蛋白质特异性论文-陈超豪,杨森,木海琦,王怡君,南存金

蛋白质特异性论文-陈超豪,杨森,木海琦,王怡君,南存金

导读:本文包含了蛋白质特异性论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献,主要关键词:前列腺特异性抗原,肿瘤异常蛋白,质金属蛋白酶9,前列腺癌

蛋白质特异性论文文献综述

陈超豪,杨森,木海琦,王怡君,南存金[1](2019)在《血清前列腺特异性抗原、肿瘤异常蛋白、质金属蛋白酶9在前列腺癌患者中的水平变化及其与转移的关系分析》一文中研究指出目的探讨血清前列腺特异性抗原(PSA)、肿瘤异常蛋白(TAP)、质金属蛋白酶9(MMP-9)与前列腺癌转移的关系。方法选取前列腺癌患者66例,依据核素显像分为转移组(40例)和无转移组(26例),同期选取健康人员66例,检测所有人员血清PSA、TAP、MMP-9水平。结果前列腺癌患者血清PSA、TAP、MMP-9水平明显高于健康人员,转移组血清PSA、TAP、MMP-9水平明显高于无转移组,差异有统计学意义(P<0.05);ROC曲线分析结果显示,在诊断前列腺癌转移敏感度、特异度、准确度、曲线下面积方面,PSA>45.26 ng/ml时分别为82.50%、76.92%、80.30%、0.745,TAP>173.54μm~2时分别为77.50%、73.08%、75.76%、0.733,MMP-9>94.62 mg/L时分别为85.00%、80.77%、83.33%、0.768,叁者联合时分别为97.50%、96.15%、96.97%、0.923,明显高于叁者单独时,差异有统计学意义(P<0.05)。结论血清PSA、TAP、MMP-9水平与前列腺癌的发生、转移有关,叁者可作为诊断前列腺癌转移的重要参考指标。(本文来源于《中国卫生检验杂志》期刊2019年03期)

邢林林,郭茂祖,刘晓燕,李傲[2](2018)在《水稻组织特异性蛋白质相互作用网络构建方法》一文中研究指出组织特异的基因表达和蛋白质相互作用是研究基因调控、蛋白质功能、细胞过程的重要部分.相较于其他模式生物在蛋白质相互作用研究方面的进展,高等模式植物水稻中组织特异性蛋白质相互作用的研究十分缺乏.因此,提出了一种用于水稻组织特异性蛋白质相互作用网络构建的计算方法.该方法主要包含叁部分:第一,在统一标准下融合多数据识别组织特异的基因;第二,提出了新的同源映射方法,并集成6种模式生物相互作用数据构建和评估目标物种蛋白质相互作用网络;第叁,构建不同组织的蛋白质相互作用子网,并筛选高可靠的蛋白质相互作用.为了验证方法的有效性,构建并分析了水稻首个组织特异的蛋白质相互作用网络(PTSN4R:Predicted Tissue-Specific Network for Rice). PTSN4R包含了水稻23个组织的组织特异基因及对应的组织特异蛋白质相互作用子网,为分析组织特异的基因表达和蛋白质相互作用提供了便利条件. PTSN4R有助于理解水稻的生长调控机制,为水稻增产提供线索.同时,提出的方法能够方便的应用到其他物种,促进组织特异的蛋白质相互作用网络的研究.(本文来源于《哈尔滨工业大学学报》期刊2018年11期)

李艳,潘彤,李浩龙,袁玉华,孔伟伟[3](2018)在《液相芯片法验证蛋白质免疫印迹试验检测HIV-1结果的敏感性和特异性》一文中研究指出目的初步分析采用液相芯片法研制人类免疫缺陷病毒(HIV)-1检测试剂的可行性。方法采用液相芯片技术用蛋白质免疫印迹试验(Western Blot)检测HIV-1阳性和阴性的标本;用HIV-1的gp120、gp41、p24抗原分别包被不同编号的免疫磁珠,与生物素化二抗、亲和素化荧光染料PE组成液相芯片检测系统,对标本进行检测分析。结果 55份标本经Western Blot法确认阳性样本检测符合率为100%;76份经酶联免疫吸附试验(ELISA)初检和复检阴性的标本检测HIV-1gp120、HIV-1gp41、HIV-1p24抗原均为阴性;86份经ELISA法检测初检和复检为阳性而Western Blot法确认为阴性的样本,其HIV-1gp120、HIV-1gp41、HIV-1p24单片段检测均为阴性。液相芯片法检测HIV-1抗体的敏感度和特异度均为100%。结论采用液相芯片技术组成的HIV-1抗体检测系统,其敏感度和特异度均优于ELISA法检测。(本文来源于《实用检验医师杂志》期刊2018年03期)

