导读:本文包含了江口萝卜猪论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献，主要关键词:江口萝卜猪,UCP2基因,启动子,SNP位点
江口萝卜猪论文文献综述
吴雪,张继,邱淦远,刘鹏程,杨茂林[1]（2019）在《江口萝卜猪UCP2基因启动子变异分析》一文中研究指出【目的】研究江口萝卜猪UCP2基因启动子变异,并对其进行生物信息学分析,为江口萝卜猪品种选育及开发利用提供理论依据。【方法】利用江口萝卜猪基因组DNA构建混合DNA池,PCR产物直接测序后采用DNASTAR等生物软件分析筛选出SNP位点,然后采用Neural Network Promoter Prediction、TFsitescan、WebGene等生物信息学分析软件预测单核苷酸突变前后的UCP2基因启动子核心区域、转录因子结合位点和CpG岛。【结果】在江口萝卜猪UCP2基因启动子上共筛选到3个SNPs位点,分别是G~(-84)>A、G~(-161)>C和T~(-366)>A。利用生物信息学分析软件分析单核苷酸突变对UCP2基因启动子核心区域、转录因子结合位点及CpG岛的影响,结果发现,从江口萝卜猪UCP2基因启动子上筛选到的3个SNPs位点均不在预测到的启动子核心区域,但靠近转录起始点;3个SNPs位点也不在预测得到的CpG岛内,且不会影响UCP2基因启动子的甲基化水平;3个SNPs位点能在不同程度上导致转录因子结合位点消失或产生新的转录因子结合位点,其中G~(161)>C突变对转录因子结合位点的影响最大。【结论】从江口萝卜猪UCP2基因启动子上筛选到3个SNPs位点,分别为G~(-84)>A、G~(-161)>C和T~(-366)>A,虽然这3个SNPs位点均不在启动子核心区域及CpG岛内,但不同程度造成转录因子结合位点消失或产生,其中G~(-161)>C的影响最大,可能是调控UCP2基因表达的重要功能突变位点。(本文来源于《南方农业学报》期刊2019年10期）
张继,吴雪,邱淦远,刘鹏程,杨茂林[2]（2019）在《江口萝卜猪UCP2基因多态性与基因表达量及肉品质的相关性研究》一文中研究指出为研究UCP2基因与猪肉品质性状之间的关系,本研究测定10～12月龄144头江口萝卜猪11项肉品质指标,并提取基因组DNA构建DNA池扩增UCP2基因全部外显子序列,测序后筛选SNPs位点,单个样本DNA扩增后测序验证并分型,分析不同基因型个体肉品质差异。检测不同基因型个体背最长肌中UCP2基因表达量,研究UCP2基因表达量与肉品质的相关性。结果表明:共发现3个SNPs位点,分别为UCP2-T5728G、UCP2-T5774G、UCP2-C5878T;群体遗传参数分析发现等位基因频率差异均较大,多态信息含量均为中度多态,UCP2-C5878T位点显着偏离Hardy-Weinberg平衡;UCP2-T5728G和UCP2-T5774G位点为完全连锁不平衡;UCP2-T5728G和UCP2-T5774G位点野生型的大理石纹评分显着高于杂合型,UCP2-C5878T位点杂合型和野生型的剪切力显着高于突变型;UCP2-T5728G和UCP2-T5774G位点杂合型的UCP2基因表达量极显着高于野生型和突变型,UCP2-C5878T位点杂合型和野生型的表达量极显着高于突变型;UCP2基因在背最长肌中的表达量与剪切力呈极显着正相关,与大理石纹和肌内脂肪含量呈极显着负相关。上述结果说明,江口萝卜猪背最长肌中UCP2基因的表达量越高则肌内脂肪含量越低,肉品质越差,UCP2-T5728G和UCP2-T5774G位点杂合型为基因高表达型,肌内脂肪沉积效率降低,对肉品质有不利影响,UCP2-C5878T位点突变型基因表达量极显着降低,肌内脂肪沉积效率升高,有利于肉品质性改善。本研究证明UCP2基因可以作为辅助江口萝卜猪选种选育的候选基因,筛选到的3个SNPs位点均可能是影响猪肉品质性状的重要SNPs位点。(本文来源于《中国畜牧杂志》期刊2019年10期）
