导读:本文包含了家族转录因子论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献，主要关键词:亚洲百合,转录组,MYB转录因子,生物信息学分析
家族转录因子论文文献综述
王雪倩,袁国振,吴泽,李茜,滕年军[1]（2019）在《亚洲百合MYB转录因子家族的鉴定及调控花粉败育MYB基因的筛选》一文中研究指出v-myb禽成髓细胞瘤病毒致癌基因同源物(v-myb avian myeloblastosis viral oncogene homolog,MYB)转录因子家族在调控植物生殖及生长发育过程中发挥着重要的作用,本研究在转录水平上鉴定出亚洲百合品种'小小的吻'(Lilium Asiatic hybrids'Little Kiss') MYB转录因子家族成员并对其进行生物信息学分析,旨在筛选出调控花粉败育的基因,为亚洲百合MYB的功能研究提供基础资料。基于百合转录组数据,利用Pfam31.0和BLASTP等软件对百合MYB蛋白序列进行筛选与鉴定,使用MEGA 7.0、Web Logo 3.0等生物信息学软件,重点对占比最多的R2R3-MYB类转录因子进行保守结构域和系统进化树分析,并用Mev软件对LaMYB基因在小孢子减数分裂时期和单核花粉粒时期的表达水平进行分析。共筛选出69个LaMYB基因,包含50个R2R3-MYB类基因,15个1R-MYB类基因和4个3R-MYB类基因,所有LaMYB蛋白均为亲水性不稳定蛋白;亚细胞定位预测结果表明LaMYB基因编码的蛋白均定位于细胞核;Web logo3.0分析发现R2R3-MYB类蛋白结构域比较保守,但其C-端转录激活域的易变性使其具有功能多样性;系统进化分析将百合R2R3-MYB类蛋白划分为22个亚家族,其中参与花粉败育的拟南芥同源基因主要属于S18、S23、S21和S22亚家族;同时,RNA-Seq数据分析结果表明,和花粉发育的正常时期(减数分裂时期)相比,在花粉败育的关键时期(单核花粉粒时期),69个LaMYB基因中有42个的表达量呈现上调趋势,仅27个基因的表达量呈现下调趋势;q RT-PCR分析结果表明6个候选基因在百合花粉正常时期(减数分裂时期)和败育时期(单核花粉粒时期)的表达量有显着差异。该研究结果表明LaMYB基因在花粉败育过程中发挥重要的调控作用。此研究为深入探究LaMYB基因在花粉败育过程中发挥的功能提供基础资料。(本文来源于《农业生物技术学报》期刊2019年11期）
吴杭,刘瑞华,白林泉,张立新,张部昌[2]（2019）在《林可链霉菌中一种新的TetR家族转录因子负调控林可霉素的生物合成》一文中研究指出林可霉素是由林可链霉菌产生的次级代谢产物,作为一种强效的抑菌性抗生素,在临床上被广泛使用。林可霉素生物合成途径比较清晰,但其转录调控机制研究鲜有报道。通过遗传学实验在林可链霉菌中识别了一个TetR家族转录因子SLCG_2919,可负向调控林可霉素的生物合成。相比出发菌株,SLCG_2919基因缺失突变株中,林可霉素生物合成基因簇的结构基因、叁个抗性基因(lmrA、lmrB和lmrC)和调控基因lmbU的转录显着提高。SLCG_2919可特异性结合林可霉素基因簇的所有启动子。尽管在林可链霉菌染色体上,SLCG_2919基因远离林可霉素基因簇,但SLCG_2919仍然可直接调控林可霉素基因簇的转录表达。SLCG_2919临近基因编码一种ATP/GTP结合蛋白,可能通过偶联一个跨膜蛋白参与抗生素外排,将该基因在林可链霉菌中进行过表达,所获得的突变株较出发菌株的林可霉素抗性与产量明显增加。