涂文文:NaCl处理对酸枣幼苗内源激素含量的影响及转录组测序分析论文

涂文文:NaCl处理对酸枣幼苗内源激素含量的影响及转录组测序分析论文

本文主要研究内容

作者涂文文(2019)在《NaCl处理对酸枣幼苗内源激素含量的影响及转录组测序分析》一文中研究指出:为探究不同浓度NaCl处理对酸枣幼苗叶和根系内源激素含量的影响,利用高效液相色谱法测定不同浓度NaCl处理不同时间,酸枣幼苗叶、根中脱落酸,生长素,赤霉素,玉米素4种内源激素的含量,利用BGISEQ-500测序平台分别对0 mmol?L-11 NaCl处理(对照)和150 mmol?L-11 NaCl处理6 h的酸枣幼苗叶和根进行转录组测序。主要结果如下:(1)与0 mmol?L-1NaCl处理相比,处理时间相同时,酸枣幼苗叶和根在50、100、150、200 mmol?L-1NaCl处理下ABA含量显著增加,IAA、ZT、GA3的含量、IAA/ABA,GA3/ABA的比值整体显著下降。与处理0h相比,不同浓度NaCl处理下,随着处理时间的延长,酸枣叶,根的ABA含量显著升高,IAA/ABA,GA3/ABA的比值均显著降低;100mmol?L-1NaCl处理下,酸枣叶和根的GA3、IAA、ZT含量显著下降。NaCl处理下,处理时间相同时,酸枣幼苗通过增加叶和根ABA含量,降低叶和根IAA、ZT、GA3含量、IAA/ABA和GA3/ABA的比值适应盐胁迫。(2)由转录组测序可知,酸枣叶和根共获得27.7GB的有效数据,通过序列拼接组装共得到277841759条Unigene,其中33856条Unigene在KEGG,GO等数据库中得到注释。与对照相比,根据GO分类发现富集到催化活性、膜相关、代谢过程的差异表达基因最多;在KEGG富集标准下,注释到MAPK信号通路-植物的差异表达基因在酸枣幼苗叶和根中都有富集并且差异表达基因数量较多。与对照相比,150 mmol?L-11 NaCl处理,酸枣叶片和根转录组中共发现11223个差异表达基因,包括8421个上调基因和2802个下调基因,根部的差异表达基因明显多于叶片。(3)通过本实验筛选出在NaCl处理下酸枣幼苗叶响应ABA差异表达基因的家族有C2C2-YABBY(107428651)、根响应ABA差异表达基因的家族有MYB(107433002)、C2C2-YABBY(107434921,107410267)、bZIP(107432186)、AP2-EREBP(107413884),以及通过GO注释和KEGG注释筛选出叶和根中log2 Ratio最高的12个与ABA相关基因。

Abstract

wei tan jiu bu tong nong du NaClchu li dui suan zao you miao xie he gen ji nei yuan ji su han liang de ying xiang ,li yong gao xiao ye xiang se pu fa ce ding bu tong nong du NaClchu li bu tong shi jian ,suan zao you miao xie 、gen zhong tuo la suan ,sheng chang su ,chi mei su ,yu mi su 4chong nei yuan ji su de han liang ,li yong BGISEQ-500ce xu ping tai fen bie dui 0 mmol?L-11 NaClchu li (dui zhao )he 150 mmol?L-11 NaClchu li 6 hde suan zao you miao xie he gen jin hang zhuai lu zu ce xu 。zhu yao jie guo ru xia :(1)yu 0 mmol?L-1NaClchu li xiang bi ,chu li shi jian xiang tong shi ,suan zao you miao xie he gen zai 50、100、150、200 mmol?L-1NaClchu li xia ABAhan liang xian zhe zeng jia ,IAA、ZT、GA3de han liang 、IAA/ABA,GA3/ABAde bi zhi zheng ti xian zhe xia jiang 。yu chu li 0hxiang bi ,bu tong nong du NaClchu li xia ,sui zhao chu li shi jian de yan chang ,suan zao xie ,gen de ABAhan liang xian zhe sheng gao ,IAA/ABA,GA3/ABAde bi zhi jun xian zhe jiang di ;100mmol?L-1NaClchu li xia ,suan zao xie he gen de GA3、IAA、ZThan liang xian zhe xia jiang 。NaClchu li xia ,chu li shi jian xiang tong shi ,suan zao you miao tong guo zeng jia xie he gen ABAhan liang ,jiang di xie he gen IAA、ZT、GA3han liang 、IAA/ABAhe GA3/ABAde bi zhi kuo ying yan xie pai 。(2)you zhuai lu zu ce xu ke zhi ,suan zao xie he gen gong huo de 27.7GBde you xiao shu ju ,tong guo xu lie pin jie zu zhuang gong de dao 277841759tiao Unigene,ji zhong 33856tiao Unigenezai KEGG,GOdeng shu ju ku zhong de dao zhu shi 。yu dui zhao xiang bi ,gen ju GOfen lei fa xian fu ji dao cui hua huo xing 、mo xiang guan 、dai xie guo cheng de cha yi biao da ji yin zui duo ;zai KEGGfu ji biao zhun xia ,zhu shi dao MAPKxin hao tong lu -zhi wu de cha yi biao da ji yin zai suan zao you miao xie he gen zhong dou you fu ji bing ju cha yi biao da ji yin shu liang jiao duo 。yu dui zhao xiang bi ,150 mmol?L-11 NaClchu li ,suan zao xie pian he gen zhuai lu zu zhong gong fa xian 11223ge cha yi biao da ji yin ,bao gua 8421ge shang diao ji yin he 2802ge xia diao ji yin ,gen bu de cha yi biao da ji yin ming xian duo yu xie pian 。(3)tong guo ben shi yan shai shua chu zai NaClchu li xia suan zao you miao xie xiang ying ABAcha yi biao da ji yin de jia zu you C2C2-YABBY(107428651)、gen xiang ying ABAcha yi biao da ji yin de jia zu you MYB(107433002)、C2C2-YABBY(107434921,107410267)、bZIP(107432186)、AP2-EREBP(107413884),yi ji tong guo GOzhu shi he KEGGzhu shi shai shua chu xie he gen zhong log2 Ratiozui gao de 12ge yu ABAxiang guan ji yin 。

论文参考文献

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  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自石河子大学的涂文文,发表于刊物石河子大学2019-09-26论文,是一篇关于酸枣论文,处理论文,内源激素论文,转录组分析论文,石河子大学2019-09-26论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自石河子大学2019-09-26论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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