标记筛选论文-刘勇,艾均文,唐芸,薛宏,何行健

标记筛选论文-刘勇,艾均文,唐芸,薛宏,何行健

导读:本文包含了标记筛选论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献,主要关键词:家蚕核型多角体病毒(BmNPV),抗性基因,荧光定量PCR,表达水平

标记筛选论文文献综述

刘勇,艾均文,唐芸,薛宏,何行健[1](2019)在《家蚕抗核型多角体病毒(BmNPV)相关基因的表达分析及其实用性分子标记的筛选》一文中研究指出家蚕核型多角体病毒(Bombyx mori nucleopolyhedrovirus, BmNPV)是一种对家蚕具有高致病性的病毒,会导致蚕业生产上的严重经济损失。迄今已在家蚕中发现了几种对BmNPV有抑制作用的蛋白,但各基因的表达水平与家蚕不同遗传类型材料BmNPV抗性的相关程度仍不清晰。本研究以高抗材料(highly resistant parent, R)和高感材料(highly susceptible parent, S)组配成F1、F2及回交等不同遗传类型材料,利用添毒实验与荧光定量PCR技术,检测家蚕不同遗传类型材料在不同感染条件下对BmNPV的抵抗能力及其相应的5个抗性相关基因(家蚕脂肪酶Ⅰ基因(Bmlipase-1),家蚕丝氨酸蛋白酶Ⅱ基因(serine proteaseⅡ, BmSP-2),家蚕核糖体蛋白S3A基因(ribosomal protein S3A, BmS3A),家蚕抑制蛋白酶Ⅱ基因(suppressor of profilin 2, BmSop2),家蚕烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸氧化还原酶基因(nicotinamide adenine dinucleotide phosphate oxidoreductase, BmNOX)的相对表达量,分析其与抗性的关联性。结果表明:Bmlipase-1和BmSP-2在家蚕中肠特异表达,其他基因没有组织表达特异性;Bmlipase-1、BmSP-2、BmNOX和BmSop2四个基因在不同遗传类型材料中肠的相对表达量之间均存在明显差异,且抗性越强的遗传类型材料的相对表达量也越高,各基因的相对表达量与材料抗性呈正相关性。而BmS3A基因的表达差异在各遗传类型材料间没有呈现出一定的相关性;Bmlipase-1在不同遗传类型材料的相对表达量与其抗性水平的一致性最高,该基因的相对表达水平可以在家蚕育种过程中作为抗核型多角体病毒材料选择与鉴定的依据之一。(本文来源于《农业生物技术学报》期刊2019年12期)

谢遇春,奈日乐,杨峰,马丽娜,米璐[2](2019)在《基于非标记蛋白质组学技术筛选影响察哈尔羊肌肉品质的重要分子标记》一文中研究指出为研究察哈尔羊不同部位肌肉蛋白质组成差异及差异蛋白功能,通过数据信息依赖性获取与SWATH非标记蛋白组学定量技术,对察哈尔羊背最长肌和臀肌进行蛋白质鉴定和定量分析,并对其进行生物信息学分析。结果表明:察哈尔羊背最长肌和臀肌肌肉中共检测到蛋白质1 073个,筛选出差异蛋白140个,其中背最长肌中高表达差异蛋白116个,低表达差异蛋白24个;背最长肌中高表达差异蛋白GO(gene ontology)功能富集分析结果表明,在细胞组分中,富集于细胞外外泌体中的蛋白质最多,其次富集于细胞膜内,在分子功能中,蛋白质主要参与分子内转移酶活性、聚RNA结合和L-乳酸脱氢酶活性过程,在生物学进程中,蛋白质主要参与碳水化合物代谢过程、肌节组织和肌肉收缩过程;通过差异蛋白的网络互作分析发现,肌纤维组成模块包括肌球蛋白-11、肌球蛋白-1(myosin-1,MYH1)、肌间蛋白-1、肌球蛋白-2(myosin-2,MYH2)、肌球蛋白-8(myosin-8,MYH8)、肌球蛋白轻链激酶-2、肌球蛋白轻链-2、肌钙蛋白T-3、视松蛋白和肌球蛋白结合蛋白C等蛋白质,肌球蛋白MYH1、MYH2、MYH8有望成为影响肉品质的重要分子标记。(本文来源于《肉类研究》期刊2019年11期)

