导读:本文包含了短短芽孢杆菌论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献，主要关键词:嗜铁素,短短芽孢杆菌,生物信息学,原核表达
短短芽孢杆菌论文文献综述
袁林,贾化可,盛淼淼,王兵,曾丽娜[1]（2019）在《短短芽孢杆菌GZDF3嗜铁素合成酶基因Gene5693的生物信息学分析及原核表达》一文中研究指出目的:从短短芽孢杆菌GZDF3菌株中克隆嗜铁素合成酶基因Gene5693,构建其原核表达载体并进行重组表达。方法:利用antiSMASH软件对GZDF3全基因组序列进行次级代谢物预测分析,然后采用ExPASy在线分析预测嗜铁素合成酶基因Gene5693的基本理化性质并进行重组表达。结果:生物信息学分析结果显示,短短芽孢杆菌GZDF3全基因组序列与Petrobactin嗜铁素基因簇的相似性为83%,Gene5693基因编码的蛋白与Petrobactin嗜铁素编码的蛋白AsbE的相似性为51.06%;Gene5693编码蛋白氨基酸长度为327个氨基酸,分子量为39.05 kDa,等电点(pI)为4.94,为酸性亲水性蛋白;Gene5693基因的PCR扩增成功获得预测的Gene5693基因片段,菌落PCR及重组DNA分子的双酶切电泳结果显示成功构建重组质粒;SDS-PAGE结果表明Gene5693编码的蛋白大小与生物信息学预测的结果一致。结论:成功克隆了嗜铁素合成基因Gene5693,并进行了重组表达。(本文来源于《贵州医科大学学报》期刊2019年08期）
陶小买,曾丽娜,贾化可,张婷婷,任建国[2]（2019）在《短短芽孢杆菌几丁质酶BBChi4基因的原核表达及抑菌活性研究》一文中研究指出采用生物信息学方法分析短短芽孢杆菌GZDF3菌株几丁质酶BBChi4基因,以GZDF3菌株全基因组DNA为模版设计特异性引物,通过PCR扩增出BBChi4基因的全序列并对其测序验证。将测序验证无误的基因序列连接到原核表达载体(pET-28a),构建重组表达载体pET-28a-BBchi4,转入大肠杆菌BL21进行诱导表达,利用打孔法对诱导表达产物进行抑菌活性研究。生物信息学分析显示BBChi4基因全长为2 181 bp,编码726个氨基酸,分子量大小为77.69 kD,等电点为4.83,属于酸性几丁质酶。破碎重组表达菌体上清液SDS-PAGE电泳显示,重组蛋白质分子量大约为78 kD,与生物信息学预测结果一致。诱导表达最佳参数为1 mmol/L IPTG,30℃诱导4 h。破碎重组表达菌体上清液对半夏致病真菌(尖孢镰刀菌)有较强的拮抗作用。重组表达载体pET-28a-BBchi4的成功构建及表达为深入研究几丁质酶的功能提供科学依据。(本文来源于《基因组学与应用生物学》期刊2019年08期）
厉彦芳,王春阳,谢菁菁,赵秀香[3]（2019）在《侧孢短芽孢杆菌B8抑制植物病毒及促进番茄生长作用研究》一文中研究指出测定了侧孢短芽孢杆菌(Brevibacillus laterosporus)B8菌株对蜡状芽孢杆菌(Bacillus cereus)、烟草花叶病毒(Tobacco mosaic virus,TMV)和番茄黄化曲叶病毒(Tomato yellow leaf curl virus,TYLCV)的抑制作用及对番茄的促生长作用。结果表明,菌株B8及其发酵液能抑制蜡状芽孢杆菌和TMV,发酵液与TMV体外混合后接种心叶烟对TMV的抑制率为87.52%;B8无菌发酵液喷施烟草NC89对其TMV的预防作用和治疗作用分别为62.40%和58.91%。番茄预先喷施无菌发酵液、灌根和种子浸泡处理后接种TYLCV的处理,均能减轻TYLCV的侵染,其中灌根处理对TYLCV的防治效果最好。其抑菌蛋白粗提物与TMV混合后接种心叶烟对TMV的抑制率为42.50%;用发酵液稀释20倍液处理番茄种子能促进种子提早发芽、生根和番茄幼苗生长。菌株B8在培养过程中可分泌吲哚乙酸(IAA)。推测抑菌蛋白和IAA是菌株B8抑制病毒和促进番茄生长的主要原因之一。(本文来源于《中国植保导刊》期刊2019年07期）
