罗志嘉:角鳖RNA-seq转录组分析及生长相关基因筛选论文

罗志嘉:角鳖RNA-seq转录组分析及生长相关基因筛选论文

本文主要研究内容

作者罗志嘉,李潇,曾丹,王佩,彭娜,王晓清(2019)在《角鳖RNA-seq转录组分析及生长相关基因筛选》一文中研究指出:角鳖是一种具有极高经济价值的淡水动物,市场开发潜力较大。其生长上存在的显著差异,制约了角鳖养殖业的健康可持续发展。为了探索角鳖生长发育的相关分子机制,本研究以生长存在显著差异的快长组和慢长组角鳖肝脏为材料,采用Illumina HiSeq TM 2500高通量测序平台进行转录组分析,经过拼接组装共获得264 757 372条Clean reads,148 093个Unigene,序列平均长度为900.8 bp。将Unigene与NR、SWISSPROT、KOG、KEGG和GO进行比对,共有34 666条得到了注释结果。通过以快长组为对照组,慢长组为实验组进行基因表达情况对比,结果显示有2 246个基因表达存在差异,其中显著性上调的基因1 264个,显著性下调的基因982个。通过KEGG pathway分析,Fox O信号通路、p53信号通路、PI3K-Akt信号通路、细胞凋亡、TGF-beta信号通路及胰岛素信号通路等生长发育相关代谢途径的部分基因表达存在显著的差异。本研究为进一步揭示角鳖生长发育的相关分子机制、生长相关基因克隆和表达等研究及奠定了坚实的基础,也为后续开展龟鳖类分子生物学研究提供了宝贵的基因数据来源。

Abstract

jiao bie shi yi chong ju you ji gao jing ji jia zhi de dan shui dong wu ,shi chang kai fa qian li jiao da 。ji sheng chang shang cun zai de xian zhe cha yi ,zhi yao le jiao bie yang shi ye de jian kang ke chi xu fa zhan 。wei le tan suo jiao bie sheng chang fa yo de xiang guan fen zi ji zhi ,ben yan jiu yi sheng chang cun zai xian zhe cha yi de kuai chang zu he man chang zu jiao bie gan zang wei cai liao ,cai yong Illumina HiSeq TM 2500gao tong liang ce xu ping tai jin hang zhuai lu zu fen xi ,jing guo pin jie zu zhuang gong huo de 264 757 372tiao Clean reads,148 093ge Unigene,xu lie ping jun chang du wei 900.8 bp。jiang Unigeneyu NR、SWISSPROT、KOG、KEGGhe GOjin hang bi dui ,gong you 34 666tiao de dao le zhu shi jie guo 。tong guo yi kuai chang zu wei dui zhao zu ,man chang zu wei shi yan zu jin hang ji yin biao da qing kuang dui bi ,jie guo xian shi you 2 246ge ji yin biao da cun zai cha yi ,ji zhong xian zhe xing shang diao de ji yin 1 264ge ,xian zhe xing xia diao de ji yin 982ge 。tong guo KEGG pathwayfen xi ,Fox Oxin hao tong lu 、p53xin hao tong lu 、PI3K-Aktxin hao tong lu 、xi bao diao wang 、TGF-betaxin hao tong lu ji yi dao su xin hao tong lu deng sheng chang fa yo xiang guan dai xie tu jing de bu fen ji yin biao da cun zai xian zhe de cha yi 。ben yan jiu wei jin yi bu jie shi jiao bie sheng chang fa yo de xiang guan fen zi ji zhi 、sheng chang xiang guan ji yin ke long he biao da deng yan jiu ji dian ding le jian shi de ji chu ,ye wei hou xu kai zhan gui bie lei fen zi sheng wu xue yan jiu di gong le bao gui de ji yin shu ju lai yuan 。

论文参考文献

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  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自基因组学与应用生物学的罗志嘉,李潇,曾丹,王佩,彭娜,王晓清,发表于刊物基因组学与应用生物学2019年04期论文,是一篇关于角鳖论文,转录组论文,生长基因筛选论文,基因组学与应用生物学2019年04期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自基因组学与应用生物学2019年04期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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