吴果果,宋淑婷,岳荣,张晶,关莹[3](2019)在《反向筛选标记基因upp在杀真菌链霉菌遗传改造中的应用》一文中研究指出为进一步简化放线菌的遗传操作流程,缩短重组菌株的筛选周期,在对杀真菌链霉菌(Streptomyces fungicidicus ATCC 21013)进行遗传操作的过程中引入了一个反向筛选标记基因——尿嘧啶磷酸核糖转移酶基因(upp)。并通过原始菌株中upp基因的敲除,以及带有upp基因的自杀型基因敲除载体的构建,开发了一套完整的针对杀真菌链霉菌的无痕敲除系统。通过载体的整合、二次交换及反向筛选实现了杀真菌链霉菌基因组中StrR基因的快速无痕敲除。upp反向筛选标记基因的引入使得链霉菌重组菌株的平均筛选周期缩短了2周左右,并进一步减少了假阳性重组菌株出现的概率,可实现放线菌中目的基因的连续无痕敲除,因此值得进一步推广和应用。(本文来源于《中国生物工程杂志》期刊2019年11期)

张丽华,韩浩章,王晓立,李素华,王芳[4](2019)在《香樟SRAP分子标记引物筛选》一文中研究指出以香樟嫩叶为试验材料,采用SRAP-PCR分子标记体系对420对引物组合进行了筛选。结果表明:共选出19对引物组合,扩增出367条带,平均19.3条,范围在15~25条。其中,多态性带230条,平均12.11条,范围在6~17条;多态性的比例62.16%,范围在40%~81%。SRAP-PCR分子标记体系稳定,筛选出的引物组合可用于不同种源香樟遗传多样性及品种鉴定的研究。(本文来源于《安徽农学通报》期刊2019年20期)

周俐宏,石慧,王志刚,蔡忠杰[5](2019)在《百合荧光SSR标记体系构建及引物筛选》一文中研究指出为了确定百合荧光SSR-PCR反应的最佳体系,对反应体系和程序中的模板DNA、酶量和退火温度进行了优化筛选。结果表明,适用于百合的荧光SSR-PCR反应体系为:总体系为20μl,10×PCR buffer(Mg~(2+))2μl,2.5 mM dNTP 1μl,正、反引物各0.5μl,模板DNA 40 ng,Taq酶1 U,用ddH_2O补足。反应程序为:94℃预变性5 min,94℃(30 s)/58℃(45 s)/72℃(45 s)35个循环,最后72℃延伸10 min。利用优化后的反应体系对百合SSR引物进行筛选,从50对引物中筛选出6对多态性高的SSR引物,并通过合成荧光标记引物对77个百合品(野生)种进行复选,验证了6对引物的稳定性。该研究为百合的遗传多样性分析、分子标记辅助育种等方面的进一步研究提供了技术支持。(本文来源于《辽宁农业科学》期刊2019年05期)

苑克俊,葛福荣,牛庆霖,孟晓烨,李圣龙[6](2019)在《利用SLAF-seq技术筛选杏甜仁和苦仁性状相关分子标记》一文中研究指出杏甜仁和苦仁性状是由一对基因控制。有研究推测控制‘凯特’杏这对性状的基因位点是杂合的,前人将近缘树种扁桃的甜仁和苦仁性状基因定位在扁桃第5号染色体上UDA045、BPP037和PceGA025等5个标记附近。简化基因组测序SLAF-seq(Specific-length amplified fragment sequencing)技术作为一种高通量SNP挖掘和基因型鉴定技术,在开发分子标记上具有效率高、成本低、测序要求低、数量丰富等优势。利用SLAF-seq技术挖掘控制杏甜仁和苦仁性状的分子标记对于开展杏的分子辅助育种具有重要意义。试验材料为‘凯特’(母本)和‘珍珠油杏’(父本)的杂交F1代群体25份材料、‘珍珠油杏’实生后代群体30份材料。从群体中筛选出甜仁性状和苦仁性状的植株,分别构建杂交群体甜仁性状样品DNA混池和苦仁性状样品DNA混池、实生群体甜仁性状样品DNA混池和苦仁性状样品DNA混池,利用SLAF-seq技术进行测序和分析。基因组DNA提取采用CTAB法,SLAF-seq技术测序由北京百迈客生物科技有限公司完成。获得365 443个SLAF标签,序列长度69.7 Mb,参照近缘树种扁桃基因组大小240 Mb计算,大约是基因组大小的29%,其中多态性SLAF标签97 020个,大约平均每2 533 bp就有1个多态性SLAF标签,适合高密度筛选性状相关的分子标记。通过对杂交群体的甜仁性状组混池DNA和苦仁性状组混池DNA进行测序和分析,筛选出2 737个标记;对实生群体的两个混池DNA进行测序和分析,筛选出1744个标记;两个群体共同标记286个,其中符合杂交后代基因遗传规律的标记5个。以这5个标记的序列在蔷薇科果树基因组数据库GDR中比对,其中M198、M253和M237定位在近缘种扁桃5号染色体上邻近前人定位的QTL区域。利用M253和M237两个标记的SLAF标签序列,在GDR数据库中找出相关基因序列,设计引物,进行PCR扩增产物和测序验证,结果两个标记对15份杏样品的甜仁和苦仁性状预测准确率均为80%,证实M253和M237是甜仁和苦仁性状的紧密关联分子标记。(本文来源于《中国园艺学会2019年学术年会暨成立90周年纪念大会论文摘要集》期刊2019-10-21)

