导读:本文包含了多态性标记论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献，主要关键词:草莓,简单重复序列,序列相关扩增多态性,遗传多样性
多态性标记论文文献综述
忻雅,方献平,王淑珍,童建新,来文国[1]（2019）在《简单重复序列标记和序列相关扩增多态性标记在草莓遗传多样性分析中的比较》一文中研究指出利用简单重复序列(simple sequence repeat, SSR)和序列相关扩增多态性(sequence related amplified polymorphism, SRAP)标记分析了来自国内外43个草莓品种的遗传多样性,并比较了这2种分子标记的效果差异。结果表明:30对SSR引物平均多态性位点数为6.43个,每个位点的平均多态性信息含量(polymorphism information content, PIC)值为0.628 4;20个SRAP引物组合平均多态性位点数为14.30个,PIC值高达0.911 4。基于SSR标记的聚类结果与基于SRAP标记的聚类结果的相关系数为0.817,呈显着水平。而SSR标记、SRAP标记分别与SSR+SRAP联合标记的相关系数为0.938和0.966,都达到极显着水平。SSR和SRAP标记都能较好地分析草莓遗传多样性,其中SRAP标记的效果略优于SSR标记,而SSR+SRAP联合标记分析则能更好地评估种质的遗传多样性和亲缘关系。(本文来源于《浙江大学学报(农业与生命科学版)》期刊2019年03期）
曾玉琳,蒙裕欢,张钰,杜红丽[2]（2018）在《用于四种常用品系大鼠鉴定的单核苷酸多态性标记筛查和应用研究》一文中研究指出目的筛选出能快速鉴定四种常用品系大鼠[Wistar大鼠、Goto-Kakizaki(GK)大鼠、Brown-Norway(BN)大鼠、Sprague-Dawley(SD)大鼠]的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点并验证其可靠性。方法首先对Wistar大鼠和GK大鼠进行全基因组重测序,利用生物信息学技术将重测序结果比对到BN大鼠参考基因组,筛查到Wistar大鼠和GK大鼠基因组范围内的特异性SNP,并从中进一步筛选出一组候选SNP位点,再利用一代测序和DNA混合池法对以上候选SNP位点在Wistar、GK、BN、SD四种大鼠群体中进一步筛查与验证。结果 Wistar和GK大鼠通过比对分别得到94 800和106 019个纯合特异性SNP,其中有56 216个SNP为Wistar和GK大鼠所共有,且发现BN大鼠参考基因组、Wistar大鼠和GK大鼠叁者基因型互不相同的位点仅有38个,从中挑选了15个作为候选SNP位点,最终在Wistar、GK、BN、SD四种大鼠群体验证中得到13个可以区分四个品系大鼠的SNP标记及其在各个品系中的基因型。结论筛查并验证了能区分Wistar、GK、BN和SD四种大鼠的13个SNP标记,这些SNP标记可快速区分出Wistar、GK、BN和SD大鼠。(本文来源于《中国比较医学杂志》期刊2018年11期）
马小定,唐江红,张佳妮,崔迪,李慧[3]（2019）在《东乡野生稻与日本晴多态性标记的开发》一文中研究指出东乡野生稻是分布于全球最北端的一种普通野生稻,与亚洲栽培稻基因组差异较大,目前缺少覆盖其全基因组的分子标记。本文以东乡野生稻和日本晴为材料,通过筛选已有的1017个标记,并利用东乡野生稻基因组重测序信息设计的217个InDel标记,共检测出203个标记在东乡野生稻与日本晴间呈现多态性。这些标记均匀分布于12条染色体,平均间隔1.9 Mb,基本覆盖东乡野生稻全基因组区域。通过对籼粳亚种的检验分析,发现该套多态性分子标记在东乡野生稻与粳稻杂交后代群体基因型分析上具有较高的应用价值。本研究结果为发掘东乡野生稻的有利基因以及分子标记辅助选择育种提供了有力的工具。(本文来源于《作物学报》期刊2019年02期）
