成启明:不同品种紫花苜蓿转录组分析及营养品质差异的探讨论文

成启明:不同品种紫花苜蓿转录组分析及营养品质差异的探讨论文

本文主要研究内容

作者成启明,格根图,撒多文,王志军,范文强,卜振鲲,司强,李俊峰,卢娟,贾玉山(2019)在《不同品种紫花苜蓿转录组分析及营养品质差异的探讨》一文中研究指出:为了丰富紫花苜蓿转录组数据信息,找出不同品种紫花苜蓿的差异基因及代谢通路。通过Illumina HiSeq 4000平台对准格尔和WL319HQ的苜蓿叶片的RNA文库进行de novo组装。得到了约39G总的核苷酸,2亿多个reads,组装得到66734个Unigenes,平均长度为869 bp。将所得到的Unigenes与NCBI nonredundant protein(Nr),A manually annotated and reviewed protein sequence database(Swissprot),Clusters of eukaryotic orthologous groups(KOG)和Kyoto encyclopedia of genes and genomes(KEGG)数据库比对,分别获得44888(67.26%),29190(43.74%),24844(37.23%)和15647(23.45%)条序列的注释信息。在2个紫花苜蓿叶片中找到1098个差异表达基因(DEGs),其中有706个上调,392个下调(准格尔-vs-WL319HQ)。对其差异基因做了Gene ontology(GO)功能分析和KEGG途径分析,初步分析了2个品种营养品质差异的内在原因。极大地丰富了紫花苜蓿转录组数据信息,为今后紫花苜蓿的转录组测序提供理论依据,同时为紫花苜蓿生产实践提供参考。

Abstract

wei le feng fu zi hua mu xu zhuai lu zu shu ju xin xi ,zhao chu bu tong pin chong zi hua mu xu de cha yi ji yin ji dai xie tong lu 。tong guo Illumina HiSeq 4000ping tai dui zhun ge er he WL319HQde mu xu xie pian de RNAwen ku jin hang de novozu zhuang 。de dao le yao 39Gzong de he gan suan ,2yi duo ge reads,zu zhuang de dao 66734ge Unigenes,ping jun chang du wei 869 bp。jiang suo de dao de Unigenesyu NCBI nonredundant protein(Nr),A manually annotated and reviewed protein sequence database(Swissprot),Clusters of eukaryotic orthologous groups(KOG)he Kyoto encyclopedia of genes and genomes(KEGG)shu ju ku bi dui ,fen bie huo de 44888(67.26%),29190(43.74%),24844(37.23%)he 15647(23.45%)tiao xu lie de zhu shi xin xi 。zai 2ge zi hua mu xu xie pian zhong zhao dao 1098ge cha yi biao da ji yin (DEGs),ji zhong you 706ge shang diao ,392ge xia diao (zhun ge er -vs-WL319HQ)。dui ji cha yi ji yin zuo le Gene ontology(GO)gong neng fen xi he KEGGtu jing fen xi ,chu bu fen xi le 2ge pin chong ying yang pin zhi cha yi de nei zai yuan yin 。ji da de feng fu le zi hua mu xu zhuai lu zu shu ju xin xi ,wei jin hou zi hua mu xu de zhuai lu zu ce xu di gong li lun yi ju ,tong shi wei zi hua mu xu sheng chan shi jian di gong can kao 。

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  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自草业学报的成启明,格根图,撒多文,王志军,范文强,卜振鲲,司强,李俊峰,卢娟,贾玉山,发表于刊物草业学报2019年10期论文,是一篇关于紫花苜蓿论文,转录组测序论文,营养品质论文,组装论文,差异基因论文,草业学报2019年10期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自草业学报2019年10期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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