导读:本文包含了高分辨率熔解曲线论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献，主要关键词:银杏(Ginkgo,biloba,L.),高分辨率熔解曲线,单核苷酸多态性,基因分型
高分辨率熔解曲线论文文献综述
吴雅琼,辛月,王建文,祁铭,荣浩[1]（2019）在《基于高分辨率熔解曲线的银杏SNP分型方法构建》一文中研究指出本研究旨在探究利用高分辨率熔解曲线(HRM)进行银杏SNP分型的最优体系。试验结果表明:使用Forget-Me-Not~(TM)qPCR Master Mix Eva Green染料(10μL反应体系),引物浓度为0.1μmol/L,DNA浓度2.5 ng/μL情况下,银杏SNP分型能取得较好的区分效果。结果显示本体系有高通量、方便快捷和经济实用等优势。本研究建立的银杏SNP基因分型体系适合一次试验对单位点、多个体情况下的SNP鉴定和快速分型。利用优化的HRM体系,从银杏转录组数据中筛选获得了22个阳性SNP位点,并在3个银杏地区(90个个体中)进行了分型验证。该方法将在林木遗传图谱构建、品种鉴别、遗传多样性研究等方面有广泛应用前景。(本文来源于《分子植物育种》期刊2019年15期）
张雪艳,袁媛,胡启跳,蒋超,方成武[2]（2019）在《龟甲的特异性PCR及高分辨率熔解曲线技术鉴别方法研究》一文中研究指出目的:建立高效、稳定的龟甲Testudinis Carapax et Plastrum DNA鉴别方法。方法:利用龟甲的特异性聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction,PCR)鉴别方法和高分辨率熔解曲线(HRM)鉴别方法,根据龟甲及其混伪品COI序列差异,寻找特异性单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点设计鉴别引物,并对PCR反应条件进行优化;并使用通用引物扩增COI区域,产物直接进行HRM分析。结果:当退火温度为60℃,循环次数为35,使用设计的龟甲特异性鉴别引物GJ-360.F/R进行PCR扩增,经扩增均获得约360 bp特异性鉴别条带,混伪品皆无条带;使用通用引物RonM-tl和Vl-tl进行PCR扩增,产物使用HRM分析,龟甲药材在模板DNA质量浓度为3.5～87.9 ng·μL~(-1)、引物浓度为0.2μmol·L~(-1)、镁离子浓度为2.0 mmol·L~(-1)的条件下,龟甲药材标准熔解曲线为双峰,其T_m均值分别为(83.15±0.76)、(87.53±0.69)℃。结论:特异性PCR和HRM均可作为一种快速准确鉴别龟甲正伪品的鉴定方法。(本文来源于《中国现代中药》期刊2019年09期）
徐娟,吴伟伟,郑文爱,赵飞,张玲[3]（2019）在《基于高分辨率熔解曲线的常见五种皮肤癣菌分子鉴定》一文中研究指出皮肤癣菌是浅表真菌感染的重要致病菌,常见致病菌种包括红色毛癣菌、趾间毛癣菌、絮状表皮癣菌、犬小孢子菌和内弯小孢子菌。本研究基于实时荧光PCR的高分辨率熔解曲线分析技术,以几丁质合成酶1为目标基因设计扩增引物,对经测序鉴定的上述5种皮肤癣菌进行熔解曲线分析,并在方法建立后,对已鉴定的临床菌株进行验证。实验结果表明,使用该方法上述5种皮肤癣菌均能扩增,并表现出不同的熔解曲线和熔解温度值,可有效区分;对其余对照菌及人基因均无法扩增,特异性为100%;临床菌株的熔解曲线分析结果与DNA测序结果一致。本研究提供了一种快速、准确鉴别5种常见皮肤癣菌的方法,可为临床应用和分子流行病学研究提供参考。(本文来源于《菌物学报》期刊2019年08期）