SLCG_2919可直接抑制该基因的转录表达,并确定SLCG_2919在其临近基因启动子区域的精确结合位点是内部10-nt富含AT的序列,而不是两边的反向重复序列,这与传统的TetR家族转录因子的DNA结合位点不尽相同。同时还发现SLCG_2919及其临近编码ATP/GTP结合蛋白的基因组合元件广泛存在于多种链霉菌中,这表明链霉菌中存在一种新的参与抗生素产生与抗性的调控元件。(本文来源于《中国生物工程学会第十叁届学术年会暨2019年全国生物技术大会论文集》期刊2019-11-09）
马梓铭,吴涛,姜文洙,都兴林[3]（2019）在《AP2家族OsRPH1转录因子调控水稻株型的功能研究》一文中研究指出【研究背景】株型是作物多个农艺性状在整体水平上的综合体现,它是决定产量形成的重要因素。其中激素是导致株型改变的重要因素之一,研究表明AP2家族中的ERF亚家族与植物生长激素有关。【研究目的】本研究目的在于证明OsRPH1转录因子基因是与株型有关的,并利用OsRPH1的过表达转基因材料进行功能分析。【材料与方法】利用一个AP2/ERF转录因子基因,OsRPH1的过表达转基因材料进行各种实验。转基因植物材料是以粳型日本稻'Kitaake'背景,将Kitaake和转基因幼苗在16小时光照30℃/8小时黑暗24℃循环下水培生长10-15天。通过RT-PCR实验观察赤霉素合成相关基因的表达情况。亚细胞定位与酵母自激活观察OsRPH1在细胞中的转录活性。酵母筛选CDNA文库,酵母双杂交实验,双分子荧光互补实验等验证转录因子的互作。通过不同光对幼苗处理,赤霉素处理实验与内源赤霉素含量的测定验证OsRPH1通过CRY1b互作影响下游赤霉素基因,赤霉素含量下降从而负调控水稻株高。【结果与分析】过表达OsRPH1的转基因材料在幼苗阶段与Kitaake相比,转基因植物表现出降低的幼苗高度和根长。在成熟时,转基因植物的平均高度仅为平均Kitaake高度的约81%,所有转基因植物的节间显着短于Kitaake的节间。酵母筛选CDNA文库等实验证明了OsRPH1转录因子能够与OsCRY1B互作调控赤霉素相关基因合成。在不同种光处理下的植株对比,我们发现转基因植株在蓝光下才会导致矮化表型。OsRPH1过表达株系中GA合成相关基因的表达显着降低,而GA失活相关基因的表达则升高。外源GA激素处理表明,过表达植株对GA有响应。分别测量植株的内源赤霉素含量,发现转基因植株中的赤霉素含量显着低于正常Kitaake对照植株【结论】OsRPH1被提出作为一种新的AP2/ERF转录因子,其通过与调节GA相关基因的OsCRY1b相互作用负调节植物高度。OsRPH1过表达水稻和Kitaake植物中GA含量的差异,以及OsRPH1对植物的进一步分子调控机制在未来的研究中可以阐明。(本文来源于《2019年中国作物学会学术年会论文摘要集》期刊2019-10-27）
高升华,李宁,王飞,尹延旭,余楚英[4]（2019）在《辣椒AP2/ERF家族转录因子CaERF109的克隆和表达分析》一文中研究指出植物AP2/ERF转录因子参与多个生物学进程。为了研究辣椒AP2/ERF家族成员CaERF109在逆境和激素响应过程中的作用,从‘遵辣1号’中克隆了CaERF109,并对其基因结构、理化性质等进行生物信息学分析,利用qRT-PCR检测高温、低温、生长素、赤霉素和茉莉酸甲酯处理后CaERF109的表达情况。