导读:本文包含了序列模式分析论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献，主要关键词:家蝇,几丁质酶2,基因克隆,生物信息学分析
序列模式分析论文文献综述
苏佩佩,赵欣宇,李妍,马慧玲,杨隆兵[1]（2019）在《家蝇几丁质酶MDCht2基因的序列分析、克隆与表达模式分析》一文中研究指出目的从家蝇的基因组库中筛选几丁质酶2(MDCht2)基因,进行cDNA克隆及分子特性分析,对其时空表达模式进行初步探索。方法从家蝇基因组数据库中筛选MDCht2基因,以该基因的cDNA为模板进行PCR扩增,采用生物信息学相关软件对MDCht2基因及其编码蛋白质的基本理化性质、信号肽、蛋白质结构等进行分析,预测蛋白质功能。取家蝇不同生活史时期(卵,1龄幼虫,2龄幼虫,3龄幼虫,蛹,雌雄成虫)及3龄幼虫不同组织(体壁,气管,马氏管,唾液腺,脂肪体,肠道)标本,采用实时荧光定量PCR检测MDCht2基因表达情况。结果 MDCht2基因cDNA全长1 932 bp,ORF框全长1 530 bp,编码509个氨基酸,理论相对分子质量为57.8×10~3,pI 5.67,属于亲水性的酸性蛋白,有信号肽,功能结构域位于第37～385位氨基酸间,无几丁质结合域。二级结构分析显示存在无规则卷曲(Cc),α螺旋(Hh),β折叠(Ee)3种类型。PCR扩增得到MDCht2基因长为1 530 bp的序列片段。实时荧光定量PCR检测家蝇MDCht2基因在蛹期的表达量较卵期上调6.477 01倍(P<0.01),3龄幼虫表达量上调2.655 25倍(P<0.01),1龄幼虫的表达量上调2.475 01倍(P<0.05),表达水平排列顺序为蛹>3龄幼虫>1龄幼虫>2龄幼虫>卵>雄成虫>雌成虫。以体壁为参照,MDCht2基因在家蝇气管中的表达量较高,气管中的表达量较体壁上调1.816 51倍(P<0.01),表达水平为气管>体壁>唾液腺>脂肪体>肠道>马氏管。结论成功克隆了家蝇的MDCht2基因并初步探索了其时空表达模式,即MDCht2基因在蛹期及气管组织高表达,为MDCht2的功能研究奠定了基础。(本文来源于《中国病原生物学杂志》期刊2019年06期）
刘豫航,黄少伟,梅生伟,张雪敏[2]（2019）在《基于序列模式挖掘的电力系统连锁故障模式分析方法》一文中研究指出研究连锁故障的传播规律,对于识别系统薄弱环节、制定连锁故障预防和阻断策略具有重要意义。在分析连锁故障发展过程的基础上,定义了连锁故障模式的概念,并基于序列模式挖掘技术提出连锁故障模式挖掘算法,实现对海量仿真数据的快速分析,有效辨识系统连锁故障模式。最后以IEEE 39节点系统和某省实际电网为例,利用该算法挖掘出系统主要连锁故障模式,并结合系统拓扑和潮流状态分析了系统连锁故障传播规律。测试结果证明,该方法对于分析系统连锁故障模式和辨识关键线路具有良好的效果。(本文来源于《电力系统自动化》期刊2019年06期）
张园,刘正杰,徐绍忠,赵明富,林春[3]（2018）在《铁皮石斛蔗糖合成酶基因序列特征与表达模式分析》一文中研究指出目前,在铁皮石斛多糖的研究主要集中在多糖的结构、生物活性等方面,对多糖合成相关基因研究较少,本研究通过对‘红鑫1号’铁皮石斛幼苗期和二年生植株以及‘红鑫6号’铁皮石斛二年生植株叶、茎、根叁部位蔗糖合成酶基因SS进行RT-PCR扩增与测序,发现‘红鑫1号’与‘红鑫6号’铁皮石斛的蔗糖合成酶前体m RNA存在拼接差异的现象,主要形成叁种不同的mRNA转录本,其翻译得到的蔗糖合成酶,结构功能没有改变;分析序列的可变剪切的差异;同时对铁皮石斛叶、茎、根SS的表达量进行半定量RT-PCR检测,蔗糖合成酶基因在植株中不同部位表达量不同,其表达模式表现为茎>叶>根。本研究为铁皮石斛蔗糖合成酶基因功能研究提供了科学依据。(本文来源于《分子植物育种》期刊2018年20期）
