亲缘关系聚类论文-赵小刚,张蒙蒙,黄河,戴思兰

亲缘关系聚类论文-赵小刚,张蒙蒙,黄河,戴思兰

导读:本文包含了亲缘关系聚类论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献,主要关键词:多头小菊,聚类分析,亲缘关系

亲缘关系聚类论文文献综述

赵小刚,张蒙蒙,黄河,戴思兰[1](2018)在《基于聚类分析的小菊品种间亲缘关系分析》一文中研究指出为了探讨聚类分析方法在多头小菊有性杂交亲本选配中的应用,本研究选取49个小菊株系的25个性状进行数值编码和人工测量,利用聚类分析方法评估株系间的亲缘关系。结果表明,育种背景相同或相似的株系可以聚为一类,花期相同或相近的可以聚为一类,托桂型株系也可以聚为一类。结合有性杂交育种过程和品种引进背景,本研究结果表明,聚类分析可较准确地反映株系间的亲缘关系,在进行菊花有性杂交育种时使用聚类分析可以很大程度上避免亲本选配的盲目性,增大获得优良子代的概率。(本文来源于《中国观赏园艺研究进展2018》期刊2018-07-25)

刘娟[2](2015)在《猕猴桃溃疡病抗性材料评价及其亲缘关系的ISSR聚类分析》一文中研究指出近年来,猕猴桃的细菌性溃疡病(PSA)在全世界范围内大面积爆炸性发生并迅速扩展,对猕猴桃产业产生了极其严重的影响。为调查四川境内常见猕猴桃品种对细菌性溃疡病的抗性以及抗性与遗传多样性的关系,本试验以四川省自然资源科学研究院提供的41种猕猴桃品种(品系)为试材,对猕猴桃种质资源进行了溃疡病的田间抗性调查和室内抗性试验,分析猕猴桃品种在田间和室内对溃疡病的抗病能力并按照抗病程度对其排序;利用ISSR标记对25个雌性猕猴桃品种和16个雄性猕猴桃品种进行遗传多样性分析,探讨ISSR分子标记与其对猕猴桃溃疡病抗性之间的关系。主要研究结果如下:1、田间抗性调查研究中发现,春秋季节为溃疡病的高发期,夏冬季节为低频期。溃疡病的发病时期、发病品种和发病区域均较为集中,红什2号、79-1、04270、04137均为易感品种。2、室内抗性试验发现,不同种类、品种和不同性别的猕猴桃对溃疡病的抗病能力存在较大差异,相对抗病指数范围在0.35-0.82之间。从种来看,京梨、美味、四鄂、软枣和葛枣较抗病,中华、阔叶、毛花较感病;从品种看,中华猕猴桃中79-1(雄株)、SF0808(雌株)和金什1号(雄株)为中抗品种,其余均为中感或感病品种。3、从100条ISSR引物中筛选出10条带清晰、数量较多的引物用于猕猴桃样品DNA的ISSR扩增。共扩增出172条带,其中多态性条带为172条,多态性达到100%。雌性品种的遗传相似系数值在0.51至0.87之间,雄性品种的遗传相似系数值在0.60至0.90之间。4、聚类分析结果显示,雌性品种分成两类,第1类由星果组与斑果组组成,第2类由净果组里的片髓系和实髓系组成。第1类分成四组,A组为京梨猕猴桃;B组为美味二倍体;C组包括毛花猕猴桃、‘soreli'和阔叶猕猴桃;D组包含了中华猕猴桃和美味猕猴桃两个品种群。雄性猕猴桃聚类形成叁类,第1类为星毛组品种,第2类为魁绿,第3类为四萼。第1类分为四组,A组为阔叶和毛花;B组为‘红阳'、'红什 2 号'、'金什 1 号'、‘金什 2 号'、‘Soreli'、‘04137'、'金艳'和‘Hort16A';C 组为‘79-1'和'秦美'、'红美';D组为‘海沃德'。试验结果表明,猕猴桃品种对溃疡病的抗病能力与遗传有关,京梨、美味、四鄂、软枣和葛枣较抗病,中华、阔叶、毛花较易感病。溃疡病在春秋季爆发并大面积扩散,其爆发扩散与季节有关。抗性试验与ISSR分子标记的关联研究表明,各品种猕猴桃溃疡病抗性的强弱分组与ISSR聚类组有明显的相关性,表明ISSR分子标记技术可用于辅助选育猕猴桃溃疡病抗病品种。(本文来源于《四川农业大学》期刊2015-06-01)

