本文主要研究内容
作者杨理凯（2019）在《略阳乌鸡不同生长时期脾脏转录组学分析及免疫相关基因筛选》一文中研究指出：本研究在测定略阳乌鸡体重、脾脏重量等生长性状及鸡脾脏发育状况的基础上,运用转录组测序和生物信息学分析技术鉴定差异表达基因和影响脾脏发育的关键基因,旨在进一步发掘略阳乌鸡生长脾脏发育与免疫相关基因及相关通路,探索其内在分子机制。选取7日龄、30日龄和120日龄且饲养条件相同的略阳乌鸡各3只。测量体重和脾脏重量,收集脾脏组织,利用石蜡切片对脾脏发育进行组织学分析,利用RNA-seq技术对略阳乌鸡脾脏组织进行转录组测序,分析基因表达模式。主要结果如下:1.脾脏组织学观察:7日龄略阳乌鸡脾脏T、B淋巴细胞和淋巴鞘开始产生,30日龄略阳乌鸡脾脏T、B淋巴细胞数量和淋巴鞘数量更多,形态趋于稳定,120日龄略阳乌鸡脾脏与30日龄相比无显著差异。2.转录组测序筛选差异表达基因:通过转录组测序发现7日龄与30日龄相比差异表达基因340个;30日龄与120日龄相比差异表达基因174个;7日龄与120日龄相比差异表达基因1100个。三组对比共同差异表达基因17个。3.差异表达基因GO、KEGG分析:7日龄与30日龄差异表达基因主要富集在外部刺激反应、白细胞迁移、细胞趋化性、粒细胞迁移和防御反应等与免疫相关的条目。30日龄与120日龄差异表达基因主要富集在细胞趋化作用、白介素-1的调节、外部刺激反应、细菌防御反应和趋化因子受体结合等与免疫相关的条目。7日龄与120日龄差异表达基因主要富集在细胞周期、有丝分裂核分裂、染色体的浓缩、着丝粒和纺锤体微管等与细胞分裂相关的条目。此外,三组间对比的差异基因均富集到了造血细胞谱系信号通路、神经活性配体受体相互作用信号通路和细胞因子-细胞因子受体相互作用信号通路。4.权重基因共表达网络分析:构建了与性状相关联的权重基因共表达网络,筛选出与鸡生长发育相关的关键基因有:EVL、FGD3、TNIK、QRICH1、ZYX、TBL1X、IFT80、SF3B1、CEPT1、MYH9、POLH和MICAL1;影响略阳乌鸡免疫功能的关键基因有:EVL、VAV3、TNIK、NLRC3、IL2RB、RPS25、WBP1L、DDX17、ABHD10、PON2、FANCD2和CD3E。
Abstract
ben yan jiu zai ce ding lve yang wu ji ti chong 、pi zang chong liang deng sheng chang xing zhuang ji ji pi zang fa yo zhuang kuang de ji chu shang ,yun yong zhuai lu zu ce xu he sheng wu xin xi xue fen xi ji shu jian ding cha yi biao da ji yin he ying xiang pi zang fa yo de guan jian ji yin ,zhi zai jin yi bu fa jue lve yang wu ji sheng chang pi zang fa yo yu mian yi xiang guan ji yin ji xiang guan tong lu ,tan suo ji nei zai fen zi ji zhi 。shua qu 7ri ling 、30ri ling he 120ri ling ju si yang tiao jian xiang tong de lve yang wu ji ge 3zhi 。ce liang ti chong he pi zang chong liang ,shou ji pi zang zu zhi ,li yong dan la qie pian dui pi zang fa yo jin hang zu zhi xue fen xi ,li yong RNA-seqji shu dui lve yang wu ji pi zang zu zhi jin hang zhuai lu zu ce xu ,fen xi ji yin biao da mo shi 。zhu yao jie guo ru xia :1.pi zang zu zhi xue guan cha :7ri ling lve yang wu ji pi zang T、Blin ba xi bao he lin ba qiao kai shi chan sheng ,30ri ling lve yang wu ji pi zang T、Blin ba xi bao shu liang he lin ba qiao shu liang geng duo ,xing tai qu yu wen ding ,120ri ling lve yang wu ji pi zang yu 30ri ling xiang bi mo xian zhe cha yi 。2.zhuai lu zu ce xu shai shua cha yi biao da ji yin :tong guo zhuai lu zu ce xu fa xian 7ri ling yu 30ri ling xiang bi cha yi biao da ji yin 340ge ;30ri ling yu 120ri ling xiang bi cha yi biao da ji yin 174ge ;7ri ling yu 120ri ling xiang bi cha yi biao da ji yin 1100ge 。san zu dui bi gong tong cha yi biao da ji yin 17ge 。3.cha yi biao da ji yin GO、KEGGfen xi :7ri ling yu 30ri ling cha yi biao da ji yin zhu yao fu ji zai wai bu ci ji fan ying 、bai xi bao qian yi 、xi bao qu hua xing 、li xi bao qian yi he fang yu fan ying deng yu mian yi xiang guan de tiao mu 。30ri ling yu 120ri ling cha yi biao da ji yin zhu yao fu ji zai xi bao qu hua zuo yong 、bai jie su -1de diao jie 、wai bu ci ji fan ying 、xi jun fang yu fan ying he qu hua yin zi shou ti jie ge deng yu mian yi xiang guan de tiao mu 。7ri ling yu 120ri ling cha yi biao da ji yin zhu yao fu ji zai xi bao zhou ji 、you si fen lie he fen lie 、ran se ti de nong su 、zhao si li he fang chui ti wei guan deng yu xi bao fen lie xiang guan de tiao mu 。ci wai ,san zu jian dui bi de cha yi ji yin jun fu ji dao le zao xie xi bao pu ji xin hao tong lu 、shen jing huo xing pei ti shou ti xiang hu zuo yong xin hao tong lu he xi bao yin zi -xi bao yin zi shou ti xiang hu zuo yong xin hao tong lu 。4.quan chong ji yin gong biao da wang lao fen xi :gou jian le yu xing zhuang xiang guan lian de quan chong ji yin gong biao da wang lao ,shai shua chu yu ji sheng chang fa yo xiang guan de guan jian ji yin you :EVL、FGD3、TNIK、QRICH1、ZYX、TBL1X、IFT80、SF3B1、CEPT1、MYH9、POLHhe MICAL1;ying xiang lve yang wu ji mian yi gong neng de guan jian ji yin you :EVL、VAV3、TNIK、NLRC3、IL2RB、RPS25、WBP1L、DDX17、ABHD10、PON2、FANCD2he CD3E。
论文参考文献
论文详细介绍
论文作者分别是来自陕西理工大学的杨理凯，发表于刊物陕西理工大学2019-07-06论文，是一篇关于略阳乌鸡论文,生长发育论文,免疫论文,脾脏组织论文,转录组测序论文,陕西理工大学2019-07-06论文的文章。本文可供学术参考使用，各位学者可以免费参考阅读下载，文章观点不代表本站观点，资料来自陕西理工大学2019-07-06论文网站，若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权，请联系我们删除。
标签：略阳乌鸡论文; 生长发育论文; 免疫论文; 脾脏组织论文; 转录组测序论文; 陕西理工大学2019-07-06论文;