导读:本文包含了核糖体转录论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献，主要关键词:小鼠骨肉瘤病毒致癌基因同族体B,内部核糖体进入位点,5′非翻译区,荧光素酶
核糖体转录论文文献综述
马晶,孙柳柳,马文囡,陶义芬,陈蕴[1]（2019）在《转录因子FOSB mRNA 5′非翻译区内部核糖体进入位点的活性》一文中研究指出研究FOSB基因侧翼序列是否含有内部核糖体进入位点(internal ribosme entry site,IRES),进而探究其生理功能。作者利用双顺反子报告载体(pRL-FL),构建检测质粒(pRLFOSB-FL),并将其转染到人胚肾细胞HEK293和4种癌细胞中,检测FOSB m RNA 5′非翻译区(5′untranslated region,5′UTR)IRES活性并通过逐步截断探索其活性中心,最后对肝癌细胞Bel-7402进行药物(紫杉醇和顺铂)刺激。报告载体的结果显示,FOSB m RNA 5′UTR具有IRES活性,且在不同细胞中FOSB IRES活性存在显着性差异,在卵巢癌细胞A2780/WT细胞中FOSB IRES活性较高。序列截断发现,FOSB m RNA 5′UTR中的160nt(-376到-217)对其IRES的功能至关重要.在肝癌细胞中,随着加药浓度的增加,其IRES活性逐渐增加,尤其在紫杉醇刺激下活性增加更为明显。本研究发现的FOSB基因的这些特性为研究FOSB在肿瘤的预防与治疗提供了一种新的思路。(本文来源于《食品与生物技术学报》期刊2019年07期）
程香荣,胡兴琳,姜琦,黄星卫,王楠[2]（2019）在《核糖体DNA转录的表观调控与肿瘤发生》一文中研究指出近年来,表观遗传机制的研究结果提示核糖体DNA (rDNA)表观调控机制的缺陷可能诱导肿瘤发生。ATRX/DAXX复合物通过介导H3.3的H3K9me3修饰,建立和维持rDNA转录沉默。ATRX/DAXX基因在部分肿瘤中经常发生突变,可能刺激rDNA转录而促进肿瘤发生发展。本文主要阐述rDNA转录表达异常对肿瘤发生的促进作用,介绍rDNA基因转录的表观遗传调控机制,以期为针对rDNA转录调控机制的药物研发提供新的理论支持。(本文来源于《遗传》期刊2019年03期）
岑常活,韩晓静,常琼琼,段琛,侯晓晖[3]（2018）在《库蠓核糖体DNA内转录间隔区1序列的测定与分析》一文中研究指出目的测定核糖体DNA内转录间隔区1(nuclear ribosomal DNA internal transcribed spacer 1,rDNA-ITS1)序列进行库蠓种类鉴别与系统发育分析,以探究rDNA-ITS1序列在库蠓分子鉴定和系统发育研究方面的适用性。方法采用DNA扩增、纯化、克隆及测序的方法获得荒川库蠓Culicoides arakawai、凹缘库蠓C.holcus、连斑库蠓C.jacobsoni、印度库蠓C.indianus、霍飞库蠓C.huffi和肩宏库蠓C.humeralis等6种库蠓的rDNA-ITS1序列,基于Kimura 2-parameter公式计算种内和种间遗传距离,应用MEGA 6.06软件分析DNA序列碱基组成并以环纹埃蠓Allohelea annulata为外群构建系统发育树(邻接法和最大似然法)。结果上述6种库蠓的rDNA-ITS1序列经过Clustal W比对及人工校对和编辑后的长度为352bp,其中T、C、A、G 4种碱基的含量分别为36.8%、13.0%、30.0%和20.1%,A+T的含量(66.8%)高于C+G的含量(33.1%);K-2p遗传距离在种内和种间具显着差异(t=32.430,P<0.05);系统发育树中不同种类库蠓各自构成单系(群),同种类不同地理种群聚为一支,其与形态学鉴定结果一致。结论本研究证实了rDNA-ITS1序列可用于进行库蠓及其近似种的分子鉴定和系统发育分析。(本文来源于《中国人兽共患病学报》期刊2018年12期）