杨艳婷,侯向阳,魏臻武,乔志宏,常春[4]（2018）在《羊草叶绿体非编码区多态性标记筛选及群体遗传多样性》一文中研究指出为筛选多态性丰富的羊草叶绿体非编码区片段,本研究以9个不同地理位置的羊草居群为材料,通过对12个叶绿体非编码区DNA片段测序及其序列间变异分析试图从中找出有遗传差异的叶绿体DNA(cpDNA)片段,并利用有多态性的cpDNA片段进行遗传多样性分析。结果表明,序列ndhF-rpl32、trnL-trnF、trnC-ycf6、aptI-aptH具有比较丰富的变异,可作为下一步研究野生羊草群体遗传学和谱系地理学较为理想的分子标记。在37个羊草个体4条非编码区片段的合并序列中,共检测到15种单倍型,单倍型多态性(Hd)为0.928,核苷酸多态性(Pi)为0.00101;遗传分化指数(Fst)为0.58884,基因流(Nm)为0.17,基因流较小;中性检验Tajima’s D(-1.08542)和Fu’s Fs(-5.301)均为负值,且差异不显着(P>0.10),推测羊草遵循中性进化理论,可能经历过种群扩张;AMOVA结果显示,65%的分子变异出现在居群间,35%出现在居群内;Mantel检验得到,遗传距离与地理距离具有显着相关性(r=0.449,P<0.05);居群分化值Nst 0.386(0.1865)大于Gst 0.234(0.1506),差异显着(P<0.05),表明羊草居群存在分子谱系地理结构。通过系统发育树分析得到,羊草15个单倍型分为两大分支,H2和H10聚为一支,它们与别的居群个体亲缘关系较远,其余单倍型聚为另一支;单倍型网络图显示,H2和H12、H10和H12亲缘关系较远,与系统发育树分析结果基本一致。本研究为羊草的种质资源保护、谱系地理学研究等工作奠定了基础。(本文来源于《草业学报》期刊2018年10期）
刘娟,陈广凤,田纪春,吴澎,赵子彤[5]（2018）在《馒头质构性状与单核苷酸多态性标记关联分析》一文中研究指出质构是影响馒头品质的一个重要因素,研究馒头质构相关性状的基因位点对改良其品质具有指导意义。以205份小麦品种为实验材料,利用分布于小麦21条染色体的24 355个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)标记对其制成的馒头质构性状进行全基因组关联分析。共检测到与馒头质构性状显着关联的位点313个。其中,31个极显着(p<0.000 1)关联位点,11个位点至少在两个环境中表达,46个高遗传贡献率位点(R~2>10%),分布在小麦21条染色体中的15条。同时,还得到5个主效关联位点,如控制黏着性的极显着位点Kukri_c13329_800,在两个环境中表达且遗传贡献率>10%。得到的控制馒头质构相关性状的位点为在分子水平上研究馒头品质相关性状提供了一定参考。(本文来源于《食品与发酵工业》期刊2018年07期）
林兴娥,牛俊海,陈莹,马蔚红,臧小平[6]（2018）在《红毛丹SSR-PCR反应体系优化及多态性标记筛选》一文中研究指出为建立适宜红毛丹SSR-PCR反应的最佳体系并筛选出具有多态性的SSR引物,采用L16(45)正交试验设计对反应体系中的各组分(模板DNA,引物, Mg~(2+), dNTPs和Taq DNA聚合酶)进行了优化,建立了红毛丹SSR-PCR的最佳反应体系(20μL):DNA模板30 ng、dNTPs 0.40 mmol/L、引物0.4μmol/L、Taq DNA聚合酶1.5 U、Mg~(2+)1.50 mmol/L;利用优化后的SSR-PCR体系和6份红毛丹种质基因组DNA模板,从50对SSR引物中筛选出11对条带清晰、多态性丰富、重复性好的SSR引物,多态比例达22%。本研究为后续红毛丹种质资源遗传多样性分析、分子指纹图谱构建和品种鉴定等研究提供了技术参考。(本文来源于《分子植物育种》期刊2018年21期）
王振玉,李威,周晓箭,裴小雨,刘艳改[7]（2016）在《棉花单核苷酸多态性标记研究进展》一文中研究指出单核苷酸多态性标记已在农作物研究中得到广泛应用并取得重大进展。为了便利棉花SNP(Single nucleotide polymorphism)标记的研究和应用,介绍了利用基因芯片、简化基因组测序、重测序等在棉花中开发SNP标记的方法 ,综述了SNP标记在棉花遗传图谱构建、数量位点的定位和分子标记辅助育种、基因组测序以及系统进化等研究中的应用。并对异源四倍体棉花中SNP标记开发时,同源序列位点和部分同源序列位点上的SNP标记辨别问题进行了系统探讨,对其快捷的开发、检测方式和在数量基因定位中的应用前景进行了展望。(本文来源于《棉花学报》期刊2016年04期）
