异分析。结果显示,新疆分离株LM90SB2的lmo2192基因序列全长为1 277bp,包含969bp开放阅读框,共编码322个氨基酸;LM90SB2株lmo2192基因核苷酸序列与CIIMS-PH-1同源性为100.0%,与81-0861、10-0809、81-0592、81-0558、NTSN、F2365和WSLC1033的同源性为99.8%～99.9%,与L2074和NH1同源性分别为97.0%和96.9%。推导的氨基酸序列同源性为91.6%～100.0%。系统进化树显示,LM90SB2菌株lmo2192基因与4b血清型菌株亲缘关系较近,聚为同一分支。蛋白质二级结构预测表明,LM90SB2lmo2192蛋白为亲水性蛋白,无信号肽,不形成跨膜结构。蛋白结构域预测,lmo2192蛋白为ATP酶组分。本试验成功克隆LM90SB2分离株lmo2192基因,为进一步研究其基因功能提供理论依据。(本文来源于《中国畜牧兽医》期刊2018年11期）
杨航,姬祥,郭南,黄巧玲,杨彩虹[6]（2018）在《新疆喀什地区结核分枝杆菌分离株氧氟沙星耐药基因gyrA突变位点分析》一文中研究指出我国是结核病高负担国家之一,也是耐药结核病高负担国家[1]。新疆是我国结核病高发省份,而喀什地区结核病发病率又高于新疆其他地区,是新疆结核病防控的重点区域[1]。新疆结核分枝杆菌抗结核药物耐药率虽低于全国平均水平[1],但是结核病患者基数大,传统的药敏试验耗时长,给耐药结核病的早诊断、早治疗带来较大困难。研究目的:了解新疆喀什地区、石河子地区及华东地区结核分枝杆菌临床分离株对氧氟沙星的耐药性,分析耐药相关基因gyr A喹诺酮耐药决定区(QRDR)突变的位置及类型,以比例法药敏试验为参照,评价DNA测序技术检测氧氟沙星耐药的效率。实验方法:采用比例法药敏试验检测191株结核分枝杆菌临床分离株对氧氟沙星药物的耐药性;对喹诺酮类药物耐药相关基因gyr A的QRDR区进行扩增与测序,分析耐药相关突变位点。以药敏试验结果为标准,通过Kappa值评价DNA测序和药敏试验在结核分枝杆菌临床分离株氧氟沙星耐药检测的一致性。研究结果:191株临床分离株结核分枝杆菌中16株为氧氟沙星耐药株,氧氟沙星总耐药率为8.37%。对gyr A基因QRDR区域扩增后测序,共发现4个位点存在突变;分别是第56、74、90、94位密码子。其中,第56位密码子处由CTC→CTG,为同义突变。74位密码子突变均发生在喀什分离株,由GCC→GTA,氨基酸由Ala突变为Val;90位密码子由GCG→GTG,氨基酸由Ala突变为Val;94位密码子突变占临床分离株耐药位点突变的71%,共发现GAC→TAC、GAC→GCC、GAC→GGC3种突变类型,第94位氨基酸Asp分别突变为Thr、Ala、Gly。与药敏试验结果比较,DNA测序对结核分枝杆菌临床分离株氧氟沙星耐药检测具有高度一致性(Kappa=0.895)。结论与讨论:gyr A基因第74、90、94位密码子的突变与结核分枝杆菌对氧氟沙星药耐药有关,喀什分离株存在74位新突变位点。用DNA测序技术分析结核分枝杆菌gyr A基因氧氟沙星耐药相关突变对判断结核分枝杆菌氧氟沙星类药物耐药性具有较高的灵敏度和特异性,可为结核分枝杆菌氟沙星耐药性诊断提供依据。以比例法药敏试验结果作为参照,利用DNA测序技术检测结核分枝杆菌氧氟沙星耐药的敏感性和特异性分别为87.5%和99.4%。影响该检测方法敏感性的原因是有2株喀什地区结核分枝杆菌氧氟沙星耐药株gyr A基因喹诺酮耐药决定区不存在已知类型的耐药突变,其耐药机制有待进一步研究。(本文来源于《中国畜牧兽医学会兽医病理学分会第二十四次学术研讨会、中国病理生理学会动物病理生理学专业委员会第二十叁次学术研讨会、中国实验动物学会实验病理学专业委员会第叁次学术研讨会、中国兽医病理学家第叁次学术研讨会论文集》期刊2018-07-27）
