廖子亚:产四醚膜脂盐碱菌的分布及三株盐碱菌的应用研究论文

廖子亚:产四醚膜脂盐碱菌的分布及三株盐碱菌的应用研究论文

本文主要研究内容

作者廖子亚(2019)在《产四醚膜脂盐碱菌的分布及三株盐碱菌的应用研究》一文中研究指出:盐碱菌是一类最适生长盐度大于0.5 mol·L–1同时最适生长pH高于9.0,生活在高盐高碱双重极端环境中的极端细菌。它们广泛应用于人类生活的各个领域。随着基因组测序技术的迅猛发展,我们能够以低廉的价格高效准确地获得菌株的全基因组序列,以此更加深入地了解盐碱菌的遗传学基础及其在极端环境下的嗜极机制。高效液相色谱-质谱分析bGDGTs,Illumina Miseq、ddPCR技术测定松嫩平原盐碱土样品的细菌群落结构。液相色谱-质谱结果表明含较少环戊基环的bGDGTs绝对含量高,能在土壤中长期存在大量积累。bGDGTs分布和相对丰度受6个环境变量控制,影响最大的环境因子为pH,高pH限制着bGDGTs环戊基环的数量,另一个显著因子Na+浓度为99.83-5196.72 mg/kg时与bGDGT环化指标CBT呈负相关。之后通过ddPCR技术对土壤细菌拷贝数的检测,联合土壤理化性质分析,得到细菌16S rRNA基因拷贝数(对数值)与Na+、TN有强烈的相关性。细菌16S rRNA基因拷贝数与bGDGTs组分一致,受到pH、Na+支配。最后网络分析bGDGT IIa的细菌来源为Catelliglobosispora、Longispora、Truepera、unidentified(Gemmatimonadetes目)、Tepidamorphus、Rubricoccus、Planctomyces、Singulisphaera,bGDGT IIb来源于Pseudomonas。通过上述内容,寻找到bGDGTs分布特征及其与环境因子之间的对应关系,解析了细菌的群落结构特征及生态功能,探明了bGDGTs细菌生物源。应用Illumina Miseq二代测序测定两株本实验室从新疆盐碱湖中分离的细菌基因组草图。第一株Halomonas urumqiensis BZ-SZ-XJ27T,其最适生长盐度1.42 M。测序结果得BZ-SZ-XJ27T基因组总长约3.97 Mb,包含3588个预测基因,鉴定得到一些维持细胞内渗透平衡的基因,如甘氨酸甜菜碱合成基因簇、谷氨酰胺合成基因簇、四氢嘧啶合成基因簇等。分离到的另一株盐碱菌Bacillus urumqiensis BZ-SZ-XJ18T,其最适生长盐度1.08 M,pH值8.5-9.5。该菌基因组大小约3.28 Mb,共3228个基因,包括甘氨酸甜菜碱合成基因簇、trk基因、钠氢泵基因等参与渗透平衡和酸碱平衡。通过二代测序揭示了盐碱菌在分子层面对极端环境的独特嗜极机理。通过pacBio三代测序平台对木聚糖降解菌Alkalitalea saponilacus SC/BZ-SP2T进行全基因组测序。该菌基因组总长4,775,573 bps,G+C含量39.27%,包含12个与木聚糖完全降解途径相关基因和多个与渗透平衡和酸碱平衡相关基因。GC技术分析A.saponilacus发酵木聚糖主要产物为丙酸。利用二硝基水杨酸法(DNS)测定木聚糖酶活力得0.4%(w/v)蔗糖+0.1%(w/v)桦木木聚糖为最优的碳源。同时确定了提取粗酶的最佳条件并分析了其酶学特性。上述研究表明,A.saponilacus发酵主产物丙酸以及生物合成的耐盐热木聚糖酶在工业生产中具有广泛的应用前景。