滕新栋,程晓兰,陈晓光,贺骥,朱可[4]（2019）在《高分辨率熔解曲线快速特异的鉴定叁带喙库蚊》一文中研究指出叁带喙库蚊是我国日本脑炎的主要传播媒介,从其体内分离到日本脑炎病毒的概率和最低现场感染率均较高;在热带、亚热带地区是基孔肯雅病毒的传播媒介之一;叁带喙库蚊还可携带Colti病毒、盖塔病毒、Kadipiro病毒等病原微生物;鉴于叁带喙库蚊的危害,准确快速的鉴定对预防和控制以叁带喙库蚊为传播载体的蚊媒传染病有重要意义。本研究旨在探讨高分辨率熔解曲线(HRM)快速特异的鉴定叁带喙库蚊。从辽宁口岸,山东口岸和广东口岸捕获叁带喙库蚊、淡色库蚊、致倦库蚊、白纹伊蚊、埃及伊蚊、刺扰伊蚊、骚扰阿蚊、背点伊蚊、凶小库蚊,依据《中国国境口岸医学媒介生物鉴定图谱》进行形态学鉴定;设计针对叁带喙库蚊线粒体基因组COIII基因的特异性引物(COIII-F:5’-CGATGAGGAATAATTTTATT-3’,COIII-R:5’-CAGTAAAGAATAAACTTTGAG-3’),并对引物特异性进行验证;用HRM鉴定叁带喙库蚊,并测试检测方法的重复性。结果显示,从叁带喙库蚊中扩增出COIII基因片段(262 bp),经测序比对,与形态学鉴定一致;叁带喙库蚊有明显的HRM扩增曲线,淡色库蚊、致倦库蚊、白纹伊蚊、埃及伊蚊、刺扰伊蚊、骚扰阿蚊、背点伊蚊、凶小库蚊和阴性对照均无扩增曲线;建立的方法重复检测提取的叁带喙库蚊线粒体基因组DNA,COIII基因片段扩增曲线走势差异较小,具良好的重复性。结果表明,采用基于COIII基因的HRM能准确快速鉴定叁带喙库蚊,可作为叁带喙库蚊相关标本特异性鉴定的手段。(本文来源于《第六届国际蚊虫及虫媒病监测和防治学术研讨会暨第十二届全国医学昆虫学学术讨论会摘要集》期刊2019-05-27）
姚欣,黎彧利,朱艮苗[5]（2019）在《高分辨率熔解曲线对痰液中结核分枝杆菌耐药性分析》一文中研究指出目的利用高分辨率熔解曲线检测痰液中结核分枝杆菌的耐药性。方法取250例肺结核患者的痰样品进行涂片镜检和琼脂平板耐药性分析,通过实时PCR对耐药基因位点进行扩增。通过熔解曲线,将rpoB基因作为利福平抗性的生物标志物,将katG基因和inhA启动子区域作为异烟肼抗性的生物标志物。比较药敏试验的结果和熔解曲线分析的结果,以评估灵敏度、特异性、阳性预测值和阴性预测值的参数。结果高分辨率熔解曲线对利福平耐药的敏感性为90.3%,特异性为90.4%,阳性预测值为84.8%,阴性预测值为94.0%。对异烟肼的耐药率为90.2%,特异性为93.9%,阳性预测值为91.1%,阴性预测值为93.3%。多药耐药结核病的敏感性、特异性、阳性预测值和阴性预测值分别为89.9%、90.6%、78.5%和95.9%。结论高分辨率熔解曲线分析可用于痰标本中多药耐药结核的快速诊断。(本文来源于《新疆医科大学学报》期刊2019年05期）
杨敏,于潞,吴长新,张辉,陈创夫[6]（2019）在《高分辨率熔解曲线检测结核分枝杆菌对利福平耐药性研究》一文中研究指出目的评价高分辨率熔解曲线(high resolution melt,HRM)技术检测结核分枝杆菌对利福平耐药性的临床应用价值。方法用传统结核分枝杆菌药敏试验对新疆石河子大学人畜共患病实验室保存的50株临床分离菌进行耐药性检测。以rpoB基因的利福平耐药决定区为靶标设计引物进行高分辨率熔解曲线分析,判断分离出的结核分枝杆菌是否对利福平耐药。应用SPSS 17.0分析,以传统结核分枝杆菌药敏试验结果为标准,计算两种方法的符合率。用χ~2检测分析比例法药敏结果与高分辨率熔解曲线检测结果的差异性。用Kappa检测分析两种结果的一致性。结果药敏试验结果显示,50株菌中有1株为非结核分枝杆菌;49株中有20株同时对利福平和异烟肼耐药、1株仅对利福平耐药;HRM检测结果显示,21株对利福平耐药,28株为敏感株。以传统药敏试验为参考,HRM检测利福平耐药性的敏感性为86.36%,特异性为92.59%,经Kappa检验显示,两种方法检测结果具有高度一致性。结论 HRM可快速检测结核分枝杆菌对利福平的耐药性,具有较高灵敏度,在耐药结核病的早期诊断上有一定的应用价值。(本文来源于《中国预防医学杂志》期刊2019年03期）
