导读:本文包含了基因测序法论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献，主要关键词:北京,霾污染,PM2.5,16S,rRNA基因
基因测序法论文文献综述
王步英,郎继东,张丽娜,方剑火,曹晨[1]（2015）在《基于16S rRNA基因测序法分析北京霾污染过程中PM_(2.5)和PM_(10)细菌群落特征》一文中研究指出2013年1月8~14日,北京出现了严重的霾污染.霾污染时高浓度的大气颗粒物增加了暴露人群的健康风险,而大气中的微生物也可能带来一些风险,但目前对霾污染时大气中微生物组成了解较少.本研究选取了2013年1月8~14日北京7d的PM2.5和PM10采样样本,通过对细菌16S rRNA基因V3区扩增和Mi Seq测序,得到PM2.5和PM10中的细菌群落结构特征,并将结果与相同采样样本的宏基因组测序结果及叁项国外基于16S rRNA基因测序方法的大气中细菌研究结果进行了比较.研究发现7 d连续采样条件下,PM2.5中细菌群落结构在门和属的水平上均差别不大.在属级别上,节杆菌属(Arthrobacter)和弗兰克氏菌属(Frankia)是北京冬季大气中细菌群落的主要类群.16S rRNA基因测序与宏基因组测序结果对比分析发现,在属级别上,两种分析方法中有39个相同的属类群(两种分析方法丰度前50的细菌类群合并所得),弗兰克氏菌属(Frankia)和副球菌属(Paracoccus)在16S rRNA基因测序分析结果中相对含量较多,而考克氏菌属(Kocuria)和地嗜皮菌属(Geodermatophilus)在宏基因组测序结果中相对含量较高.在门和属的水平上,PM2.5和PM10中细菌群落结构特征呈现出相似的规律.在门水平上,放线菌门(Actinobacteria)在PM2.5中的相对百分比较大,而厚壁菌门(Firmicutes)在PM10中的相对百分比较大.在属水平上,梭菌属(Clostridium)在PM10中的相对百分比较大.与叁项国外基于16S rRNA基因测序研究结果对比发现,尽管在采样地点和采样时间上有较大差异,大气中普遍存在一些相同的细菌类群,且近地面大气细菌群落结构特征相似度较高,区别于高空对流层中细菌群落结构特征.(本文来源于《环境科学》期刊2015年08期）
马荣,崔丽娟,姜敏[2]（2014）在《基因测序法检测FLT3和NPM1的突变研究》一文中研究指出目的:基因测序法检测FLT3和NPM1突变在急性髓系白血病(AML)中预后判断和分子靶向治疗的意义。方法:利用基因测序法检测35例急性髓系白血病的突变。结果:发现35例样本中FLT3-ITD突变4(13.3%)例,NPM1突变6(20%)例,没有发现FLT3和NPM1都突变,其它25(71.4%)例均为FLT3阴性、NPM1阴性。结论:AML存在NPM1突变958bp处出现插入突变,缺失TGGCAGTG和缺失后替换成gcccgcggttta的突变,FLT3中出现内部串联重复突变,直接测序法最方便检测此突变。(本文来源于《生物技术世界》期刊2014年10期）
陈莹,袁建芬,喻海忠,张小洁,肖春红[3]（2014）在《双探针FQ-PCR法与基因测序法联合检测乙肝病毒耐药基因》一文中研究指出目的:建立一种检测乙型耐药基因的方法。方法:采用双探针实时荧光定量聚合酶链反应(FQ-PCR)对46例HBV-DNA阳性的标本进行YMDD变异株的检测,对阳性结果进行基因测序。结果:双探针FQ-PCR法检测出YMDD变异株18例,占36.96%,18例阳性标本中拉米夫定耐药株17例、阿德福韦耐药株6例、替比夫定耐药株8例、恩替卡韦耐药株2例。结论:本法既有FQ-PCR简便、快速、灵敏、经济的特点,又有测序法对基因突变的明确性,为临床用药提供及时、准确的指导。(本文来源于《中医临床研究》期刊2014年21期）