刘春浩,梁楠松,于磊,赵兴堂,曹羊[4]（2018）在《水曲柳丙二烯氧化物合成酶基因FmAOS序列与表达模式分析》一文中研究指出茉莉酸(jasmonic acid,JA)作为一种重要的信号分子参与了植物的生长发育过程,JA生物合成途径中的关键酶为丙二烯氧化物合成酶(allene oxide synthase,AOS)。本研究克隆了水曲柳(Fraxinus mandschurica)AOS基因,命名为Fm AOS。生物信息学分析表明该基因全长1 605 bp,具有完整的开放阅读框,编码534个氨基酸。Fm AOS为两性不稳定性蛋白,不存在信号肽,具有跨膜能力,亚细胞定位预测其存在于叶绿体中。叁维建模分析表明该蛋白属于混和型。Fm AOS表达模式分析表明,其响应了寒冷、Na Cl、干旱等非生物胁迫及脱落酸(ABA)、赤霉素(GA3)等植物激素信号,但表达模式各不相同,说明Fm AOS参与了植物的生长发育和逆境胁迫的平衡。本文为Fm AOS功能的深入研究提供参考。(本文来源于《植物生理学报》期刊2018年05期）
施梦军,赵海峰,陈虹,马猛[5]（2018）在《基于移动序列模式分析人基因组调控短序列》一文中研究指出基因表达过程主要包括转录、剪接和翻译,多种调控元件参与其中,是个高度调控的过程。建模识别分析这些调控元件,对理解基因表达具有重要意义。本研究提出了一个基于移动序列模式的短序列建模模型,并对转录启动子和剪接调控元件进行了建模分析。启动子是基因转录的核心调控元件,剪接调控元件参与调控剪接位点的识别。分类实验结果表明,该模型可有效识别转录启动子序列和剪接调控元件序列。并进一步利用该模型,建模分析已为生物实验验证的、会导致剪接影响的基因组变异,实验结果表明,该模型可有效预测基因组变异的剪接影响,进一步验证了该模型的有效性。(本文来源于《基因组学与应用生物学》期刊2018年10期）
王茹茹,邓帅,丁瑞瑞,赵荣荣,张元湖[6]（2017）在《青香蕉苹果MdAFS基因序列与表达模式分析》一文中研究指出以青香蕉苹果叶片为材料,研究青香蕉苹果‘White Winter Pearmain’α-法尼烯合酶(α-farnesene synthase,Md AFS)全长基因结构特征及编码蛋白质性质,分析Md AFS基因的诱导表达模式。采用生物信息学软件对Md AFS及其编码蛋白质进行详细分析,应用MEGA 6.0对不同物种来源的AFS构建系统进化树,利用q RT-PCR技术研究Md AFS诱导表达模式。α-法尼烯合酶基因(Gen Bank No:AY563622)全长1 731 bp,由576氨基酸组成,是α螺旋为主要构成元件的混合型蛋白。不同物种的α-法尼烯合酶氨基酸序列相似度低,但α-法尼烯合酶N端RRx8W和C端的H-α1loop具有高度保守性。非生物胁迫和激素信号能诱导Md AFS基因上调表达,且MV、ABA和Me JA诱导该基因上调表达更加明显。α-法尼烯合酶氨基酸序列相似度低,但蛋白叁维结构相似;α-法尼烯合酶在蛋白结构和功能上具有单萜合酶特征,初步揭示了非生物胁迫和激素信号能诱导青香蕉苹果α-法尼烯代谢途径的关键酶Md AFS基因上调表达。(本文来源于《生物技术通报》期刊2017年07期）