陈静奇[4](2018)在《纳米粒子与蛋白质特异性与非特异性相互作用的研究》一文中研究指出拥有巨大比表面积的纳米粒子进入生命体后通常会吸附多种蛋白质,在外围形成一层蛋白质包裹,称为“蛋白冠”。蛋白冠改变了纳米粒子表面性质,影响了细胞对纳米粒子的识别,从而决定了纳米粒子的命运。同时,纳米粒子作为理想的药物载带平台,常常被修饰赋予靶向功能,研究靶向纳米药物与其靶标的相互作用,对纳米药物的研发也有重要意义蛋白冠的形成和靶向纳米药物与其靶标蛋白的相互作用有着很大的区别。前者的形成是一种不专一的吸附结果,源于纳米粒子与多种蛋白质的非特异性相互作用;这种非特异性的相互作用还会使纳米粒子表面修饰的靶向基团被遮蔽,降低纳米药物的靶向效果。而靶向纳米药物与其靶标蛋白的相互作用则是纳米粒子与蛋白质的特异性相互作用,是一种专一的相互识别结合,对于发展靶向纳米药物具有重要意义。为了更好地实现靶向纳米粒子与蛋白质特异性的相互作用,同时减少非特异性的相互作用,对靶向纳米粒子与蛋白质的特异性和非特异性的相互作用特点和异同的研究必不可少。我们实验室前期合成的对溶菌酶(Hen Egg White Lysozyme,HEWL)特异性和非特异性结合的金纳米粒子(Au-P1和Au-P1s)是开展上述研究的理想对象。我们取得如下研究结果:在热力学研究中,利用聚丙烯酰胺凝胶电泳、荧光光谱仪和停流光谱仪等,我们定量得到了纳米粒子上吸附的HEWL个数,Au-P1比Au-P1s结合更多的HEWL,Au-P1与HEWL解离常数K_d值为7.5×10~-88 M,而Au-P1s与HEWL的解离常数远大于这一数值。无论结合在Au-P1上还是Au-P1s上,HEWL的结构都发生了改变,而形成这一改变的时间很短,少于0.5 h。在动力学研究中,利用停流光谱仪测定了Au-P1和Au-P1s与HEWL的结合过程。结果表明Au-P1与HEWL结合过程中存在一个极快的识别结合阶段,此阶段的k_(on)为3.6×10~6(M·s)~(-1),k_(off)为0.27 s~(-1),而Au-P1s与HEWL相互作用中却不存在这一阶段。除此之外,利用停流光谱仪研究了Au-P1和Au-P1s结合上的HEWL与体系中游离HEWL的交换动力学过程。发现两种纳米粒子上的HEWL与体系中游离的HEWL都发生交换,交换过程都是由一个快速的容易交换阶段和一个慢速的不易交换阶段组成,交换率都达到了30%。为了确定Au-P1上对与溶菌酶的特异性相互作用起关键作用的关键氨基酸位点,我们逐个突变多肽P1上的氨基酸,将得到的突变多肽嫁接在金纳米粒子上,然后测定纳米粒子与HEWL的结合动力学。结果表明,多肽P1上4号、6号、7号和8号位点是保持Au-P1能特异性结合溶菌酶的关键位点。通过研究纳米粒子与蛋白质特异性和非特异性的相互作用的特点和异同,我们希望从一个全新的角度来探寻纳米粒子与蛋白质相互作用的规律,以期对靶向纳米药物的研发提供指导。(本文来源于《上海大学》期刊2018-06-01)

