本文主要研究内容
作者姚怡玮,徐静,杨萌,李燕呢,何美军,郭坤元,吴斌（2019）在《基于生物信息学方法预测野葛中的miRNA及其靶基因》一文中研究指出：目的:基于GitHub上释放的野葛转录组序列和miRBase中的microRNAs(miRNA)数据,通过生物信息学方法预测野葛中保守的miRNA,为研究其在野葛中的生物学作用奠定基础。方法:根据miRNA在植物中的保守性,利用psRobot软件的前体预测模块"psRobot-mir"将miRBase数据库中已知的miRNA序列与野葛转录组序列进行比对,按照miRNA的判定标准进行筛选,并随机选取了7条miRNA进行茎-环PCR验证,随后利用psRNATarget软件对这些miRNA进行了靶基因预测。结果:在野葛中共预测出34条潜在的miRNA序列,它们属于18个基因家族,miRNA茎-环PCR验证的成功率是100%。基于罚分≤3,预测出235个靶基因,其中66个具有明确的功能,涉及野葛抗病、生长发育、转录调节、胁迫应答等,其中28个为抗病蛋白。结论:预测出的野葛保守miRNA及其靶基因,为今后解析miRNA在野葛抗病和次生代谢产物合成中的作用奠定了基础。
Abstract
mu de :ji yu GitHubshang shi fang de ye ge zhuai lu zu xu lie he miRBasezhong de microRNAs(miRNA)shu ju ,tong guo sheng wu xin xi xue fang fa yu ce ye ge zhong bao shou de miRNA,wei yan jiu ji zai ye ge zhong de sheng wu xue zuo yong dian ding ji chu 。fang fa :gen ju miRNAzai zhi wu zhong de bao shou xing ,li yong psRobotruan jian de qian ti yu ce mo kuai "psRobot-mir"jiang miRBaseshu ju ku zhong yi zhi de miRNAxu lie yu ye ge zhuai lu zu xu lie jin hang bi dui ,an zhao miRNAde pan ding biao zhun jin hang shai shua ,bing sui ji shua qu le 7tiao miRNAjin hang jing -huan PCRyan zheng ,sui hou li yong psRNATargetruan jian dui zhe xie miRNAjin hang le ba ji yin yu ce 。jie guo :zai ye ge zhong gong yu ce chu 34tiao qian zai de miRNAxu lie ,ta men shu yu 18ge ji yin jia zu ,miRNAjing -huan PCRyan zheng de cheng gong lv shi 100%。ji yu fa fen ≤3,yu ce chu 235ge ba ji yin ,ji zhong 66ge ju you ming que de gong neng ,she ji ye ge kang bing 、sheng chang fa yo 、zhuai lu diao jie 、xie pai ying da deng ,ji zhong 28ge wei kang bing dan bai 。jie lun :yu ce chu de ye ge bao shou miRNAji ji ba ji yin ,wei jin hou jie xi miRNAzai ye ge kang bing he ci sheng dai xie chan wu ge cheng zhong de zuo yong dian ding le ji chu 。
论文参考文献
论文详细介绍
论文作者分别是来自中国现代中药的姚怡玮,徐静,杨萌,李燕呢,何美军,郭坤元,吴斌，发表于刊物中国现代中药2019年04期论文，是一篇关于野葛论文,生物信息学论文,靶基因论文,中国现代中药2019年04期论文的文章。本文可供学术参考使用，各位学者可以免费参考阅读下载，文章观点不代表本站观点，资料来自中国现代中药2019年04期论文网站，若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权，请联系我们删除。
标签：野葛论文; 生物信息学论文; 靶基因论文; 中国现代中药2019年04期论文;