贾化可,张功友,陶小买,吴东明,隆耀航[4]（2019）在《短短芽孢杆菌GZDF3中PilZ结构域基因的挖掘和糖基转移酶的原核表达》一文中研究指出【背景】PilZ结构域是最早发现的环二鸟苷酸(Cyclic diguanylate,c-di-GMP)受体信号分子,与c-di-GMP结合后可以调控目标基因或者蛋白的活性,在细菌的生长过程中发挥着至关重要的作用,而短短芽孢杆菌中PilZ结构域的研究相对缺乏。【目的】挖掘短短芽孢杆菌GZDF3菌株中的PilZ结构域蛋白基因,并进行重组表达,为研究其功能奠定基础。【方法】从Pfam数据库中下载PilZ结构域模型,HMMScan软件扫描GZDF3全基因组序列,在保守结构域数据库(Conserved domain database,CDD)中分析蛋白保守结构域,Protein BLAST比对分析;采用ExPASy在线软件预测蛋白的基本理化性质;构建重组表达载体进行蛋白重组表达。【结果】GZDF3基因中存在5个含有PilZ结构域的蛋白编码基因,其中命名为Gene4836的基因经Protein BLAST比对分析显示其编码糖基转移酶,Gene1423为YcgR超家族蛋白编码基因,Gene1723编码透明质酸合成酶,属于糖基转移酶超家族2,其余Gene2571、Gene2956编码假定蛋白;Gene4836的编码产物分子量为24.08 kD,等电点为6.39,为酸性亲水性蛋白;C端有一个PilZ结构域;0.5 mmol/L乳糖诱导、30°C培养20 h,表达出一大小约为25kD的重组蛋白,与生物信息学预测结果相符。【结论】首次对短短芽孢杆菌含有PilZ结构域蛋白编码基因进行原核表达,并成功纯化出重组蛋白,为后续研究其功能奠定了基础。(本文来源于《微生物学通报》期刊2019年11期）
杨从军[5]（2019）在《抗番茄灰霉病菌的内生短短芽孢杆菌W4菌株发酵条件优化》一文中研究指出为提高内生短短芽孢杆菌(Brevibacillus brevis)W4菌株发酵液对番茄灰霉病菌(Botrytis cinerea)的抑菌活性,采用单因素试验与正交试验设计相结合,优化发酵培养基及发酵条件。结果表明,最佳发酵培养基为蛋白胨2.0%、果糖1.0%、NaCl 0.25%;最佳发酵条件为初始pH 8.0、接种种龄20 h、接种量5%、装液量50 mL(250 mL叁角瓶)、发酵温度35℃、摇床转速150 r·min~(-1)、发酵时间24 h。产生的发酵液稀释25倍对番茄灰霉病菌的抑制率达92.8%,比未经优化得到的发酵液提高26.9个百分点。通过培养基和发酵条件优化,显着提高了短短芽孢杆菌W4发酵液活性,为进一步提取分离抗番茄灰霉病菌的活性成分奠定了基础。(本文来源于《中国蔬菜》期刊2019年06期）
陶小买[6]（2019）在《缺铁胁迫对短短芽孢杆菌GZDF3菌株次生代谢物合成酶表达的影响》一文中研究指出目的:研究缺铁胁迫对短短芽孢杆菌GZDF3菌株次生代谢产物合成酶表达的影响,为深入研究次生代谢物的合成与调控奠定基础。方法:分别以NA培养基、缺铁培养基(SA)、低铁培养基(SA+10μmol/L Fe~(3+))叁种培养基培养短短芽孢杆菌GZDF3菌株并绘制生长曲线;以白色念珠菌为受试菌,琼脂打孔法检测3种培养基发酵上清液的抑菌活性;并利用同位素相对标记和绝对定量技术(iTRAQ)研究叁种培养基中GZDF3菌株次生代谢物合成酶的表达差异,进一步通过RT-PCR对有差异的合成酶进行转录水平验证。