Haiyan,Hong,Yongfei,Cai,Shijun,Zhang,Hongyan,Ding,Haitao,Wang[5](2018)在《蛋白质多肽氨基端乙酰化酶NatB介导底物特异性乙酰化反应的分子基础》一文中研究指出文章简介蛋白质多肽氨基端乙酰化(N-terminal acetylation)发生在蛋白质或多肽的氨基端第一个氨基酸的(N端)α氨基上,是真核生物中一种最常见的蛋白质翻译后修饰方式。该修饰是由6类N端乙酰转移酶(NAT)来完成的(Nat A至Nat F),而每一种都只作用于其特异的蛋白(本文来源于《科学新闻》期刊2018年04期)

杨艳,王沁园,郭俊含,马潇,马丽[6](2018)在《骨特异性分子标志物与慢性肾脏病患者蛋白质——能量消耗的关系》一文中研究指出目的探索慢性肾脏疾病(CKD)患者血清及RNA水平下骨特异性分子标志物FGF23、Pin1、Wnt1、β-catenin、DKK1与蛋白质—能量消耗(PEW)的关系。方法选取113例CKD患者,统计PEW发生率,并按照PEW发生与否,分为PEW组和非PEW组,组间比较以下指标:一般资料(性别、年龄、身体质量指数),生化指标(血清白蛋白(ALB)、血清总胆固醇(TCHO)、估计肾小球滤过率(e GFR)、血清肌酐(Scr)、甲状旁腺激素、维生素D)及合并症(体重及膳食减少、糖尿病、高血压、心脏疾病)。血清及RNA水平下上述5种骨特异性分子标志物与PEW的关系采用单因素及多因素Logistic回归分析法,其与PEW的相关性采用Pearson相关分析。结果与非PEW组比较,PEW组生化指标ALB、CHO、e GFR降低,Scr升高(P<0.05);PEW组中伴随体重下降、膳食摄入减少,合并糖尿病、合并心脏疾病的患者比例高于非PEW组(P<0.05)。血清水平下FGF23在PEW组高于非PEW组(P=0.05)。Pearson相关分析显示,血清水平下FGF23与PEW呈正相关(r=0.281,P=0.049)。单因素及多因素Logistic回归分析表明,血清FGF23和Wnt1水平分别是PEW的风险因素,血清水平下FGF23与PEW的ROC曲线下面积为0.659,血清水平下Wnt1与PEW的ROC曲线下面积为0.593,均具有一定诊断价值。RNA水平下的各标志物均与PEW无相关性。结论随着CKD的进展,PEW的发生率逐渐增加。骨特异性标志物FGF23有望成为PEW早期诊断的血清学标志物,Wnt信号通路相关蛋白与PEW的关系需要进一步研究。(本文来源于《兰州大学学报(医学版)》期刊2018年01期)