肖超[8]（2016）在《母胎差异甲基化联合单核苷酸多态性标记建立无创性产前亲权鉴定方法的探索研究》一文中研究指出研究背景近年来,随着社会的发展和需要,产前亲权鉴定案例逐年增多。目前,常规穿刺抽取羊水进行产前亲权鉴定,不仅存在胎儿损伤、流产等风险,也受到妊娠时间的限制(最佳抽取羊水时间一般在妊娠17~21周)。因此,找到更安全、更灵活的产前亲权鉴定方法一直是法医遗传学领域关注的热点之一。1997年Lo等发现孕妇血浆中存在游离胎儿DN A(Cell-free fetal DNA,cffDNA),为无创性产前亲权鉴定开辟了新的途径。CffDNA从妊娠第6周开始就可被检测到,含量随孕期增加而增加,平均约占血浆总DNA的10%,分娩后24h或更短时间内又被迅速清除,因此可在妊娠早期用于产期亲权鉴定,而且不受历史妊娠的干扰,是进行无创性产前亲权鉴定的理想生物检材。然而,cffDNA与大量母体DNA混杂在一起,除Y染色体特异性序列外,直接检测结果均为母体与胎儿混合基因型,所以难以判断父权。表观遗传学研究发现,绒毛组织与母体血细胞之间存在差异甲基化区域(Differentially methylated region,DMR),表现为胎儿甲基化、母体未甲基化,为消除母体DNA干扰提供了可能。首先采用甲基化敏感限制性内切酶(Methylation sensitive restriction enzyme,MSRE)彻底消化孕妇外周血浆DNA中的母体成分,然后PCR特异性扩增DMRs得到胎儿DNA。亲权鉴定需要进行遗传标记分型,而cffDNA多以小于200bp的短片段存在,因此单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)位点成为最适合的分型标记。由于SNP多态性较低,所以必须对多个位点分型才能达到亲权鉴定要求,因此联合MSRE-PCR和SNaPshot微测序技术建立复合检测体系便成为无创性产前亲权鉴定的全新策略。目的探索联合MSRE-PCR和SNaPshot微测序技术建立复合检测体系用于无创性产前亲权鉴定的可行性。方法(1)查阅相关文献,挑选出具有如下特征的DMRs:(1)包含2~6个双限制酶切位点组合HpaII+HinP1I或Bst UI+HinP1I;(2)胎儿绒毛或胎盘组织在识别位点甲基化,而母体外周血细胞未甲基化;(3)包含中国汉族人群高多态性SNP位点(最小等位基因频率≧0.2);(4)SNP位点与酶切位点的最远距离不超过150bp。(2)用Primer 3软件自行设计DMRs靶片段扩增引物。MSRE酶切验证甲基化状态:首先采用MSRE消化绒毛组织和配对母体血细胞样本,然后PCR扩增消化后产物,经非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分离扩增产物。通过比较目的条带的有无筛选出MSRE特异性胎儿绒毛组织甲基化、母体外周血细胞未甲基化的DMRs。(3)继续使用Primer 3软件自行设计靶片段单碱基延伸引物,并将所有DMRs根据MSRE的不同分成两组进行复合扩增检测。建立复合检测体系:先采用特异性引物扩增出包含SNP位点在内的目标DNA片段,纯化后再利用单碱基延伸引物进行各SNP位点等位基因特异性延伸反应,以此构建含多个SNP位点的复合检测体系。(4)用构建的复合检测体系对150名武汉汉族健康无关个体、4例孕妇外周血浆DNA进行分型检测。结果(1)采用MSRE-PCR验证后共挑选出14个胎儿绒毛或胎盘组织甲基化、母体血细胞未甲基化的DMRs。(2)成功构建了用于检测18个SNPs的两组复合检测体系。所有18个SNPs在武汉汉族群体中均具有遗传多态性。(3)3例孕晚期和1例孕早期孕妇外周血浆DNA酶切后SNP分型与胎儿分型完全一致。结论本文成功构建了用于检测母体外周血浆cffDNA的复合检测体系,为后续进一步改善实验结果打下基础。(本文来源于《华中科技大学》期刊2016-05-01）
张沁斌,秦永田,许蒙蒙,陈永强,李卫华[9]（2016）在《利用单核苷酸多态性标记定位玉米叶夹角主效QTL》一文中研究指出对EMS诱变获得的平展叶夹角突变体M 87-1的遗传规律进行了标记分析。结果表明,在豫82背景影响下,M 87-1与豫82组配的分离群体的叶夹角表现典型的数量性状遗传。在3 072个单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphisms,SNPs)标记中,共检测到1 254个SNPs在双亲间存在多态性。通过简化的数量性状位点(Quantitative trait locus,QTLs)分析方法,对BC1((豫82×M 87-1)×M 87-1)分离群体的叶夹角性状进行遗传定位,共检测到3个主效QTLs,分别位于第1,2,7染色体上,其中位于第7染色体上的QTL与叶夹角表型拟合程度最高,可能包含EMS诱变的突变位点。(本文来源于《河南农业大学学报》期刊2016年02期）
