导读:本文包含了短串联重复序列分析论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献，主要关键词:短串联重复序列(STR),遗传多态性,法医学,河南
短串联重复序列分析论文文献综述
王海丽,张静,钱文莉[1]（2019）在《河南地区汉族人群20个短串联重复序列位点遗传多态性分析》一文中研究指出目的探讨河南地区汉族人群CSF1PO、D12S391、D13S317、D16S539、D18S51、D19S433、D1S1656、D21S11、D2S1338、D3S1358、D5S818、D6S1043、D7S820、D8S1179、FGA、Penta D、Penta E、TH01、TPOX、vWA共20个短串联重复序列(STR)位点的遗传多态性分布情况。方法选取河南地区无血缘关系汉族个体94例,其中男性46例,女性48例;年龄18～40岁,平均年龄29岁。用磁珠法提取受试者的外周血DNA样本,采用多重聚合酶链反应扩增技术和荧光检测技术对20个常染色体STR基因座进行复合扩增,并使用ABI 3500遗传分析仪进行基因分型。GeneMapper v3.2软件进行等位基因数据分析。结果 20个STR位点的基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡,具有群体代表性(P> 0.05)。20个STR位点的个体识别率、多态性信息含量、非父排除率、杂合度分别为0.785 2～0.978 6、0.547 9～0.916 6、0.296 2～0.775 3、0.604 4～0.890 1,其中Penta E位点的个体识别率和非父排除率最高,分别为0.978 6和0.775 3。20个STR位点的累计个体识别率和累计非父排除率均> 99.999 999%。结论 20个STR位点在河南地区汉族人群中具有群体代表性,且其具有较高的个体识别率和非父排除率,在法医学和群体遗传学研究中具有一定的应用价值。Penta E位点具有高度个体识别能力和鉴别能力,可作为核心位点用于法医个体识别和亲权关系鉴定中。(本文来源于《生物医学工程与临床》期刊2019年06期）
王磊,陈琼城,胡璐璐,邱亚群,林一曼[2]（2019）在《深圳地区致泻性大肠埃希菌多位点可变数目串联重复序列分析分型方法的研究》一文中研究指出目的通过比较多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)和脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型方法,探索更优的致泻性大肠埃希菌(DEC)的快速溯源方法。方法本研究采用筛选的可变数目串联重复序列(VNTR)位点,对DEC菌株进行MLVA分型,并将该方法与金标准PFGE进行比较评估。结果 PFGE分型方法将58株DEC分为43种带型,其中3种带型成簇,多样性指数(DI)值为0.965。MLVA分型方法将58株菌分为42种带型,4种型别成簇,DI值为0.955。此外,2种方法对2起暴发菌株的分型结果一致。结论 MLVA方法与PFGE方法对深圳地区的58株DEC菌株的分型能力差异无统计学意义,但MLVA具有快速、简便、通量高的特点,使得MLVA优于PFGE分型方法,在疾病监测、疾病暴发调查中将会发挥重要的应用价值。(本文来源于《疾病监测》期刊2019年10期）
黄惠妮,何保仁,刘学军,裴永峰,李恒聪[3]（2019）在《应用性别基因座Amelogenin短串联重复序列荧光分析进行亲子鉴定检出克氏综合征1例》一文中研究指出本所在采用短串联重复序列(STR)基因分型技术对一对父子进行亲子鉴定分析发现,争议父与子的9个遗传位点不符合孟德尔遗传规律,排除亲生血缘关系。同时发现,争议父的STR分型图上性别基因座分型异常,经细胞染色体核型分析证实,争议父为克氏综合征患者。(本文来源于《内科》期刊2019年05期）
