网络相关因子论文-周金枝,杨植全,郭亮,杨庆勇,周永明

网络相关因子论文-周金枝,杨植全,郭亮,杨庆勇,周永明

导读:本文包含了网络相关因子论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献,主要关键词:甘蓝型油菜,eQTL,GWAS,转录因子

网络相关因子论文文献综述

周金枝,杨植全,郭亮,杨庆勇,周永明[1](2018)在《基于GWAS和eQTL挖掘油菜含油量相关的转录因子及其调控网络》一文中研究指出甘蓝型油菜(Brassica napus,AACC,2n=38,以下简称油菜)是我国重要的油料作物,系统研究油菜种子发育过程中的脂质代谢相关基因的表达调控及其与表型之间的联系,对于揭示菜籽油分形成和积累的调控关系非常关键。为了挖掘甘蓝型油菜含油量相关的转录因子(TF),揭示油脂合成相关基因的转录调控机制,我们通过对505份油菜种子含油量进行GWAS分析,鉴定出了380个与含油量显着相关的SNP。同时我们利用上述群体中309份材料的基因表达数据和基因型数据,鉴定出107个eQTL热点区域,并发现eQTL热点中TF显着富集,表明eQTL热点中可能存在与脂肪酸代谢相关的TF。通过整合油菜GWAS和eQTL数据和拟南芥脂类代谢网络等多组学信息,本研究鉴定了甘蓝型油菜种子含油量相关的转录因子并构建其调控网络。其中16个转录因子同时存在与含油量性状和脂类代谢基因显着关联的SNP位点,并且大部分转录因子都具有一因多效(调控多个含油量相关基因)。(本文来源于《中国作物学会油料作物专业委员会第八次会员代表大会暨学术年会综述与摘要集》期刊2018-11-19)

鞠正,曹东艳,梁岩,田慧琴,朱本忠[2](2018)在《利用加权基因共表达网络分析(WGCNA)的方法挖掘番茄果实成熟相关的转录因子》一文中研究指出为挖掘番茄果实成熟相关的转录因子,利用10个不同番茄组织RNA-Seq数据,通过加权基因共表达网络分析的方法构建网络。进一步将该网络划分为24个模块,并寻找到8个组织中共16个组织特异性模块。通过对3个番茄破色10 d的果实组织特异性模块分析,发现这些模块中含有大量果实品质形成所需的糖、脂、蛋白等相关的代谢过程,并存在类萝卜素合成、果实软化、芳香物质合成以及乙烯生物合成和信号转导所需的关键基因。此结果验证了网络和组织特异性模块的可靠性。通过对棕色模块中转录因子分析,发现在该模块中存在MADS-RIN、AP2a、FUL1(TDR4)、CNR、NAC4、ERF6、NAC-NOR等果实成熟相关的转录因子,以及大量MADS-RIN转录因子直接作用的靶基因。由此推断棕色模块中其它58个转录因子是潜在的果实成熟转录因子。此结果为番茄果实成熟机制的研究提供新思路。(本文来源于《中国食品学报》期刊2018年06期)

刘进波,周克男,任明会[3](2018)在《基于相关因子的BP神经网络电力负荷短期预测》一文中研究指出电力行业是一个国家非常重要的基础性行业,电力负荷的合理预测对整个国家的安全、社会的稳定以及人民的生活都有着重大的意义。本文作者主要研究了影响短期电力负荷预测的相关因子,并建立了基于相关因子的BP神经网络模型,最后给出了实例分析。(本文来源于《信息记录材料》期刊2018年01期)

