导读:本文包含了基因的结构与功能论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献，主要关键词:塔里木马鹿,VDR基因,实时荧光定量PCR,生物信息学分析
基因的结构与功能论文文献综述
塔依尔江·麦麦提,苏比奴尔·艾力,布威海丽且姆·阿巴拜科日,佐日古丽·伊斯马伊力,阿迪力·艾合麦提[1]（2019）在《塔里木马鹿维生素D受体（VDR）基因结构和功能的预测与分析》一文中研究指出为了分析塔里木马鹿(Cervus elaphus yarkandensis)维生素D受体(VDR)基因的结构和相关功能,本研究从前期研究获得的塔里木马鹿和天山马鹿(C. e. songaricus)皮肤组织转录组测序结果中,获得上调表达的塔里木马鹿VDR基因的序列,对塔里木马鹿VDR基因进行实时荧光定量PCR(qPCR)验证,利用相关软件进行同源性比对、系统进化树构建和生物信息学分析。实时荧光定量PCR结果显示,VDR基因在转录组测序的结果与q PCR的结果中表达趋势一致,均为上调。基于VDR基因同源性比对结果显示,塔里木马鹿与白尾鹿(Odocoileus virginianus,GenBank登录号XM_020889235.1)的遗传距离较近,同源性最高;与褐家鼠(Rattus norvegicus,GenBank登录号NM_017058.1)的遗传距离较远,同源性最低。系统进化树也证实了这个结果。生物信息学分析结果表明,塔里木马鹿VDR蛋白由20种氨基酸组成,分子质量为32.92 ku,理论等电点为5.73,不稳定系数为33.56,总平均亲水性为﹣0.298,脂溶系数94.95,无跨膜区,无信号肽,无O-糖基化位点,有1个N-糖基化位点,有15个磷酸化位点,最有可能位于内质网膜中,二级结构和叁级结构主要由α-螺旋和无规则卷曲组成,有3个低复杂度区域,无保守结构区域。(本文来源于《动物学杂志》期刊2019年05期）
张燕玉,韩卓然,孙敬锋,吕爱军,胡秀彩[2]（2019）在《海藻希瓦氏菌感染对半滑舌鳎肠道菌群结构及相关功能基因表达的影响》一文中研究指出【目的】明确海藻希瓦氏菌(Shewanella algae)感染对半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis)肠道菌群结构及相关功能基因表达的影响,揭示肠道菌群和肠道组织相关功能基因在疾病发生及免疫应答过程中的作用机制。【方法】以致病性海藻希瓦氏菌人工感染半滑舌鳎后,采用16S rDNA高通量测序技术探究其肠道菌群组成结构的变化情况,并利用实时荧光定量PCR检测分析半滑舌鳎肠道组织中参与疾病发生和免疫应答相关功能基因的表达规律。【结果】共测序获得118657条有效序列,按97%的序列相似度聚类后得到6732个OTUs。Alpha多样性分析结果显示,Shannon指数和Chao1指数以感染前(CG)的健康半滑舌鳎最高,在感染后12 h(12hpi)最低;感染海藻希瓦氏菌前后半滑舌鳎肠道优势菌门无明显变化,但不同类群的相对丰度发生变化。在属水平上,Elizabethkingia、曼噬甲壳菌属(Chitinophaga)、Brevinema、苯基杆菌属(Phenylobacterium)、假单胞菌属(Pseudomonas)、乳杆菌属(Lactobacillus)、Marivita和雷尔氏菌属(Ralstonia)的相对丰度在CG半滑舌鳎肠道菌群组成中占比最高,希瓦氏菌属(Shewanella)、Petrimonas、Proteiniphilum和Aminobacterium的相对丰度在12hpi的占比最高,食酸菌属(Acidovorax)、芽孢杆菌属(Bacillus)和弧菌属(Vibrio)的相对丰度在感染后24 h(24hpi)的占比最高。