Yu-zhu,GUO,Hui-hui,SUN,Xiang-ting,WANG,Mei-ting,WANG[4]（2018）在《头颈部肿瘤转录组分析揭示与核糖体生物合成和表皮分化相关的关键长链非编码RNA（英文）》一文中研究指出目的:研究长链非编码RNA(lncRNA)与头颈部肿瘤发生、发展及预后的关系。创新点:通过使用整合的转录组分析方法筛选出与头颈部肿瘤密切相关的lncRNA,其中CYTOR和HCG22在头颈部肿瘤发生发展中具有重要的生物学功能和临床预后价值,为制定新的治疗策略和探索新的预后标记分子提供参考。方法:从癌症基因组数据集(The Cancer Genome Atlas)中获得RNA-seq数据。结合差异表达分析和共表达网络分析的方法发掘出与头颈部鳞状细胞癌相关的lnc RNA,探讨其与头颈部肿瘤临床病理变化和预后的关系,进一步利用外部数据集以及细胞水平进行验证。结论:发现9个与头颈部肿瘤发生发展密切相关的lncRNA,其中CYTOR可能参与核糖体的生物合成,与病人生存率呈负相关。HCG22可能参与细胞表皮分化过程,与病人生存率呈正相关。此外,CYTOR和HCG22可作为头颈部鳞状细胞癌独立的预后标记物。(本文来源于《Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology)》期刊2018年09期）
靳元春,李芬,刘进辉,刘梦婷,吴昌义[5]（2018）在《我国人源蛔虫和猪源蛔虫核糖体第一内转录间隔区的扩增克隆及序列分析》一文中研究指出本研究旨为研究人蛔虫和猪蛔虫核糖体第一内转录间隔区(ITS-1 r DNA)的遗传变异,应用聚合酶链式反应(PCR)对人蛔虫和猪蛔虫分离株ITS-1 r DNA序列进行扩增、克隆、测序,将获得的序列用Clustal X 1.83程序进行比对分析,再用Phy ML 3.0程序中的最大似然树法(ML)绘制种系进化树。本结果显示,人蛔虫和猪蛔虫的ITS-1 r DNA序列长度分别为447~448 bp和447~451 bp;人蛔虫和猪蛔虫ITS-1 r DNA序列的差异性为0.4%~1.6%。种系发育树表明,人蛔虫和猪蛔虫分离株位于两个不同分支。本研究结果支持人蛔虫和猪蛔虫可能为同一个种不同基因型的结论。(本文来源于《中国兽医杂志》期刊2018年05期）
高文青[6]（2017）在《人信号传导与转录激活因子（STAT）家族5'非翻译区内部核糖体进入位点的研究》一文中研究指出信号传导及转录激活因子(signal transducer and activator of transcription,STAT)家族包括7个成员:STAT1、STAT2、STAT3、STAT4、STAT5a、STAT5b以及STAT6。它们参与细胞生长、凋亡、分化及免疫应答等多种生理功能的调节,研究表明该家族蛋白的异常表达与多种疾病的发生和发展密切相关。目前,STAT家族成员翻译水平的调控机制尚不明确。通过搜索NCBI数据库,发现STAT家族成员的5′非翻译区(untranslated region,UTR)相对较长,且能形成稳定、复杂的二级茎环结构,存在潜在的内部核糖体进入位点(internal ribosome entry site,IRES)活性,可能是细胞基础生命活动过程中STATs蛋白稳定表达的重要机制。本文对STAT家族成员的IRES元件在结构、细胞生理学活性以及结合蛋白等方面进行研究,旨在为STAT家族蛋白的调控和细胞IRES元件的研究提供新视角。主要结果如下:1.利用双荧光素报告基因检测系统检测STAT家族成员5′-UTR的IRES活性。随后,通过实验分别排除了潜在启动子、核糖体通读以及内部剪切位点对IRES活性鉴定的干扰作用。结果发现STAT1、STAT2和STAT4的5′-UTR存在IRES活性。此外,本文比较了STAT家族成员的IRES在一系列肿瘤细胞中的活性,发现STAT1和STAT4的IRES活性与其在细胞中的蛋白表达量正相关。2.为了探究STAT1、STAT2和STAT4 IRES的活性中心域,本研究根据模拟的二级茎环结构对其分别进行了5′和3′端碱基的逐步截短实验。结果显示:STAT1 5′-UTR的活性中心位于5′端1-232碱基之间,其中两段序列(1-26 bp和94-232 bp)是STAT1IRES元件中必不可少的活性区域。STAT2 IRES的活性域位于5′-UTR中间区域的31-170碱基之间。STAT4 IRES的序列特点与STAT1相反,其活性中心域定位于3′端101-315碱基之间。为了进一步定位影响STAT1和STAT4 IRES活性的关键茎环结构,本文针对它们活性中心域的二级结构,设计并构建了含有全长IRES元件的突变体质粒,其中,STAT1对应12个突变体质粒,STAT4对应11个突变体质粒。通过检测不同突变体质粒的IRES活性后,我们发现位于5′末端的1GCUGAG6和22UGAUUGG28以及两个嘧啶密集序列61CCUUUU66或86CUUUCC91是STAT1 IRES元件中的重要茎环结构。而位于3′末端的199AGAAAUGCAAAU210,273GGAC276和301UGAGAGA307是STAT4 IRES元件中不可或缺的部分。3.