结果:1.生长曲线测定结果显示,缺铁胁迫短时间不会影响GZDF3菌株的生长;2.叁种培养基中GZDF3菌株发酵上清液对白色念珠菌均有明显抑菌效果,NA培养基发酵上清抑菌圈直径达21±0.5 mm,缺铁培养基发酵上清抑菌圈直径达32±0.5 mm,低铁培养基发酵上清抑菌圈直径达24±0.5 mm;3.叁种培养基中一共筛选出3892个符合蛋白筛选标准的可信差异蛋白,其中NA与缺铁培养基中差异表达蛋白质1313个,NA与低铁培养基中差异表达蛋白质1312个,缺铁培养基与低铁培养基中差异表达蛋白质1267个;4.iTRAQ差异蛋白分析显示,与抑菌活性相关的次生代谢产物合成酶中几丁质酶D(GENE6369)、线性短杆菌肽合成酶A(GENE677)、线性短杆菌肽合成酶B(GENE676)和短杆菌酪肽合成酶B(GENE796)在缺铁培养基中表达上调,而几丁质酶A(GENE2828)在缺铁培养基中表达下调;5.RT-PCR结果显示几丁质酶chiA编码基因gene2828和NRPS合成酶肽酶S8编码基因gene1818在缺铁培养基中表达下调,而线性短杆菌肽合成酶A(LgrA)编码基因gene677和短杆菌酪肽合成酶B(TycB)编码基因gene796在缺铁培基中表达上调。结论:缺铁胁迫会促进GZDF3菌株线性短杆菌肽LgrA、B、C及短杆菌酪肽TycB合成,抑制几丁质酶chiA的合成。(本文来源于《贵州医科大学》期刊2019-05-31）
胡艳红,龚雪梅,丁柳柳,高嵩,李婷婷[7]（2019）在《利用短短芽孢杆菌进行酮还原酶CgKR2的高效表达与纯化》一文中研究指出酮还原酶CgKR2能够一步还原前手性羰基化合物生成高附加值的手性醇,有望解决手性醇传统制备方法的步骤烦琐和高成本问题,具有很高的经济效益。研究表明,CgKR2催化底物2-氧代-4-苯基丁酸乙酯(OPBE)生成普利类降压药的重要中间体(R)-2-羟基-4-苯基丁酸乙酯[(R)-HPBE]具有良好效果。但CgKR2的生产成本高昂、过程烦琐。利用短短芽孢杆菌胞外分泌表达酮还原酶CgKR2,获得该酶的高效表达,并经简便的一步镍亲和层析纯化,即获得高纯度酮还原酶CgKR2,产率高达每升发酵7. 8mg纯酶。以酶标板法测定其比活力、温度稳定性以及动力学参数等基本酶学性质,结果显示,CgKR2的比活力为(78. 32±7. 62) U/mg、Km为(0. 2±0. 02) mmol/L、Vmax为(117. 64±3. 6)μmol/(min·mg)、Kcat为73s-1,与以往报道的数据一致,并且获得的CgKR2纯酶在30℃下孵育72h依然保持80%的活性,酶活的稳定性远好于以往的制备方法。开发出的一套简便高效的酮还原酶CgKR2表达纯化工艺,降低了生产成本、简化了生产工艺,可推进手性醇生物催化制备的普及,对其他生物催化工程酶的制备方法研究也有借鉴作用。(本文来源于《中国生物工程杂志》期刊2019年08期）
刘影[8]（2019）在《短短芽孢杆菌对磷酸叁甲苯酯的降解机制及降解产物毒性研究》一文中研究指出有机磷酸酯阻燃剂(organophosphate flame retardants,OPFRs)是一类常用的阻燃剂,由于OPFRs容易被释放到环境中且具有毒性效应,对环境和人体健康构成了潜在的威胁,近年来已受到人们的普遍关注。然而目前关于OPFRs的微生物降解性能和机制的研究还相对较少。本文以磷酸叁甲苯酯(tricresyl phosphates,TCPs)作为OPFRs的代表污染物,以短短芽孢杆菌(Brevibacillus brevis)为实验菌株,研究了B.brevis对TCPs的降解特性和降解机制,并分析了TCPs及其降解产物的细胞毒性效应和作用机理。