肖桂娥,魏绍静,张复春,陈伟烈,兰芸[4]（2014）在《比较基因测序法和探针杂交法对HCV基因分型的准确性》一文中研究指出目的比较基因测序法和探针杂交法对HCV基因分型的准确性,为临床HCV基因型诊断和制定抗病毒治疗策略提供可靠依据。方法以国际HCV基因库中HCV全基因序列代表株的分型结果为"金标准",设计C区和NS5B区基因序列扩增引物,检测191例临床丙型肝炎患者的HCV基因,测序结果与"金标准"共建系统进化树进行基因分型,分型结果与患者的探针杂交法分型结果进行对比。结果从国际HCV基因库中共获得92个代表株,涵盖7个基因型,54个基因亚型和5个重组基因型。C区和(本文来源于《中华医学会第十叁次全国感染病学术会议论文汇编》期刊2014-06-13）
朱健铭,姜如金,吴康乐,翁幸鐾,孔海深[5]（2014）在《全基因测序法分析肺炎克雷伯菌JM45株对喹诺酮类药物耐药基因》一文中研究指出目的分析泛耐药肺炎克雷伯菌JM45株携带的喹诺酮类药物耐药基因,研究其对喹诺酮类药物的耐药机制。方法采用Roche454高通量测序技术对肺炎克雷伯菌JM45株做全基因组测序(完成图),分析喹诺酮类耐药基因携带状况,再将gyrA与parC全长基因与其他6株肺炎克雷伯菌做分子进化分析。结果最终得到JM45株一条完整的基因组(染色体)序列及两条质粒序列;基因组(染色体)序列大小为5 273 812bp(GC含量65.8%),质粒1序列大小为317 156bp(GC含量53.0%),质粒2序列大小为12 209bp(GC含量55.3%);在基因组(染色体)序列中携带了gyrA基因(全基因组Feature ID:KPN_1614),parC基因(Feature ID:KPN_0743);与肺炎克雷伯菌喹诺酮类药物敏感株相比较,gyrA基因第83位密码子由TCC→ATC,翻译成氨基酸序列后丝氨酸(Ser)→异亮氨酸(Ile),parC基因第80位密码子由AGC→ATC,翻译成氨基酸序列后丝氨酸(Ser)→异亮氨酸(Ile)。结论肺炎克雷伯菌JM45株喹诺酮类药物耐药是gyrA基因和parC基因喹诺酮耐药决定区(QRDR)突变所致;gyrA与parC全长基因的分子进化分析提示JM45株与肺炎克雷伯菌HS11286关系最为接近(序列相同),与肺炎克雷伯菌342关系最远。(本文来源于《中华医院感染学杂志》期刊2014年10期）
丁晓[6]（2013）在《16S rRNA基因测序法鉴定猪多杀性巴氏杆菌的研究》一文中研究指出对66株猪多杀性巴氏杆菌的鉴定结果表明,PCR是一种快速、特异、灵敏的病原检测方法。应用能够扩增大多数原核生物16S rRNA基因的通用引物,对猪多杀性巴氏杆菌疫苗株(EO630)和野外分离株的16S基因rRNA进行PCR扩增,以期为分子水平上准确地鉴别猪巴氏杆菌提供依据。(本文来源于《湖北畜牧兽医》期刊2013年05期）
Karen,Hampton[7]（2009）在《科学家发现新型果蝇基因测序法》一文中研究指出美国斯托瓦斯医学研究所开发出了一种名为全基因组测序法"的果蝇突变基因测序法.研究人员称,在寻找果蝇突变基因上该方法能大幅减少时间和精力.相关研究发表在5月出版的《遗传学》(Genetics)杂志上.据介绍,研究人员是通过测定果蝇突变后所产生的复合乙基甲((本文来源于《浙江大学学报(农业与生命科学版)》期刊2009年03期）
王小龙[8]（2009）在《美发现新型果蝇基因测序法》一文中研究指出本报讯美国斯托瓦斯医学研究所开发出了一种名为“全基因组测序法”的果蝇突变基因测序法。研究人员称，在寻找果蝇突变基因上该方法能大幅减少时间和精力。相关研究发表在5月出版的《遗传学》杂志上。 据介绍，研究人员是通过测定果蝇突变后所产生的复合乙基甲(本文来源于《科技日报》期刊2009-05-07）