为探究细胞应激条件下STAT1和STAT4 IRES的生理功能,本文利用血清饥饿和化学药物紫杉醇对肝癌细胞进行加压处理,通过Western Blot和细胞免疫荧光检测STAT1和STAT4的蛋白表达。结果显示:血清饥饿和药物处理都能导致肝癌细胞中STAT1和STAT4蛋白表达量的增加,且均呈现出浓度依赖性。同时,细胞压力条件下IRES活性的检测结果证明这两种蛋白表达量的上调与IRES介导的翻译方式相关。4.IRES介导的翻译起始不仅与其一级序列和二级茎环结构相关,还依赖于一些反式作用因子(IRES trans-acting factors,ITAFs)的参与。其中,La蛋白(La)、Y-盒结合蛋白1(YB1)、多嘧啶序列结合蛋白1(PTB1)和p97蛋白(DAP5/p97)是四种重要的反式作用因子。本研究通过RNA-蛋白免疫共沉淀实验探究这四种ITAFs是否结合STAT1和STAT4的5′-UTR,并参与调控它们的IRES活性。结果显示:STAT1和STAT45′-UTR均能结合YB1和p97,而PTB1选择性结合STAT1 5′-UTR,La选择性结合STAT4 5′-UTR。利用RNA干扰技术分别沉默肿瘤细胞内La、YB1、PTB1和P97,发现STAT家族成员的IRES活性被抑制,证明这四种反式作用因子促进STAT家族成员的IRES在肿瘤细胞内介导翻译起始。考察La、YB1、PTB1和P97在细胞压力条件下的表达与分布后发现,四种ITAFs在肝癌细胞质中的表达量均呈现显着上升趋势。此外,La和PTB1蛋白由胞核转移到胞质,提示细胞压力条件下,反式作用因子参与调控STAT家族成员的IRES活性。5.通过比较STAT家族成员的IRES元件与其他已鉴定的IRES元件后发现,结合相同反式作用因子的IRES元件有相似的茎环结构。结合IRES元件的二级结构特点和生理作用,预测四种与细胞压力相关的因子mRNA 5′-UTR有潜在的IRES活性,并通过实验证实了这一猜测。(本文来源于《江南大学》期刊2017-06-01）
李慧敏,杨志刚,江绍萍[7]（2016）在《小鼠核糖体蛋白基因中的组合转录调控元件分析》一文中研究指出研究表明,第一内含子可能参与基因转录调控。利用Markov链方法在小鼠核糖体蛋白(ribosomal protein)基因上游至第一内含子序列中抽提出一批高频出现模体(over-represented motifs),这些模体大部分与TRANSFAC中收集的小鼠基因转录因子结合位点吻合,是潜在的调控元件。将这些模体两两组合,利用超几何分布(hypergeometric distribution)和曼-惠特尼U检验(Mann-Whitney U test)获得了133对潜在转录调控模体对,其中一些与已知具有相互作用的转录因子对吻合,且大部分为协同作用。对抽提的模体对在不同区域中的出现情况进行分析,发现模体对主要出现在"上游-上游"(95.5%)和"上游-内含子"(57.9%)区域。结果进一步支持了内含子参与转录调控的假设,并且推测上游与内含子之间具有转录协同作用。(本文来源于《基因组学与应用生物学》期刊2016年10期）
陶义芬,马晶,朱瑞宇,段作营,金坚[8]（2016）在《转录因子GATA3 mRNA 5′非翻译区内部核糖体进入位点的活性》一文中研究指出GATA3(GA-TA-binding protein-3)是锌指蛋白GATA家族成员之一,在细胞的增殖和分化中起着重要的作用,GATA3在细胞中的异常表达也是导致众多肿瘤形成的原因。通过对GATA3m RNA 5′非翻译区(untranslated region,UTR)进行分析,发现其UTR长达557 bp并且具有复杂的二级结构。将GATA3 m RNA 5′UTR克隆至双荧光素酶报告载体p RL-FL中,瞬时转染至细胞中然后对细胞进行无血清培养后,发现GATA3 m RNA 5′UTR介导的翻译明显升高。将GATA3 m RNA 5′UTR克隆至Δp RL-FL载体上,瞬时转染细胞后检测萤火虫荧光素酶的表达,发现GATA3 m RNA 5′UTR不具有隐含启动子,进而确定GATA3 m RNA 5′UTR具有内部核糖体进入位点(internal ribosome entry sites,IRES)元件;进一步对GATA3 m RNA 5′UTR进行序列截短分析,发现GATA3 m RNA 5′UTR中345~557 bp区间可能是抑制IRES活性的调控元件,而95~344 bp区间则是IRES元件的主要活性中心调控域,并且在不同的细胞系中GATA3 IRES元件的活性存在显着的差异。该研究结果表明,GATA3m RNA的5′UTR可参与GATA3的表达调控。(本文来源于《中国细胞生物学学报》期刊2016年06期）