李梦婕,田俊,韦曦[7](2019)在《基于抗体芯片技术筛选牙髓炎诊断标记物的初步研究》一文中研究指出目的:获取大鼠牙髓组织细胞因子差异表达谱,筛选差异表达因子并揭示其与牙髓炎组织病理表现的相关性,探讨利用生物标记物评估牙髓炎症状态的可行性。材料与方法:LPS诱导建立大鼠上切牙实验性牙髓炎模型,HE染色观察牙髓炎症情况,并对冠、根部牙髓炎症程度进行分段评分。采用抗体芯片技术检测LPS作用12 h和72 h后炎症牙髓与正常牙髓67个细胞因子表达水平,筛选差异显着的因子作为牙髓炎潜在生物标记物。ELISA验证差异表达因子在健康牙髓以及(本文来源于《2019第九次全国口腔生物医学学术年会论文汇编》期刊2019-10-11)

单红丽,李文凤,黄应昆,王晓燕,张荣跃[8](2019)在《甘蔗抗褐锈病基因定位亲本间多态性SSR标记筛选》一文中研究指出为获得更多用于构建甘蔗遗传连锁图谱可用的多态性SSR标记,本研究以6个高抗甘蔗褐锈病品种和6个高感甘蔗褐锈病品种为亲本,根据感病母本×抗病父本选配12个杂交组合,筛选在亲本间条带清晰、多态性明显、重复性较好的引物。结果表明,组合柳城03-1137×德蔗93-88、Mex105×粤糖00-236亲本间的多态性引物数最多,分别占总数的52. 38%和47. 62%;其中,10对引物(18-mSSCIR34、22-m SSCIR38、25-mSSCIR48、32-mSSCIR67、51-mSSCIR50、57-MSSCIR21、71-SMC1490CL*、73-SMC278CS*、75-SMC31CUQ*、77-SMC336BS*)在组合柳城03-1137×德蔗93-88中多态性最好,7对引物(22-m SSCIR38、25-mSSCIR48、45-mSSESTC04、51-mSSCIR50、67-mSSCIR9*、76-SMC334BS*、80-SMC486CG*)在Mex105×粤糖00-236中多态性最好,利用筛选得到的引物,更有利于构建分子遗传图谱。本研究结果为抗褐锈病新基因定位和开发与其紧密连锁的分子标记研究提供了一定的理论依据。(本文来源于《核农学报》期刊2019年11期)

赵彦花,区又君,温久福,李加儿,周慧[9](2019)在《基于转录组测序技术的黄唇鱼SSR分子标记筛选》一文中研究指出【目的】筛选出可用于黄唇鱼(Bahaba flavolabiata)遗传资源评价及亲缘鉴定的SSR分子标记,为开展其保护遗传学研究打下基础。【方法】利用Illumina HiSeq 4000测序平台对野生黄唇鱼样本进行转录组测序,采用TGICL对转录组数据进行聚类去冗余以获得Unigene,并通过生物信息学方法进行功能注释分类、代谢通路和SSR特征分析等。【结果】黄唇鱼混合组织的转录组测序共获得13.43 Gb数据,经组装并去冗余后获得65047条Unigenes。采用BLAST对组装获得的Unigenes进行七大功能数据库(NR、NT、GO、COG、KEGG、Swissprot和Interpro)注释,结果共有55583条Unigenes被注释(占85.45%)。通过MISA对黄唇鱼的Unigene进行SSR搜索,共检测到29797个SSR位点分布于19664条Unigenes中。SSR位点分布类型及其特征分析结果显示,最主要的重复类型为二核苷酸重复基元(11855个,占39.79%),其次是单核苷酸重复基元(9695个,占32.54%)和叁核苷酸重复基元(6663个,22.36%),而四核苷酸、五核苷酸和六核苷酸重复基元的数量相对较少。二核苷酸重复基元类型中重复最多的基序是AC/GT(8355条),在叁核苷酸重复基元类型中重复最多的基序是AGG/CCT(1866条)。从随机选取的186对SSR引物中,最终筛选出47对扩增稳定性好且具有多态性的SSR引物,以二核苷酸和四核苷酸重复基元的扩增结果居多。【结论】通过转录组测序能有效筛选出具有多样性的黄唇鱼SSR分子标记,可为黄唇鱼的遗传多样性分析、亲缘鉴定和遗传图谱构建等后续研究提供基础资料。(本文来源于《南方农业学报》期刊2019年09期)