主要研究结果如下:(1)B.brevis可高效降解TCPs,当温度为30℃,pH值为7.0时,2 g/L的B.brevis在5 d内对TCPs(1 mg/L)的降解率达到86.5%。B.brevis降解TCPs的过程中,细胞形态发生变化,细胞官能团羟基(-OH)、脂肪酸、有机磷酸盐等可能影响菌体对TCPs的降解。高浓度的TCPs诱导菌体发生氧化应激反应,引起细胞内ROS含量的增加。细胞色素P450酶抑制剂显着抑制了B.brevis对TCPs的降解效果。利用B.brevis生物强化修复河水体系中的TCPs,处理120 h后TCPs的降解率达到91.3%。(2)反应5 d后,分别有93.9%、82.9%、53.9%的磷酸叁对甲苯酯(tri-para-cresyl phosphate,TpCP)、磷酸叁间甲苯酯(Tri-meta-cresyl phosphate,TmCP)、磷酸叁邻甲苯酯(tri-ortho-cresyl phosphate,ToCP)被B.brevis降解,且胞内酶在降解过程中起关键作用。在B.brevis降解TCPs的过程中,利用LC-Q-TOF-MS高分辨质谱共检测到12种TCPs的代谢产物,代谢过程主要涉及到水解和羟基化过程。B.brevis向胞外释放了Cl~-、Na~+,吸收了一定量的PO_4~(3-)、SO_4~(2-)、K~+和Mg~(2+),并在降解体系中检测到了乙酸、柠檬酸、草酸、丙二酸四种小分子有机酸。(3)TmCP和ToCP对A549细胞活力产生了抑制,破坏了线粒体膜的完整性,引起细胞发生氧化应激反应,细胞线粒体膜电位下降,从而诱导A549细胞凋亡。高浓度的TmCP和ToCP导致A549细胞发生了G0/G1期阻滞,减少了S期细胞的比例。TpCP以及TCPs的降解产物对A549细胞的毒性效应均不明显。本研究揭示了微生物对TCPs的降解转化机制,并分析比较了TCPs及其降解产物可能对环境和人体健康产生的毒害作用,为开发OPFRs污染的微生物修复技术提供了理论支持。(本文来源于《华南理工大学》期刊2019-05-26）
邹亮,吴敬,陈晟[9]（2019）在《重组蔗糖异构酶在短短芽孢杆菌中的表达及发酵优化》一文中研究指出对重组菌株Brevibacillus choshinensis/pNCMO2-SI摇瓶发酵产蔗糖异构酶进行研究,进一步探讨了3 L发酵罐不同发酵条件对菌体生长及产酶的影响。结果表明,摇瓶发酵后胞外酶活为50 U/mL,最优3 L发酵罐培养条件为:初始碳源为葡萄糖质量浓度10 g/L,初始氮源为多聚蛋白胨、牛肉浸膏质量浓度各15 g/L,发酵温度30℃,溶氧30%,在此条件下得到的最高酶活为275 U/mL。为了探索启动子对蔗糖异构酶表达的影响,分别选取来源于枯草芽孢杆菌的启动子Papr-E,Pnpr-E,Pamy以及来源于巨大芽孢杆菌的启动子Pxyl进行研究。结果表明,使用启动子Papr-E的表达量最高。进一步优化摇瓶发酵条件,重组菌株BCpNapr-SI摇瓶发酵的胞外上清酶活为137 U/mL,在此条件下进行3 L发酵罐发酵,最终发酵上清胞外酶活为485.5 U/mL,是未优化启动子的1.76倍。(本文来源于《食品与生物技术学报》期刊2019年01期）