结果显示:CaERF109的开放阅读框长693 bp,由2个外显子组成,编码230个氨基酸,分子量为2.6 kD,等电点为7.91,含一个氨基酸组成的AP2/ERF DNA结合结构域;CaERF109与同为茄科的番茄、马铃薯、烟草同源基因具有较近的亲缘关系,氨基酸序列同源性超过76%;CaERF109基因的表达受低温诱导,不受高温和植物外源激素生长素、赤霉素和茉莉酸甲酯诱导。综上所述,CaERF109基因可能参与辣椒低温胁迫应答,更对CaERF109基因深入的研究将有利于该基因功能和调控机制的揭示。(本文来源于《分子植物育种》期刊2019年19期）
查英,白琳,谢小丽,王凯,元超[5]（2019）在《艾纳香AP2/EREBP转录因子家族生物信息学分析》一文中研究指出AP2/EREBP是植物特有的一类具有庞大家族的转录因子。该转录因子广泛参与调节植物生理功能和水杨酸、茉莉酸、脱落酸和乙烯等信号转导途径。本研究利用艾纳香的全长转录组数据,通过生物信息学的手段对艾纳香AP2/EREBP家族进行挖掘并分析,为从分子水平研究艾纳香代谢调控提供参考依据。利用DNAMAN、MEGA5.05软件以及Protparam、SOPMA在线网站,对艾纳香AP2/EREBP转录因子家族的类型、结构域、系统进化、蛋白理化性质和氨基酸序列高级结构等进行分析。结果表明从艾纳香转录组中挖掘到57个AP2/EREBP基因,通过查找开放阅读框筛选出18条能翻译成完整蛋白的序列;根据结构域的划分可分为DREB、ERF和AP2叁个亚族;通过与拟南芥AP2/EREBP相关基因进行系统进化分析,结果表明艾纳香DREB和ERF亚族成员分别属于B2、B4、B5、B6和A6簇;生物信息学表明艾纳香AP2/EREBP转录因子家族蛋白富含酸性氨基酸,热稳定性较高且均为亲水性蛋白,全部蛋白都以无规则卷曲为主;每个亚家族的蛋白质叁级结构差异不明显,但不同亚族之间有差异,主要表现在β-转角、β-折迭及无规则卷曲长度不同。本研究结果为进一步研究艾纳香AP2/EREBP基因功能提供参考。(本文来源于《分子植物育种》期刊2019年18期）
李坤杰,谭杉杉,孙勃,饶丹,何琦[6]（2019）在《芥菜TCP转录因子家族全基因组鉴定及表达分析》一文中研究指出【目的】对芥菜基因组中TCP转录因子家族基因成员进行鉴定和序列分析,并分析TCP家族基因在茎发育时期的表达水平,为研究芥菜TCP基因功能和茎膨大机理提供基因源和理论依据。【方法】从芸薹属基因组数据库下载芥菜基因组数据,结合转录组数据,对芥菜TCP转录因子家族成员进行鉴定,并利用生物信息学方法对该家族成员进行理化性质、亚细胞定位、系统发育关系、基因结构、染色体定位及茎不同发育时期基因表达谱等方面的分析。【结果】芥菜TCP家族共有53个成员;系统进化树分析可分为两个大的亚组;TCP基因大都位于细胞核上,但理化性质差异很大;大部分基因没有内含子,基因结构保守性较高;在染色体上分布不均;表达模式分析显示TCP家族基因可能在芥菜茎膨大中起重要作用。【结论】鉴定了53个芥菜TCP家族基因成员,并发现PCF亚组成员在芥菜茎发育时期特异性表达,可能在芥菜茎的生长发育过程中起重要作用,该研究为芥菜及其他植物中TCP家族的鉴定和功能研究提供了理论基础。(本文来源于《四川农业大学学报》期刊2019年04期）