林兴娥,周兆禧,葛宇,臧小平,肖正新[10]（2015）在《红毛丹SRAP反应体系优化及多态性标记筛选》一文中研究指出为建立成熟可靠的红毛丹SRAP-PCR扩增检测技术体系,本研究首先采用单因素实验设计,对反应体系中的DNA模板、Mg2+、d NTPs、Taq DNA聚合酶和引物浓度等5个主要影响因素,设置不同的水平梯度,筛选出适宜的因子范围;在此基础上,进一步采用L16(45)正交设计,建立了红毛丹SRAP-PCR最佳反应体系:20μL体系中包含DNA模板20 ng、d NTPs 0.25 mmol/L、引物0.6μmol/L、r Taq酶1.0 U、Mg2+2.5 mmol/L。并利用优化的反应体系,从116对SRAP引物组合中筛选出37对扩增条带清晰、产物多态性较好的引物。本研究建立的SRAP-PCR体系及筛选的引物,将为红毛丹从分子水平进行种质资源遗传多样性分析、品种指纹图谱构建等研究提供基础。(本文来源于《分子植物育种》期刊2015年11期）
多态性标记论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
目的筛选出能快速鉴定四种常用品系大鼠[Wistar大鼠、Goto-Kakizaki(GK)大鼠、Brown-Norway(BN)大鼠、Sprague-Dawley(SD)大鼠]的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点并验证其可靠性。方法首先对Wistar大鼠和GK大鼠进行全基因组重测序,利用生物信息学技术将重测序结果比对到BN大鼠参考基因组,筛查到Wistar大鼠和GK大鼠基因组范围内的特异性SNP,并从中进一步筛选出一组候选SNP位点,再利用一代测序和DNA混合池法对以上候选SNP位点在Wistar、GK、BN、SD四种大鼠群体中进一步筛查与验证。结果 Wistar和GK大鼠通过比对分别得到94 800和106 019个纯合特异性SNP,其中有56 216个SNP为Wistar和GK大鼠所共有,且发现BN大鼠参考基因组、Wistar大鼠和GK大鼠叁者基因型互不相同的位点仅有38个,从中挑选了15个作为候选SNP位点,最终在Wistar、GK、BN、SD四种大鼠群体验证中得到13个可以区分四个品系大鼠的SNP标记及其在各个品系中的基因型。结论筛查并验证了能区分Wistar、GK、BN和SD四种大鼠的13个SNP标记,这些SNP标记可快速区分出Wistar、GK、BN和SD大鼠。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
多态性标记论文参考文献
[1].忻雅,方献平,王淑珍,童建新,来文国.简单重复序列标记和序列相关扩增多态性标记在草莓遗传多样性分析中的比较[J].浙江大学学报(农业与生命科学版).2019
[2].曾玉琳,蒙裕欢,张钰,杜红丽.用于四种常用品系大鼠鉴定的单核苷酸多态性标记筛查和应用研究[J].中国比较医学杂志.2018
[3].马小定,唐江红,张佳妮,崔迪,李慧.东乡野生稻与日本晴多态性标记的开发[J].作物学报.2019
[4].杨艳婷,侯向阳,魏臻武,乔志宏,常春.羊草叶绿体非编码区多态性标记筛选及群体遗传多样性[J].草业学报.2018
[5].刘娟,陈广凤,田纪春,吴澎,赵子彤.馒头质构性状与单核苷酸多态性标记关联分析[J].食品与发酵工业.2018
[6].林兴娥,牛俊海,陈莹,马蔚红,臧小平.红毛丹SSR-PCR反应体系优化及多态性标记筛选[J].分子植物育种.2018
[7].王振玉,李威,周晓箭,裴小雨,刘艳改.棉花单核苷酸多态性标记研究进展[J].棉花学报.2016
[8].肖超.母胎差异甲基化联合单核苷酸多态性标记建立无创性产前亲权鉴定方法的探索研究[D].华中科技大学.2016
[9].张沁斌,秦永田,许蒙蒙,陈永强,李卫华.利用单核苷酸多态性标记定位玉米叶夹角主效QTL[J].河南农业大学学报.2016
[10].林兴娥,周兆禧,葛宇,臧小平,肖正新.红毛丹SRAP反应体系优化及多态性标记筛选[J].分子植物育种.2015