刘杨柳,陈洲,李思霆,贾英民[10]（2018）在《侧孢短芽孢杆菌抗菌肽的中试发酵工艺研究》一文中研究指出源自侧孢短芽孢杆菌(Brevibacillus laterosporus)S62-9的抗菌肽BL AMPs,具有抑菌谱广、易于代谢、不易产生耐药性等特性,有望在食品防腐保鲜等领域发挥重要作用。为进一步扩大天然BL AMPs制备规模,提高抗菌肽产量,本研究在摇瓶发酵基础上对该菌50 L发酵罐的中试工艺进行了优化。以效价为评价指标,通过单因素试验对装液量、接种量、发酵转速、通气量和发酵时间参数进行了优化。发酵液再经离心、活性炭吸附等工序初步分离BL AMPs,并计算其回收率。优化结果为:50 L发酵罐中发酵培养基装量为30 L,接种量为10%,发酵转速为180 r/min,通气量为1.3 vvm,发酵时间为24 h。在此工艺参数下,发酵液中BL AMPs效价达到1870.6 AU/mL,初步分离后BLAMPs回收率可达85%。本研究建立了BLAMPs的50 L中试发酵工艺体系,提升了发酵效率,并能有效回收BL AMPs,显示出BL AMPs规模化生产的潜力,对于指导后期BL AMPs的规模化生产提供了理论基础和技术参考。(本文来源于《中国食品科学技术学会第十五届年会论文摘要集》期刊2018-11-07）
短短芽孢杆菌论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
采用生物信息学方法分析短短芽孢杆菌GZDF3菌株几丁质酶BBChi4基因,以GZDF3菌株全基因组DNA为模版设计特异性引物,通过PCR扩增出BBChi4基因的全序列并对其测序验证。将测序验证无误的基因序列连接到原核表达载体(pET-28a),构建重组表达载体pET-28a-BBchi4,转入大肠杆菌BL21进行诱导表达,利用打孔法对诱导表达产物进行抑菌活性研究。生物信息学分析显示BBChi4基因全长为2 181 bp,编码726个氨基酸,分子量大小为77.69 kD,等电点为4.83,属于酸性几丁质酶。破碎重组表达菌体上清液SDS-PAGE电泳显示,重组蛋白质分子量大约为78 kD,与生物信息学预测结果一致。诱导表达最佳参数为1 mmol/L IPTG,30℃诱导4 h。破碎重组表达菌体上清液对半夏致病真菌(尖孢镰刀菌)有较强的拮抗作用。重组表达载体pET-28a-BBchi4的成功构建及表达为深入研究几丁质酶的功能提供科学依据。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
短短芽孢杆菌论文参考文献
[1].袁林,贾化可,盛淼淼,王兵,曾丽娜.短短芽孢杆菌GZDF3嗜铁素合成酶基因Gene5693的生物信息学分析及原核表达[J].贵州医科大学学报.2019
[2].陶小买,曾丽娜,贾化可,张婷婷,任建国.短短芽孢杆菌几丁质酶BBChi4基因的原核表达及抑菌活性研究[J].基因组学与应用生物学.2019
[3].厉彦芳,王春阳,谢菁菁,赵秀香.侧孢短芽孢杆菌B8抑制植物病毒及促进番茄生长作用研究[J].中国植保导刊.2019
[4].贾化可,张功友,陶小买,吴东明,隆耀航.短短芽孢杆菌GZDF3中PilZ结构域基因的挖掘和糖基转移酶的原核表达[J].微生物学通报.2019
[5].杨从军.抗番茄灰霉病菌的内生短短芽孢杆菌W4菌株发酵条件优化[J].中国蔬菜.2019
[6].陶小买.缺铁胁迫对短短芽孢杆菌GZDF3菌株次生代谢物合成酶表达的影响[D].贵州医科大学.2019
[7].胡艳红,龚雪梅,丁柳柳,高嵩,李婷婷.利用短短芽孢杆菌进行酮还原酶CgKR2的高效表达与纯化[J].中国生物工程杂志.2019
[8].刘影.短短芽孢杆菌对磷酸叁甲苯酯的降解机制及降解产物毒性研究[D].华南理工大学.2019
[9].邹亮,吴敬,陈晟.重组蔗糖异构酶在短短芽孢杆菌中的表达及发酵优化[J].食品与生物技术学报.2019
[10].刘杨柳,陈洲,李思霆,贾英民.侧孢短芽孢杆菌抗菌肽的中试发酵工艺研究[C].中国食品科学技术学会第十五届年会论文摘要集.2018