张永平[4](2017)在《不饱和脂肪酸及神经免疫网络相关因子改善老年痴呆样病变的机制》一文中研究指出老年痴呆症即阿尔茨海默病(Alzheimer disease,AD),是当今致残致死的重大疾病之一,表现为记忆及认知障碍和丧失,常继发抑郁和狂躁等精神症状。由于对其发病原因不明,目前对该病尚无理想的治疗药物。最近神经炎症被认为在AD发病和发展中起到关键的作用。研究证明在AD患者脑中,白介素(interleukin,IL)-1?等促炎因子和激活的小胶质细胞在与认知相关的脑区如海马、前脑皮层增多。小胶质和星型胶质细胞既能诱导脑内炎症反应,又能分泌神经营养因子(neuotrophic factor,NTFs),两者共同决定神经元的存活和功能。而AD脑内具有抗炎功能的Omega-3多不饱和脂肪酸(n-3 PUFAs)含量下降。本课题根据AD发病的假说,在多个AD样模型上研究炎症诱导AD的神经免疫机制,并1)探索天然海洋不饱和脂肪酸如何通过抗炎、抗氧化和神经营养调节发挥神经保护;2)比较纯n-3 PUFA及不同比例组合的神经保护作用;3)研究神经免疫调节因子对AD发生通路上关键环节进行干预有效性。本课题通过以下6个实验进行探索:1)利用A?诱导的(32)D模型评价北极虾提取物4-2A的神经保护作用实验发现,A?25–35显着降低SH-SY5Y细胞存活率和GSH、NGF、Trk A和Tr KB水平,明显增加ROS、NO水平和TNF-?、BDNF、Caspase-3表达以及Bax/Bcl-2的比率;除NO、BDNF和Tr KB外,4-2A预处理可显着逆转以上其他指标的变化。2)通过脂多糖(Lipopolysaccharide,LPS)刺激小胶质细胞BV2的条件培养基和神经细胞SH-SY5Y共培养模式,发现LPS诱导BV2细胞核转录因子(NF-k B/p65)的活化以及炎症因子IL-1?、IL-6、肿瘤坏死因子(TNF-?)、活性氧自由基(ROS)水平及神经营养因子前体(pro NGF)和凋亡相关基因表达显着升高;LPS诱导BV2细胞介导的SH-SY5Y细胞存活率显着降低;Eicosapentaenoic acid(EPA)预处理可显着抑制以上变化。3)通过A?诱导神经细胞AD模型,发现纯或高比例EPA组合比DHA更有效发挥抗氧化作用,而纯或高比例DHA更显着促进NTFs及其受体的表达;两者在1:1下可协同发挥抗炎作用;DHA比EPA更有效降低细胞凋亡和提高细胞存活率。4)通过IL-1?诱导慢性中枢炎症模型发现,IL-1?诱发大鼠在Morris水迷宫空间学习记忆能力的下降,在旷野实验和糖水偏好实验中的焦虑抑郁行为,小胶质细胞的激活,炎症因子水平IL-1?,IL-6和TNF-?的升高,以及外周淋巴细胞增殖能力降低;抗炎因子IL-10可显着逆转以上指标的变化。5)在慢性中枢炎症模型中证明GC受体拮抗剂RU486显着降低IL-1?诱发大鼠在高架迷宫和旷野实验中的焦虑抑郁行为以及大脑海马组织炎症因子IL-1?,IL-6和TNF-?的升高,而升高NGF,BDNF,Tr K A和Tr K B的表达。6)BDNF显着逆转IL-1?诱发大鼠的Morris水迷宫的空间学习记忆能力的下降,小胶质细胞的激活,炎症因子水平IL-1?、IL-6、TNF-?和INF-γ,和促凋亡基因p75、Bax/Bcl-2比值和Caspase-3的升高,以及IL-10、GFAP,NGF,BDNF,Tr K A和Tr K B的降低。综上所述,本课题证实了海洋不饱和脂肪酸可通过抗炎、抗氧化和调节NTFs途径发挥神经保护功能,及DHA和EPA在功能上的不同及最优的比例组合;明确对AD发生通路上关键环节的干预:抗炎、阻断阻断皮质激素和补充NTF在防治AD的有效性。本课题的研究有助于进一步完善精神神经免疫学说,为药物开发提供重要思路;为海洋不饱和脂肪酸在临床药物和营养品的开发提供依据。(本文来源于《广东海洋大学》期刊2017-12-01)

康争春,李勃,蔡慧,马立业,于恩达[5](2017)在《胃癌转录调控网络构建及预后相关转录因子分析》一文中研究指出目的构建胃癌转录调控网络,分析预后相关转录因子。方法首先用基因芯片数据构建差异表达转录因子在癌组织中的共表达网络,进而发现共表达网络中的核心亚网络,然后用具有预后数据的合适表达谱芯片,根据构建的网络筛选预后相关的转录因子,采用样本量较大、有预后数据的表达谱芯片验证转录因子对胃癌患者预后是否有预测作用。结果共发现4个核心网络、21个核心转录因子。结合转录因子核心网络,确定和预后相关的4个核心转录因子其中的3个和患者预后相关。结论构建胃癌转录调控网络可为研究胃癌的潜在调控机制提供参考,并可能为将来胃癌的诊断治疗提供分子标志物及靶点。(本文来源于《检验医学与临床》期刊2017年21期)