Abstract

yan jian jun shi yi lei zui kuo sheng chang yan du da yu 0.5 mol·L–1tong shi zui kuo sheng chang pHgao yu 9.0,sheng huo zai gao yan gao jian shuang chong ji duan huan jing zhong de ji duan xi jun 。ta men an fan ying yong yu ren lei sheng huo de ge ge ling yu 。sui zhao ji yin zu ce xu ji shu de xun meng fa zhan ,wo men neng gou yi di lian de jia ge gao xiao zhun que de huo de jun zhu de quan ji yin zu xu lie ,yi ci geng jia shen ru de le jie yan jian jun de wei chuan xue ji chu ji ji zai ji duan huan jing xia de shi ji ji zhi 。gao xiao ye xiang se pu -zhi pu fen xi bGDGTs,Illumina Miseq、ddPCRji shu ce ding song nen ping yuan yan jian tu yang pin de xi jun qun la jie gou 。ye xiang se pu -zhi pu jie guo biao ming han jiao shao huan wu ji huan de bGDGTsjue dui han liang gao ,neng zai tu rang zhong chang ji cun zai da liang ji lei 。bGDGTsfen bu he xiang dui feng du shou 6ge huan jing bian liang kong zhi ,ying xiang zui da de huan jing yin zi wei pH,gao pHxian zhi zhao bGDGTshuan wu ji huan de shu liang ,ling yi ge xian zhe yin zi Na+nong du wei 99.83-5196.72 mg/kgshi yu bGDGThuan hua zhi biao CBTcheng fu xiang guan 。zhi hou tong guo ddPCRji shu dui tu rang xi jun kao bei shu de jian ce ,lian ge tu rang li hua xing zhi fen xi ,de dao xi jun 16S rRNAji yin kao bei shu (dui shu zhi )yu Na+、TNyou jiang lie de xiang guan xing 。xi jun 16S rRNAji yin kao bei shu yu bGDGTszu fen yi zhi ,shou dao pH、Na+zhi pei 。zui hou wang lao fen xi bGDGT IIade xi jun lai yuan wei Catelliglobosispora、Longispora、Truepera、unidentified(Gemmatimonadetesmu )、Tepidamorphus、Rubricoccus、Planctomyces、Singulisphaera,bGDGT IIblai yuan yu Pseudomonas。tong guo shang shu nei rong ,xun zhao dao bGDGTsfen bu te zheng ji ji yu huan jing yin zi zhi jian de dui ying guan ji ,jie xi le xi jun de qun la jie gou te zheng ji sheng tai gong neng ,tan ming le bGDGTsxi jun sheng wu yuan 。ying yong Illumina Miseqer dai ce xu ce ding liang zhu ben shi yan shi cong xin jiang yan jian hu zhong fen li de xi jun ji yin zu cao tu 。di yi zhu Halomonas urumqiensis BZ-SZ-XJ27T,ji zui kuo sheng chang yan du 1.42 M。ce xu jie guo de BZ-SZ-XJ27Tji yin zu zong chang yao 3.97 Mb,bao han 3588ge yu ce ji yin ,jian ding de dao yi xie wei chi xi bao nei shen tou ping heng de ji yin ,ru gan an suan tian cai jian ge cheng ji yin cu 、gu an xian an ge cheng ji yin cu 、si qing mi ding ge cheng ji yin cu deng 。fen li dao de ling yi zhu yan jian jun Bacillus urumqiensis BZ-SZ-XJ18T,ji zui kuo sheng chang yan du 1.08 M,pHzhi 8.5-9.5。gai jun ji yin zu da xiao yao 3.28 Mb,gong 3228ge ji yin ,bao gua gan an suan tian cai jian ge cheng ji yin cu 、trkji yin 、na qing beng ji yin deng can yu shen tou ping heng he suan jian ping heng 。tong guo er dai ce xu jie shi le yan jian jun zai fen zi ceng mian dui ji duan huan jing de du te shi ji ji li 。tong guo pacBiosan dai ce xu ping tai dui mu ju tang jiang jie jun Alkalitalea saponilacus SC/BZ-SP2Tjin hang quan ji yin zu ce xu 。gai jun ji yin zu zong chang 4,775,573 bps,G+Chan liang 39.27%,bao han 12ge yu mu ju tang wan quan jiang jie tu jing xiang guan ji yin he duo ge yu shen tou ping heng he suan jian ping heng xiang guan ji yin 。GCji shu fen xi A.saponilacusfa jiao mu ju tang zhu yao chan wu wei bing suan 。li yong er xiao ji shui yang suan fa (DNS)ce ding mu ju tang mei huo li de 0.4%(w/v)zhe tang +0.1%(w/v)hua mu mu ju tang wei zui you de tan yuan 。tong shi que ding le di qu cu mei de zui jia tiao jian bing fen xi le ji mei xue te xing 。shang shu yan jiu biao ming ,A.saponilacusfa jiao zhu chan wu bing suan yi ji sheng wu ge cheng de nai yan re mu ju tang mei zai gong ye sheng chan zhong ju you an fan de ying yong qian jing 。

论文参考文献

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  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自中国农业科学院的廖子亚,发表于刊物中国农业科学院2019-07-05论文,是一篇关于盐碱菌论文,支链论文,数字论文,木聚糖酶论文,中国农业科学院2019-07-05论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自中国农业科学院2019-07-05论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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