甲基化检测法论文-徐鹏,于文强

甲基化检测法论文-徐鹏,于文强

导读:本文包含了甲基化检测法论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献,主要关键词:DNA甲基化,导向定位测序(GPS),肿瘤转移,同化共生

甲基化检测法论文文献综述

徐鹏,于文强[1](2019)在《给DNA甲基化检测装上GPS,看肿瘤细胞如何变花样》一文中研究指出DNA甲基化对于细胞的正常生长和增殖非常关键,其异常可能导致一系列疾病,包括癌症,因此全基因组DNA甲基化的检测对于疾病的诊断和治疗具有重要意义。文章介绍了复旦大学于文强课题组研发的全基因组DNA甲基化检测方法"导向定位测序(guide positioning sequencing, GPS)"。相比于通用的WGBS(whole-genome bisulfite sequencing),GPS具有精确性高、比对率高、检测成本低、没有序列偏好性,可同时检测表观基因组和基因组学变异等优势。利用GPS对肝癌细胞和组织进行检测和分析,我们揭示了基于DNA甲基化调控的肿瘤转移的"同化共生"新机制。(本文来源于《自然杂志》期刊2019年05期)

陈瑞英,刘雅,孙婷,刘峰辉,马小花[2](2019)在《支气管肺泡灌洗液中SHOX2和RASSF1A基因甲基化检测对肺癌的诊断价值》一文中研究指出目的:对疑诊肺癌患者支气管肺泡灌洗液(BALF)中SHOX2、RASSF1A基因甲基化分析,评估两指标联合检测区分肺癌与肺良性疾病的诊断效能及联合细胞学使用对肺癌的诊断价值。方法:收集276例肺部疾病患者(肺癌组131例,肺部良性疾病组145例)的BALF样本,应用PCR法检测BALF中SHOX2和RASSF1A基因甲基化,并将检测结果和Sanger测序法结果比较。结果:PCR和Sanger测序法一致性分析显示两种方法在检测SHOX2和RASSF1A基因甲基化具有良好的一致性(Kappa=0. 978,95%CI=0. 954~1. 000)。SHOX2和RASSF1A基因甲基化联合检测在肺癌组的诊断灵敏度为0. 840,高于良性疾病组(0. 193)(P <0. 001);肺癌组BALF中SHOX2、RASSF1A基因甲基化联合检测阳性率在小细胞肺癌和肺鳞癌中分别是100%和90. 9%,高于肺腺癌(66. 0%);SHOX2和RASSF1A基因甲基化联合检测阳性率在晚期肺癌高达89. 3%,明显高于早期肺癌阳性检出率。ROC曲线分析显示当SHOX2、RASSF1A基因甲基化、细胞学叁指标联合使用时进一步将诊断灵敏度提高至0. 931。结论:对BALF中SHOX2、RASSF1A基因甲基化PCR检测在肺癌诊断中有良好的灵敏度; SHOX2、RASSF1A甲基化PCR检测与细胞学联合使用可显着提高肺癌诊断灵敏度,是肺癌病理学诊断的有效补充工具。(本文来源于《郑州大学学报(医学版)》期刊2019年05期)

李建,樊华,贺晓斌,吴耀禄,李晓勇[3](2019)在《血浆SFRP1和Septin9基因甲基化检测对结直肠癌诊断的临床价值》一文中研究指出探讨SFRP1和Septin9基因甲基化对结直肠癌的诊断价值,收集结肠镜检查和组织病理学确诊为结直肠癌的患者47例,非结直肠癌的对照组33例;测定两组外周血浆中SFRP1和Septin9基因的甲基化状态,并且进行粪隐血检测。结果显示,SFRP1和Septin9基因甲基化诊断结直肠癌的敏感度为80.0%,特异度为95.3%,粪便免疫学检测的敏感度为86.3%,特异度为54.3%,两者结合后敏感度为97.6%,特异度为96.8%,且明显高于单独检测。故SFRP1和Septin9基因甲基化联合粪免疫学检查可提高结直肠癌诊断的敏感度和特异度,而且具有无创、采样简单、依从性强、实验方法稳定等特点,适宜于临床推广使用。(本文来源于《中南医学科学杂志》期刊2019年05期)