黄晓婧,张珺,夏惠,邓群仙,王进[7]（2019）在《葡萄MADS-box转录因子家族全基因组鉴定及表达分析》一文中研究指出从葡萄基因组中共鉴定出54个MADS-box基因,其中Type-Ⅰ型10个,Type-Ⅱ型44个,分布于15条染色体中,编码的蛋白质序列为62～596个氨基酸,外显子数1～16个。启动子区含有大量光信号、植物激素、胁迫和分生组织等相关功能域。根据实时荧光定量RT-PCR的结果发现,SEP、FUL、FLC、SVP、SOC1和ANR1亚类基因随叶片生长表达水平逐步升高,在成熟叶中最高,衰老叶片中下降;果实第1次膨大期和果实转色期是SEP、SOC1和ANR1亚类基因的两个表达高峰期;单氰胺处理诱导SVP、AGL15、SOC1、AP3/PI、AGL12和FLC亚类基因在休眠过程中表达量持续上升,在休眠解除过程表达量下降。(本文来源于《园艺学报》期刊2019年10期）
李雅君,李爱宁,孟繁凡,张宏宇,钱韦[8]（2019）在《MarR家族转录因子HpaR和XC0449协同调控野油菜黄单胞菌致病性》一文中研究指出MarR家族转录因子广泛存在于细菌及古生菌中,并灵活、精细地调控多种毒力、抗胁迫及抗生素相关的生理生化途径。在野油菜黄单胞菌中,MarR家族转录因子HpaR (XC2827)的失活会显着降低细菌对于寄主甘蓝的致病力,同时会导致胞外蛋白酶的过量表达。本研究进一步发现,Xcc 8004基因组一共编码9个MarR家族转录因子。表达并纯化其中的HpaR (XC2827)和XC0449,体外微量热泳动(MST)实验及Pull-down实验证明二者可以在体外特异性结合。同时,表型检测发现XC0449突变会导致细菌致病力显着下降。通过体外凝胶迁移阻滞试验(EMSA)、体内qRT-PCR和GUS检测证明,XC0449和HpaR均作为转录激活子协同调控下游致病相关基因XC0705的表达,最终调控细菌毒力及胞外酶合成。(本文来源于《生物工程学报》期刊2019年08期）
李宁,高升华,王飞,尹延旭,姚明华[9]（2019）在《辣椒CONSTANS-like转录因子家族的生物信息学分析》一文中研究指出CONSTANS(CO)基因介于生物节律钟与下游开花基因之间,是光周期途径中的关键基因。以‘Zunla-1’辣椒基因组数据为试验材料,利用生物信息学工具对辣椒CO-like转录因子基因家族进行研究,以期为进一步揭示CO-like转录因子基因家族在辣椒开花中的作用提供参考。结果表明:‘Zunla-1’辣椒基因组中共有9个CO-like基因,CO-like的蛋白大小相似,理论等电点均小于7;多序列和进化树分析将辣椒CO-like基因家族划分为3个组;利用转录组数据对9个CO-like基因家族成员的基因表达情况进行了分析,发现上述基因在叶片均有表达。(本文来源于《北方园艺》期刊2019年15期）
韩雯毓,李国瑞,风兰,闫星伊,白英俊[10]（2019）在《蓖麻WOX转录因子家族成员的全基因组分析及逆境胁迫响应》一文中研究指出WOX是植物中特有的一类转录因子,参与植物发育和应激反应。为探究蓖麻基因组WOX转录因子信息,本研究通过生物信息学方法鉴定出11个蓖麻WOX转录因子家族成员,并对其系统发育、基因结构、保守基序及理化性质等基本信息进行鉴定与分析。结果显示,11个WOX成员被分为叁个进化支,在古代进化支、中间进化支和现在进化支分别有2、2和7个成员,同一进化支成员的外显子、基因结构具有相似性,但理化性质差异较大。利用RT-qPCR检测根、茎、叶不同组织中5个蓖麻RcWOXs基因在干旱与盐胁迫下表达情况,结果表明,RcWOXs在不同组织中的表达具有特异性;除RcWOX10受干旱胁迫抑制外,RcWOX2、RcWOX4、RcWOX8和RcWOX9在干旱和盐胁迫下均被诱导表达,表明RcWOX转录因子在蓖麻逆境胁迫中起调控作用。本研究结果为进一步探究蓖麻WOX转录因子家族在逆境胁迫中的功能提供了一定的理论参考。(本文来源于《核农学报》期刊2019年10期）