吴雪[3]（2019）在《江口萝卜猪UCP和STAT3基因变异与组织表达规律研究》一文中研究指出江口萝卜猪是贵州省优良的地方畜禽品种,具有肉质细嫩,鲜香浓郁的特点。因此,筛选有效的分子标记,对于江口萝卜猪的选种选育有着重要意义。STAT3是JAK-STAT通路中重要的转录激活因子,对于脂质代谢有重要的调控作用,UCP2、UCP3作为解耦联蛋白家族成员,对动物机体的能量代谢模式有着重大的影响,因此它们均是作为改善畜禽生产性能和肉质性能的重要候选基因。本试验以江口萝卜猪为试验材料采用混合DNA池直接测序法筛选SNPs位点,并做生物信息学分析、群体遗传参数分析以及连锁不平衡分析;对SNPs位点采用直接测序法分型各个体基因型并对各基因型与肉质性状进行关联性分析。同时采用qPCR方法检测各基因不同组织、不同月龄的表达量。另外分析了这叁个基因在背最长肌表达量与肉质性状的相关性。获得主要结果如下:1.在STAT3基因中筛查出1个SNP位点(STAT3-C56621T),位于16外显子,为同义突变,生物信息学分析发现该突变位点对mRNA二级结构的构象造成较大的影响,最小自由能增大,使结构稳定性降低。在样本群体中STAT3基因C56621T位点只发现突变型TT和杂合型TC,其中T为优势等位基因,基因频率为0.7430。基因型与肉质关联性分析发现TT型的江口萝卜猪大理石纹和熟肉率显着高于TC型,TT型剪切力和失水率显着低于TC型猪,总体来看TT型猪肉质好于TC型猪。对不同组织、不同月龄江口萝卜猪STAT3基因的表达分析表明:不同组织之间比较,肺、十二指肠、脾中的表达量显着高于其它组织。江口萝卜猪背最长肌STAT3基因表达量与肌内脂肪含量、大理石纹评分、熟肉率呈正相关,与剪切力呈负相关,突变型TT个体背最长肌中STAT3基因的表达量显着高于杂合型CT。不同月龄中,在肾、胃、肝脏和心4个组织中,其表达量与月龄无关,背最长肌、腰大肌、肺以及十二指肠中STAT3基因的表达量随月龄的增长而增长;2、在UCP2基因上筛查到6个SNPs位点,其中3个位于启动子,另外3个位于3’UTR区,江口萝卜猪UCP2基因启动子序列与Genbank参考序列对比发现了一段长17 bp的插入序列,生物信息学分析表明3个位于启动子上的多态位点和17bp插入序列可能导致UCP2基因转录因子结合效率增高。3个位于3’UTR区的多态位点会不同程度的影响mRNA二级结构稳定性。在样本群体中UCP2基因连锁不平衡分析发现Promoter-T-366A、Promoter-G-161C、UCP2-T5728G、UCP2-T5774G、UCP2-C5878T这5个位点中除Promoter-T-366A位点与UCP2-C5878T位点之外,其余两两位点之间为强连锁不平衡。基因型与肉质相关性分析发现Promoter-T-366A位点TA型,Promoter-G-161C位点GC型、UCP2-C5878T位点CT型,剪切力差异均显着高于其它基因型。UCP2-T5728G和UCP2-T5774G位点完全连锁,均为TT型大理石纹显着高于TG型。对不同组织、不同月龄江口萝卜猪UCP2基因的表达分析表明:不同组织相比,肺、肝、脾中UCP2基因表达量较高,肾和心中的表达量处于中等水平,背最长肌、腰大肌、十二指肠和胃中UCP2基因的表达量较低。不同月龄相比十二指肠与胃差异不显着,其余组织呈现随着月龄增长而下降的趋势。在江口萝卜猪背最长肌UCP2基因表达量与肉质指标相关性分析表明:UCP2基因表达量与大理石纹评分和肌内脂肪含量呈极显着负相关,与剪切力呈极显着正相关。UCP2基因Promoter-T-366A位点杂合型TA表达量显着高于野生型TT,Promoter-G-161C位点杂合型GC表达量显着高于突变型CC和野生型GG。UCP2-T5728G、UCP2-T5774G、UCP2-C5878T 3个位点均为杂合型个体表达量极显着高于突变型和野生型个体。