张俊,王静毅,陈友,冯慧敏,武耀廷[3](2014)在《基于模型的香蕉种质资源群体结构聚类分析及其亲缘关系分析》一文中研究指出应用SSR分子标记技术,结合structure软件分析了32份香蕉种质之间的遗传关系。结果显示32份香蕉群体分为4大亚群:本地大蕉群、ABB群(包含引进大蕉亚群、粉蕉群)、AAA群及mix群。国内大蕉与引进大蕉遗传关系较远;粉蕉和大蕉各个品种之间存在丰富的遗传多样性;AAA群的皇帝蕉、Yangambi KM5和AAcv Rose栽培品种与我国早期引进的主栽品种Williams遗传关系较远;本地大蕉群中的酸芭蕉(ABB)和东莞中把大蕉(ABB)与其它大蕉相聚较远;ABB群组中巨型大蕉(ABB)和FHIA-03(AABB)与该群中的其它品种相聚较远;华农15和Williams没有被区分开,它们可能是同一克隆。研究结果表明基于模型的structure聚类分析也能用于遗传多样性分析。(本文来源于《热带作物学报》期刊2014年02期)

赵亚波,宁伟,赵鑫,高维凡,曹珍[4](2010)在《11种蒲公英亲缘关系聚类分析》一文中研究指出对11种蒲公英(Taraxacum)材料的34个形态性状进行统计,并对获得的信息数据运用数量分类学聚类方法进行UPGMA聚类分析。结果表明:在相似性系数为0.648可将供试材料分为3大组;几种蒲公英之间的相似性系数在0.43~0.82之间;供试材料的聚类与地理来源有很大的相关性。研究结果可为蒲公英种质的鉴别、创新及合理利用等提供理论依据。(本文来源于《沈阳农业大学学报》期刊2010年04期)

吴国盛,陈发棣,陈素梅,赵宏波,房伟民[5](2009)在《部分菊属与亚菊属植物的形态学聚类及亲缘关系分析》一文中研究指出对18份菊属植物、2份亚菊属植物及2个两属间杂种的24个形态性状和1个生物学性状进行统计,并对获得的信息数据运用数量分类学聚类方法进行聚类分析。结果表明:Dendranthema arcticum与其他菊属植物的形态相差较大,单独成一类,其他21份材料聚为一类;野菊与菊花脑、异色菊与甘菊、龙脑菊与那贺川野菊两两间形态相似;毛华菊与日本野生菊属植物有较近亲缘关系,日本野生菊属植物较我国野生菊属植物进化;亚菊属矶菊与纪伊潮菊间形态相似,且与菊属植物形态相近,表明两属间有很近亲缘关系。本研究的形态性状聚类结果与传统分类结果基本吻合,表明所涉及的性状指标可以作为菊属系统发生关系研究的有效辅助指标。(本文来源于《南京农业大学学报》期刊2009年01期)

梁景霞,祁建民,方平平,王涛,陈顺辉[6](2008)在《烟草种质资源遗传多样性与亲缘关系的ISSR聚类分析》一文中研究指出【目的】深化烟草种质资源遗传多样性研究,为种质利用改良烟草提供科学依据。【方法】应用ISSR分子标记方法,以烟草属6个种共96份有代表性的种质为材料,进行遗传多样性与亲缘关系分析。【结果】(1)从90个ISSR引物中筛选出18个多态性引物对全部实验材料进行PCR扩增,共获得314条稳定的条带,其中多态性条带299条(占95.2%)。(2)应用Nei-Li相似系数法估算了96份材料间的遗传相似系数(GS),其GS在0.28~0.97之间,遗传多样性丰富。其中普通烟草栽培品种间的GS在0.62~0.98之间,平均为0.78,品种间的遗传基础相对狭窄,普通烟草栽培种与野生种及黄花烟的GS在0.28~0.58之间,平均为0.42,种间遗传差异较大;(3)对91份普通烟草栽培品种的分子系统聚类分析表明:地理来源相同的部分品种有相对聚合现象或少部分国内外品种和类型出现交叉聚类,与其亲缘关系较近有关;个别品种自行一类,与其特异的遗传基础差异较大有关。【结论】ISSR是一种较有效、稳定和可靠的分子标记,本研究可为烟草育种的亲本利用及开展烟草遗传连锁图的构建和核心种质指纹图谱的绘制提供重要的科学依据。(本文来源于《中国农业科学》期刊2008年01期)

