本文主要研究内容
作者彭曦冉,俞天奇,张宜娜,周继勇,胡伯里（2019）在《传染性法氏囊病病毒感染DF-1细胞的转录组学分析》一文中研究指出：传染性法氏囊病病毒(Infectious bursal disease virus, IBDV)感染鸡(Gallus gallus)引起的IBD是一种严重的、高度传染的免疫抑制性疾病。为探索IBDV感染所引起的宿主细胞转录组变化,本研究以IBDV感染鸡成纤维细胞系DF-1,提取细胞总RNA,使用TruSeq~?RNA LT Sample Prep Kit v2构建RNA文库,采用Illumina HiSeq 3000平台进行高通量测序,分析IBDV感染12 h引起的DF-1细胞转录组变化,筛选显著变化基因。实验结果显示,差异表达基因总共有3 417条,其中在IBDV感染组中相对高表达的基因有1 887条,相对低表达的基因有1 530条(差异倍数(Fold change, FC)>2且P≤0.05)。对差异基因进行基因本体(Gene Ontology, GO)注释及KEGG信号通路富集分析,发现IBDV感染能够引起DF-1细胞中免疫、凋亡、代谢等20多条信号通路发生显著变化;其中细胞免疫和细胞凋亡通路可能在IBDV感染和免疫调控机制中具有重要作用。随机选择9条差异表达基因进行qRT-PCR验证,变化趋势与转录组数据一致。本研究为揭示IBDV致病及免疫抑制的分子机制提供了参考信息。
Abstract
chuan ran xing fa shi nang bing bing du (Infectious bursal disease virus, IBDV)gan ran ji (Gallus gallus)yin qi de IBDshi yi chong yan chong de 、gao du chuan ran de mian yi yi zhi xing ji bing 。wei tan suo IBDVgan ran suo yin qi de su zhu xi bao zhuai lu zu bian hua ,ben yan jiu yi IBDVgan ran ji cheng qian wei xi bao ji DF-1,di qu xi bao zong RNA,shi yong TruSeq~?RNA LT Sample Prep Kit v2gou jian RNAwen ku ,cai yong Illumina HiSeq 3000ping tai jin hang gao tong liang ce xu ,fen xi IBDVgan ran 12 hyin qi de DF-1xi bao zhuai lu zu bian hua ,shai shua xian zhe bian hua ji yin 。shi yan jie guo xian shi ,cha yi biao da ji yin zong gong you 3 417tiao ,ji zhong zai IBDVgan ran zu zhong xiang dui gao biao da de ji yin you 1 887tiao ,xiang dui di biao da de ji yin you 1 530tiao (cha yi bei shu (Fold change, FC)>2ju P≤0.05)。dui cha yi ji yin jin hang ji yin ben ti (Gene Ontology, GO)zhu shi ji KEGGxin hao tong lu fu ji fen xi ,fa xian IBDVgan ran neng gou yin qi DF-1xi bao zhong mian yi 、diao wang 、dai xie deng 20duo tiao xin hao tong lu fa sheng xian zhe bian hua ;ji zhong xi bao mian yi he xi bao diao wang tong lu ke neng zai IBDVgan ran he mian yi diao kong ji zhi zhong ju you chong yao zuo yong 。sui ji shua ze 9tiao cha yi biao da ji yin jin hang qRT-PCRyan zheng ,bian hua qu shi yu zhuai lu zu shu ju yi zhi 。ben yan jiu wei jie shi IBDVzhi bing ji mian yi yi zhi de fen zi ji zhi di gong le can kao xin xi 。
论文参考文献
论文详细介绍
论文作者分别是来自农业生物技术学报的彭曦冉,俞天奇,张宜娜,周继勇,胡伯里，发表于刊物农业生物技术学报2019年06期论文，是一篇关于传染性法氏囊病病毒论文,高通量测序论文,转录组论文,信号通路论文,农业生物技术学报2019年06期论文的文章。本文可供学术参考使用，各位学者可以免费参考阅读下载，文章观点不代表本站观点，资料来自农业生物技术学报2019年06期论文网站，若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权，请联系我们删除。
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