张锐,杨铭伟,任静静,朱玲,柳旭伟[7]（2018）在《牛支原体新疆分离株P48基因的克隆、原核表达及重组蛋白免疫原性研究》一文中研究指出试验旨在确定牛支原体P48基因的免疫原性,为进一步筛选牛支原体免疫保护性基因奠定基础。本研究以牛支原体新疆分离株为研究对象,运用Overlap PCR方法扩增得到点突变后的牛支原体新疆分离株P48基因,构建原核表达载体pET-32a(+)-P48,转化大肠杆菌BL21(DE3)感受态细胞,在诱导剂ITPG的诱导下获得重组蛋白P48,纯化后的重组P48蛋白免疫BALB/c小鼠制备多克隆抗体,运用Western blotting和ELISA方法验证其反应原性和免疫原性。结果表明,试验成功构建原核表达载体pET-32a(+)-P48,重组蛋白P48大小约为66ku,纯化后的牛支原体P48重组蛋白免疫小鼠后可产生良好的免疫反应,血清抗体滴度达到较高水平(D450nm值为1.126)。Western blotting结果显示,抗牛支原体P48重组蛋白的鼠血清与牛支原体P48重组蛋白及牛支原体全菌蛋白抗原均能产生明显的抗原抗体反应,表明P48重组蛋白具有良好的免疫原性与反应原性,可作为牛支原体新型疫苗的候选基因,且牛支原体新疆分离株P48基因与国内外5株牛支原体P48基因的同源性很高,亲缘关系较近。(本文来源于《中国畜牧兽医》期刊2018年07期）
薛婷,沙拉依丁·沙力克江,李飞,杨真勇,王晓黎[8]（2018）在《辽宁与新疆两地细粒棘球蚴分离株基因型研究》一文中研究指出目的检测辽宁和新疆人源细粒棘球蚴的基因型及其遗传变异情况,分析不同地理株之间的基因差异。方法分别从两地区肝包虫病患者肝内获取棘球蚴囊,取囊内容物离心沉淀,提取DNA,以细粒棘球绦虫线粒体细胞色素氧化酶(cox1)基因为靶基因设计引物,进行PCR扩增,对扩增产物进行测序,应用NCBI Blast软件和DNAman软件分析测序结果。结果辽宁和新疆人源细粒棘球蚴cox1基因扩增片段为1 838bp,测序后进行NCBI Blast分析,发现100条同源序列,均为细粒棘球绦虫种属;其A,C,G,T含量分别为47.90%、25.13%、9.17%、17.80%和47.84%、25.13%、9.23%、17.80%,两地区分离株cox1基因序列同源性为99.94%,目的基因序列中第64位仅存在一个变异位点,两者的基因型均属于G1亚型。结论辽宁和新疆人源细粒棘球蚴基因型均为G1型,cox1基因同源性高,仅在第64位存在一个变异位点,可为当地人体细粒棘球蚴病的分子流行病学研究及其预防提供参考。(本文来源于《中国病原生物学杂志》期刊2018年06期）
张锐[9]（2018）在《牛支原体新疆分离株P48基因检测及抗原性研究》一文中研究指出牛支原体(Mycoplasma bovis,M.bovis)又称牛霉形体,是引起牛群发生多种感染的重要致病性病原体之一。1961年,美国Hale等最早从患乳腺炎的牛乳中分离得到牛支原体,1976年有研究报道,牛支原体与呼吸系统疾病密切相关。2008年国内首次分离得到牛支原体后,此病在全国范围内逐步蔓延,给我国的养牛业造成了较大的经济损失。牛支原体结构简单,细胞膜外没有细胞壁,大量的脂蛋白聚集在细胞膜的表面,这些膜表面的脂蛋白在牛支原体调节宿主免疫系统的功能上起着非常重要的作用。P48蛋白就是牛支原体众多的表面脂蛋白中的一种,它是牛支原体的一种特异性抗原。本试验对新疆不同牛支原体分离株P48基因进行克隆、序列比对,选定其中一株进行原核表达得到纯化后的P48蛋白,对其免疫原性进行探究,为新型牛支原体疫苗的研发提供理论基础,主要研究内容及结果如下:1新疆不同分离株牛支原体P48基因的PCR扩增及序列分析为研究新疆不同分离株牛支原体P48基因的遗传特性,本试验以从新疆不同地区分离得到的牛支原体为研究对象,根据NCBI上已收录的P48基因序列设计特异性引物,通过PCR扩增检测P48基因并对其进行序列分析。试验结果表明:10株来自新疆不同地区的牛支原体均扩增得到1341 bp的P48特异性目的条带,经序列分析与同源性比较,新疆分离株的P48基因与PG45国际标准株及国内其它地区分离株的P48基因同源性为96.8%~99.8%,说明P48基因在牛支原体中属于保守性基因。2牛支原体新疆分离株P48基因的克隆与原核表达为确定牛支原体P48基因的免疫原性,为进一步筛选牛支原体免疫保护性基因奠定基础。