张露[7](2018)在《新型断裂蛋白质内含子介导的蛋白质内部位点特异性标记》一文中研究指出蛋白质的标记和修饰对于研究蛋白质的功能和结构是不可或缺的。目前,随着蛋白质标记和修饰技术的不断发展和成熟,蛋白质位点特异性的标记在生物领域有着大量的潜在应用。其中在蛋白质的功能研究方面起到了重要作用,例如研究信号通路相关蛋白质时,就需要体外表达目标蛋白且进行标记或修饰;另外利用核磁共振测目标蛋白结构时,也需要对目标蛋白进行标记。为了达到目标蛋白位点特异性的修饰和标记,目前,存在很多基于分子生物学和化学的蛋白质标记或修饰的方法,但是它们都有自身的缺点,且大部分只能做到对目标蛋白质末端位点的标记做不到内部位点的特异性的标记。蛋白质的反式剪接(protein trans-splicing)技术可以说是为蛋白质位点特异性的标记提供了新的方法。首先,蛋白质的反式剪接即由断裂蛋白质内含子介导的。断裂蛋白质内含子的特点是由两部分组成,命名为断裂蛋白质内含子的N端()和断裂蛋白质内含子的C端(),它们分别位于两个开放阅读框中(open reading frame,ORF)。当N端和C端的蛋白质内含子分别翻译成熟后,和能够重新识别,并且形成具有催化功能的活性中心,从而进行蛋白质的反式剪接。最终断裂蛋白质内含子被剪切下来,蛋白质内含子两侧的外显子通过肽键连接起来。目前利用断裂蛋白质内含子已经实现了蛋白质末端的标记与修饰,但是仍然没有做到蛋白质内部位点特异性的标记与修饰。而本文实现了对蛋白质内部位点的特异性标记。这也是首次利用断裂蛋白质内含子实现蛋白质的内部标记。本课题最终选取了TE3S11和RBS1两种新型的断裂蛋白质内含子。其中S1型断裂蛋白质内含子的N端仅包含有11个氨基酸,S11型断裂蛋白质内含子的C端仅包含有6个氨基酸。可用于目标蛋白位点特异性的荧光基团的标记。将麦芽糖结合蛋白(maltose binding protein,MBP)和TE3S11N(S11型断裂蛋白质内含子的N端)融合,形成N端前体蛋白;TE3S11C(S11型断裂蛋白质内含子的C端)、标有荧光基团FITC的赖氨酸和RBS1N(S1型断裂蛋白质内含子的N端)融合形成中间前体蛋白;RBS1C(S1型断裂蛋白质内含子的C端)与硫氧还蛋白(thioredoxin,Trx)融合形成C端前体蛋白。化学法合成中间前体蛋白。利用Amylose Resin纯化可得到N端前体蛋白,利用Ni~(2+)-NTA纯化可得到C端前体蛋白。叁种前体蛋白需要按照摩尔比1:1:1在室温下进行蛋白质的反式剪接,最后通过SDS-PAGE、Western Blot、荧光扫描以及质谱鉴定终产物,判断是否可以实现蛋白质内部位点特异性的标记。最终结果表明,本文实现了对目标蛋白内部位点特异性的标记。相比较已有的技术,本文中涉及到的技术更为简便、通用和真正实现了蛋白质内部位点的特异性标记。为蛋白质的标记开辟了新的方法。在蛋白质工程中具有很大的潜在应用。(本文来源于《东华大学》期刊2018-01-18)