半滑舌鳎肠道组织相关功能基因的表达变化表现为:果糖二磷酸醛缩酶A基因(ALDOA)的相对表达量在24hpi时显着高于CG(P<0.05,下同);磷脂酶B1基因(PLB1)、热休克蛋白70 kD蛋白1A基因(HSPA1A)、组氨酸叁聚体核苷结合蛋白1基因(HINT1)和γ谷氨酰转移酶1基因(GGT1)的相对表达量显着高于CG和24hpi;海藻糖酶基因(TREH)的相对表达量在12hpi时显着低于CG和24hpi。【结论】半滑舌鳎感染海藻希瓦氏菌后其肠道菌群多样性降低、菌群结构发生变化,肠道组织中免疫功能相关基因(HSPA1A和HINT1)及代谢功能相关酶类基因(ALDOA、PLB1、GGT1和TREH)呈差异表达,说明海藻希瓦氏菌感染引起半滑舌鳎肠道微生态紊乱,且肠道组织中免疫功能相关基因和代谢功能相关酶类基因分别参与机体的免疫应答及疾病发生过程。(本文来源于《南方农业学报》期刊2019年10期）
肖化兴,王立丰,王萌[3]（2019）在《橡胶树逆境胁迫响应基因HbHSP90.1的结构与功能分析》一文中研究指出SGT1是真核生物中一类保守蛋白,其能够与多种蛋白结合参与抗病等多种生物过程,与分子伴侣HSP90结合调控NB-LRR型R蛋白的稳定性。HSP90是一类分布广泛且高度保守的蛋白质,其对于提高植物的逆境胁迫抗性具有重要意义,但在橡胶树抗逆反应中的作用尚不清楚。本研究从橡胶树‘热研73397’叶片中克隆了一个HSP90基因,其推导氨基酸含有特征性HATPase_c结构域,命名为HbHSP90.1。该基因响应干旱胁迫、ABA处理、机械伤害和白粉菌侵染等逆境胁迫。表明HbHSP90.1主要受生物和非生物胁迫诱导,参与了橡胶树对逆境胁迫的响应。本研究为阐明HbHSP90.1基因在橡胶树逆境胁迫响应下的作用提供理论参考。(本文来源于《分子植物育种》期刊2019年16期）
汪阳,王大会,张子敬,贺花,徐嘉威[4]（2019）在《FHC基因的结构与功能及其表达调控的研究进展》一文中研究指出铁蛋白为机体内贮存铁的可溶性蛋白,人血清铁蛋白是机体含铁量的间接标记物,用于诊断缺铁性贫血。铁蛋白重链1(FHC)是铁蛋白的一种亚基,在氧化应激、病毒性肝炎、肿瘤细胞、视网膜的保护、少突胶质细胞的成熟、猪蓝耳病等方面具有重要调控作用。本文就FHC基因表达调控及生物学功能进行综述,以期为该基因作为动物抗病育种的遗传标记奠定基础,为免疫治疗、癌症预防与监控等研究提供参考。(本文来源于《中国畜牧杂志》期刊2019年09期）
梁晨,于佳佳,姚丛,李传友,刘毅[5]（2019）在《不同基因型结核分枝杆菌脂聚糖的分离纯化及其结构和功能的研究》一文中研究指出目的建立分离、纯化结核分枝杆菌脂聚糖的方法 ,初步比较分析不同基因型结核分枝杆菌的脂阿拉伯甘露聚糖(Lipoarabinomannan,LAM)和脂甘露聚糖(Lipomannan,LM)的分子量、功能结构的差异,探索不同基因型菌株的脂聚糖对其毒力形成的影响及关系。此研究可以提高我们对结核分枝杆菌毒力的认识,为揭示结核分枝杆菌的致病机制、研制新抗结核药物、疫苗的开发提供新的作用靶点而奠定基础。方法选取北京基因型、T1基因型、Manu2基因型、牛分枝杆菌BCG、结核分枝杆菌H37Rv标准株、(本文来源于《中华医学会结核病学分会2019年全国结核病学术大会论文汇编》期刊2019-06-12）