王旅,彭宏,胡劲松,梁华芳[7](2006)在《层次聚类在种群亲缘关系研究中的应用》一文中研究指出聚类分析是数据挖掘技术中的一种重要方法,它广泛应用于模式识别、数据分析、图像处理、生物学、经济学等许多领域,已经成为研究品种的分类、起源和进化的重要手段。研究生物种群的遗传多样性,探讨种群间的亲缘关系及分类地位,对培养优质的良种具有重要的现实意义。文章将层次聚类方法应用于种群亲缘关系的研究,进行了实例分析,给出了聚类分析结果,构建出树状聚类图。(本文来源于《计算机时代》期刊2006年07期)

张晓明,惠长敏,曲振环[8](2006)在《甜瓜种质资源亲缘关系的聚类分析》一文中研究指出采用数量分类方法,对来源于国内外的48份甜瓜种质资源的17个农艺性状进行了聚类分析,研究其遗传亲缘关系。结果表明,供试材料在生态型上可分为两大类群,即厚皮甜瓜类群和薄皮甜瓜类群,其中厚皮甜瓜与薄皮甜瓜杂交的中间型在亲缘关系上与薄皮甜瓜更为接近,划入薄皮甜瓜类群中。厚皮甜瓜类群和薄皮甜瓜类群又分别划分为2个和6个品种群。(本文来源于《全国蔬菜和薯类种质资源研究与利用研讨会论文集》期刊2006-04-01)

铁茹,贾丽梅,许升全[9](2004)在《日本弓背蚁(Camponotus japonicus Mayr)20个地理种群亲缘关系的聚类分析》一文中研究指出用聚类分析的方法对中国20个地区的日本弓背蚁(Camponotus japonicus Mayr)工蚁的16个形态特征测量数据进行了分析以确定种群的亲缘关系。结果表明:日本弓背蚁在云贵高原北部和东南部地区分属于2个地理宗;在秦岭南北地区分属于2个地理宗;在大巴山东南部和西南部地区分属于2个地理宗。(本文来源于《当代昆虫学研究——中国昆虫学会成立60周年纪念大会暨学术讨论会论文集》期刊2004-06-30)

刘晓虹,宋勇,陈惠明[10](2001)在《黄瓜种质资源亲缘关系的聚类分析》一文中研究指出利用聚类分析方法对多个生态型黄瓜种质资源材料的遗传亲缘关系进行了研究 ,结果表明 ,黄瓜分为叁大类群 :华北生态群 ,华南生态群和欧洲温室生态群。从数值分类基础上验证了传统黄瓜地域分类和生态学分类标准(本文来源于《湖南农业科学》期刊2001年06期)