鲍洪宇[8](2017)在《人源蛋白质ARAP3选择性识别RhoA的结构基础以及拟南芥蛋白质APUM23特异性识别18S核糖体RNA的结构基础》一文中研究指出本论文的第一章介绍了我们关于含有两个GTP酶激活蛋白质结构域的人源蛋白质ARAP3选择性识别RhoA的结构与功能研究。ARAP3是一个多结构域的蛋白质,它含有1个ArfGAP结构域、1个RhoGAP结构域、1个SAM结构域、5个PH结构域、以及1个RA结构域。ARAP3的特点是同时拥有两个具有活性的GTP酶激活蛋白质结构域,其中ArfGAP可以选择性地识别并加速Arf6-GTP水解为Arf6-GDP,RhoGAP可以选择性地识别并加速RhoA-GTP水解为RhoA-GDP。PtdIns(3,4,5)P3与 ARAP3 的结合可以提高 ArfGAP 的活性,Rap1-GTP与ARAP3的结合可以提高RhoGAP的活性。ARAP3很多生物学功能都与它的RhoGAP结构域的活性有关,如参与板状伪足的形成、参与血管生成、抑制硬胃癌细胞的腹膜扩散、调节中性粒细胞的趋化性和粘附相关过程、以及参与神经突生长等。为了更清晰的了解ARAP3是如何特异性识别RhoA,我们解析了 ARAP3的RhoGAP结构域与RhoA·GDP·AlF4-在反应过渡态的复合物晶体结构。ARAP3的RhoGAP结构域由9个长的α螺旋和2个短的α螺旋反向平行折叠组成。我们对复合物结构提供的作用界面上的氨基酸进行突变,并通过细胞外1TC实验以及酶动力学实验研究了这些氨基酸对RhoGAP结构域识别RhoA以及加速RhoA-GTP水解能力的影响。我们发现对ARAP3的氨基酸的Arg-942、Arg-949、Arg-982或Arg-985的单点突变都可以显着的降低ARAP3-RhoGAP结构域与RhoA-GTP的结合能力以及GAP活性。我们还发现ARAP3是通过RhoA的α3螺旋中的氨基酸Asp-90和Glu-97来选择RhoA作为特异性作用底物的。本论文的第二章介绍了我们关于拟南芥中的PUF蛋白质APUM23特异性识别18S核糖体RNA中11个核苷酸的5'-GGAAUUGACGG-3'序列的结构与功能研究。多年来PUF蛋白质得到了广泛的结构与功能研究,但是我们对植物中的PUF蛋白质仍然知之甚少。大部分的PUF蛋白质都存在于细胞质中,它们通过结合信使RNA的3'非翻译区来调控信使RNA的翻译及定位。APUM23是少数的存在于核仁中的PUF蛋白质,它参与调节前核糖体RNA的加工过程,然而其中的分子机制目前尚不清楚。我们解析了 APUM23和目的RNA的复合物晶体结构,这是第一个解析出的植物中的PUF蛋白质结构,APUM23是由10个Puf repeat串联结构域折迭成的C型结构,APUM23有一段插入序列并在C型结构内侧折迭成α螺旋。这段插入序列参与RNA的识别。最后,我们还解析了不含插入氨基酸序列的APUM23的突变体和RNA 5'-GGAAUUGACGG-3'的复合物晶体结构。这个复合物结构显示,Go的碱基不再与APUM23的第十个Puf repeat结构域结合,而是经过大角度的翻转和A-3的碱基形成堆积相互作用稳定A+3碱基的构象。插入氨基酸序列的存在会通过空间位阻限制Go碱基的翻转,因此APUM23的插入氨基酸序列既识别RNA的碱基,又可以稳定RNA的构象。这项工作揭示了APUM23特异性识别18S核糖体RNA的结构基础。(本文来源于《中国科学技术大学》期刊2017-06-03)

张维冰,孙浩帆,楚占赢[9](2017)在《特异性功能化磁性纳米粒子的制备及其于蛋白质组学中的应用研究》一文中研究指出近年来,磁性纳米粒子以其特有的性质,在特异性功能化制备方面得到了长足的发展,并在分离分析及检测方面得到了广泛的应用。磁性纳米颗粒既具有表面效应、小尺寸效应、量子效应、宏观量子隧道效应等纳米材料所特有的性质,又具有良好的磁导向性、超顺磁性类酶催化特性和生物相容性等特殊性质。因此,特异性功能化磁性纳米粒子在蛋白组学中,对于蛋白及肽段的富集具有很大的优势。基于以上,我们通过制备特异性功能化磁性纳米材料,实现蛋白组学上的多种应用:采用聚乙二(本文来源于《第21届全国色谱学术报告会及仪器展览会会议论文集》期刊2017-05-19)

周雨[10](2017)在《位点特异性蛋白质-高分子偶联物的制备与应用》一文中研究指出重组人干扰素是一类常见的蛋白质药物,它在抗病毒、抗肿瘤方面都发挥了一定的作用。由于这类蛋白质药物进入体内后容易被肾脏清除或易被蛋白酶降解,半衰期短,因此需要对这类蛋白质进行修饰。虽然聚乙二醇修饰、包裹蛋白质药物后可以提高药物的稳定性,但该方法存在诸多缺陷,包括修饰位点不可控、高免疫原性和以及毒性等,因此寻找更合适的替代性高分子材料与修饰方法迫在眉睫。本文选择了生物相容性好、免疫原性低的聚多肽作为偶联对象,其主链的可降解性、侧链的修饰便利性和端基的选择反应活性使其成为具有位点特异性的完美的用于蛋白质修饰的高分子材料。本论文中我们主要采用自然连接法、转肽酶介导的连接反应合成了不同长度、不同拓扑结构的干扰素-聚多肽偶联物。在通过质谱、western-blotting等方法对合成的产物进行鉴定后,我们借助荧光光谱、圆二色谱谱检测了偶联物的稳定性、通过Elisa方法研究了药物代谢动力学、组织分布等信息;此外,还检测了偶联物在体外和体内的毒性、抗肿瘤活性、抗病毒活性、以及免疫原性,结果发现,(1)在体外成功合成的线型和环形偶联物的水合粒径明显增大,热稳定性和酶耐受性都有极大提高;(2)偶联物在体外维持了一定水平的抗肿瘤活性及抗病毒活性,且偶联物并未表现出比野生型更强的免疫原性;(3)由于血液循环时间的增加和生物组织分布等各方面原因,偶联物在体内表现出比较良好的抗肿瘤活性。相关结果为后续系统开发干扰素-聚多肽偶联物奠定了基础。(本文来源于《电子科技大学》期刊2017-04-01)

