导读:本文包含了组织特异性甲基化论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献，主要关键词:特异性表达,断奶仔猪,甲基化,烷基化
组织特异性甲基化论文文献综述
董文华,王靖,喻礼怀,吴圣龙,包文斌[1]（2015）在《BPI基因启动子区甲基化水平对仔猪组织特异性表达的调控作用分析》一文中研究指出引言杀菌通透性增强蛋白(bactericidal/permeability-increasing protein,BPI)是脂多糖结合蛋白家族成员,不仅可以杀灭革兰氏阴性菌,还具有中和内毒素或脂多糖等生物学功能。课题组前期研究发现BPI基因在断奶仔猪抗革兰氏阴性菌中起到重要作用,这种调控作用与BPI基因的表达水平具有密切的关系,而且BPI基因仅在断奶仔猪十二指肠和空肠等消化道组织中高度表达,具有高度的组织特异性。(本文来源于《中国猪业科技大会暨中国畜牧兽医学会2015年学术年会论文集》期刊2015-09-18）
祝艳秋,陆璐,李林,蔡彦宁,张兰[2]（2015）在《时钟基因启动子甲基化频率随增龄的组织特异性改变》一文中研究指出目的探索时钟基因启动子甲基化频率增龄性改变及其在衰老中的作用。方法 4月龄(青年组,n=9)、20月龄(老年组,n=10)C57BL小鼠,采用甲基化特异性聚合酶链反应方法检测小鼠胃、脾、血管、肾、纹状体中时钟基因Per1/2、Bmal1/2、Cry1/2、Clock、Npas2启动子甲基化水平。结果老年组脾组织Cry1、Bmal2和NPas2启动子区甲基化频率高于青年组(P<0.05),胃组织Per1基因启动子甲基化频率低于青年组(P<0.05),血管组织Bmal1启动子区甲基化频率高于青年组(P<0.05)。结论多种时钟基因启动子甲基化可能参与衰老进程,并具有组织特异性。(本文来源于《中国康复理论与实践》期刊2015年05期）
靳鹏飞[3]（2014）在《山羊DIO3基因组织特异性表达及DNA甲基化分析》一文中研究指出DI03基因在甲状腺激素代谢过程中发挥着重要的作用,它对胎儿发育、新生儿生长有着非常重要的作用,尤其对哺乳动物大脑的发育起着至关重要的作用。为了进一步理解DI03基因的结构和功能,我们从南江黄羊的心肌中分离鉴定出DI03基因,采用实时荧光定量PCR技术研究南江黄羊在出生后3 d、30 d、60 d、90 d和120 d这5个生长阶段DIO3在不同组织中mRNA水平的表达差异。同时应用原位杂交技术对大脑不同区域的DIO3 mRNA进行了定位分析；此外,采用MassArray甲基化定量检测方法对出生后3d的南江黄羊不同组织DI03基因内部的CpG岛的甲基化状态进行了检测。主要结果如下：(1)克隆得到南江黄羊DI03基因的编码区全序列,长度为906 bp,编码的氨基酸数目为301个；山羊DI03的编码序列与小鼠、大鼠、人、猪、绵羊和牛的序列相似度分别为83.61%、84.37%、88.52%、90.20%、90.95%和97.46%；而DI03的编码氨基酸序列与牛的同源性为98.67%,与小鼠、大鼠、绵羊、人和猪的相似度分别为89.47%、89.80%、92.36%、92.76%和93.11%。保守的TGA密码(编码硒代半胱氨酸)对催化活性是至关重要的。(2)对DI03基因的生物信息学分析结果表明,DI03蛋白的分子重为33.9 kDa,且理论等电点为6.45。DI03氨基酸包含11个磷酸化位点；二级结构预测发现山羊D103蛋白主要由α-螺旋(41.20%)、无规卷曲(44.52%)和延伸片段(14.29%)组成。进化关系分析结果表明山羊DI03的核苷酸序列同绵羊和牛的亲缘关系最近,山羊DI03首先与绵羊形成一支,然后再和牛、猪和犬类形成一个分支；且山羊DI03与哺乳动物的亲缘关系更近,而与叁斑海猪鱼和蓝刻齿雀鲷的亲缘关系要远。(3)在南江黄羊出生后的五个时期均检测到了DIO3 mRNA的表达,但在肝、肾和背最长肌中的表达水平较高；其次为心和脑；在肺中的表达水平较低。(4)原位杂交探针成功揭示了DIO3 mRNA在大脑不同区域的空间表达模式。在大脑皮质中,DIO3 mRNA在脑膜和分子层的表达十分微弱,但其中的神经纤维表达却十分明显。