本研究以牛支原体新疆分离株为研究对象,运用Overlap PCR方法扩增得到点突变后的牛支原体新疆分离株的P48基因,构建原核表达载体p ET-32a(+)-P48质粒,经筛选将构建成功的原核表达pET-32a(+)-P48质粒转化至大肠杆菌BL21(DE3)中,在诱导剂ITPG的诱导下获得重组蛋白P48,其大小约为66 KDa。3 P48蛋白的抗原性研究运用Western-blotting和ELISA方法验证重组蛋白P48的反应原性和免疫原性。试验结果表明,纯化后的牛支原体P48重组蛋白免疫小鼠后可产生良好的免疫反应,血清抗体滴度达到较高水平(OD_(450nm)值1.126),Western-blotting结果显示,牛支原体阳性血清与牛支原体P48重组蛋白能产生明显的抗原抗体反应,表明P48重组蛋白具有良好的免疫原性与反应原性,可作为牛支原体新型疫苗的候选基因。最后将牛支原体P48蛋白免疫给犊牛,采用P48蛋白作为抗体包被时,测定其抗体滴度为0.84(OD_(450nm)),但采用牛支原体全菌蛋白包被时,则试验组和对照之间无明显差异。(本文来源于《石河子大学》期刊2018-06-01）
姬祥,郭南,黄巧玲,杨彩虹,吴江东[10]（2018）在《新疆喀什地区结核分枝杆菌分离株氧氟沙星耐药基因gyrA突变位点分析》一文中研究指出目的了解新疆喀什地区、石河子地区及华东地区结核分枝杆菌临床分离株对氧氟沙星的耐药性,分析耐药相关基因gyrA喹诺酮耐药决定区(QRDR)突变的位置及类型,以比例法药敏试验为参照,评价DNA测序技术检测氧氟沙星耐药的效率。方法采用比例法药敏试验检测191株结核分枝杆菌临床分离株对氧氟沙星药物的耐药性;对喹诺酮类药物耐药相关基因gyrA的QRDR区进行扩增与测序,分析耐药相关突变位点。以药敏试验结果为标准,通过Kappa值评价DNA测序和药敏试验在结核分枝杆菌临床分离株氧氟沙星耐药检测的一致性。结果 191株临床分离株结核分枝杆菌中16株为氧氟沙星耐药株,氧氟沙星总耐药率为8.37%。对gyrA基因QRDR区域扩增后测序,共发现4个位点存在突变;分别是第56、74、90、94位密码子。其中,第56位密码子处由CTC→CTG,为同义突变。74位密码子突变均发生在喀什分离株,由GCC→GTA,氨基酸由Ala突变为Val;90位密码子由GCG→GTG,氨基酸由Ala突变为Val;94位密码子突变占临床分离株耐药位点突变的71%,共发现GAC→TAC、GAC→GCC、GAC→GGC3种突变类型,第94位氨基酸Asp分别突变为Thr、Ala、Gly。与药敏试验结果比较,DNA测序对结核分枝杆菌临床分离株氧氟沙星耐药检测具有高度一致性(Kappa=0.895)。结论 gyrA基因第74、90、94位密码子的突变与结核分枝杆菌对氧氟沙星药耐药有关,喀什分离株存在74位新突变位点。用DNA测序技术分析结核分枝杆菌gyrA基因氧氟沙星耐药相关突变对判断结核分枝杆菌氧氟沙星类药物耐药性具有较高的灵敏度和特异性,可为结核分枝杆菌氟沙星耐药性诊断提供依据。(本文来源于《中国病原生物学杂志》期刊2018年04期）
新疆分离株论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
为了解新疆马链球菌马亚种流行株的分子特性和遗传变异情况,对2017年采集的病马淋巴组织进行病原分离培养、生化鉴定和药敏试验,并对该分离菌株的SeM基因进行了PCR扩增和测序分析。同时,将该分离株与本实验室2013—2017年分离的10个分离株的SeM基因与国外分离株构建系统进化树。结果表明,成功分离鉴定了马链球菌马亚种ZZM17-1株,该菌株对阿莫西林、环丙沙星、克林霉素、多西环素、庆大霉素、左氧氟沙星、四环素、磺胺甲恶唑、利福平、诺氟沙星、土霉素、头孢噻呋、磺胺嘧啶钠和恩诺沙星等14种药物敏感,对青霉素和氨苄西林表现明显的耐药。基于SeM的系统进化树表明新疆地区马链球菌马亚种分离株分别属于Ⅰ群和Ⅳ群。该结果丰富了国内马链球菌马亚种的基因数据,为本地区开展马腺疫的防治提供了理论依据。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
新疆分离株论文参考文献
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