蛋白质特异性论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

组织特异的基因表达和蛋白质相互作用是研究基因调控、蛋白质功能、细胞过程的重要部分.相较于其他模式生物在蛋白质相互作用研究方面的进展,高等模式植物水稻中组织特异性蛋白质相互作用的研究十分缺乏.因此,提出了一种用于水稻组织特异性蛋白质相互作用网络构建的计算方法.该方法主要包含叁部分:第一,在统一标准下融合多数据识别组织特异的基因;第二,提出了新的同源映射方法,并集成6种模式生物相互作用数据构建和评估目标物种蛋白质相互作用网络;第叁,构建不同组织的蛋白质相互作用子网,并筛选高可靠的蛋白质相互作用.为了验证方法的有效性,构建并分析了水稻首个组织特异的蛋白质相互作用网络(PTSN4R:Predicted Tissue-Specific Network for Rice). PTSN4R包含了水稻23个组织的组织特异基因及对应的组织特异蛋白质相互作用子网,为分析组织特异的基因表达和蛋白质相互作用提供了便利条件. PTSN4R有助于理解水稻的生长调控机制,为水稻增产提供线索.同时,提出的方法能够方便的应用到其他物种,促进组织特异的蛋白质相互作用网络的研究.

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

蛋白质特异性论文参考文献

[1].陈超豪,杨森,木海琦,王怡君,南存金.血清前列腺特异性抗原、肿瘤异常蛋白、质金属蛋白酶9在前列腺癌患者中的水平变化及其与转移的关系分析[J].中国卫生检验杂志.2019

[2].邢林林,郭茂祖,刘晓燕,李傲.水稻组织特异性蛋白质相互作用网络构建方法[J].哈尔滨工业大学学报.2018

[3].李艳,潘彤,李浩龙,袁玉华,孔伟伟.液相芯片法验证蛋白质免疫印迹试验检测HIV-1结果的敏感性和特异性[J].实用检验医师杂志.2018

[4].陈静奇.纳米粒子与蛋白质特异性与非特异性相互作用的研究[D].上海大学.2018

[5].Haiyan,Hong,Yongfei,Cai,Shijun,Zhang,Hongyan,Ding,Haitao,Wang.蛋白质多肽氨基端乙酰化酶NatB介导底物特异性乙酰化反应的分子基础[J].科学新闻.2018

[6].杨艳,王沁园,郭俊含,马潇,马丽.骨特异性分子标志物与慢性肾脏病患者蛋白质——能量消耗的关系[J].兰州大学学报(医学版).2018

[7].张露.新型断裂蛋白质内含子介导的蛋白质内部位点特异性标记[D].东华大学.2018

[8].鲍洪宇.人源蛋白质ARAP3选择性识别RhoA的结构基础以及拟南芥蛋白质APUM23特异性识别18S核糖体RNA的结构基础[D].中国科学技术大学.2017

[9].张维冰,孙浩帆,楚占赢.特异性功能化磁性纳米粒子的制备及其于蛋白质组学中的应用研究[C].第21届全国色谱学术报告会及仪器展览会会议论文集.2017

[10].周雨.位点特异性蛋白质-高分子偶联物的制备与应用[D].电子科技大学.2017

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