陈焱森,谢苏,沈永巧,张淑君,黄涛[7]（2018）在《利用高分辨率熔解曲线技术进行猪亲子鉴定的研究》一文中研究指出本研究旨在为猪亲子鉴定提供一种快速、准确的鉴定方法。先用非变性聚酰胺凝胶电泳方法对猪的55个微卫星位点进行筛选,再以高分辨率熔解曲线(HRM)技术对筛选出的微卫星位点进行多态性检测,再对其中一微卫星位点进行克隆测序验证,处理得到的数据,进行猪亲子鉴定研究。结果表明:利用非变性聚酰胺凝胶电泳实验筛选出12个适于HRM检测的微卫星位点,HRM技术对12个微卫星多态性进行检测,共检测出50个等位基因,平均值为4.167个,有效等位基因数平均值为2.675 0,群体遗传杂合度平均值为0.595 0,平均多态信息含量为0.540 0;对SW72位点克隆测序的结果与HRM技术检测结果一致;12个微卫星组合在双亲未知、只知单亲和双亲已知的情况下计算的累积排除率各为0.940 1、0.991 5和0.999 9;利用建立的亲子鉴定体系对样本中8个家系进行检测,结果累积排父率均大于0.999 9。HRM技术对12个微卫星位点组合进行检测,能够快速、准确地对猪进行亲子鉴定。(本文来源于《中国畜牧杂志》期刊2018年12期）
李志刚,吴晓松,赵俊,朱灿灿,刘勇[8]（2018）在《基于微流控高分辨率熔解曲线的基因分型研究》一文中研究指出目的建立一种用于人类乙醇脱氢酶2(acetaldehyde dehydrogenase 2, ALDH2)基因单核苷酸多态性位点准确快速分型的方法。方法将微流控芯片、实时荧光聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)与高分辨率熔解曲线技术相结合。采用聚合物材料制作微流控芯片,在确保熔解过程中温度变化的均一性和精确性的同时,可显着改善热能传输,提高热循环速度,缩短分析时间,从而实现对单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点的快速检测与分析。结果在自主研制的微流控高分辨率熔解曲线分析系统上,以标准质粒为实验材料,测试了该系统的最低检测限可达10 copies/μL。同时,成功地实现了人类ALDH2基因叁种基因分型(AA/GG/AG)的检测。结论微流控高分辨率熔解曲线分析系统为ALDH2基因分型提供了一种准确快速的检测方法,对指导临床硝酸甘油的个性化用药具有重要意义。(本文来源于《中国激光医学杂志》期刊2018年05期）
李玉秋,王超越,夏正俊,刘月,桑永生[9]（2018）在《高分辨率熔解曲线技术在大豆基因分型中的应用》一文中研究指出高分辨熔解曲线(high resolution melting, HRM)分析技术是一种高效,快速,便捷的核苷酸检测方法。本实验从染料用量、模板浓度、产物片段长度3个方面探索了适宜HRM分析的最佳条件,并利用HRM技术对单核苷酸(single nucleotide polymorphism, SNP)及插入/缺失(insertion-deletion, InDel)检测及基因分型等方面进行了分析。结果表明:10μL反应体系中,20×Eva Green饱和染料加入0.1~0.3μL,模板浓度加入10~200 ng不影响HRM分辨率;扩增产物长度在70~190 bp范围内,插入/缺失片段长度3~13 bp范围内,高分辨熔解曲线均有较好的分辨效果。利用HRM分析技术检测分析F4个体基因型,结果与PAGE电泳分析完全一致。本实验结果说明,HRM技术与传统凝胶电泳基因分型方法相比,具有操作简单、分辨率高、准确快速、成本低等优点,是基因型鉴定的最佳选择。(本文来源于《分子植物育种》期刊2018年18期）
