导读:本文包含了遗传方差分量论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献，主要关键词:遗传方差,混合线性模型(AD),生物产量
遗传方差分量论文文献综述
朱正梅,赵军华,楼肖成,吕学高[1]（2012）在《玉米自交系性状遗传力及遗传方差分量剖析》一文中研究指出用混合线性(AD)模型和MINQUE(1)法对各性状遗传力、遗传方差分量及其占总表型变异的比率进行剖析。结果显示:各性状的大多数遗传效应值都达到显着(p≤0.05)或极显着水平(p≤0.01);各遗传方差分量的效应对表型方差贡献率大小不同;各性状狭义遗传力大小为总叶片数>抽雄期>散粉期=雄穗分枝>吐丝期>生物产量>果穗鲜重>穗位高>秸秆鲜重>果穗干重>株高。(本文来源于《农业科技通讯》期刊2012年01期）
叶荣[2]（2010）在《基于Cox模型的遗传方差分量模型研究及应用》一文中研究指出复杂疾病是环境因素和遗传因素共同作用的结果。为研究复杂疾病病因,遗传流行病学首先需对疾病性状进行家庭聚集性评价。家庭成员间性状不独立是家系资料的特点。对常见数量性状和质量性状,可采用边际模型或广义线性混合效应模型解决家系内相关的问题。但如发病年龄、月经初潮等删失性状,则需要在生存分析的框架下研究,Cox模型是生存分析中应用最广泛的模型之一。经典的遗传方差分量模型将家系中各成员间复杂性状的家庭相关来源分为加性遗传随机效应、显性遗传随机效应和家庭共享环境随机效应,且通常假设随机效应服从多元正态分布。本文在Cox模型的基础上引入遗传和环境随机效应,构造包含多个随机效应的Cox遗传方差分量模型。由于随机效应服从多元正态分布,给模型参数估计时求解高维积分带来极大困难,本课题探讨了应用Laplace近似法和惩罚性似然理论来解决高维积分的困难;在R和S-Plus软件中编制程序实现了核心家系和扩展家系资料的随机效应方差协方差矩阵的设计矩阵,并利用coxme函数实现了Laplace近似的惩罚性偏似然(PPL)参数估计;同时将Cox遗传方差分量模型应用于广东顺德的原发性肝癌核心家系资料和江苏泰兴的原发性肝癌扩展家系资料,利用Laplace近似的PPL参数估计方法建立原发性肝癌发病年龄的Cox遗传方差分量模型,以说明该模型和参数估计方法的可行性。本研究旨在为遗传流行病学研究者提供一种有效的、灵活的用于评价删失性状家庭聚集性的统计分析工具。(本文来源于《广东药学院》期刊2010-05-24）
郜艳晖,张丕德,丁保国,李丽霞,姜庆五[3]（2008）在《核心家系中删失性状遗传方差分量模型的研究》一文中研究指出目的研究核心家系资料中删失性状的遗传方差分量模型,评价环境因素和遗传因素对删失性状的影响。方法应用多变量脆弱模型研究删失性状的遗传方差分量,基础模型选用Cox比例危险模型,MCMC方法用于参数估计,原发性肝癌核心家系发病年龄资料的分析说明了该方法的实际应用。结果实例分析结果符合专业解释,该模型对生存时间分布没有要求因而有更广泛的适用性。结论基于Cox回归模型的遗传方差分量模型可用于家系资料,研究生存时间资料的遗传和环境因素的作用。(本文来源于《中国卫生统计》期刊2008年05期）
郜艳晖,姜庆五,丁保国,张丕德,陈思东[4]（2008）在《原发性肝癌发病年龄的遗传方差分量模型研究》一文中研究指出目的HBV感染对原发性肝癌的家庭聚集性有很重要的影响,本研究控制HBV感染的同时,研究原发性肝癌发病年龄的遗传方差分量。方法家系资料来自2001~2002年江苏泰兴的一次原发性肝癌的病例对照家系调查,利用Cox遗传方差分量模型,分析满足方差分量模型要求的178个肝癌核心家系和184个肝癌扩展家系资料,MCMC方法用于协变量回归系数和随机效应方差分量的估计。结果不包含家庭共享环境方差的简化模型最终收敛。核心家系和扩展家系资料的遗传方差分量模型得到相似的参数估计结果,扩展家系结果显示HBsAg阳性对肝癌发病年龄的HR值为12.13(95%CI:6.94-23.03);遗传加性效应方差分量为0.076(95%CI:0.002-0.291),遗传显性效应方差分量为0.301(95%CI:0.010-1.067)。结论除HBV感染的作用外,原发性肝癌发病年龄的家庭相关还有遗传因素的作用,包括遗传加性效应和遗传显性效应/同胞共享环境因素影响肝癌的发病年龄。(本文来源于《复旦学报(医学版)》期刊2008年04期）
