张毅:猪圆环病毒2型四川分离株全基因组进化分析论文

张毅:猪圆环病毒2型四川分离株全基因组进化分析论文

本文主要研究内容

作者张毅,陈斌,梁璐琪,邵靓,邓飞,丁梦蝶,陈弟诗,谢嘉宾(2019)在《猪圆环病毒2型四川分离株全基因组进化分析》一文中研究指出:为了调查四川地区猪圆环病毒2型(PCV-2)流行毒株的遗传多样性,试验对2017年于四川省12个地区分离的28株PCV-2进行全基因组扩增和测序分析,应用Lasergene 7.0和MEGA 6.0软件对分离株的全基因组序列进行比对并构建系统进化树,使用Clustal W方法对ORF2核苷酸和Cap蛋白氨基酸进行比对,并对Cap蛋白型特异性基序及抗原表位的突变情况进行比较分析。结果表明:28株PCV-2四川分离株与参考株之间的同源性为93.9%~99.9%;在进化关系上,3株为PCV-2b基因亚型,24株为PCV-2d基因亚型,1株为重组毒株;PCV-2四川分离株ORF2核苷酸与参考株之间同源性为88.6%~100%,氨基酸同源性为85.9%~100%;PCV-2四川分离株的Cap蛋白型特异性基序及抗原表位在各自亚型内较为保守,在B细胞表位和T细胞表位分别发现9处、2处氨基酸替换,其中位于122 aa和169 aa处的突变值得注意。说明2017年四川省流行的PCV-2以PCV-2d亚型为主,也存在少数的PCV-2b亚型毒株,各亚型毒株变异程度较小,但也存在少量关键位置的氨基酸替换,另外还发现四川省存在PCV-2重组毒株。

Abstract

wei le diao cha si chuan de ou zhu yuan huan bing du 2xing (PCV-2)liu hang du zhu de wei chuan duo yang xing ,shi yan dui 2017nian yu si chuan sheng 12ge de ou fen li de 28zhu PCV-2jin hang quan ji yin zu kuo zeng he ce xu fen xi ,ying yong Lasergene 7.0he MEGA 6.0ruan jian dui fen li zhu de quan ji yin zu xu lie jin hang bi dui bing gou jian ji tong jin hua shu ,shi yong Clustal Wfang fa dui ORF2he gan suan he Capdan bai an ji suan jin hang bi dui ,bing dui Capdan bai xing te yi xing ji xu ji kang yuan biao wei de tu bian qing kuang jin hang bi jiao fen xi 。jie guo biao ming :28zhu PCV-2si chuan fen li zhu yu can kao zhu zhi jian de tong yuan xing wei 93.9%~99.9%;zai jin hua guan ji shang ,3zhu wei PCV-2bji yin ya xing ,24zhu wei PCV-2dji yin ya xing ,1zhu wei chong zu du zhu ;PCV-2si chuan fen li zhu ORF2he gan suan yu can kao zhu zhi jian tong yuan xing wei 88.6%~100%,an ji suan tong yuan xing wei 85.9%~100%;PCV-2si chuan fen li zhu de Capdan bai xing te yi xing ji xu ji kang yuan biao wei zai ge zi ya xing nei jiao wei bao shou ,zai Bxi bao biao wei he Txi bao biao wei fen bie fa xian 9chu 、2chu an ji suan ti huan ,ji zhong wei yu 122 aahe 169 aachu de tu bian zhi de zhu yi 。shui ming 2017nian si chuan sheng liu hang de PCV-2yi PCV-2dya xing wei zhu ,ye cun zai shao shu de PCV-2bya xing du zhu ,ge ya xing du zhu bian yi cheng du jiao xiao ,dan ye cun zai shao liang guan jian wei zhi de an ji suan ti huan ,ling wai hai fa xian si chuan sheng cun zai PCV-2chong zu du zhu 。

论文参考文献

  • [1].猪圆环病毒2型吉林分离株全基因组的克隆与序列分析[J]. 杨博超,王凤雪,温永俊,李建喜,杨志强,武华.  动物医学进展.2013(02)
  • [2].猪圆环病毒2型分离株优势基因型分析与检测[J]. 郭抗抗,张彦明,张红,刘华科,宁蓬勃,王晶钰.  中国预防兽医学报.2010(10)
  • [3].猪圆环病毒2型201105ZJ分离株的遗传变异分析(英文)[J]. 王小敏,何孔旺,汪伟,周忠涛,杨光远,茅爱华,俞正玉,倪艳秀.  Agricultural Science & Technology.2014(11)
  • [4].猪圆环病毒2型广东分离株的基因序列分析[J]. 张梦珂,杜柏槐,陈绍红,刘铀.  西南农业学报.2018(08)
  • [5].6株猪圆环病毒2型流行毒株全基因组克隆及序列分析[J]. 黄伟坚,连慧香,尹业师,屈素洁,李军,余克伦,罗廷荣,陆芹章,刘芳.  动物医学进展.2006(07)
  • [6].猪圆环病毒2型滨州分离株全基因组的克隆与序列分析[J]. 张文通,李峰,魏凤,苗立中,吴家强,沈志强.  动物医学进展.2015(09)
  • [7].猪圆环病毒2型辽宁分离株基因序列分析[J]. 赵爱华,于长泳,崔基贤.  现代畜牧兽医.2011(12)
  • [8].猪圆环病毒2型辽宁株全基因组克隆与序列分析[J]. 隋昀原,荣柳,陈美君,朱耀才,沈国顺.  中国畜牧兽医.2013(11)
  • [9].猪圆环病毒2型青海分离株的分子鉴定及进化分析[J]. 赵玉清.  中国动物检疫.2018(09)
  • [10].六株猪圆环病毒2型国内分离株的全基因组序列测定与分析[J]. 王忠田,郭鑫,杨汉春,查振林,陈艳红.  农业生物技术学报.2005(01)
  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自黑龙江畜牧兽医的张毅,陈斌,梁璐琪,邵靓,邓飞,丁梦蝶,陈弟诗,谢嘉宾,发表于刊物黑龙江畜牧兽医2019年13期论文,是一篇关于猪圆环病毒型论文,四川分离株论文,全基因组论文,遗传进化分析论文,重组论文,黑龙江畜牧兽医2019年13期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自黑龙江畜牧兽医2019年13期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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