3、UCP3基因上筛查到6个SNPs位点3个位于5’UTR区,3个位于3’UTR区。UCP3-A3127G、UCP3-C10439T位点不影响mRNA二级结构稳定性,UCP3-C10441A和UCP3-A10479G/T位点A>T型突变会降低mRNA二级结构结构稳定性。UCP3-T3205C和UCP3-A10479G/T位点A>G型突变会增强mRNA二级结构结构稳定性。其中UCP3-A10479G/T位点,存在两种突变类型:A>G型的转换和A>T型的颠换,共检测到4种基因型,包括野生型AA,突变型GG和TT,以及杂合型AG,其余位点则表现为3种基因型。UCP3基因连锁不平衡分析发现UCP3-A3127G和UCP3-T3205C位点、UCP3-C10439T和UCP3-G10466A位点为完全连锁不平衡。基因型与肉质相关性分析表明UCP3-A10479G/T位点不同基因型个体的大理石纹评分差异显着,大理石纹评分及肌内脂肪含量突变型明显高于野生型以及杂合型。其余位点基因型与肉质指标差异不显着。对不同组织、不同月龄江口萝卜猪UCP3基因的表达分析表明:江口萝卜猪UCP3基因在背最长肌和腰大肌中表达量较高,心次之,十二指肠、肺、肝、脾、肾、胃中表达量极低。在不同月龄江口萝卜猪中,在背最长肌和腰大肌中表达量随着月龄的增长呈现大幅上升的趋势,且差异显着;十二指肠、肺、肝、脾、肾、胃中表达量在各月龄中均表达量较低。UCP3基因表达量与肌内脂肪含量呈极显着正相关,与剪切力呈极显着负相关,与大理石纹评分呈较强正相关,在对大理石纹评分有显着影响的UCP3-A10479G/T位点中则为突变型GG和TT表达量极显着高于杂合型和野生型。(本文来源于《贵州大学》期刊2019-06-01）
吴雪,张继,邱淦远,杨茂林,刘若余[4]（2019）在《江口萝卜猪STAT3基因多态性及生物信息学分析》一文中研究指出【目的】明确碱基突变对江口萝卜猪STAT3基因mRNA二级结构及其编码蛋白二、叁级结构的影响,为更好地开发利用江口萝卜猪种质资源打下基础。【方法】利用江口萝卜猪血样提取基因组DNA构建DNA池,采用混合DNA池结合PCR产物直接测序的方法对STAT3基因进行多态性分析,筛选出SNP多态位点及估算等位基因频率,并进行生物信息学分析。【结果】从江口萝卜猪血样中扩增获得STAT3基因的24个外显子,并筛选出7个SNPs位点,分别是:Exon2-A~(19)>C、Exon2-G~(20)>C、Exon2-G~(74)>A、Exon4-T~(81)>A、Exon5-G~(57)>A、Exon5-C~(64)>A和Exon22-C~(43)>A。其中,Exon2-G~(74)>A、Exon4-T~(81)>A和Exon5-G~(57)>A为同义突变,不改变其编码氨基酸序列;Exon2-A~(19)>C、Exon2-G~(20)>C、Exon5-C~(64)>A和Exon22-C~(43)>A为错义突变,会导致其编码氨基酸发生改变。Exon22-C~(43)>A突变后致使最小自由能降低为-755.90 kcal/mol,结构稳定性增强;Exon2-A~(19)>C、Exon5-G~(57)>A和Exon5-C~(64)>A突变均促使最小自由能增加,分别为-754.00、-753.40和-752.60 kcal/mol,且导致m RNA二级结构改变,结构稳定性降低,其中Exon5-G~(57)>A突变导致mRNA二级结构完全改变。Exon2-A~(19)>C、Exon2-G~(20)>C、Exon5-C~(64)>A和Exon22-C~(43)>A突变均可导致编码蛋白二、叁级结构的改变,具体表现为α-螺旋增加、β-折迭减少,而无规则卷曲除Exon2-A~(19)>C突变呈增加趋势外,其他突变均呈减少趋势。其中,Exon2-G~(20)>C突变对蛋白二级结构影响最大,而Exon2-A~(19)>C突变的影响最小。【结论】从江口萝卜猪STAT3基因的24个外显子上检测出7个SNPs位点,其中Exon2-A~(19)>C、Exon2-G~(20)>C、Exon5-C~(64)>A和Exon22-C~(43)>A 4个为错义突变,除了造成编码氨基酸改变外,还导致mRNA及编码蛋白二、叁级结构的改变,进而可能对STAT3蛋白的功能造成影响。(本文来源于《南方农业学报》期刊2019年03期）