郜艳晖,张丕德,李丽霞,徐英,姜庆五[5]（2008）在《基于Weibull回归模型的遗传方差分量模型研究》一文中研究指出目的研究家系资料中生存时间资料的遗传方差分量模型,评价环境因素和遗传因素对删失性状的影响。方法将单随机效应的Weibull回归模型扩展到多个随机效应,建立遗传方差分量模型,运用MCMC的方法进行参数估计,通过模拟研究说明参数估计的准确性。结果模拟研究表明该方法可得到近似无偏的参数估计。结论基于Weibull回归模型的遗传方差分量模型可用于家系资料,研究生存时间资料的遗传和环境因素的作用。(本文来源于《中国卫生统计》期刊2008年03期）
郜艳晖,李丽霞,张丕德,陈思东,姜庆五[6]（2007）在《核心家系中质量性状遗传方差分量模型的研究》一文中研究指出目的研究核心家系中带协变量的质量性状的遗传方差分量模型,定量地评价遗传因素和环境因素对质量性状的作用。方法将广义线性混合模型应用于核心家系资料建立遗传方差分量模型,运用MCMC方法进行参数估计。结果模拟研究表明大样本时MCMC法可得到近似无偏的参数估计。结论该方法可应用于家系资料,分析遗传因素和环境因素对质量表型的影响大小。(本文来源于《中国卫生统计》期刊2007年03期）
梁文科,张世煌,戚廷香,邱法展,庹洪章[7]（2006）在《热带温带玉米群体产量性状遗传力及遗传方差分量的剖析》一文中研究指出【目的】评估2个热带群体和7个温带群体的育种价值,并在这些群体之间寻找新的杂种优势模式,为利用这些种质提供有用的科学信息。【方法】采用9个群体的双列杂交设计,得到36个杂交组合;2002～2003年分别在河南省安阳和湖北省十堰进行田间鉴定,获取产量相关性状的试验数据,用混合线性(AD)模型和MINQUE(1)法(minimum norm quadratic unbiased estimation,最小范数二阶无偏估算法)对各性状遗传力、遗传方差分量及其占总表型变异的比率、群体的加性遗传效应和显性遗传效应进行剖析。【结果】联合分析结果显示:各性状的大多数遗传效应值都达到显着(P≤0.05)或极显着水平(P≤0.01)。各遗传方差分量的效应对小区产量贡献大小是显性>显性与环境互作>加性与环境互作>加性;各性状狭义遗传力大小为穗行数>行粒数>穗长>出籽率>百粒重>小区产量,加性效应最好的4个群体是Suwan1(31.69)、Stay green c4(25.44),WBM C4(14.15)和中综4号(10.29);而显性效应比较好的4个组合为3×6(883.65)、1×3(572.20)、1×2(404.2376)和6×7(384.59)。【结论】在温带玉米育种中Suwan1和Stay green c4是最有利用价值的外来种质,它们都与BSSS C9构成杂种优势模式。在育种实践中,可以把Suwan1和Stay green c4杂交重组,并与BSSS C9构成一对温带和热带种质的杂种优势模式,可以进一步进行相互轮回选择。(本文来源于《中国农业科学》期刊2006年11期）
梁文科,戚廷香,庹洪章,邱法展,刘永忠[8]（2004）在《热带温带玉米群体产量性状遗传力及遗传方差分量的剖析》一文中研究指出采用混合线性(AD)模型,和MINQUE(1)法(Minimum Norm Quadratic Unbiased Estimation,最小范数二阶无偏估算法)分析了9个热带亚(温)带玉米群体2年2点双列杂交设计的非平衡数据,对穗部各性状的遗传方差分量和遗传力进行了剖析;用AUP法预测它们的遗传效应值;而方差分量估计值及其标准误用Jackknife的方法对试验区组进行抽样获得;并估算了各亲本群体的加性效应和各组合的显性效应;了解和评估其育种价值。以保证在育种实践中有效地组织这些热带温带玉米种质所提供的有利等位基因。(本文来源于《2004全国玉米种质扩增、改良、创新与分子育种学术会议论文集》期刊2004-06-30）
郜艳晖,姜庆五,孟炜,陈启明,赵耐青[9]（2003）在《REML法和MCMC法在数量性状核心家系遗传方差分量模型中参数估计的比较》一文中研究指出目的 比较限制性最大似然估计(REML)和马尔可夫链蒙特卡罗(MCMC)方法在数量性状遗传方差分量模型中参数估计的偏差和精度。方法 计算机模拟50个数量性状核心家系数据集,运用SAS软件中的PROC MIXED程序和WinBUGS软件进行参数估计,比较不同样本含量时两法参数估计结果。结果 在本试验参数指定条件下,对固定效应参数,两法估计的相对偏差低于2％;对随机效应,估计偏差较高。小样本时,MCMC法估计结果比REML法更接近真值。结论 在模拟数量性状方差分量模型时,大样本家系资料可根据实际情况选用两法;小样本家系资料,MCMC法可得到比REML法更稳健的估计,推荐使用。(本文来源于《复旦学报(医学版)》期刊2003年04期）