刘萧,郭琳娟,洪葵[6](2017)在《心律失常和心肌病相关趋化因子网络研究进展》一文中研究指出趋化因子是一类能介导细胞定向迁移的细胞因子,大量研究表明趋化因子参与心血管损伤反应的各个阶段。同时,趋化因子作为一种可潜在预测心血管风险的生物学标志广受关注,并可能是治疗心血管疾病的潜在靶点。本文介绍趋化因子网络与心律失常和心肌病的研究进展。(本文来源于《临床心血管病杂志》期刊2017年09期)

苏立宁,宋小青,魏会平[7](2016)在《神经生长因子诱导大鼠骨髓间充质干细胞向神经细胞分化的效果观察及相关蛋白网络分析》一文中研究指出目的观察神经生长因子(NGF)诱导大鼠骨髓间充质干细胞(BMSCs)向神经细胞分化的效果,并分析相关蛋白网络。方法将4周龄健康SD大鼠4只,脱臼处死取股骨分离BMSCs并传代。取第5代BMSCs制备细胞爬片,分为观察组和对照组两组,观察组加入3%DMSO、60 ng/m L NGF、DMEM/F12预诱导液预诱导2 h,预诱导完成后加入100 ng/m L NGF、DMEM/F12诱导液诱导48 h。对照组不加任何药物。诱导完成后倒置显微镜观察两组细胞形态变化,用免疫组化法检测两组BMSCs中的神经元特异性烯醇酶(NSE)蛋白,用实时荧光定量PCR法检测BMSCs中的NSE mRNA。采用生物信息学软件STRING10.0分析NGF在诱导BMSCs向神经细胞分化中参与的蛋白网络,并对网络系统中编码蛋白的基因进行功能富集分析。结果镜下可见观察组细胞体积增大,细胞核固缩,核质比降低,细长突起明显,部分细胞间以网络状连接。对照组细胞密度较均匀,形态以长梭形为主。诱导完成第1、2、4天,观察组NSE mRNA相对表达量分别为1.34±0.06、2.23±0.23、1.56±0.09,两组比较,P均<0.05。观察组诱导完成第1、2天时NSE蛋白阳性细胞数分别为(35±8)、(133±6)个,对照组未检测到NSE蛋白阳性细胞,两组比较,P均<0.05。以NGF为种子节点得到与NGF直接发生作用的105个蛋白节点,共3个中心节点,分别为NGF、神经生长因子受体和泛素C。对网络中的各个节点进行GO功能富集分析,结果富集在神经分化、神经发育及调控神经凋亡等生物学过程。NGF与Ras蛋白特定鸟嘌呤核苷酸释放因子1、脑衍生神经营养因子、生长抑制蛋白、NGF、NGFR、神经营养受体酪氨酸激酶1、神经营养受体酪氨酸激酶2、神经营养因子3、极微小蛋白激酶C、GTP结合蛋白RAC、核糖体蛋白S27A、信号传导子及转录激活子3、酪氨酸羟化酶、泛素A-52、泛素B和UBC等蛋白相互作用调控神经分化过程。模块分析结果显示中心节点NGF、NGFR和UBC在模块1中发挥核心的作用。结果 NGF可诱导大鼠BMSCs向神经细胞分化。以NGF为种子节点,筛选到105个与NGF直接发生互作的蛋白节点。NGF、NGFR和UBC在NGF诱导大鼠BMSCs向神经细胞分化的蛋白网络中发挥核心作用。(本文来源于《山东医药》期刊2016年39期)

张远,李新亮[8](2015)在《在网络营销活动中对消费者购买意图产生影响因子的相关研究——以在北京的中国消费者和外国消费者为比较研究对象》一文中研究指出论文的中心议题是研究在网络营销活动中消费者的态度和行动之间的关系。消费者的态度和行动之间的关系以计划行为理论(The Theory of Planned Behavior)为理论基础进行探索性研究。网络营销在中国已经开展将近15年了,随着评价体系以及信用支付的不断完善中国消费者已经能够理性对待网络消费了。但从国内消费者网络购物的频度和额度来看还是和外国消费者有一定差距。文章将理论研究与实证研究相结合以消费者购买意图为最终研究目标,以北京地区的普通中国网络消费者与外国网络消费者为研究对象进行研究。(本文来源于《中国市场》期刊2015年23期)