李莉,田士林,宋丽,姜俊,王勇[4]（2019）在《Ccs基因启动子串联重复序列5′端缺失体表达分析》一文中研究指出以R15辣椒、micro-Tom番茄为试材,采用GUS基因瞬时表达分析、转基因技术结合PlantCARE软件分析,探讨Ccs基因启动子串联重复序列5′端缺失体的活性及功能,测定缺失体转基因植株在不同逆境条件下的响应。结果表明:具有启动活性的最短启动子5′端缺失体长度为151bp,干旱和高温胁迫下转基因植株中的GUS报告基因活性增强,而遮阴胁迫下GUS报告基因活性略微有所降低。(本文来源于《扬州大学学报(农业与生命科学版)》期刊2019年01期）
冯富鹏,牛越,陈鹏[5]（2018）在《新疆地区AR基因CAG、GGC及POLG基因CAG短串联重复序列多态性与睾丸生殖细胞肿瘤相关性分析》一文中研究指出睾丸生殖细胞肿瘤(testicular germ cell tumor,TGCT)是20～40岁青壮年男性较常见的恶性肿瘤,占男性肿瘤的1%～1. 5%,占所有泌尿生殖系统肿瘤的5%,近年来发病率有增高趋势~([1])。然而,TGCT的发病机制目前尚未阐明,最新研究表明遗传因素在TGCT发病过程中起重要作用~([2])。目前确定的危险因素有:隐睾、TGCT家族史、睾丸萎缩、不(本文来源于《中华男科学杂志》期刊2018年10期）
樊金萍,袁宝珠[6]（2018）在《用于鉴别猴源细胞及其交叉污染短串联重复序列图谱分析方法的建立》一文中研究指出目的建立用于鉴别猴源细胞及其交叉污染的短串联重复序列(Short Tandem Repeat,STR)图谱分析方法。方法选择可用于猴源细胞鉴别的10个STR位点,采用PCR-毛细管电泳分析方法分别检测猴源、人源、鼠源细胞及猴源细胞交叉污染模型细胞中的10个STR位点,并验证方法的特异性及稳定性。同时对5家不同受检单位生产用的Vero细胞进行STR图谱分析。结果 STR图谱分析法可为每一个独立的猴源细胞系提供独特的STR图谱,并能有效判断猴源细胞与其他细胞间的交叉污染,且特异性及稳定性较高。采用该方法检测的5株不同受检单位生产用的Vero细胞均未发生污染。结论建立的STR图谱分析方法具有良好的特异性和稳定性,可用于不同猴源细胞系的鉴别和有效判断相关细胞间交叉污染。(本文来源于《中国生物制品学杂志》期刊2018年08期）
罗世强,严提珍,许泽辉,王秋华,钟青燕[7]（2016）在《短串联重复序列叁带型等位基因的遗传多态性分析》一文中研究指出目的观察亲子鉴定常用STR基因座的叁带型现象,分析探讨其特点。方法用Chelex法提取18688个亲子鉴定个体样本血液中的基因组DNA,利用美国ABI公司Amp FISTRR?Identifiler TM plus试剂盒进行复合荧光PCR扩增确定STR基因型,若出现异常峰型则采用Power Plex?21系统进行复查验证,对于13、18、21号染色体基因座出现异常峰型的个体进一步进行染色体核型分析。结果 7个个案在D21S11、D18S51和FGA基因座上出现叁带型等位基因(均属于I型)现象,叁带型的检出总频率为0.0375%,其中D21S11检出率最高,为0.0214%;D18S51检出率为0.0107%);FGA检出率为0.0054%。D21S11和D18S51叁带型等位基因个体经染色体核型分析未发现叁体综合征。结论在亲子鉴定检案中叁带型等位基因现象极为少见,判读须慎重。在PCR-STR分型中,叁体症患者、嵌合体、发生肿瘤病变的组织或细胞、体内有供者细胞生长的骨髓移植或脐血移植受者均可能检出叁带型等位基因,应用不同试剂盒加以验证非常有必要,如怀疑叁体综合征还应做染色体核型分析。(本文来源于《中华医学会第十五次全国医学遗传学学术会议暨中国医师协会医学遗传医师分会第一届全国学术会议暨2016年浙江省医学遗传学年会论文汇编》期刊2016-11-05）