尹小平,王安东,罗丹,田延河,梁臻[9]（2016）在《阿拉山口地区凶小库蚊核糖体DNA第二转录间隔区基因多态性的分析》一文中研究指出为了探讨中哈边境阿拉山口口岸地区凶小库蚊核糖体DNA第二转录间隔区(r DNA-ITS2)基因序列特征,分析其遗传变异和亲缘关系,为口岸地区蚊的鉴定及疾病防治奠定基础。本研究提取中哈边境阿拉山口口岸地区凶小库蚊蚊虫DNA,PCR扩增凶小库蚊的r DNA-ITS2基因并测序。将测序结果进行Blast分析,使用Mage 6.0构建分子进化树。结果显示:PCR扩增获得凶小库蚊第二转录间隔区(r DNA-ITS2)323 bp左右的基因片段。Blast显示与Culex restuans(U22136)具有较高的同源性,与其他库蚊属蚊种序列间差异集中在24-323 bp,差异表现为插入/缺失、转换/颠换、简单重复单元拷贝数不同等。结论:本研究报道了凶小库蚊第二转录间隔区(r DNA-ITS2)基因序。阿拉山口口岸凶小库蚊第二转录间隔区(r DNA-ITS2)基因区显示存在遗传多态性,可能与蚊虫地理区域,生态环境和贸易往来有一定关系。(本文来源于《石河子大学学报(自然科学版)》期刊2016年03期）
林杉杉,鲍相渤,刘忠颖,王超,杨慧花[10]（2016）在《远东偏顶蛤核糖体DNA第二转录间隔区(ITS2)测序及分析》一文中研究指出利用通用引物成果扩增了远东偏顶蛤核糖体DNA第二转录间隔区序列,并对其进行了一致性比对和系统进化分析,结果表明:远东偏顶蛤ITS2序列全长共245bp,四个个体的序列无差异。与其他物种相比,与远东偏顶蛤一致性最高的物种为同属的偏顶蛤,系统进化树中,远东偏顶蛤与同属的其他两个种聚为一支。本文研究结果为该种的遗传进化及多样性研究提供了基础数据。(本文来源于《河北渔业》期刊2016年06期）
核糖体转录论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
近年来,表观遗传机制的研究结果提示核糖体DNA (rDNA)表观调控机制的缺陷可能诱导肿瘤发生。ATRX/DAXX复合物通过介导H3.3的H3K9me3修饰,建立和维持rDNA转录沉默。ATRX/DAXX基因在部分肿瘤中经常发生突变,可能刺激rDNA转录而促进肿瘤发生发展。本文主要阐述rDNA转录表达异常对肿瘤发生的促进作用,介绍rDNA基因转录的表观遗传调控机制,以期为针对rDNA转录调控机制的药物研发提供新的理论支持。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
核糖体转录论文参考文献
[1].马晶,孙柳柳,马文囡,陶义芬,陈蕴.转录因子FOSBmRNA5′非翻译区内部核糖体进入位点的活性[J].食品与生物技术学报.2019
[2].程香荣,胡兴琳,姜琦,黄星卫,王楠.核糖体DNA转录的表观调控与肿瘤发生[J].遗传.2019
[3].岑常活,韩晓静,常琼琼,段琛,侯晓晖.库蠓核糖体DNA内转录间隔区1序列的测定与分析[J].中国人兽共患病学报.2018
[4].Yu-zhu,GUO,Hui-hui,SUN,Xiang-ting,WANG,Mei-ting,WANG.头颈部肿瘤转录组分析揭示与核糖体生物合成和表皮分化相关的关键长链非编码RNA（英文）[J].JournalofZhejiangUniversity-ScienceB(Biomedicine&Biotechnology).2018
[5].靳元春,李芬,刘进辉,刘梦婷,吴昌义.我国人源蛔虫和猪源蛔虫核糖体第一内转录间隔区的扩增克隆及序列分析[J].中国兽医杂志.2018
[6].高文青.人信号传导与转录激活因子（STAT）家族5'非翻译区内部核糖体进入位点的研究[D].江南大学.2017
[7].李慧敏,杨志刚,江绍萍.小鼠核糖体蛋白基因中的组合转录调控元件分析[J].基因组学与应用生物学.2016
[8].陶义芬,马晶,朱瑞宇,段作营,金坚.转录因子GATA3mRNA5′非翻译区内部核糖体进入位点的活性[J].中国细胞生物学学报.2016
[9].尹小平,王安东,罗丹,田延河,梁臻.阿拉山口地区凶小库蚊核糖体DNA第二转录间隔区基因多态性的分析[J].石河子大学学报(自然科学版).2016
[10].林杉杉,鲍相渤,刘忠颖,王超,杨慧花.远东偏顶蛤核糖体DNA第二转录间隔区(ITS2)测序及分析[J].河北渔业.2016
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