宋健,黎萍,袁桂红,贾真,张荣琳[4](2019)在《ELMO1基因甲基化检测在胃癌早期诊断中的价值》一文中研究指出背景胃癌(gastric cancer, GC)是严重危害人体健康的恶性肿瘤,其发病率和死亡率分别占中国恶性肿瘤的第2位和第1位,早期诊断困难,因此,寻找GC诊断的新标志物对于提高GC的早期发现率及改善患者预后至关重要.目前,吞噬细胞运动蛋白1(engulfment and cell motility 1, ELMO1)基因甲基化在GC中诊断价值研究鲜有报道.目的探讨ELMO1基因甲基化与GC的关系,旨在为GC早期诊断提供新思路.方法选取海南省肿瘤医院内镜中心2017-01/2018-08诊治的慢性非萎缩性胃炎20例、慢性萎缩性胃炎20例、GC37例(早期GC15例,进展期GC22例),胃镜检查同时收集胃液及活组织检查收集病理组织标本.通过甲基化特异聚合酶链反应检测叁组患者ELMO1基因甲基化水平,并进行组间对比分析,并分析ELMO1基因甲基化与GC的发生、分期及转移的关系.结果 ELMO1基因甲基化率在病理组织DNA中依次为慢性浅表性胃炎组0%,慢性萎缩性胃炎20%, GC组93.3%,差异显着(P <0.01);在胃液DNA中依次为:慢性浅表性胃炎组0%,慢性萎缩性胃炎组12.3%, GC组76.7%,差异显着(P <0.05).癌旁组织DNA中ELMO1基因甲基化率为96.7%,与GC组比较差异不显着(P>0.05);早期GC与进展期GC患者胃液中ELMO1基因甲基化率分别为73.3%、80.0%,两者组织中ELMO1基因甲基化率分别为86.7%、100%,两者在胃液及组织中比较均无显着差异(P>0.05).结论 GC患者病理组织及胃液DNA中ELMO1基因启动子区均呈高甲基化状态,并有较高的一致性,并且在早期GC中即明显升高, ELMO1基因甲基化可作为GC早期诊断的分子靶标,并且胃液可用于ELMO1基因甲基化检测的良好临床标本.(本文来源于《世界华人消化杂志》期刊2019年17期)

李姗飞,王玲,赵慧,孙俊红,季安全[5](2019)在《DNA甲基化检测与生物物证时间关联性研究进展》一文中研究指出生物物证时间关联性涉及生物物证来源个体的年龄和生物物证的形成时间。DNA甲基化是一种重要的表观遗传标记,在个体生长、发育、衰老过程中发挥着重要作用。在人类基因组中存在有大量差异性的甲基化位点,其中一些特定DNA位点的甲基化水平与年龄呈线性相关,而另一些特定DNA甲基化位点还呈现昼夜节律变化,这些研究结果显示DNA甲基化在生物物证时间关联性方面具有潜在的应用价值。本文对常用DNA甲基化检测方法的优缺点做比较分析,并介绍基于DNA甲基化的个体年龄推断和生物物证形成时间的最新研究进展。(本文来源于《刑事技术》期刊2019年04期)

党红,杨金宇,郭炫[6](2019)在《肺癌诊断中血浆中多基因联合甲基化检测的价值》一文中研究指出目的:探讨肺癌诊断中血浆中多基因联合甲基化检测的价值。方法:选取80例肺癌患者的资料作为研究组,选取80例健康体检者为对照组,比较两组多基因检测及甲基化状态。结果:肺癌组织的CDH13、RASSF1A、RUN3基因甲基化率高于癌旁组织甲基化率(P<0.05)。研究组患者的CpG岛甲基化表型阳性率高于对照组(P<0.05)。结论:血浆中多基因联合甲基化检测在肺癌早期诊断中有重要意义。(本文来源于《中外女性健康研究》期刊2019年15期)

