高高:家兔MHC Ⅱ DQ基因的分子克隆及其表达分析论文

高高:家兔MHC Ⅱ DQ基因的分子克隆及其表达分析论文

本文主要研究内容

作者高高(2019)在《家兔MHC Ⅱ DQ基因的分子克隆及其表达分析》一文中研究指出:主要组织相容性复合物(MHC)是一种高度多态性的基因组,编码脊椎动物中发现的免疫球蛋白样受体,其表达产物分布在各种细胞的表面。它被称为MHC分子,在人体免疫系统中起着非常重要的抗原呈递作用。它不仅与移植排斥有关,而且与动物的某些经济特征密切相关。MHC抗原参与机体的免疫反应,在机体的免疫反应调节,抗原识别和呈递中发挥重要作用。同时,MHC的遗传背景和不同个体之间的多样性水平的差异可导致个体对疾病的抗性和易感性的差异。因此,MHC作为抗病性和易感性的候选基因已成为遗传育种研究的热点,并且它也越来越受到生态学家群体遗传学家和动物遗传学育种者的关注。本研究以家兔为实验材料,为更加完整的了解MHCⅡDQ基因的结构和功能,采用RACE技术,获得了家兔MHCⅡDQ基因的完整cDNA序列,并进行了克隆测序,采用生物信息学技术,分析并预测了基因的结构和功能。主要研究结果如下:1.使用RACE技术克隆获得了家兔MHCⅡDQ基因的完整cDNA序列,采用生物信息学技术,分析和预测基因的结构和功能。MHCⅡDQ基因cDNA全长1148bp(GenBank登录号:XM002714510.3),5’UTR21bp,3’UTR318bp。其中CDS区为768bp,编码255个氨基酸。分析预测MHCⅡDQ蛋白分子量为28.094kDa,理论等电点:pI=5.23,二级结构大部分为α螺旋和β折叠,有明显的跨膜区,属于分泌蛋白,基因编码的氨基酸序列中存在2个N-连接糖基化,不存在O-连接糖基化位点。成熟蛋白质不稳定指数(instability index(II))为45.89,是一种不稳定蛋白质;共含有28个负性氨基酸残基(Asp+Glu),20个带正电荷的氨基酸残基(Arg+Lys),其总平均疏水指数(Grand average of hydropathicity)为0.076,属于疏水蛋白。在与其它动物序列比对中,核苷酸序列与氨基酸序列与牛、马同源性最高。2.在mRNA水平上,MHCⅡDQ是一个广谱表达基因,它广泛存在于肝脏和脾脏中,在心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、胃、大脑、回肠中均可检测到,且在脾脏和大脑之间存在明显的组织差异表达(P<0.05)。在脾脏、肝脏表达较高,在大脑中表达最低。MHCⅡDQ基因mRNA的表达量:脾脏>肝脏>肺脏>回肠>心脏>肾脏>胃>大脑,说明免疫器官存在MHCⅡDQ基因的高表达。

Abstract

zhu yao zu zhi xiang rong xing fu ge wu (MHC)shi yi chong gao du duo tai xing de ji yin zu ,bian ma ji chui dong wu zhong fa xian de mian yi qiu dan bai yang shou ti ,ji biao da chan wu fen bu zai ge chong xi bao de biao mian 。ta bei chen wei MHCfen zi ,zai ren ti mian yi ji tong zhong qi zhao fei chang chong yao de kang yuan cheng di zuo yong 。ta bu jin yu yi zhi pai chi you guan ,er ju yu dong wu de mou xie jing ji te zheng mi qie xiang guan 。MHCkang yuan can yu ji ti de mian yi fan ying ,zai ji ti de mian yi fan ying diao jie ,kang yuan shi bie he cheng di zhong fa hui chong yao zuo yong 。tong shi ,MHCde wei chuan bei jing he bu tong ge ti zhi jian de duo yang xing shui ping de cha yi ke dao zhi ge ti dui ji bing de kang xing he yi gan xing de cha yi 。yin ci ,MHCzuo wei kang bing xing he yi gan xing de hou shua ji yin yi cheng wei wei chuan yo chong yan jiu de re dian ,bing ju ta ye yue lai yue shou dao sheng tai xue jia qun ti wei chuan xue jia he dong wu wei chuan xue yo chong zhe de guan zhu 。ben yan jiu yi jia tu wei shi yan cai liao ,wei geng jia wan zheng de le jie MHCⅡDQji yin de jie gou he gong neng ,cai yong RACEji shu ,huo de le jia tu MHCⅡDQji yin de wan zheng cDNAxu lie ,bing jin hang le ke long ce xu ,cai yong sheng wu xin xi xue ji shu ,fen xi bing yu ce le ji yin de jie gou he gong neng 。zhu yao yan jiu jie guo ru xia :1.shi yong RACEji shu ke long huo de le jia tu MHCⅡDQji yin de wan zheng cDNAxu lie ,cai yong sheng wu xin xi xue ji shu ,fen xi he yu ce ji yin de jie gou he gong neng 。MHCⅡDQji yin cDNAquan chang 1148bp(GenBankdeng lu hao :XM002714510.3),5’UTR21bp,3’UTR318bp。ji zhong CDSou wei 768bp,bian ma 255ge an ji suan 。fen xi yu ce MHCⅡDQdan bai fen zi liang wei 28.094kDa,li lun deng dian dian :pI=5.23,er ji jie gou da bu fen wei αluo xuan he βshe die ,you ming xian de kua mo ou ,shu yu fen bi dan bai ,ji yin bian ma de an ji suan xu lie zhong cun zai 2ge N-lian jie tang ji hua ,bu cun zai O-lian jie tang ji hua wei dian 。cheng shou dan bai zhi bu wen ding zhi shu (instability index(II))wei 45.89,shi yi chong bu wen ding dan bai zhi ;gong han you 28ge fu xing an ji suan can ji (Asp+Glu),20ge dai zheng dian he de an ji suan can ji (Arg+Lys),ji zong ping jun shu shui zhi shu (Grand average of hydropathicity)wei 0.076,shu yu shu shui dan bai 。zai yu ji ta dong wu xu lie bi dui zhong ,he gan suan xu lie yu an ji suan xu lie yu niu 、ma tong yuan xing zui gao 。2.zai mRNAshui ping shang ,MHCⅡDQshi yi ge an pu biao da ji yin ,ta an fan cun zai yu gan zang he pi zang zhong ,zai xin zang 、gan zang 、pi zang 、fei zang 、shen zang 、wei 、da nao 、hui chang zhong jun ke jian ce dao ,ju zai pi zang he da nao zhi jian cun zai ming xian de zu zhi cha yi biao da (P<0.05)。zai pi zang 、gan zang biao da jiao gao ,zai da nao zhong biao da zui di 。MHCⅡDQji yin mRNAde biao da liang :pi zang >gan zang >fei zang >hui chang >xin zang >shen zang >wei >da nao ,shui ming mian yi qi guan cun zai MHCⅡDQji yin de gao biao da 。

论文参考文献

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  • 论文详细介绍

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