Mudassar,Ahmad[6]（2019）在《梨CBF和NAC转录因子系统进化及基因结构和功能研究》一文中研究指出中国是一个气候多样的大陆国家,拥有比其他国家更丰富的梨属种质资源。梨属(Pyrus)起源于中国西部和西南部的山区,而中国东部和中亚被认为是梨的遗传多样性的两个亚中心。最近,南京农业大学梨工程技术研究中心完成了对亚洲梨之一的中国白梨(Pyrus bretschneideri Rehd)的完整基因组测序。梨基因组的解码,使梨几乎所有的基因序列变为己知,为梨的生物学研究提供了新的资源。通过全基因组功能和比较研究使得研究人员能够深入了解生物机制以及鉴定出的新的基因家族。关于植物转录因子的现有研究大多数来自拟南芥(Arabidopsis thaliana),其具有2,296个转录因子基因,分为58个家族,而在梨中已经鉴定了 42,812子基因。迄今为止,学者对梨的9个基因家族和4个转录因子家族进行了全基因组分析,目前对潜在转录因子的研究非常有限,因此需要对涉及梨的果实着色,非生物胁迫耐受性和芽休眠的植物发育相关的转录因子进行全基因组分析。因此,基于我们之前的研究,我们选择梨中的CBF/DREB和NAC转录因子,在亚洲梨中进行系统发育,结构,调控和功能鉴定研究。CBF/DRE转录因子在多种适应性机制,分子信号转导以及对植物非生物胁迫的耐受性方面发挥作用。在梨和其他蔷薇科作物中,需要研究CBF亚家族的独立进化,以了解它们可能的不同功能。我们从梨基因组中发现了 15个PpPCBF,但序列的相似性>0.90,对于那些具有类似的系统发育分支(PpyCBFs 7,8,9,10,11,12,13,14)、不完整序列(PpyCBF12)和在 Scaffold上(PpyCF7,8,10,11,13,14,15)的基因没有进行后续研究,而我们选择其保守序列即PpyCBFsl-6开展进一步研究。系统发育树将PpyCBF分成叁个主要的进化枝/亚型,有趣的是PpyCBF与其他蔷薇科植物一起显示出与模式作物拟南芥AtCBFs的独立进化。第一进化枝不仅具有来自双子叶植物和单子叶植物作物的CBF,而且还具有PpyCBF3共线性基因,其表明PpyCBF3可能是祖先CBF,而所有其他CBF在梨的全基因组复制(WGD)过程中从PpCBF3进化而来。对所有6个PpyCBF在非生物胁迫(低温,盐和干旱),外源ABA和芽内休眠期间的表达进行分析,结果表明,所有PpyCBF基因表达均被诱导,但对各种胁迫,ABA处理和芽内休眠过程的响应有所差异。这些CBF表达模式类似于胁迫响应相关基因PpyCOR(PpyCOR47,PpyCOR15A,PpyRD29A和PpyKIN)。第二枝PpyCBFs在低温和ABA处理期间显示出更高的转录水平,而发现Ⅰ和Ⅲ进化枝更多的是响应盐和干旱反应。启动子分析显示,I(PpyCBF3)和Ⅲ进化枝(PpyCBF5)CBF缺乏G-boxl顺式元件,存在ABRE顺式元件,表明它们仅受ABI3/VP1级联调控,而Ⅱ进化枝PpyCBF受到b-ZIP和ABI3转录因子的调控。在拟南芥中异位表达PpyCBF2和PpyCBF3增强了其对非生物胁迫(尤其是低温(PpCBF2)以及盐和干旱胁迫(PpyCBF3)、更低的ROS的耐受性,并增加了抗氧化基因活性。正常生长条件下,在PpyCBF2、3过表达拟南芥中,依赖内源性ABA(AtABF2和AtRD29BA和不依赖ABA的(AtCOR47,AtCOR15A和AtRD29A)胁迫相关基因的表达增加,表明PpyCBF发挥功能可能拥有依赖ABA和不依赖于ABA的两条途径。所有PpyCBF尤其是祖先CBF具有6X CCGAC结合元件的高反式激活活性。通过荧光素酶和酵母单杂交实验,我们发现所有CBF均与PpyCOR47和PpyCOR15A(PpyCBF6除外)发生互作,而Ⅱ进化枝PpyCBF对PpyRD29A具有高于Ⅰ和Ⅲ进化枝PpyCBF的调控作用。先前鉴定的'CCGA'结合位点和PpyCOOR15A启动子中'CGACA'结合位点的突变显示'CGA'是梨中PpyCBF的核心结合元件。