靳婵婵,贺静,王蕾,陈鹏,杨继青[8]（2016）在《云南汉族15个短串联重复序列基因座遗传多态性特征及分析》一文中研究指出目的:调查云南地区汉族的D8S1179、D21S11、D7S820、CSF1PO、D3S1358、TH01、D13S317、D16S539、D2S1338、D19S433、VWA、TPOX、D18S51、D5S818、FGA 15个短串联重复序列(Short tandem repeat,STR)基因座的遗传多态性。方法:收集云南汉族313名无关个体血样,提取DNA,PCR复合扩增并利用ABI-3130型基因分析仪进行毛细管电泳检测每个样本各基因座的等位基因大小,分别统计每个STR基因座各基因型的频率,并进行Hardy-Weinberg遗传平衡检验。结果:云南汉族这15个STR基因座各基因型频率分布符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05),杂合度在0.636~0.901,匹配概率在0.034~0.220,单一STR位点的个体识别率在0.780~0.966、非父排除率在0.336~0.797、多态性信息总量在0.555~0.860,联合使用这15个位点所产生的累积个体识别率大于0.999 999 99,累积非父排除率等于0.999 998 408。与中国其他地区汉族群体这15个STR基因座等位基因频率分布相比有较高的相似性,但也有轻微的地区差异。结论:云南汉族的D8S1179、D21S11、D7S820、CSF1PO、D3S1358、TH01、D13S317、D16S539、D2S1338、D19S433、VWA、TPOX、D18S51、D5S818、FGA这15个STR基因座具有高度的多态性,与中国其他地区汉族群体有较高的相似性,在法医学中的亲子鉴定和个人识别方面具有较高应用价值。(本文来源于《中国免疫学杂志》期刊2016年10期）
焦保权,吴小华,张洁[9]（2016）在《15个短串联重复序列在河北部分地区汉族群体的遗传多态性分析》一文中研究指出目的:研究PowerplexTM 16荧光标记复合扩增系统的15个短串联重复序列(simple tandem repeats,STR)在河北中南部地区25 295例汉族个体的多态性分布,建立河北中南部地区汉族群体的遗传学基础数据。方法:采用Chelex-100法应用Powerplex TM 16荧光标记复合扩增系统和ABI 3130遗传分析仪对25 295例河北中南部地区汉族个体血样DNA进行检测,统计计算15个STR基因座的基因型分布,基因频率,杂合度(heterozygosity,Ho),多态信息量(polymorphism information contents,PIC),个体识别率(discrimination power,DP),非父排除率(probability of paternity exclusion,PE)等群体遗传学参数,并进行Handy-Weinberg平衡检验。结果:15个基因座在群体中具有较高多态性,基因型分布均符合Handy-Weinberg平衡定律(P>0.05)。共检测出293个等位基因,1364种基因型,基因频率在0.002%~51.58%之间,杂合度(Ho)在0.6206~0.9146之间,多态信息量(PIC)在0.5610~0.8967之间,累积个人识别率(cumulative individual discrimination power,CDP)为0.999 999 999 999 999 996 156,累积非父排除率(cumulative probability of paternity exclusion,CPE)为0.999 999 663。结论:Powerplex TM 16荧光标记复合扩增系统的15个STR基因座适合作为河北中南部汉族群体的遗传标记。通过大量样本实验,首次得到了客观可靠的河北中南部地区汉族群体15个STR基因座群体遗传资料,为遗传疾病连锁分析、法医学亲权鉴定和个体识别等领域研究提供基础数据。(本文来源于《中国优生与遗传杂志》期刊2016年09期）
