万仁鹏:卡奇霉素产生菌棘孢小单胞菌ATCC 15837的全基因组测序及序列分析论文

万仁鹏:卡奇霉素产生菌棘孢小单胞菌ATCC 15837的全基因组测序及序列分析论文

本文主要研究内容

作者万仁鹏,李翔,杨慧林,朱笃,颜日明,张志斌,汪涯(2019)在《卡奇霉素产生菌棘孢小单胞菌ATCC 15837的全基因组测序及序列分析》一文中研究指出:棘孢小单胞菌(Micromonospora echinospora) ATCC 15837是一种高GC含量的革兰氏阳性稀有放线菌,能够合成烯二炔类抗肿瘤抗生素卡奇霉素(calicheamicin, CLM)。目前,还没有相关研究报道棘孢小单胞菌ATCC 15837的全基因组序列,这限制了其代谢产物合成途径和比较基因组学等研究。本研究首次通过高通量测序技术对棘孢小单胞菌ATCC 15837进行全基因组测序,使用相关生物信息学软件对数据进行组装和注释等分析。使用Velvet软件进行组装拼接得到77个Contigs,GC含量为72.36%,基因组大小约为7.69 Mb。序列已提交至美国国立生物技术信息中心(NCBI)的GenBank数据库(登录号为NGNT00000000)。本研究首次报道了一株烯二炔类抗肿瘤抗生素卡奇霉素产生菌棘孢小单胞菌ATCC 15837的全基因组序列,分析了基因组基本特征,预测了该菌株的次级代谢产物生物合成基因簇,为后续的进一步代谢调控与合成生物学提供了理论基础。

Abstract

ji bao xiao chan bao jun (Micromonospora echinospora) ATCC 15837shi yi chong gao GChan liang de ge lan shi yang xing xi you fang xian jun ,neng gou ge cheng xi er gui lei kang zhong liu kang sheng su ka ji mei su (calicheamicin, CLM)。mu qian ,hai mei you xiang guan yan jiu bao dao ji bao xiao chan bao jun ATCC 15837de quan ji yin zu xu lie ,zhe xian zhi le ji dai xie chan wu ge cheng tu jing he bi jiao ji yin zu xue deng yan jiu 。ben yan jiu shou ci tong guo gao tong liang ce xu ji shu dui ji bao xiao chan bao jun ATCC 15837jin hang quan ji yin zu ce xu ,shi yong xiang guan sheng wu xin xi xue ruan jian dui shu ju jin hang zu zhuang he zhu shi deng fen xi 。shi yong Velvetruan jian jin hang zu zhuang pin jie de dao 77ge Contigs,GChan liang wei 72.36%,ji yin zu da xiao yao wei 7.69 Mb。xu lie yi di jiao zhi mei guo guo li sheng wu ji shu xin xi zhong xin (NCBI)de GenBankshu ju ku (deng lu hao wei NGNT00000000)。ben yan jiu shou ci bao dao le yi zhu xi er gui lei kang zhong liu kang sheng su ka ji mei su chan sheng jun ji bao xiao chan bao jun ATCC 15837de quan ji yin zu xu lie ,fen xi le ji yin zu ji ben te zheng ,yu ce le gai jun zhu de ci ji dai xie chan wu sheng wu ge cheng ji yin cu ,wei hou xu de jin yi bu dai xie diao kong yu ge cheng sheng wu xue di gong le li lun ji chu 。

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  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自基因组学与应用生物学的万仁鹏,李翔,杨慧林,朱笃,颜日明,张志斌,汪涯,发表于刊物基因组学与应用生物学2019年01期论文,是一篇关于棘孢小单胞菌论文,全基因组测序论文,卡奇霉素论文,次级代谢产物论文,生物合成基因簇论文,基因组学与应用生物学2019年01期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自基因组学与应用生物学2019年01期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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