DI03转录物在脑干中的神经元和神经纤维网中广泛分布。在小脑的分子层、浦肯野细胞层和颗粒细胞层中,DIO3 mRNA普遍呈现出中等程度的表达,但在小脑白质中呈现出极高浓度的表达。此外,在延髓中,DIO3 mRNA的表达信号主要集中于神经纤维网。相似的,DIO3 mRNA在下丘脑和白髓中的表达也主要分布于神经纤维网中。(5)山羊DIO3基因包含一个保守的CpG岛,几乎覆盖整个编码区(g.71-851),共包括51个CpG位点,且它们的平均甲基化水平位于0.03-0.79之间。在不同的组织中甲基化模式具有保守性。甲基化分析结果显示DIO3基因内部的CpG岛的甲基化程度在5’区域和3’区域存在差异,编码区内的5’区域(CpGs-1～24)的甲基化程度显着低于(P<0.01)3’区域(CpGs_25～51)；六个测试组织之间DIO3基因的甲基化水平差异不显着(29.11%-33.12%)。(本文来源于《四川农业大学》期刊2014-06-01）
吕萌,倪志勇,王娟,李波,罗淑萍[4]（2010）在《棉花甲基化酶基因COMT和CCoAOMT的组织特异性表达分析》一文中研究指出本研究利用半定量RT-PCR分析方法探索了陆地棉(Gossypium hirsutum L.)木质素合成途径中甲基化酶基因家族COMT和CCoAOMT在不同组织和不同发育时期纤维中的表达情况。结果表明COMT1,COMT2,COMT3和CCoAOMT1,CCoAOMT2在棉花的7个组织器官(根、茎、叶、子叶、花瓣、雄蕊、胚珠)中都有表达,其中COMT1和CCoAOMT1在各组织中的表达趋势类似,COMT2,COMT3和CCoAOMT2表达趋势各异。在5～25d的棉纤维发育过程中,COMT1和COMT3表达稳定,COMT2表达量逐渐增加。而CCoAOMT基因家族的2个基因的表达量变化相对明显,CCoAOMT1在25d出现表达高峰,CCoAOMT2则在10d和15d呈现高表达量。本研究表明甲基化酶基因家族COMT和CCoAOMT在棉花的根,茎等维管组织中具有相对一致的高表达量,而在其他组织和发育纤维中则呈现出明显的组织特异性和纤维发育时期特异性。(本文来源于《核农学报》期刊2010年04期）
林宝行[5]（2009）在《DNA甲基化在胰岛组织特异性基因表达和分化中的作用研究》一文中研究指出目的:通过比较不同细胞类型胰岛组织特异性基因DNA甲基化程度差异及与基因表达的关系,探讨DNA甲基化在胰岛组织特异性基因表达和胰岛分化中的作用。方法:采用甲基化DNA免疫共沉淀—实时定量PCR法(MeDIP—qPCR)比较小鼠胰岛素瘤β细胞(NIT1)、NIH小鼠成纤维细胞(NIH3T3)及小鼠胚胎干细胞(mES)叁者Pdx-1、Pax4、MafA、Nkx6.1和Insulin等基因转录起始区DNA甲基化程度差异。同时采用实时定量RT-PCR检测上述叁种细胞各基因mRNA表达水平。比较这些基因DNA甲基化水平与基因表达之间的相互关系。结果:NIH3T3细胞Pdx-1、MafA和Nkx6.1基因转录起始区呈高甲基化,在NIT1细胞和mES细胞中这些基因则呈低甲基化,前者的甲基化程度明显高于后两者(P＜0.05)。另外两种基因Pax4和Insulin转录起始区在叁种细胞中呈低甲基化,NIH3T3细胞Pax4基因的甲基化程度与NIT1细胞无统计学差异(P＞0.05);前者Insulin基因呈非甲基化,其甲基化程度低于后者(P＜0.05)。在基因表达方面,NIT1细胞高表达Pdx-1、Pax4、MafA、Nkx6.1和Insulin等基因,NIH3T3和mES细胞则未见这些基因表达。结果显示高甲基化状态的NIH3T3细胞无Pdx-1、MafA和Nkx6.1表达,而呈低甲基化状态的NIT1细胞则高表达Pdx-1、MafA和Nkx6.1。Pax4和Insulin基因甲基化状态与基因表达之间则无相关性。在胚胎干细胞中各基因呈低甲基化状态,也未见基因表达。结论:DNA甲基化参与了胰岛组织特异性基因的表达调控,且在胚胎干细胞向胰岛分化的过程中起重要调节作用。(本文来源于《暨南大学》期刊2009-05-15）