总之,PpyCBF转录因子可能通过依赖ABA和不依赖ABA两条途径冗余地发挥作用,并且与亚洲梨的非生物胁迫信号和响应密切相关。NAC蛋白在不同的植物发育过程以及对生物和非生物胁迫的耐受性中发挥作用。梨基因组的解码为找到PpNAC转录因子的进化、复制、基因结构和预测功能的全基因组分析提供了基础。我们在梨中共发现185个PpNAC基因,其中148个位于染色体上,37个位于未组装的Scaffold上。在11号染色体上观察到最大PpNAC基因频率(11%),随后是10号染色体(9%),而16号和7号染色体(1%和1.6%)展现出最小的频率。通过系统发育分析,我们将NAC基因分为6个进化枝(第1组-第6组)及其亚进化枝(亚组A至亚组H),而第1组是最大的,有40个PpNAC基因和8个亚组(1A-1H),其次是第2组和第6组,分别具有34个基因和4个(2A-2D)和3个(6A-6C)亚组。基因结构和基序分析表明,具有相似基因结构和基序的NAC蛋白存在于相同的亚组中,每组显示共同的基序,没有/微小的变化使其具有相似的功能。每组的外显子数量从1到12不等,平均为3个外显子。在亚洲梨中有44对重复的NAC。不同梨品种/种的qPCR和RNA-Seq数据分析验证了 PpNAC基因的一些预测功能,即PpNAC 37,61,70(2A,53,151(2D),10,92,130和154(3D)是可能参与芽休眠,PpNA 61,70(2A),172,176和23(4E)与蓝光下果实色素沉着有关,PpNACs127(1E),46(1G)和56(5A)可能分别与早期、中后期果实发育有关。此外,通过针对梨中的应激反应基因,发现来自亚组2D和3D的所有基因与非生物胁迫(冷,盐和干旱)耐受性相关。目前全基因组分析为了解梨和高等植物中NAC基因家族的分类,基序和基因结构,进化和预测功能提供了有价值的信息。总之,PpNAC转录因子在梨的非生物胁迫耐受性,果实发育和成熟,果实后熟和着色以及芽休眠等多条途径中扮演着不同的角色。(本文来源于《浙江大学》期刊2019-06-01）
兰冬雪,汤丽影,李佳,谢鹏远,吕玉光[7]（2019）在《禾本科植物NBS-LRR类抗病基因结构、功能和进化研究进展》一文中研究指出禾本科植物是粮食的主要来源,NBS-LRR类抗病基因作为抗病基因数目最多的家族,在植物抵御病虫害中起着关键作用。为了深入研究NBS-LRR抗病基因,本研究介绍了禾本科植物NBS-LRR类抗病基因的结构与功能、分类和数量,抗病基因的分布及进化模式。同时对该类基因的研究前景进行了展望,提出需要深入研究的问题。(本文来源于《中国农学通报》期刊2019年15期）
罗毅[8]（2019）在《小麦抗条锈病基因Yr10功能结构域的初步探究》一文中研究指出小麦条锈病是由条形柄锈菌小麦专化型(Puccinia striiformis f.sp.tritici)引起的重要的小麦病害,在全球小麦产区普遍流行,给小麦的生产带来重大的损失。小麦条锈菌是一种活体寄生真菌,也是一种转主寄生菌,在小麦上进行无性繁殖,产生夏孢子、冬孢子和担孢子,在转主寄主小檗上进行有性生殖,产生性孢子和锈孢子。小麦条锈菌还有众多的具有不同致病力的生理小种,条锈菌生理小种很容易发生毒性变异,这导致抗病小麦品种抗性“丧失”现象时有发生。因此,小麦抗锈育种是一项长期且艰巨的工作,含有抗条锈病基因的抗源材料的发掘,抗条锈病基因的染色体定位以及克隆是小麦抗锈育种的关键。目前,大约有80个抗条锈病基因位点被正式命名,但只有6个抗条锈病被克隆出来。抗条锈病基因Yr10来源于普通小麦“Moro”,是一个全生育期小种特异性抗病基因,在我国大部分地区,Yr10对大多数的当地流行的条锈菌生理小种还具有抗性。因此,Yr10抗病基因在抗病育种中还具有重要利用价值。