本文主要研究内容
作者吴华莉,涂尾龙,曹建国,张莺莺,王洪洋,谈永松（2019）在《BPI基因生物信息学分析及其在不同猪群体中的遗传变异情况》一文中研究指出：【目的】明确猪杀菌性/通透性增加蛋白(BPI)基因中可能存在的SNP位点,并探讨BPI基因外显子10在上海地区5个猪群体中的多态性及其与抗病相关的优势基因型,为揭示BPI基因在仔猪腹泻抗病机制中的作用及开展猪抗病育种提供理论依据。【方法】采用在线生物信息学软件分别从碱基序列、SNP位点和蛋白氨基酸序列等角度比对分析猪BPI基因全长cDNA序列与电子克隆序列的差异,采用PCR-RFLP检测分析猪BPI基因外显子10的多态性,并检测BPI基因外显子10在杜洛克、长白、大白、申农和梅山猪群体中的基因型及基因频率。【结果】猪BPI基因电子克隆编码区(CDS)序列长度1452 bp,编码483个氨基酸,存在44个SNP位点,其中22个为同义SNP位点、22个为非同义SNP位点。猪BPI基因全长cDNA序列(EF436278.1和FJ810853.1)与电子克隆序列相比存在14处碱基差异,而对应的翻译蛋白序列存在4处氨基酸差异。猪BPI基因外显子10存在AA、BB和AB 3种基因型,各基因型在杜洛克猪、长白猪、大白猪、申农猪和梅山猪群体中的分布情况各不相同。在杜洛克猪群体中AA基因型和AB基因型呈中度多态分布(0.404和0.416),BB基因型检出比例较低(0.180);在长白猪和申农猪群体中均未检测出AA基因型,BB基因型检出比例较高,而AB基因型检出比例较低;在大白猪和梅山猪群体中均以BB基因型检出比例较高,AB基因型次之,AA基因型检出比例最低。总体来看,除了杜洛克猪群体的A等位基因频率较高外,其他4个猪群体均以B等位基因频率较高。【结论】猪BPI基因外显子10 AA基因型频率在杜洛克猪群体中最高,在大白猪和梅山群体中较低,在长白猪和申农猪群体中未检出,即AA基因型在杜洛克猪群体中比例高与其仔猪腹泻发病率低的情况一致。因此,在大白猪和梅山猪育种过程中需提高AA基因型比例,而在长白猪和申农猪育种过程中需引进AA基因型个体,降低BB和AB基因型比例,以增加仔猪的抗病能力。
Abstract
【mu de 】ming que zhu sha jun xing /tong tou xing zeng jia dan bai (BPI)ji yin zhong ke neng cun zai de SNPwei dian ,bing tan tao BPIji yin wai xian zi 10zai shang hai de ou 5ge zhu qun ti zhong de duo tai xing ji ji yu kang bing xiang guan de you shi ji yin xing ,wei jie shi BPIji yin zai zai zhu fu xie kang bing ji zhi zhong de zuo yong ji kai zhan zhu kang bing yo chong di gong li lun yi ju 。【fang fa 】cai yong zai xian sheng wu xin xi xue ruan jian fen bie cong jian ji xu lie 、SNPwei dian he dan bai an ji suan xu lie deng jiao du bi dui fen xi zhu BPIji yin quan chang cDNAxu lie yu dian zi ke long xu lie de cha yi ,cai yong PCR-RFLPjian ce fen xi zhu BPIji yin wai xian zi 10de duo tai xing ,bing jian ce BPIji yin wai xian zi 10zai du luo ke 、chang bai 、da bai 、shen nong he mei shan zhu qun ti zhong de ji yin xing ji ji yin pin lv 。【jie guo 】zhu BPIji yin dian zi ke long bian ma ou (CDS)xu lie chang du 1452 bp,bian ma 483ge an ji suan ,cun zai 44ge SNPwei dian ,ji zhong 22ge wei tong yi SNPwei dian 、22ge wei fei tong yi SNPwei dian 。zhu BPIji yin quan chang cDNAxu lie (EF436278.1he FJ810853.1)yu dian zi ke long xu lie xiang bi cun zai 14chu jian ji cha yi ,er dui ying de fan yi dan bai xu lie cun zai 4chu an ji suan cha yi 。zhu BPIji yin wai xian zi 10cun zai AA、BBhe AB 3chong ji yin xing ,ge ji yin xing zai du luo ke zhu 、chang bai zhu 、da bai zhu 、shen nong zhu he mei shan zhu qun ti zhong de fen bu qing kuang ge bu xiang tong 。zai du luo ke zhu qun ti zhong AAji yin xing he ABji yin xing cheng zhong du duo tai fen bu (0.404he 0.416),BBji yin xing jian chu bi li jiao di (0.180);zai chang bai zhu he shen nong zhu qun ti zhong jun wei jian ce chu AAji yin xing ,BBji yin xing jian chu bi li jiao gao ,er ABji yin xing jian chu bi li jiao di ;zai da bai zhu he mei shan zhu qun ti zhong jun yi BBji yin xing jian chu bi li jiao gao ,ABji yin xing ci zhi ,AAji yin xing jian chu bi li zui di 。zong ti lai kan ,chu le du luo ke zhu qun ti de Adeng wei ji yin pin lv jiao gao wai ,ji ta 4ge zhu qun ti jun yi Bdeng wei ji yin pin lv jiao gao 。【jie lun 】zhu BPIji yin wai xian zi 10 AAji yin xing pin lv zai du luo ke zhu qun ti zhong zui gao ,zai da bai zhu he mei shan qun ti zhong jiao di ,zai chang bai zhu he shen nong zhu qun ti zhong wei jian chu ,ji AAji yin xing zai du luo ke zhu qun ti zhong bi li gao yu ji zai zhu fu xie fa bing lv di de qing kuang yi zhi 。yin ci ,zai da bai zhu he mei shan zhu yo chong guo cheng zhong xu di gao AAji yin xing bi li ,er zai chang bai zhu he shen nong zhu yo chong guo cheng zhong xu yin jin AAji yin xing ge ti ,jiang di BBhe ABji yin xing bi li ,yi zeng jia zai zhu de kang bing neng li 。
论文参考文献
论文详细介绍
论文作者分别是来自南方农业学报的吴华莉,涂尾龙,曹建国,张莺莺,王洪洋,谈永松，发表于刊物南方农业学报2019年03期论文，是一篇关于杀菌性论文,通透性增加蛋白论文,位点论文,基因型论文,多态性论文,南方农业学报2019年03期论文的文章。本文可供学术参考使用，各位学者可以免费参考阅读下载，文章观点不代表本站观点，资料来自南方农业学报2019年03期论文网站，若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权，请联系我们删除。