梁梦夏[7]（2017）在《面向协同任务优化的序列模式分析方法研究》一文中研究指出在互联网、物联网、云计算、大数据及其他新兴信息技术的支持下,多组织协同完成一项任务的模式-协同任务模式在越来越多的领域得到应用,提高协同任务中业务过程的整体效率至关重要。相应地,资源服务也应该以“服务流”的方式服务于业务过程,促使二者之间更佳地匹配。然而,协同任务通常是一种跨组织的业务过程,资源服务的选取和使用对于每个组织而言相对独立,因此,这种自治性和全局最优化之间的矛盾制约了资源服务流的选取。为此,资源服务流的挖掘已成为协同任务系统中一个重要的研究主题。在协同工作流下,分析资源服务之间的时序关系,挖掘资源服务的序列模式,着重考虑资源服务序列的跨组织特性,并提出相应的分析和挖掘方法。分别展开如下研究:(1)资源服务时序关系模型。为了准确地描述资源服务序列,基于工作流模型,把资源服务的时序关系从工作流模型中分离出来,提出一种资源服务时序关系模型。(2)资源服务序列模式挖掘方法。为了分析并获得资源服务序列模式,通过分析资源服务之间的时序依赖关系,求解时序关系强度;同时,针对大规模业务数据,提出一种基于迭代的挖掘结果合并方法,其中,借助了移动平均法合并各分析结果为最终的资源服务时序关系模型,最后通过实验验证方法的有效性并对实验结果进行分析。(3)基于相似度的跨组织资源服务序列模式获取方法。考虑资源服务序列的组织特性,同时也为提高资源服务序列模式的可重用性,基于资源服务序列模式的分析和获取,对已有的资源服务序列进行扩展,首先定义同构序列和原始序列,从资源服务时序关系模型中得到原始序列,再对组织信息的相似度进行量化定义,把相似度高的同构序列作为扩展序列,并通过实验验证获取方法的有效性。最后,详细介绍了一个典型的协同任务系统-中小企业云制造服务平台,并通过该平台验证理论研究结果的有效性。(本文来源于《华侨大学》期刊2017-05-19）
周杨[8]（2017）在《基于序列模式挖掘的软件行为模式分析》一文中研究指出随着软件规模的不断增大,对复杂软件系统的行为进行分析日益成为数据挖掘领域的热点。软件的一次运行对应一条执行轨迹,表示软件的一次行为,从大量的软件执行轨迹中挖掘出人们感兴趣的行为模式对于帮助解决软件缺陷定位、软件异常检测、测试用例的选择和约减具有重要的现实意义。从数据挖掘的角度来看,软件的执行轨迹可以看成软件执行序列,因此,结合序列模式挖掘,从大量动态软件执行轨迹中进行软件行为模式分析,相关工作如下。首先,从软件执行轨迹中提取软件执行序列,并从动态、静态两个角度出发,结合距离匹配和统计分析方法提出一种关键函数的度量方法,既可以识别出软件中的关键函数,又可以为下文研究提供参考。其次,提出了一种基于PT-tree的频繁模式挖掘算法,该算法将软件执行序列数据库压缩成一个树结构,并通过数据结构FNodesets存储PT-tree中每个节点包含的项集,利用集合枚举树作为搜索空间,并基于超集等价特性作为剪枝策略,提升算法的效率。再次,结合前文给出的关键函数度量标准以及函数之间的调用关系,提出了一种基于函数调用路径序列的高效用路径模式挖掘算法FHUPPM。根据关键函数的排名分配各函数项的外部效用所占的比重,设计了一种表结构PIUL用于存储模式的效用信息和位置信息,提出了UCMS矩阵结构,并基于该结构设计了一种高效用模式剪枝策略,作为相邻路径模式扩展的判断依据。最后,对提出的挖掘算法进行实现,基于Windows平台,通过java语言进行实现。并通过对比算法进行实验分析,验证提出的算法在运行时间,内存占用及可扩展性等方面的性能。(本文来源于《燕山大学》期刊2017-05-01）
李晓一,詹亚光,娄晓瑞,曾凡锁[9]（2016）在《白桦BpUVR8基因的序列与表达模式分析》一文中研究指出本研究克隆了白桦(Betula platyphylla)UVR8基因,命名为BpUVR8(Gen Bank:AHY02156)。生物信息学分析表明该基因全长1 326 bp,编码441个氨基酸,为稳定性蛋白,不存在信号肽,具有2个跨膜区。二级结构分析表明该蛋白属于混合型。叁级结构预测结果显示,BpUVR8与AtUVR8蛋白结构具有较高相似性,均由7个β螺旋组成片层结构。BpUVR8表达模式分析表明,其主要在白桦叶片中表达,且8月份表达量最高;紫外诱导6 h,其转录表达水平上调约2倍;同时,非生物胁迫以及信号诱导在一定时间内也能影响该基因的转录表达。本文为研究白桦对UV-B信号的响应以及对UVR8功能的深入研究提供参考。(本文来源于《植物生理学报》期刊2016年05期）