刘艳枚,杨梦,林金端,周鹏,陈晨[7](2019)在《SDC2基因甲基化检测在结直肠癌早期诊断中的应用》一文中研究指出目的:通过比较叁种结直肠癌筛查的方法,为结直肠癌早期诊断寻找一种非侵入性、检测性能良好的新型筛查方法。方法:收集2017年3月至2019年3月在广州医科大学第六附属医院确诊结直肠癌的153例患者的病例资料,分析SDC2基因甲基化检测、粪便潜血试验(FOBT)、血清癌胚抗原(CEA)检测叁种方法阳性检出情况。结果:153例结直肠癌患者中,SDC2基因甲基化检测阳性为114例,灰度区为9例,阴性30例,FOBT阳性78例,阴性75例,血清CEA检测阳性36例,阴性117例,SDC2基因甲基化检测阳性检出率明显高于FOBT、血清CEA检测,且SDC2阳性+灰度区检出率达到80.39%。按照结直肠癌病理和临床分期分析,原位癌、Ⅰ期、Ⅱ期、Ⅲ期结直肠癌患者中SDC2基因甲基化检测阳性检出率显着高于FOBT、血清CEA检测,Ⅳ期结直肠癌患者中SDC2基因甲基化检测阳性检出率略低于FOBT。结论:SDC2甲基化检测诊断结直肠癌及癌前病变有高的准确性,有望在结直肠癌及癌前病变早期筛查中发挥重要的作用。(本文来源于《深圳中西医结合杂志》期刊2019年14期)

胡育铭,郑阔,于冠宇,张卫[8](2019)在《结肠直肠癌早期诊断中DNA甲基化检测的研究进展》一文中研究指出结肠直肠癌(colorectal cancer, CRC)是最常见的胃肠道恶性肿瘤。每年全世界新发CRC150万例~([1-2]),在恶性肿瘤发生率位于第3位。每年死于CRC例数约60万,在癌症死因中占第3位~([2])。在全球范围内,CRC的发病率和病死率仍进一步升高。CRC起病隐匿,进展较快,病人预后与明确诊断时的临床分期密切相关。2015年我国癌症统计数据显示:我(本文来源于《外科理论与实践》期刊2019年04期)

林列坤,卢春生,郑义,杨菊红,邹继彬[9](2019)在《支气管肺泡灌洗液SHOX2和RASSF1A基因甲基化检测在临床肺癌诊断中的应用》一文中研究指出目的探讨支气管肺泡灌洗液中人矮小同源盒基因2(SHOX2)、RAS相关区域家族1A(RASSF1A)基因甲基化检测在肺癌诊断中的应用效果。方法 202例呼吸科住院患者,其中33例经组织病理诊断肺癌患者, 169例肺部良性结节疾病患者,收集所有患者支气管肺泡灌洗液,然后修饰纯化脱氧核糖核酸(DNA),进行SHOX2、RASSF1A基因甲基化检测,观察其肺泡灌洗液SHOX2、RASSF1A基因甲基化诊断肺癌敏感性、特异性及诊断准确率,并比较SHOX2、RASSF1A基因甲基化检测与细胞学诊断肺癌敏感性,比较SHOX2联合RASSF1A基因甲基化与细胞学诊断肺癌病理学四期敏感性。结果肺泡灌洗液SHOX2基因甲基化诊断敏感性为87.88%,特异性为89.35%,诊断准确率为89.11%。肺泡灌洗液RASSF1A基因甲基化诊断敏感性为81.82%,特异性为93.49%,诊断准确率为91.58%。SHOX2、RASSF1A基因甲基化诊断肺癌敏感性分别为87.88%(29/33)、81.82%(27/33),均高于细胞学的54.55%(18/33),差异具有统计学意义(P<0.05)。SHOX2联合RASSF1A基因甲基化诊断Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ期肺癌的敏感性分别为75.00%(6/8)、94.12%(16/17)、83.33%(5/6)、100.00%(2/2),细胞学诊断Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ期肺癌的敏感性分别为37.50%(3/8)、52.94%(9/17)、66.67%(4/6)、100.00%(2/2), SHOX2联合RASSF1A基因甲基化诊断Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ期肺癌的敏感性均高于细胞学诊断。其中SHOX2联合RASSF1A基因甲基化诊断Ⅱ期肺癌的敏感性高于细胞学诊断,差异具有统计学意义(P<0.05)。结论支气管肺泡灌洗液SHOX2和RASSF1A基因甲基化检测有助于肺癌的早期诊断,可以作为新型的肿瘤分子标志物。(本文来源于《中国实用医药》期刊2019年18期)