孟华[5]（2018）在《优良地方猪品种——江口萝卜猪》一文中研究指出江口萝卜猪主产于贵州省江口县,是贵州省优良地方猪品种,具有早熟易肥、皮薄骨细、肉味香浓等优点,养殖历史悠久。1.体形外貌。全身被毛黑色。头大小适中,嘴较长而尖。额部有2～3条横向皱纹,耳大小适中、下垂,背腰平直而稍窄。臀部倾斜,大腿瘦削,腹部容积大。乳房发育良好,乳头多为6对,排列匀称。四肢短而纤细、结实,后肢略高于前肢。4～5岁老龄公猪均有獠牙。2.生物学特性。适应能力强,(本文来源于《农村百事通》期刊2018年17期）
李晓凤,夏先林,高俊波,李吉祥,罗刚[6]（2017）在《江口萝卜猪肌肉氨基酸组成及营养价值分析》一文中研究指出江口萝卜猪是贵州着名的小型地方猪种,主要分布于贵州省江口县、松桃县和岑巩县,它具有耐粗饲、适应性强、肉嫩和味香浓等优点。试验旨在探究江口萝卜猪肌肉蛋白质营养价值,为其今后肉品深加工提供理论依据和实践参考。采用氨基酸比值系数法对江口萝卜猪肌肉蛋白质氨基酸模式进行评价。结果表明,脱脂江口萝卜猪肌肉中总氨基酸含量高达80.74%,鲜味、甜味和芳香类族氨基酸的含量分别为19.43%,12.47%和7.57%,各种人体必需氨基酸种类齐全,且比例相对均衡,蛋氨酸+胱氨酸的氨基酸比值系数(RC)为1.10,比值系数分(SRC)为77.59。几种人体必需氨基酸中,第一限制氨基酸为缬氨酸,第二限制性氨基酸为亮氨酸和异亮氨酸。(本文来源于《食品工业》期刊2017年11期）
杨茂林,杨旭[7]（2017）在《江口萝卜猪选种选育技术》一文中研究指出江口萝卜猪是我国优良的地方猪种之一,近年来,江口萝卜猪数量急据下滑和无计划杂交利用,导致该猪体型外貌不一、生产性能不稳定、遗传多样性变窄等,制约了其优良特性的发挥。在此背景下,指导养殖企业或养殖合作社(农户)开展选种选育技术工作,以进一步提高该猪的生产性能,发挥其种质优势。(本文来源于《畜禽业》期刊2017年11期）
杨忠诚,龚俞,杨茂林,廖乔平,杨昌平[8]（2016）在《不同屠宰体重对江口萝卜猪胴体性状、肉品质、氨基酸和脂肪酸的影响》一文中研究指出为研究不同屠宰体重对江口萝卜猪胴体性状、肉品质、氨基酸及脂肪酸的影响,本研究选取60、70、80、90、100、110kg各6头江口萝卜猪测定了其不同体重阶段的胴体品质和肉质特性,以分析其胴体性状、肉品质及肌肉营养成分随体重的变化规律。结果显示,江口萝卜猪在体重达80kg之前,其屠宰率、眼肌面积随体重的增加增长较快,氨基酸的含量增加明显,80kg时肌肉中含有丰富的脂肪酸种类,其中油酸、亚油酸等不饱和脂肪酸含量较高。江口萝卜猪在体重达90kg之后脂肪过多沉积,各体重组赖氨酸、缬氨酸、苏氨酸等必需氨基酸的含量呈显着或极显着差异(P<0.05;P<0.01)。总体上看,江口萝卜猪在体重达80kg左右时其胴体性状及肉质性能较好,肌肉中氨基酸和脂肪酸含量丰富,且具有理想的氨基酸和脂肪酸构成,尤其是必需氨基酸及鲜味氨基酸含量高,不饱和脂肪酸及饱和脂肪酸构成比例适宜。因此,综合各项测定指标江口萝卜猪在体重达80kg左右屠宰较优。(本文来源于《中国畜牧兽医》期刊2016年09期）
盘道兴,王振,杨茂林,廖乔平,杨昌平[9]（2016）在《江口萝卜猪和可乐猪PPARγ基因多态性研究》一文中研究指出以江口萝卜猪和可乐猪为实验材料分别构建DNA池,采用直接测序技术对猪PPA Rγ基因多态性进行筛查,共检测出4个多态位点,分别为exon2-C50T、exon7-G53T、exon8-G16A、exon9-C32T;其均为错义突变,分别使编码氨基酸发生Thr→Ile、Asp→Tyr、Asp→Asn、Ala→Asp的改变;对其进行生物信息学分析,结果表明多态位点野生型、突变型的等位基因频率估算、蛋白质二级及叁级结构预测均有差异。(本文来源于《中国畜牧杂志》期刊2016年03期）