何小龙,李蓓,付绍印,刘永斌,祁云霞[10]（2016）在《乌珠穆沁羊生长分化因子11基因外显子1序列CpG位点的甲基化模式分析》一文中研究指出为了探讨乌珠穆沁羊生长分化因子11(growth differentiation factor 11,GDF11)基因外显子1的甲基化模式,本研究采用亚硫酸氢盐测序PCR(BSP)的方法对普通乌珠穆沁羊和多脊椎乌珠穆沁羊GDF11基因外显子1的甲基化水平进行检测,通过检测发现普通乌珠穆沁羊GDF11基因外显子1的平均甲基化率为0.123,多脊椎乌珠穆沁羊的平均甲基化率为0.569,差异显着性检验表明这两组数据间差异极显着(P<0.01),即多脊椎乌珠穆沁羊GDF11基因外显子1中的CpG甲基化率极显着高于普通乌珠穆沁羊(P<0.01)。通过分析GDF11基因外显子1的13个CpGs位点发现,多脊椎乌珠穆沁羊CpG_11和CpG_13位点的甲基化率值最高,达到90%,推测这两个位点的甲基化可能与乌珠穆沁羊的脊椎数增加有关,是导致多脊椎发生的主要原因。(本文来源于《中国畜牧兽医》期刊2016年02期）
序列模式分析论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
研究连锁故障的传播规律,对于识别系统薄弱环节、制定连锁故障预防和阻断策略具有重要意义。在分析连锁故障发展过程的基础上,定义了连锁故障模式的概念,并基于序列模式挖掘技术提出连锁故障模式挖掘算法,实现对海量仿真数据的快速分析,有效辨识系统连锁故障模式。最后以IEEE 39节点系统和某省实际电网为例,利用该算法挖掘出系统主要连锁故障模式,并结合系统拓扑和潮流状态分析了系统连锁故障传播规律。测试结果证明,该方法对于分析系统连锁故障模式和辨识关键线路具有良好的效果。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
序列模式分析论文参考文献
[1].苏佩佩,赵欣宇,李妍,马慧玲,杨隆兵.家蝇几丁质酶MDCht2基因的序列分析、克隆与表达模式分析[J].中国病原生物学杂志.2019
[2].刘豫航,黄少伟,梅生伟,张雪敏.基于序列模式挖掘的电力系统连锁故障模式分析方法[J].电力系统自动化.2019
[3].张园,刘正杰,徐绍忠,赵明富,林春.铁皮石斛蔗糖合成酶基因序列特征与表达模式分析[J].分子植物育种.2018
[4].刘春浩,梁楠松,于磊,赵兴堂,曹羊.水曲柳丙二烯氧化物合成酶基因FmAOS序列与表达模式分析[J].植物生理学报.2018
[5].施梦军,赵海峰,陈虹,马猛.基于移动序列模式分析人基因组调控短序列[J].基因组学与应用生物学.2018
[6].王茹茹,邓帅,丁瑞瑞,赵荣荣,张元湖.青香蕉苹果MdAFS基因序列与表达模式分析[J].生物技术通报.2017
[7].梁梦夏.面向协同任务优化的序列模式分析方法研究[D].华侨大学.2017
[8].周杨.基于序列模式挖掘的软件行为模式分析[D].燕山大学.2017
[9].李晓一,詹亚光,娄晓瑞,曾凡锁.白桦BpUVR8基因的序列与表达模式分析[J].植物生理学报.2016
[10].何小龙,李蓓,付绍印,刘永斌,祁云霞.乌珠穆沁羊生长分化因子11基因外显子1序列CpG位点的甲基化模式分析[J].中国畜牧兽医.2016