王姝懿:布鲁菌疫苗株A19全基因组测序及功能分析论文

王姝懿:布鲁菌疫苗株A19全基因组测序及功能分析论文

本文主要研究内容

作者王姝懿,赵学亮,孙珂,呼和巴特尔,王文龙(2019)在《布鲁菌疫苗株A19全基因组测序及功能分析》一文中研究指出:采用Illumina Hiseq和PacBio测序技术对布鲁菌A19进行全基因组测序,并进行GO注释、VFDB注释、ARDB注释、CRISPR以及基因岛预测等生物信息学分析。结果显示:A19全基因组大小为3.28 Mb,GC含量分布未见异常,含1个CRISPR和16个基因岛,通过GO数据库注释发现,参与生物学途径的基因5 311个、细胞组份基因有3 350个、分子功能基因有3 078个;通过VFDB注释发现,与毒力相关的基因82个,主要包括脂多糖(LPS)、纤连结合蛋白、virB四型分泌系统等毒力相关因子;通过ARDB数据库注释发现,与耐药相关的基因1个,该基因的表达产物通过影响焦磷酸异构酶的表达,从而产生对抗生素的耐药。本试验通过A19全基因组测序,为布鲁菌病的治疗和致病机制的研究及疫苗的开发奠定了基础。

Abstract

cai yong Illumina Hiseqhe PacBioce xu ji shu dui bu lu jun A19jin hang quan ji yin zu ce xu ,bing jin hang GOzhu shi 、VFDBzhu shi 、ARDBzhu shi 、CRISPRyi ji ji yin dao yu ce deng sheng wu xin xi xue fen xi 。jie guo xian shi :A19quan ji yin zu da xiao wei 3.28 Mb,GChan liang fen bu wei jian yi chang ,han 1ge CRISPRhe 16ge ji yin dao ,tong guo GOshu ju ku zhu shi fa xian ,can yu sheng wu xue tu jing de ji yin 5 311ge 、xi bao zu fen ji yin you 3 350ge 、fen zi gong neng ji yin you 3 078ge ;tong guo VFDBzhu shi fa xian ,yu du li xiang guan de ji yin 82ge ,zhu yao bao gua zhi duo tang (LPS)、qian lian jie ge dan bai 、virBsi xing fen bi ji tong deng du li xiang guan yin zi ;tong guo ARDBshu ju ku zhu shi fa xian ,yu nai yao xiang guan de ji yin 1ge ,gai ji yin de biao da chan wu tong guo ying xiang jiao lin suan yi gou mei de biao da ,cong er chan sheng dui kang sheng su de nai yao 。ben shi yan tong guo A19quan ji yin zu ce xu ,wei bu lu jun bing de zhi liao he zhi bing ji zhi de yan jiu ji yi miao de kai fa dian ding le ji chu 。

论文参考文献

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  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自中国兽医学报的王姝懿,赵学亮,孙珂,呼和巴特尔,王文龙,发表于刊物中国兽医学报2019年09期论文,是一篇关于布鲁菌论文,布鲁菌疫苗株论文,全基因组测序论文,功能分析论文,中国兽医学报2019年09期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自中国兽医学报2019年09期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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