王雪亮,权静,魏萌,徐幸,孔骏[10](2019)在《血浆Septin9基因甲基化检测质控品制备及其应用》一文中研究指出目的制备可模拟临床标本的血浆Septin9基因甲基化(mSEPT9)质控品并用于室间质量评价。方法选择Septin9区域已发生/未发生甲基化的HeLa/Jurkat细胞进行培养,收集并抽提细胞基因组DNA,经mSEPT9试剂盒检测,依据检测Ct值用阴性血浆稀释分装成含有不同浓度的质控品,对质控品均匀性和稳定性进行评价后,将5个样品随机编号后发送至参评实验室,分析评价回报结果。结果抽提得到的细胞基因组DNA纯度和浓度均可满足使用需求,且可用作mSEPT9检测的质控品。均匀性和稳定性均符合中国合格评定国家认可委员会对能力验证样品要求。部分参评实验室出现假阳性和假阴性情况,仅有约55.6%实验室的检测结果(Ct值)呈良好线性相关。9家参评实验室中,7家实验室(77.8%)成绩优秀,1家实验室(11.1%)成绩合格,1家实验室(11.1%)成绩不合格。结论成功研制血浆mSEPT9检测的质控品并应用于室间质评,有利于评估并提升临床实验室检测能力。(本文来源于《临床检验杂志》期刊2019年06期)

甲基化检测法论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

目的:对疑诊肺癌患者支气管肺泡灌洗液(BALF)中SHOX2、RASSF1A基因甲基化分析,评估两指标联合检测区分肺癌与肺良性疾病的诊断效能及联合细胞学使用对肺癌的诊断价值。方法:收集276例肺部疾病患者(肺癌组131例,肺部良性疾病组145例)的BALF样本,应用PCR法检测BALF中SHOX2和RASSF1A基因甲基化,并将检测结果和Sanger测序法结果比较。结果:PCR和Sanger测序法一致性分析显示两种方法在检测SHOX2和RASSF1A基因甲基化具有良好的一致性(Kappa=0. 978,95%CI=0. 954~1. 000)。SHOX2和RASSF1A基因甲基化联合检测在肺癌组的诊断灵敏度为0. 840,高于良性疾病组(0. 193)(P <0. 001);肺癌组BALF中SHOX2、RASSF1A基因甲基化联合检测阳性率在小细胞肺癌和肺鳞癌中分别是100%和90. 9%,高于肺腺癌(66. 0%);SHOX2和RASSF1A基因甲基化联合检测阳性率在晚期肺癌高达89. 3%,明显高于早期肺癌阳性检出率。ROC曲线分析显示当SHOX2、RASSF1A基因甲基化、细胞学叁指标联合使用时进一步将诊断灵敏度提高至0. 931。结论:对BALF中SHOX2、RASSF1A基因甲基化PCR检测在肺癌诊断中有良好的灵敏度; SHOX2、RASSF1A甲基化PCR检测与细胞学联合使用可显着提高肺癌诊断灵敏度,是肺癌病理学诊断的有效补充工具。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

甲基化检测法论文参考文献

[1].徐鹏,于文强.给DNA甲基化检测装上GPS,看肿瘤细胞如何变花样[J].自然杂志.2019

[2].陈瑞英,刘雅,孙婷,刘峰辉,马小花.支气管肺泡灌洗液中SHOX2和RASSF1A基因甲基化检测对肺癌的诊断价值[J].郑州大学学报(医学版).2019

[3].李建,樊华,贺晓斌,吴耀禄,李晓勇.血浆SFRP1和Septin9基因甲基化检测对结直肠癌诊断的临床价值[J].中南医学科学杂志.2019

[4].宋健,黎萍,袁桂红,贾真,张荣琳.ELMO1基因甲基化检测在胃癌早期诊断中的价值[J].世界华人消化杂志.2019

[5].李姗飞,王玲,赵慧,孙俊红,季安全.DNA甲基化检测与生物物证时间关联性研究进展[J].刑事技术.2019

[6].党红,杨金宇,郭炫.肺癌诊断中血浆中多基因联合甲基化检测的价值[J].中外女性健康研究.2019

[7].刘艳枚,杨梦,林金端,周鹏,陈晨.SDC2基因甲基化检测在结直肠癌早期诊断中的应用[J].深圳中西医结合杂志.2019

[8].胡育铭,郑阔,于冠宇,张卫.结肠直肠癌早期诊断中DNA甲基化检测的研究进展[J].外科理论与实践.2019

[9].林列坤,卢春生,郑义,杨菊红,邹继彬.支气管肺泡灌洗液SHOX2和RASSF1A基因甲基化检测在临床肺癌诊断中的应用[J].中国实用医药.2019

[10].王雪亮,权静,魏萌,徐幸,孔骏.血浆Septin9基因甲基化检测质控品制备及其应用[J].临床检验杂志.2019

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