毛同辉,吴高奇,郭义军[10]（2015）在《江口萝卜猪种质资源研究进展与开发利用》一文中研究指出江口萝卜猪主产于贵州省铜仁市江口县,耐粗饲、适应性强、肉质优良,是贵州省的优良地方猪种之一。本文综述了江口萝卜猪种质特性的研究进展、保护和开发利用现状,并对其今后的研究和开发利用进行了探讨。(本文来源于《中国猪业》期刊2015年06期）
江口萝卜猪论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
为研究UCP2基因与猪肉品质性状之间的关系,本研究测定10～12月龄144头江口萝卜猪11项肉品质指标,并提取基因组DNA构建DNA池扩增UCP2基因全部外显子序列,测序后筛选SNPs位点,单个样本DNA扩增后测序验证并分型,分析不同基因型个体肉品质差异。检测不同基因型个体背最长肌中UCP2基因表达量,研究UCP2基因表达量与肉品质的相关性。结果表明:共发现3个SNPs位点,分别为UCP2-T5728G、UCP2-T5774G、UCP2-C5878T;群体遗传参数分析发现等位基因频率差异均较大,多态信息含量均为中度多态,UCP2-C5878T位点显着偏离Hardy-Weinberg平衡;UCP2-T5728G和UCP2-T5774G位点为完全连锁不平衡;UCP2-T5728G和UCP2-T5774G位点野生型的大理石纹评分显着高于杂合型,UCP2-C5878T位点杂合型和野生型的剪切力显着高于突变型;UCP2-T5728G和UCP2-T5774G位点杂合型的UCP2基因表达量极显着高于野生型和突变型,UCP2-C5878T位点杂合型和野生型的表达量极显着高于突变型;UCP2基因在背最长肌中的表达量与剪切力呈极显着正相关,与大理石纹和肌内脂肪含量呈极显着负相关。上述结果说明,江口萝卜猪背最长肌中UCP2基因的表达量越高则肌内脂肪含量越低,肉品质越差,UCP2-T5728G和UCP2-T5774G位点杂合型为基因高表达型,肌内脂肪沉积效率降低,对肉品质有不利影响,UCP2-C5878T位点突变型基因表达量极显着降低,肌内脂肪沉积效率升高,有利于肉品质性改善。本研究证明UCP2基因可以作为辅助江口萝卜猪选种选育的候选基因,筛选到的3个SNPs位点均可能是影响猪肉品质性状的重要SNPs位点。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
江口萝卜猪论文参考文献
[1].吴雪,张继,邱淦远,刘鹏程,杨茂林.江口萝卜猪UCP2基因启动子变异分析[J].南方农业学报.2019
[2].张继,吴雪,邱淦远,刘鹏程,杨茂林.江口萝卜猪UCP2基因多态性与基因表达量及肉品质的相关性研究[J].中国畜牧杂志.2019
[3].吴雪.江口萝卜猪UCP和STAT3基因变异与组织表达规律研究[D].贵州大学.2019
[4].吴雪,张继,邱淦远,杨茂林,刘若余.江口萝卜猪STAT3基因多态性及生物信息学分析[J].南方农业学报.2019
[5].孟华.优良地方猪品种——江口萝卜猪[J].农村百事通.2018
[6].李晓凤,夏先林,高俊波,李吉祥,罗刚.江口萝卜猪肌肉氨基酸组成及营养价值分析[J].食品工业.2017
[7].杨茂林,杨旭.江口萝卜猪选种选育技术[J].畜禽业.2017
[8].杨忠诚,龚俞,杨茂林,廖乔平,杨昌平.不同屠宰体重对江口萝卜猪胴体性状、肉品质、氨基酸和脂肪酸的影响[J].中国畜牧兽医.2016
[9].盘道兴,王振,杨茂林,廖乔平,杨昌平.江口萝卜猪和可乐猪PPARγ基因多态性研究[J].中国畜牧杂志.2016
[10].毛同辉,吴高奇,郭义军.江口萝卜猪种质资源研究进展与开发利用[J].中国猪业.2015