赵慧利:葡萄果实发育期性状的SSR遗传分析及相关品质性状的GWAS分析论文

赵慧利:葡萄果实发育期性状的SSR遗传分析及相关品质性状的GWAS分析论文

本文主要研究内容

作者赵慧利(2019)在《葡萄果实发育期性状的SSR遗传分析及相关品质性状的GWAS分析》一文中研究指出:为寻找控制葡萄果实发育期性状及其他品质性状的基因位点,本研究对‘莎巴珍珠’SSR标记在后代衍生品种中的遗传传递情况进行分析。并以179个葡萄品种为材料,基于GBS测序结果对8个葡萄果实品质性状进行了全基因组关联分析研究。1.对‘莎巴珍珠’衍生系(‘莎巴珍珠’及其后代32个衍生品种以及5个其他亲本)进行SSR标记。选取50对分布在葡萄19条染色体上的SSR标记,对‘莎巴珍珠’SSR标记在其衍生后代中的遗传传递情况进行了分析。经筛选得到3个高遗传稳定且遗传频率均在80%以上的‘莎巴珍珠’特异SSR标记——VVMD5、VVMD32和VMC4F8分别位于16、4和1号染色体上。注释发现,其所在区域基因分别注释为受体蛋白激酶、未知蛋白和WRKY转录因子。研究结果表明,这些基因与‘莎巴珍珠’衍生品种果实发育期性状相关。2.对收集到的179份葡萄材料进行GBS测序。经筛选共获得的32,311个分布于葡萄全基因组的高质量SNP标记,用于全基因组关联分析(GWAS)。(1)以葡萄果粒颜色的定位结果为参照选择最优统计模型——GEMMA,作为本研究GWAS分析的模型对葡萄果实品质性状进行分析。(2)研究结果表明,葡萄果粒颜色与2号染色体上mybAs转录因子显著相关。果实发育期与两个位于16号染色体的SNPs标记显著相关,对该区间的进行基因注释发现该区间大多数候选基因为受体蛋白激酶。在17、18和19号染色体上均发现了与单果重显著相关的SNP位点。与葡萄果肉质地相关位点定位在16号染色体上,且在这一区间相关的候选基因与钙有关。5号染色体上检测到一个与果实香味相关的SNP标记,本研究找到的与葡萄发育期性状相关SNP与前人的QTL分析结果相一致。

Abstract

wei xun zhao kong zhi pu tao guo shi fa yo ji xing zhuang ji ji ta pin zhi xing zhuang de ji yin wei dian ,ben yan jiu dui ‘sha ba zhen zhu ’SSRbiao ji zai hou dai yan sheng pin chong zhong de wei chuan chuan di qing kuang jin hang fen xi 。bing yi 179ge pu tao pin chong wei cai liao ,ji yu GBSce xu jie guo dui 8ge pu tao guo shi pin zhi xing zhuang jin hang le quan ji yin zu guan lian fen xi yan jiu 。1.dui ‘sha ba zhen zhu ’yan sheng ji (‘sha ba zhen zhu ’ji ji hou dai 32ge yan sheng pin chong yi ji 5ge ji ta qin ben )jin hang SSRbiao ji 。shua qu 50dui fen bu zai pu tao 19tiao ran se ti shang de SSRbiao ji ,dui ‘sha ba zhen zhu ’SSRbiao ji zai ji yan sheng hou dai zhong de wei chuan chuan di qing kuang jin hang le fen xi 。jing shai shua de dao 3ge gao wei chuan wen ding ju wei chuan pin lv jun zai 80%yi shang de ‘sha ba zhen zhu ’te yi SSRbiao ji ——VVMD5、VVMD32he VMC4F8fen bie wei yu 16、4he 1hao ran se ti shang 。zhu shi fa xian ,ji suo zai ou yu ji yin fen bie zhu shi wei shou ti dan bai ji mei 、wei zhi dan bai he WRKYzhuai lu yin zi 。yan jiu jie guo biao ming ,zhe xie ji yin yu ‘sha ba zhen zhu ’yan sheng pin chong guo shi fa yo ji xing zhuang xiang guan 。2.dui shou ji dao de 179fen pu tao cai liao jin hang GBSce xu 。jing shai shua gong huo de de 32,311ge fen bu yu pu tao quan ji yin zu de gao zhi liang SNPbiao ji ,yong yu quan ji yin zu guan lian fen xi (GWAS)。(1)yi pu tao guo li yan se de ding wei jie guo wei can zhao shua ze zui you tong ji mo xing ——GEMMA,zuo wei ben yan jiu GWASfen xi de mo xing dui pu tao guo shi pin zhi xing zhuang jin hang fen xi 。(2)yan jiu jie guo biao ming ,pu tao guo li yan se yu 2hao ran se ti shang mybAszhuai lu yin zi xian zhe xiang guan 。guo shi fa yo ji yu liang ge wei yu 16hao ran se ti de SNPsbiao ji xian zhe xiang guan ,dui gai ou jian de jin hang ji yin zhu shi fa xian gai ou jian da duo shu hou shua ji yin wei shou ti dan bai ji mei 。zai 17、18he 19hao ran se ti shang jun fa xian le yu chan guo chong xian zhe xiang guan de SNPwei dian 。yu pu tao guo rou zhi de xiang guan wei dian ding wei zai 16hao ran se ti shang ,ju zai zhe yi ou jian xiang guan de hou shua ji yin yu gai you guan 。5hao ran se ti shang jian ce dao yi ge yu guo shi xiang wei xiang guan de SNPbiao ji ,ben yan jiu zhao dao de yu pu tao fa yo ji xing zhuang xiang guan SNPyu qian ren de QTLfen xi jie guo xiang yi zhi 。

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  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自河南科技大学的赵慧利,发表于刊物河南科技大学2019-09-18论文,是一篇关于葡萄论文,果实发育期论文,河南科技大学2019-09-18论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自河南科技大学2019-09-18论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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