张胜忠,苗华荣,赵立波,崔凤高,张智猛[10](2019)在《花生种子长宽比性状遗传分析和相关SSR标记筛选》一文中研究指出本研究以‘花育36号’ב高油613’构建重组自交系(recombinant inbred line, RIL)群体为试验材料,考察2个环境下(E1、E2)RIL群体种子长宽比表型数据,采用数量性状主基因+多基因混合遗传模型联合分离分析方法进行遗传分析。结果表明,E1环境下花生种子长宽比符合B_1_8模型(即2对存在重迭作用的独立主基因遗传模型),主基因间互作效应为-0.19,主基因遗传率为89.86%;E2环境花生种子长宽比符合B_1_7模型(即2对存在互补作用的独立主基因遗传模型),主基因间互作效应为-0.22,主基因遗传率为92.04%。通过对多态性SSR标记筛选和相关性分析,发现标记AGGS1325在2个环境下均与种子长宽比显着性相关。本研究将为深入开展花生粒型分子机制研究和推进花生外观品质育种提供重要理论基础。(本文来源于《花生学报》期刊2019年03期)

标记筛选论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

为研究察哈尔羊不同部位肌肉蛋白质组成差异及差异蛋白功能,通过数据信息依赖性获取与SWATH非标记蛋白组学定量技术,对察哈尔羊背最长肌和臀肌进行蛋白质鉴定和定量分析,并对其进行生物信息学分析。结果表明:察哈尔羊背最长肌和臀肌肌肉中共检测到蛋白质1 073个,筛选出差异蛋白140个,其中背最长肌中高表达差异蛋白116个,低表达差异蛋白24个;背最长肌中高表达差异蛋白GO(gene ontology)功能富集分析结果表明,在细胞组分中,富集于细胞外外泌体中的蛋白质最多,其次富集于细胞膜内,在分子功能中,蛋白质主要参与分子内转移酶活性、聚RNA结合和L-乳酸脱氢酶活性过程,在生物学进程中,蛋白质主要参与碳水化合物代谢过程、肌节组织和肌肉收缩过程;通过差异蛋白的网络互作分析发现,肌纤维组成模块包括肌球蛋白-11、肌球蛋白-1(myosin-1,MYH1)、肌间蛋白-1、肌球蛋白-2(myosin-2,MYH2)、肌球蛋白-8(myosin-8,MYH8)、肌球蛋白轻链激酶-2、肌球蛋白轻链-2、肌钙蛋白T-3、视松蛋白和肌球蛋白结合蛋白C等蛋白质,肌球蛋白MYH1、MYH2、MYH8有望成为影响肉品质的重要分子标记。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

标记筛选论文参考文献

[1].刘勇,艾均文,唐芸,薛宏,何行健.家蚕抗核型多角体病毒(BmNPV)相关基因的表达分析及其实用性分子标记的筛选[J].农业生物技术学报.2019

[2].谢遇春,奈日乐,杨峰,马丽娜,米璐.基于非标记蛋白质组学技术筛选影响察哈尔羊肌肉品质的重要分子标记[J].肉类研究.2019

[3].吴果果,宋淑婷,岳荣,张晶,关莹.反向筛选标记基因upp在杀真菌链霉菌遗传改造中的应用[J].中国生物工程杂志.2019

[4].张丽华,韩浩章,王晓立,李素华,王芳.香樟SRAP分子标记引物筛选[J].安徽农学通报.2019

[5].周俐宏,石慧,王志刚,蔡忠杰.百合荧光SSR标记体系构建及引物筛选[J].辽宁农业科学.2019

[6].苑克俊,葛福荣,牛庆霖,孟晓烨,李圣龙.利用SLAF-seq技术筛选杏甜仁和苦仁性状相关分子标记[C].中国园艺学会2019年学术年会暨成立90周年纪念大会论文摘要集.2019

[7].李梦婕,田俊,韦曦.基于抗体芯片技术筛选牙髓炎诊断标记物的初步研究[C].2019第九次全国口腔生物医学学术年会论文汇编.2019

[8].单红丽,李文凤,黄应昆,王晓燕,张荣跃.甘蔗抗褐锈病基因定位亲本间多态性SSR标记筛选[J].核农学报.2019

[9].赵彦花,区又君,温久福,李加儿,周慧.基于转录组测序技术的黄唇鱼SSR分子标记筛选[J].南方农业学报.2019

[10].张胜忠,苗华荣,赵立波,崔凤高,张智猛.花生种子长宽比性状遗传分析和相关SSR标记筛选[J].花生学报.2019

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