家族转录因子论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
林可霉素是由林可链霉菌产生的次级代谢产物,作为一种强效的抑菌性抗生素,在临床上被广泛使用。林可霉素生物合成途径比较清晰,但其转录调控机制研究鲜有报道。通过遗传学实验在林可链霉菌中识别了一个TetR家族转录因子SLCG_2919,可负向调控林可霉素的生物合成。相比出发菌株,SLCG_2919基因缺失突变株中,林可霉素生物合成基因簇的结构基因、叁个抗性基因(lmrA、lmrB和lmrC)和调控基因lmbU的转录显着提高。SLCG_2919可特异性结合林可霉素基因簇的所有启动子。尽管在林可链霉菌染色体上,SLCG_2919基因远离林可霉素基因簇,但SLCG_2919仍然可直接调控林可霉素基因簇的转录表达。SLCG_2919临近基因编码一种ATP/GTP结合蛋白,可能通过偶联一个跨膜蛋白参与抗生素外排,将该基因在林可链霉菌中进行过表达,所获得的突变株较出发菌株的林可霉素抗性与产量明显增加。SLCG_2919可直接抑制该基因的转录表达,并确定SLCG_2919在其临近基因启动子区域的精确结合位点是内部10-nt富含AT的序列,而不是两边的反向重复序列,这与传统的TetR家族转录因子的DNA结合位点不尽相同。同时还发现SLCG_2919及其临近编码ATP/GTP结合蛋白的基因组合元件广泛存在于多种链霉菌中,这表明链霉菌中存在一种新的参与抗生素产生与抗性的调控元件。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
家族转录因子论文参考文献
[1].王雪倩,袁国振,吴泽,李茜,滕年军.亚洲百合MYB转录因子家族的鉴定及调控花粉败育MYB基因的筛选[J].农业生物技术学报.2019
[2].吴杭,刘瑞华,白林泉,张立新,张部昌.林可链霉菌中一种新的TetR家族转录因子负调控林可霉素的生物合成[C].中国生物工程学会第十叁届学术年会暨2019年全国生物技术大会论文集.2019
[3].马梓铭,吴涛,姜文洙,都兴林.AP2家族OsRPH1转录因子调控水稻株型的功能研究[C].2019年中国作物学会学术年会论文摘要集.2019
[4].高升华,李宁,王飞,尹延旭,余楚英.辣椒AP2/ERF家族转录因子CaERF109的克隆和表达分析[J].分子植物育种.2019
[5].查英,白琳,谢小丽,王凯,元超.艾纳香AP2/EREBP转录因子家族生物信息学分析[J].分子植物育种.2019
[6].李坤杰,谭杉杉,孙勃,饶丹,何琦.芥菜TCP转录因子家族全基因组鉴定及表达分析[J].四川农业大学学报.2019
[7].黄晓婧,张珺,夏惠,邓群仙,王进.葡萄MADS-box转录因子家族全基因组鉴定及表达分析[J].园艺学报.2019
[8].李雅君,李爱宁,孟繁凡,张宏宇,钱韦.MarR家族转录因子HpaR和XC0449协同调控野油菜黄单胞菌致病性[J].生物工程学报.2019
[9].李宁,高升华,王飞,尹延旭,姚明华.辣椒CONSTANS-like转录因子家族的生物信息学分析[J].北方园艺.2019
[10].韩雯毓,李国瑞,风兰,闫星伊,白英俊.蓖麻WOX转录因子家族成员的全基因组分析及逆境胁迫响应[J].核农学报.2019