郭会芳,阚显照,张韧,陈鸿珊[9]（2008）在《nrDNA ITS和cpDNA rpl16基因测序法对六种鼠尾草的检测(英文)》一文中研究指出为从鼠尾草属植物中鉴别丹参品种,采用基因测序方法,用核糖体核酸内转录间隔区基因(nrDNAITS),编码核蛋白体大亚基多肽L16的基因(rpl16)及叶绿体DNA上包含trnL以及trnL和trnF间隔区的区域基因(trnL-trnF)的序列,检测六种鼠尾草属新鲜植物。由于nrDNAITS和rpl16突变率较高,可以做为6种鼠尾草的基源鉴定标记,依此设计了两对特异引物,从6种鼠尾草中鉴定出丹参(Salvia miltiorrhi-za)和云南鼠尾草(S. yunnanensis)。但trnL-trnF突变率太低,未能用于鉴别。商品干燥中药材因加工和储藏的方式致使DNA降解严重,基因测序法难于应用。(本文来源于《云南植物研究》期刊2008年03期）
李峰,管宇,沈志强,刘金华,林初文[10]（2008）在《应用16S rRNA基因测序法鉴定兔支气管败血波氏杆菌的研究》一文中研究指出应用16S rRNA基因测序法对兔支气管败血波氏杆菌Bb-1株进行了16S rRNA基因序列分析。结果表明,能够扩增出与预期结果相符合的片断。经Blastn比较,分离菌与兔支气管败血波氏杆菌RB50株(BX640449)同源性为99.8%。进一步的生化实验鉴定表明,Bb-1株生化反应结果符合兔支气管败血波氏杆菌生化反应特征。综合各种实验结果表明,分离菌Bb-1株为兔支气管败血波氏杆菌。(本文来源于《中国养兔杂志》期刊2008年01期）
基因测序法论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
目的:基因测序法检测FLT3和NPM1突变在急性髓系白血病(AML)中预后判断和分子靶向治疗的意义。方法:利用基因测序法检测35例急性髓系白血病的突变。结果:发现35例样本中FLT3-ITD突变4(13.3%)例,NPM1突变6(20%)例,没有发现FLT3和NPM1都突变,其它25(71.4%)例均为FLT3阴性、NPM1阴性。结论:AML存在NPM1突变958bp处出现插入突变,缺失TGGCAGTG和缺失后替换成gcccgcggttta的突变,FLT3中出现内部串联重复突变,直接测序法最方便检测此突变。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
基因测序法论文参考文献
[1].王步英,郎继东,张丽娜,方剑火,曹晨.基于16SrRNA基因测序法分析北京霾污染过程中PM_(2.5)和PM_(10)细菌群落特征[J].环境科学.2015
[2].马荣,崔丽娟,姜敏.基因测序法检测FLT3和NPM1的突变研究[J].生物技术世界.2014
[3].陈莹,袁建芬,喻海忠,张小洁,肖春红.双探针FQ-PCR法与基因测序法联合检测乙肝病毒耐药基因[J].中医临床研究.2014
[4].肖桂娥,魏绍静,张复春,陈伟烈,兰芸.比较基因测序法和探针杂交法对HCV基因分型的准确性[C].中华医学会第十叁次全国感染病学术会议论文汇编.2014
[5].朱健铭,姜如金,吴康乐,翁幸鐾,孔海深.全基因测序法分析肺炎克雷伯菌JM45株对喹诺酮类药物耐药基因[J].中华医院感染学杂志.2014
[6].丁晓.16SrRNA基因测序法鉴定猪多杀性巴氏杆菌的研究[J].湖北畜牧兽医.2013
[7].Karen,Hampton.科学家发现新型果蝇基因测序法[J].浙江大学学报(农业与生命科学版).2009
[8].王小龙.美发现新型果蝇基因测序法[N].科技日报.2009
[9].郭会芳,阚显照,张韧,陈鸿珊.nrDNAITS和cpDNArpl16基因测序法对六种鼠尾草的检测(英文)[J].云南植物研究.2008
[10].李峰,管宇,沈志强,刘金华,林初文.应用16SrRNA基因测序法鉴定兔支气管败血波氏杆菌的研究[J].中国养兔杂志.2008