贺文,吴婉婉,陆平,薛志刚,盛哲津[10]（2018）在《高分辨率熔解曲线在CRISPR基因编辑检测和基因型鉴定中的应用》一文中研究指出目的建立一种基于PCR和在线高分辨率熔解曲线(high-resolution melting curve,HRM)分析工具的检测方法,实现对DNA序列微小差异的快速检测。方法在CRISPR基因编辑检测和基因型鉴定中,采用两步PCR,分别对目的片段进行扩增和富集,并通过免费在线软件对HRM进行分析。结果 HRM分析结果显示,本实验所设计的CRISPR慢病毒系统未能对COS7细胞中的RPE65基因进行有效的基因编辑;而在瘦素突变大鼠的子代基因型中,HRM可以明显区分杂合子和纯合子。结论 HRM能够快速鉴定CRISPR编辑和区分基因型。(本文来源于《同济大学学报(医学版)》期刊2018年04期）
高分辨率熔解曲线论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
目的:建立高效、稳定的龟甲Testudinis Carapax et Plastrum DNA鉴别方法。方法:利用龟甲的特异性聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction,PCR)鉴别方法和高分辨率熔解曲线(HRM)鉴别方法,根据龟甲及其混伪品COI序列差异,寻找特异性单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点设计鉴别引物,并对PCR反应条件进行优化;并使用通用引物扩增COI区域,产物直接进行HRM分析。结果:当退火温度为60℃,循环次数为35,使用设计的龟甲特异性鉴别引物GJ-360.F/R进行PCR扩增,经扩增均获得约360 bp特异性鉴别条带,混伪品皆无条带;使用通用引物RonM-tl和Vl-tl进行PCR扩增,产物使用HRM分析,龟甲药材在模板DNA质量浓度为3.5～87.9 ng·μL~(-1)、引物浓度为0.2μmol·L~(-1)、镁离子浓度为2.0 mmol·L~(-1)的条件下,龟甲药材标准熔解曲线为双峰,其T_m均值分别为(83.15±0.76)、(87.53±0.69)℃。结论:特异性PCR和HRM均可作为一种快速准确鉴别龟甲正伪品的鉴定方法。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
高分辨率熔解曲线论文参考文献
[1].吴雅琼,辛月,王建文,祁铭,荣浩.基于高分辨率熔解曲线的银杏SNP分型方法构建[J].分子植物育种.2019
[2].张雪艳,袁媛,胡启跳,蒋超,方成武.龟甲的特异性PCR及高分辨率熔解曲线技术鉴别方法研究[J].中国现代中药.2019
[3].徐娟,吴伟伟,郑文爱,赵飞,张玲.基于高分辨率熔解曲线的常见五种皮肤癣菌分子鉴定[J].菌物学报.2019
[4].滕新栋,程晓兰,陈晓光,贺骥,朱可.高分辨率熔解曲线快速特异的鉴定叁带喙库蚊[C].第六届国际蚊虫及虫媒病监测和防治学术研讨会暨第十二届全国医学昆虫学学术讨论会摘要集.2019
[5].姚欣,黎彧利,朱艮苗.高分辨率熔解曲线对痰液中结核分枝杆菌耐药性分析[J].新疆医科大学学报.2019
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[7].陈焱森,谢苏,沈永巧,张淑君,黄涛.利用高分辨率熔解曲线技术进行猪亲子鉴定的研究[J].中国畜牧杂志.2018
[8].李志刚,吴晓松,赵俊,朱灿灿,刘勇.基于微流控高分辨率熔解曲线的基因分型研究[J].中国激光医学杂志.2018
[9].李玉秋,王超越,夏正俊,刘月,桑永生.高分辨率熔解曲线技术在大豆基因分型中的应用[J].分子植物育种.2018
[10].贺文,吴婉婉,陆平,薛志刚,盛哲津.高分辨率熔解曲线在CRISPR基因编辑检测和基因型鉴定中的应用[J].同济大学学报(医学版).2018