亲缘关系聚类论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

近年来,猕猴桃的细菌性溃疡病(PSA)在全世界范围内大面积爆炸性发生并迅速扩展,对猕猴桃产业产生了极其严重的影响。为调查四川境内常见猕猴桃品种对细菌性溃疡病的抗性以及抗性与遗传多样性的关系,本试验以四川省自然资源科学研究院提供的41种猕猴桃品种(品系)为试材,对猕猴桃种质资源进行了溃疡病的田间抗性调查和室内抗性试验,分析猕猴桃品种在田间和室内对溃疡病的抗病能力并按照抗病程度对其排序;利用ISSR标记对25个雌性猕猴桃品种和16个雄性猕猴桃品种进行遗传多样性分析,探讨ISSR分子标记与其对猕猴桃溃疡病抗性之间的关系。主要研究结果如下:1、田间抗性调查研究中发现,春秋季节为溃疡病的高发期,夏冬季节为低频期。溃疡病的发病时期、发病品种和发病区域均较为集中,红什2号、79-1、04270、04137均为易感品种。2、室内抗性试验发现,不同种类、品种和不同性别的猕猴桃对溃疡病的抗病能力存在较大差异,相对抗病指数范围在0.35-0.82之间。从种来看,京梨、美味、四鄂、软枣和葛枣较抗病,中华、阔叶、毛花较感病;从品种看,中华猕猴桃中79-1(雄株)、SF0808(雌株)和金什1号(雄株)为中抗品种,其余均为中感或感病品种。3、从100条ISSR引物中筛选出10条带清晰、数量较多的引物用于猕猴桃样品DNA的ISSR扩增。共扩增出172条带,其中多态性条带为172条,多态性达到100%。雌性品种的遗传相似系数值在0.51至0.87之间,雄性品种的遗传相似系数值在0.60至0.90之间。4、聚类分析结果显示,雌性品种分成两类,第1类由星果组与斑果组组成,第2类由净果组里的片髓系和实髓系组成。第1类分成四组,A组为京梨猕猴桃;B组为美味二倍体;C组包括毛花猕猴桃、‘soreli'和阔叶猕猴桃;D组包含了中华猕猴桃和美味猕猴桃两个品种群。雄性猕猴桃聚类形成叁类,第1类为星毛组品种,第2类为魁绿,第3类为四萼。第1类分为四组,A组为阔叶和毛花;B组为‘红阳'、'红什 2 号'、'金什 1 号'、‘金什 2 号'、‘Soreli'、‘04137'、'金艳'和‘Hort16A';C 组为‘79-1'和'秦美'、'红美';D组为‘海沃德'。试验结果表明,猕猴桃品种对溃疡病的抗病能力与遗传有关,京梨、美味、四鄂、软枣和葛枣较抗病,中华、阔叶、毛花较易感病。溃疡病在春秋季爆发并大面积扩散,其爆发扩散与季节有关。抗性试验与ISSR分子标记的关联研究表明,各品种猕猴桃溃疡病抗性的强弱分组与ISSR聚类组有明显的相关性,表明ISSR分子标记技术可用于辅助选育猕猴桃溃疡病抗病品种。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

亲缘关系聚类论文参考文献

[1].赵小刚,张蒙蒙,黄河,戴思兰.基于聚类分析的小菊品种间亲缘关系分析[C].中国观赏园艺研究进展2018.2018

[2].刘娟.猕猴桃溃疡病抗性材料评价及其亲缘关系的ISSR聚类分析[D].四川农业大学.2015

[3].张俊,王静毅,陈友,冯慧敏,武耀廷.基于模型的香蕉种质资源群体结构聚类分析及其亲缘关系分析[J].热带作物学报.2014

[4].赵亚波,宁伟,赵鑫,高维凡,曹珍.11种蒲公英亲缘关系聚类分析[J].沈阳农业大学学报.2010

[5].吴国盛,陈发棣,陈素梅,赵宏波,房伟民.部分菊属与亚菊属植物的形态学聚类及亲缘关系分析[J].南京农业大学学报.2009

[6].梁景霞,祁建民,方平平,王涛,陈顺辉.烟草种质资源遗传多样性与亲缘关系的ISSR聚类分析[J].中国农业科学.2008

[7].王旅,彭宏,胡劲松,梁华芳.层次聚类在种群亲缘关系研究中的应用[J].计算机时代.2006

[8].张晓明,惠长敏,曲振环.甜瓜种质资源亲缘关系的聚类分析[C].全国蔬菜和薯类种质资源研究与利用研讨会论文集.2006

[9].铁茹,贾丽梅,许升全.日本弓背蚁(CamponotusjaponicusMayr)20个地理种群亲缘关系的聚类分析[C].当代昆虫学研究——中国昆虫学会成立60周年纪念大会暨学术讨论会论文集.2004

[10].刘晓虹,宋勇,陈惠明.黄瓜种质资源亲缘关系的聚类分析[J].湖南农业科学.2001

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