黄达锋[6]（2008）在《棉花组织特异性DNA甲基化及海岛棉种内甲基化多态性分析》一文中研究指出DNA胞嘧啶甲基化是棉花生长发育和组织分化过程中一种非常重要的表观遗传现象,不同材料或同一材料的不同组织能够通过改变DNA甲基化的模式来调控基因的表达。本研究采用甲基化敏感性扩增多态性(MSAP)技术,对Pima3-79和鄂棉22开花期幼叶、老叶、苞叶、纤维DNA的5′-CCGG-3′位点的胞嘧啶甲基化进行分析。并探讨了海陆杂种相对其亲本的甲基化差异。同时首次基于甲基化多态性对海岛棉系统聚类,并将甲基化多态性聚类与序列多态性聚类结果进行了比较分析。MSAP结果显示:1.组织特异性甲基化分析采用88对引物组合,扩增出5321条清晰的带型,对其中的663(12.5%)条在鄂棉22或Pima3-79中表现甲基化的片段予以记录整理分析发现:对于鄂棉22,四个不同组织具有相同甲基化模式的片段有618(93.3%),而组织特异性胞嘧啶甲基化仅有45(6.7%);Pima3-79叁个不同组织具有相同甲基化模式的片段有616(92.9%),而组织特异性胞嘧啶甲基化仅有47(7.1%);说明棉花组织特异性甲基化水平很低。2.杂交种相对双亲,发生了广泛的胞嘧啶甲基化变化,这种变化包括超甲基化和去甲基化同时还包括甲基化类型的潜在转变(如从外部胞嘧啶甲基化到内部胞嘧啶甲基化的转变或从内部胞嘧啶甲基化到外部胞嘧啶甲基化的转变);去甲基化位点数(63.9%)高于超甲基化位点数(6.1%)。3.海岛棉甲基化多态性分析得到117个甲基化位点,其中甲基化多态性位点31(26.5%)个,利用24个表现较高的重复性和可信度的甲基化多态性位点数据对28份材料聚类,聚类图将陆地棉,海岛棉及其杂种很好的分离开来,甲基化聚类的平均相似系数(0.67)明显高于先前已有的SRAP序列聚类平均相似系数(0.48),说明海岛棉间的甲基化差异远小于序列差异。同时发现Pima3-79、Pima90、比马棉1和苏丹2B甲基化多态性聚类与SRAP序列聚类结果较相似,未发现其它系列海岛棉两种聚类结果的相关性。4.7个甲基化位点测序发现:有5个与已知的功能基因相匹配,它们分别是雷蒙德氏棉转座子类似增变子、细胞色素氧化酶亚单位Ⅲ、DNA修复酶RecA基因、毒素前体蛋白基因Hfr-2 mRNA;还有2个位点与Zhao等(2008)报道的利用MSAP研究棉花甲基化与杂种优势关系所得的序列高度匹配,数据库中无相似序列的功能报道。(本文来源于《华中农业大学》期刊2008-06-01）
组织特异性甲基化论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
目的探索时钟基因启动子甲基化频率增龄性改变及其在衰老中的作用。方法 4月龄(青年组,n=9)、20月龄(老年组,n=10)C57BL小鼠,采用甲基化特异性聚合酶链反应方法检测小鼠胃、脾、血管、肾、纹状体中时钟基因Per1/2、Bmal1/2、Cry1/2、Clock、Npas2启动子甲基化水平。结果老年组脾组织Cry1、Bmal2和NPas2启动子区甲基化频率高于青年组(P<0.05),胃组织Per1基因启动子甲基化频率低于青年组(P<0.05),血管组织Bmal1启动子区甲基化频率高于青年组(P<0.05)。结论多种时钟基因启动子甲基化可能参与衰老进程,并具有组织特异性。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
组织特异性甲基化论文参考文献
[1].董文华,王靖,喻礼怀,吴圣龙,包文斌.BPI基因启动子区甲基化水平对仔猪组织特异性表达的调控作用分析[C].中国猪业科技大会暨中国畜牧兽医学会2015年学术年会论文集.2015
[2].祝艳秋,陆璐,李林,蔡彦宁,张兰.时钟基因启动子甲基化频率随增龄的组织特异性改变[J].中国康复理论与实践.2015
[3].靳鹏飞.山羊DIO3基因组织特异性表达及DNA甲基化分析[D].四川农业大学.2014
[4].吕萌,倪志勇,王娟,李波,罗淑萍.棉花甲基化酶基因COMT和CCoAOMT的组织特异性表达分析[J].核农学报.2010
[5].林宝行.DNA甲基化在胰岛组织特异性基因表达和分化中的作用研究[D].暨南大学.2009
[6].黄达锋.棉花组织特异性DNA甲基化及海岛棉种内甲基化多态性分析[D].华中农业大学.2008