邵学谦,孙雯[9](2014)在《结肠癌相关蛋白质相互作用的网络分析及其microRNA、转录因子和药物预测》一文中研究指出目的通过生物信息学方法分析结肠癌(colorectal cancer,CRC)相关的基因,构建其蛋白质相互作用网络,并预测结肠癌的microRNA、转录因子和相关药物。方法首先通过倍数关系值分析255个结肠癌相关的微阵列芯片样本中的表达基因,然后使用蛋白质网络数据库String构建其蛋白质相互作用网络,最后应用MSig DB 3.0分析法并结合Web Gestalt在线软件,对3组数据中的表达基因进行microRNA、转录因子和药物预测。结果本研究识别了4763个与结肠癌有关的基因,并采用表达最显着的前200个基因构建了蛋白质相互作用网络。此外,本文又采用前200个基因,通过生物信息学方法预测得到了与结肠癌有关的22条microRNA、58个转录因子和9种药物。结论本研究识别了结肠癌的表达基因,构建了其蛋白质相互作用网络,并预测了其microRNA、转录因子和结肠癌有关药物,为结肠癌的诊断和治疗提供了潜在的生物标记。(本文来源于《中国生化药物杂志》期刊2014年08期)

王传奇[10](2013)在《大学生网络依赖与大五人格各因子的相关研究》一文中研究指出本研究运用问卷法,对江苏省五所高校共1300名大学生实测,重点探讨大学生网络依赖群体在性别、年级、学历上的差异。同时运用《大五人格量表》测量被试的人格特点,对大学生大五人格各因子与网络依赖行为进行相关研究。(本文来源于《统计与管理》期刊2013年06期)

网络相关因子论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

为挖掘番茄果实成熟相关的转录因子,利用10个不同番茄组织RNA-Seq数据,通过加权基因共表达网络分析的方法构建网络。进一步将该网络划分为24个模块,并寻找到8个组织中共16个组织特异性模块。通过对3个番茄破色10 d的果实组织特异性模块分析,发现这些模块中含有大量果实品质形成所需的糖、脂、蛋白等相关的代谢过程,并存在类萝卜素合成、果实软化、芳香物质合成以及乙烯生物合成和信号转导所需的关键基因。此结果验证了网络和组织特异性模块的可靠性。通过对棕色模块中转录因子分析,发现在该模块中存在MADS-RIN、AP2a、FUL1(TDR4)、CNR、NAC4、ERF6、NAC-NOR等果实成熟相关的转录因子,以及大量MADS-RIN转录因子直接作用的靶基因。由此推断棕色模块中其它58个转录因子是潜在的果实成熟转录因子。此结果为番茄果实成熟机制的研究提供新思路。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

网络相关因子论文参考文献

[1].周金枝,杨植全,郭亮,杨庆勇,周永明.基于GWAS和eQTL挖掘油菜含油量相关的转录因子及其调控网络[C].中国作物学会油料作物专业委员会第八次会员代表大会暨学术年会综述与摘要集.2018

[2].鞠正,曹东艳,梁岩,田慧琴,朱本忠.利用加权基因共表达网络分析(WGCNA)的方法挖掘番茄果实成熟相关的转录因子[J].中国食品学报.2018

[3].刘进波,周克男,任明会.基于相关因子的BP神经网络电力负荷短期预测[J].信息记录材料.2018

[4].张永平.不饱和脂肪酸及神经免疫网络相关因子改善老年痴呆样病变的机制[D].广东海洋大学.2017

[5].康争春,李勃,蔡慧,马立业,于恩达.胃癌转录调控网络构建及预后相关转录因子分析[J].检验医学与临床.2017

[6].刘萧,郭琳娟,洪葵.心律失常和心肌病相关趋化因子网络研究进展[J].临床心血管病杂志.2017

[7].苏立宁,宋小青,魏会平.神经生长因子诱导大鼠骨髓间充质干细胞向神经细胞分化的效果观察及相关蛋白网络分析[J].山东医药.2016

[8].张远,李新亮.在网络营销活动中对消费者购买意图产生影响因子的相关研究——以在北京的中国消费者和外国消费者为比较研究对象[J].中国市场.2015

[9].邵学谦,孙雯.结肠癌相关蛋白质相互作用的网络分析及其microRNA、转录因子和药物预测[J].中国生化药物杂志.2014

[10].王传奇.大学生网络依赖与大五人格各因子的相关研究[J].统计与管理.2013

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