郜艳晖,姜庆五,孟炜,陈启明,沈福民[10]（2003）在《核心家系中数量性状遗传方差分量模型的研究》一文中研究指出目的 研究核心家系中带协变量的数量性状的遗传方差分量模型 ,探索数量性状的遗传因素和环境因素作用大小的分析方法。方法 将线性混合模型应用于核心家系资料 ,根据核心家系成员的遗传关系建立遗传方差分量模型 ,运用SAS软件中的Mixed模块和WinBUGS软件进行参数估计 ,分析各影响因素作用大小。结果 模拟研究表明REML法和MCMC法都可得到近似无偏的参数估计。REML法计算耗时较少 ,但该法对各参数的区间估计具有一定的局限性 ,而MCMC法可方便地得到各参数的可信区间。结论 该模型可应用于实际家系资料 ,分析遗传因素和环境因素对数量表型的影响大小(本文来源于《中国卫生统计》期刊2003年01期）
遗传方差分量论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
复杂疾病是环境因素和遗传因素共同作用的结果。为研究复杂疾病病因,遗传流行病学首先需对疾病性状进行家庭聚集性评价。家庭成员间性状不独立是家系资料的特点。对常见数量性状和质量性状,可采用边际模型或广义线性混合效应模型解决家系内相关的问题。但如发病年龄、月经初潮等删失性状,则需要在生存分析的框架下研究,Cox模型是生存分析中应用最广泛的模型之一。经典的遗传方差分量模型将家系中各成员间复杂性状的家庭相关来源分为加性遗传随机效应、显性遗传随机效应和家庭共享环境随机效应,且通常假设随机效应服从多元正态分布。本文在Cox模型的基础上引入遗传和环境随机效应,构造包含多个随机效应的Cox遗传方差分量模型。由于随机效应服从多元正态分布,给模型参数估计时求解高维积分带来极大困难,本课题探讨了应用Laplace近似法和惩罚性似然理论来解决高维积分的困难;在R和S-Plus软件中编制程序实现了核心家系和扩展家系资料的随机效应方差协方差矩阵的设计矩阵,并利用coxme函数实现了Laplace近似的惩罚性偏似然(PPL)参数估计;同时将Cox遗传方差分量模型应用于广东顺德的原发性肝癌核心家系资料和江苏泰兴的原发性肝癌扩展家系资料,利用Laplace近似的PPL参数估计方法建立原发性肝癌发病年龄的Cox遗传方差分量模型,以说明该模型和参数估计方法的可行性。本研究旨在为遗传流行病学研究者提供一种有效的、灵活的用于评价删失性状家庭聚集性的统计分析工具。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
遗传方差分量论文参考文献
[1].朱正梅,赵军华,楼肖成,吕学高.玉米自交系性状遗传力及遗传方差分量剖析[J].农业科技通讯.2012
[2].叶荣.基于Cox模型的遗传方差分量模型研究及应用[D].广东药学院.2010
[3].郜艳晖,张丕德,丁保国,李丽霞,姜庆五.核心家系中删失性状遗传方差分量模型的研究[J].中国卫生统计.2008
[4].郜艳晖,姜庆五,丁保国,张丕德,陈思东.原发性肝癌发病年龄的遗传方差分量模型研究[J].复旦学报(医学版).2008
[5].郜艳晖,张丕德,李丽霞,徐英,姜庆五.基于Weibull回归模型的遗传方差分量模型研究[J].中国卫生统计.2008
[6].郜艳晖,李丽霞,张丕德,陈思东,姜庆五.核心家系中质量性状遗传方差分量模型的研究[J].中国卫生统计.2007
[7].梁文科,张世煌,戚廷香,邱法展,庹洪章.热带温带玉米群体产量性状遗传力及遗传方差分量的剖析[J].中国农业科学.2006
[8].梁文科,戚廷香,庹洪章,邱法展,刘永忠.热带温带玉米群体产量性状遗传力及遗传方差分量的剖析[C].2004全国玉米种质扩增、改良、创新与分子育种学术会议论文集.2004
[9].郜艳晖,姜庆五,孟炜,陈启明,赵耐青.REML法和MCMC法在数量性状核心家系遗传方差分量模型中参数估计的比较[J].复旦学报(医学版).2003
[10].郜艳晖,姜庆五,孟炜,陈启明,沈福民.核心家系中数量性状遗传方差分量模型的研究[J].中国卫生统计.2003
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