Yr10编码一个典型的CC-NB-LRR抗病蛋白,但对其功能的研究还未见报道。因此,开展对其功能的研究很有必要,通过对其功能的研究可以明确其发挥抗病的分子机制,为Yr10在今后抗病育种中的合理利用提供理论依据。本研究在Yr10的前期研究基础上展开,我们通过分析发现,目前克隆的Yr10抗病基因并不完整,并最终克隆获得Yr10基因全长,在此基础上对Yr10的功能结构域进行了初步研究。主要研究结果如下:1.通过分析发现目前克隆的Yr10序列(AF149112)并不完整,并最终克隆到一条包含四个外显子和叁个内含子的新的Yr10基因序列。新的Yr10编码区全长为2541bp,编码846 aa,命名为Yr10-1;另外还获得了一条缺失了8 bp碱基的序列,编码区全长2604 bp,编码867 aa,命名为Yr10-2,二者编码蛋白Yr10-1和Yr10-2仅在C-端末尾部分存在差异。Yr10-1是一个典型的CC-NBS-LRR类抗病蛋白,分子量大小约95.8 kDa,理论等电点为6.82,是一个亲水性蛋白。Yr10-1的生物信息学预测显示其无跨膜结构和信号肽,定位于细胞质,参与抗病反应和响应水杨酸信号,具有结合ADP/ATP的功能。系统发育树分析显示Yr10-1与乌拉尔图小麦(Triticum urartu)中的抗病蛋白的TuRPM1亲缘关系相近。2.通过农杆菌介导的瞬时表达体系在本氏烟草(Nicotiana benthamiana)中表达Yr10-1与GFP的融合蛋白,发现其定位于细胞质,并且能诱导烟草产生细胞坏死(cell death),而改变Yr10-1的亚细胞定位使其定位于细胞核时不能诱导烟草产生细胞坏死。同样的,通过农杆菌介导的瞬时表达体系在小麦AvS中表达定位于细胞质的Yr10-1后也能诱导产生细胞坏死,使其对条锈菌CYR32的抗性增强,孢子量减少。上述结果表明,Yr10-1需要定位于细胞质才能诱导产生细胞坏死和发挥抗病作用。3.通过对Yr10-1功能结构域的研究,我们证明了Yr10-1中诱导产生细胞坏死的关键结构域是N-端的CC结构域,核心区域位于1-116之间。CC结构域在烟草中表达后能诱导产生H_2O_2,其保守的“EDVID”基序在CC结构域诱导产生细胞坏死中具有重要的作用。并且证明了CC结构域只有定位于细胞质时才能诱导产生细胞坏死,与Yr10-1全长诱导产生细胞坏死的定位相同。通过免疫共沉淀和双分子荧光互补技术证明了CC结构域自身之间可以发生相互作用。(本文来源于《西北农林科技大学》期刊2019-05-01）
陶庭磊[9]（2019）在《灰树花葡聚糖合成酶的基因结构和功能研究》一文中研究指出灰树花(Grifola frondosa)是一种富含多糖和蛋白质等生物活性成分的食药用真菌,其多糖具有抗肿瘤、免疫调节、抗氧化以及抗病毒等作用。本课题组前期研究发现,灰树花发酵胞外多糖主要为葡聚糖,其可能通过UDP-葡萄糖焦磷酸化酶将葡萄糖转化为UDP-葡萄糖,进而经葡聚糖合成酶聚合组装后形成胞外多糖并分泌至胞外。因此,葡聚糖合成酶可能是灰树花合成葡聚糖的关键酶之一。然而,有关灰树花葡聚糖合成酶(Glucan synthase of G.frondosa,GFGLS)的基因结构和功能的研究还未见报道。近年来,随着基因测序技术的发展,特别是灰树花全基因组测序结果和功能注释已公布,为分子水平研究灰树花葡聚糖合成酶GFGLS的基因结构和功能提供必要的信息资源。但目前高效改造灰树花遗传体系的技术手段仍十分匮乏,也限制了灰树花中重要功能基因的研究。因此,本研究首先基于已公布的灰树花基因组序列,设计引物并克隆GFGLS基因序列,对其结构进行生物信息学分析;进而,基于反向遗传学手段,构建高效灰树花基因沉默体系;最后考察GFGLS基因沉默对灰树花深层发酵性能的影响,基本阐明灰树花葡聚糖合成酶的在菌体生长和多糖合成中的主要功能和作用。主要研究结果如下:(1)克隆并运用生物信息学方法系统分析了灰树花葡聚糖合成酶基因GFGLS的结构信息。获得的GFGLS基因为全长5927 bp,与公布的灰树花9006-11菌株的GFGLS基因同源性达到98%。其含有11个内含子及12个外显子,编码蛋白序列全长为5346 bp,共编码1781个氨基酸,分子质量为203.66 kDa。GFGLS编码的蛋白与拟多孔菌、云芝的葡聚糖合成酶同源性相对较高,分别为90.66%和90.38%。蛋白结构域分析表明,GFGLSp有两个与葡聚糖合成酶基因家族一致的保守结构域,分别位于氨基酸残基261-369及761-1576两个位置。亲水性分析发现,GFGLSp为膜蛋白,共含有2个大跨膜结构域,主要包括N末端6个跨膜螺旋(TMHs)和C末端9个TMHs。跨膜结构域由氨基酸残基672-1253组成的亲水性细胞质结构域链接,其中,在氨基酸残基992-995中含有1个底物UDP-葡萄糖的结合位点。(2)建立了灰树花反向双元启动子基因沉默体系。通过克隆得到GFGLS保守区域片段、灰树花GPD启动子片段及构巢曲霉35S启动子片段并成功构建了pAN7-gfgls-dual沉默载体。优化了制备灰树花原生质体的条件即:利用1%丝状真菌破壁酶(购自Takara)和1%溶壁酶(购自广东微生物研究所)的组合酶酶解培养7 d的菌丝体,酶解时间为3 h,在此条件下,原生质体的得率和再生率分别达到最大值,为3.8×10~6个/mL和1.82%。利用电转法成功将基因沉默载体pAN7-gfgls-dual转入灰树花原生质体中,筛选得到10株转化子,经对标记基因HPH的PCR扩增证实9株呈阳性;荧光定量PCR(qRT-PCR)检测发现,转化菌株iGFGLS-3中GFGLS表达量下调最为显着,仅为0.26。(3)考察了GFGLS基因沉默对灰树花菌体生长和发酵性能的影响。与出发株(WT)相比,基因沉默菌株iGFGLS-3在PDA平板上生长明显变缓,7-d的平均生长率仅为3.04 mm/d,生长速率下降29.3%。WT菌丝为厚且高度分枝的表型,而iGFGLS-3菌株的长度变短,并且菌丝外观明显变薄。在发酵过程中,iGFGLS-3菌株的外观呈较小尺寸的菌球形态。发酵7 d后,WT菌株的生物量和胞外粗多糖分别为25.12 g/L和1.23 g/L,基因沉默菌株iGFGLS-3的生物量和胞外粗多糖的产量分别降低至5.02 g/L和0.38 g/L。单糖组成分析结果表明,与WT相比,转化菌株iGFGLS-3菌丝体粗多糖和胞内外粗多糖的单糖组成和比例差异不显着。因此,可以推测,灰树花葡聚糖合成酶可能通过影响葡聚糖的合成,干扰了菌丝体骨架,最终影响菌丝体的生长。(本文来源于《江苏大学》期刊2019-05-01）
王军霞,吴思楚,张鑫,张冰[10]（2019）在《迟发型阿尔茨海默病易感基因及其对脑结构和功能影响的研究进展》一文中研究指出阿尔茨海默病是最常见的老年性痴呆类型,其特征是进行性记忆丧失和认知功能退化。迄今为止,载脂蛋白E是唯一确定的与散发型阿尔茨海默病有关的致病基因。随着全基因组关联研究及磁共振成像技术的发展,愈来愈多的基因被报道与阿尔茨海默病及脑结构、脑功能相关,如桥连接蛋白、凝聚素等。然而,目前上述基因在阿尔茨海默病中的病理机制尚不明确。笔者就载脂蛋白E等基因在阿尔茨海默病中的作用通路及其对脑结构、脑功能等方面的影响予以综述。(本文来源于《磁共振成像》期刊2019年04期）
基因的结构与功能论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
【目的】明确海藻希瓦氏菌(Shewanella algae)感染对半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis)肠道菌群结构及相关功能基因表达的影响,揭示肠道菌群和肠道组织相关功能基因在疾病发生及免疫应答过程中的作用机制。【方法】以致病性海藻希瓦氏菌人工感染半滑舌鳎后,采用16S rDNA高通量测序技术探究其肠道菌群组成结构的变化情况,并利用实时荧光定量PCR检测分析半滑舌鳎肠道组织中参与疾病发生和免疫应答相关功能基因的表达规律。【结果】共测序获得118657条有效序列,按97%的序列相似度聚类后得到6732个OTUs。Alpha多样性分析结果显示,Shannon指数和Chao1指数以感染前(CG)的健康半滑舌鳎最高,在感染后12 h(12hpi)最低;感染海藻希瓦氏菌前后半滑舌鳎肠道优势菌门无明显变化,但不同类群的相对丰度发生变化。在属水平上,Elizabethkingia、曼噬甲壳菌属(Chitinophaga)、Brevinema、苯基杆菌属(Phenylobacterium)、假单胞菌属(Pseudomonas)、乳杆菌属(Lactobacillus)、Marivita和雷尔氏菌属(Ralstonia)的相对丰度在CG半滑舌鳎肠道菌群组成中占比最高,希瓦氏菌属(Shewanella)、Petrimonas、Proteiniphilum和Aminobacterium的相对丰度在12hpi的占比最高,食酸菌属(Acidovorax)、芽孢杆菌属(Bacillus)和弧菌属(Vibrio)的相对丰度在感染后24 h(24hpi)的占比最高。半滑舌鳎肠道组织相关功能基因的表达变化表现为:果糖二磷酸醛缩酶A基因(ALDOA)的相对表达量在24hpi时显着高于CG(P<0.05,下同);磷脂酶B1基因(PLB1)、热休克蛋白70 kD蛋白1A基因(HSPA1A)、组氨酸叁聚体核苷结合蛋白1基因(HINT1)和γ谷氨酰转移酶1基因(GGT1)的相对表达量显着高于CG和24hpi;海藻糖酶基因(TREH)的相对表达量在12hpi时显着低于CG和24hpi。【结论】半滑舌鳎感染海藻希瓦氏菌后其肠道菌群多样性降低、菌群结构发生变化,肠道组织中免疫功能相关基因(HSPA1A和HINT1)及代谢功能相关酶类基因(ALDOA、PLB1、GGT1和TREH)呈差异表达,说明海藻希瓦氏菌感染引起半滑舌鳎肠道微生态紊乱,且肠道组织中免疫功能相关基因和代谢功能相关酶类基因分别参与机体的免疫应答及疾病发生过程。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
基因的结构与功能论文参考文献
[1].塔依尔江·麦麦提,苏比奴尔·艾力,布威海丽且姆·阿巴拜科日,佐日古丽·伊斯马伊力,阿迪力·艾合麦提.塔里木马鹿维生素D受体（VDR）基因结构和功能的预测与分析[J].动物学杂志.2019
[2].张燕玉,韩卓然,孙敬锋,吕爱军,胡秀彩.海藻希瓦氏菌感染对半滑舌鳎肠道菌群结构及相关功能基因表达的影响[J].南方农业学报.2019
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[4].汪阳,王大会,张子敬,贺花,徐嘉威.FHC基因的结构与功能及其表达调控的研究进展[J].中国畜牧杂志.2019
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[6].Mudassar,Ahmad.梨CBF和NAC转录因子系统进化及基因结构和功能研究[D].浙江大学.2019
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