胡萌[10]（2016）在《中原汉族Y染色体短串联重复序列的遗传多态性分析》一文中研究指出Y染色体特异区呈父系单倍型遗传,其基因标记是近年来遗传学的研究热点。本研究应用27个荧光标记Y染色体STR基因座复合扩增系统,对中原地区汉族3 951名男性无关个体进行Y染色体短串联重复序列遗传多态性研究,以获得中原汉族人群的遗传信息。结果显示27个Y-STR基因座在中原地区汉族3 951名男性无关个体中检出3 944种单倍型,单倍型多样性为0.999 683,单倍型数目最多的两个基因座分别是DYS385和DYF387S1,分别检出95种和65种单倍型,其余基因座分别检出5~19种单倍型。27个基因座的基因多样性在0.377 2~0.969 1之间,累计基因多态性达0.999 999。同时将DYS385、DYS391和DYS438这3个基因座的基因多样性和湖南、湖北、浙江、广州、辽宁、闽南汉族及广西彝族进行比较分析。据本研究结果可知27个Y-STR基因座在中原汉族人群中具有丰富的遗传多态性,其数据为群体遗传学研究、法医学应用及Y-STR数据库建设提供数据支撑。(本文来源于《基因组学与应用生物学》期刊2016年08期）
短串联重复序列分析论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
目的通过比较多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)和脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型方法,探索更优的致泻性大肠埃希菌(DEC)的快速溯源方法。方法本研究采用筛选的可变数目串联重复序列(VNTR)位点,对DEC菌株进行MLVA分型,并将该方法与金标准PFGE进行比较评估。结果 PFGE分型方法将58株DEC分为43种带型,其中3种带型成簇,多样性指数(DI)值为0.965。MLVA分型方法将58株菌分为42种带型,4种型别成簇,DI值为0.955。此外,2种方法对2起暴发菌株的分型结果一致。结论 MLVA方法与PFGE方法对深圳地区的58株DEC菌株的分型能力差异无统计学意义,但MLVA具有快速、简便、通量高的特点,使得MLVA优于PFGE分型方法,在疾病监测、疾病暴发调查中将会发挥重要的应用价值。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
短串联重复序列分析论文参考文献
[1].王海丽,张静,钱文莉.河南地区汉族人群20个短串联重复序列位点遗传多态性分析[J].生物医学工程与临床.2019
[2].王磊,陈琼城,胡璐璐,邱亚群,林一曼.深圳地区致泻性大肠埃希菌多位点可变数目串联重复序列分析分型方法的研究[J].疾病监测.2019
[3].黄惠妮,何保仁,刘学军,裴永峰,李恒聪.应用性别基因座Amelogenin短串联重复序列荧光分析进行亲子鉴定检出克氏综合征1例[J].内科.2019
[4].李莉,田士林,宋丽,姜俊,王勇.Ccs基因启动子串联重复序列5′端缺失体表达分析[J].扬州大学学报(农业与生命科学版).2019
[5].冯富鹏,牛越,陈鹏.新疆地区AR基因CAG、GGC及POLG基因CAG短串联重复序列多态性与睾丸生殖细胞肿瘤相关性分析[J].中华男科学杂志.2018
[6].樊金萍,袁宝珠.用于鉴别猴源细胞及其交叉污染短串联重复序列图谱分析方法的建立[J].中国生物制品学杂志.2018
[7].罗世强,严提珍,许泽辉,王秋华,钟青燕.短串联重复序列叁带型等位基因的遗传多态性分析[C].中华医学会第十五次全国医学遗传学学术会议暨中国医师协会医学遗传医师分会第一届全国学术会议暨2016年浙江省医学遗传学年会论文汇编.2016
[8].靳婵婵,贺静,王蕾,陈鹏,杨继青.云南汉族15个短串联重复序列基因座遗传多态性特征及分析[J].中国免疫学杂志.2016
[9].焦保权,吴小华,张洁.15个短串联重复序列在河北部分地区汉族群体的遗传多态性分析[J].中国优生与遗传杂志.2016
[10].胡萌.中原汉族Y染色体短串联重复序列的遗传多态性分析[J].基因组学与应用生物学.2016
标签：短串联重复序列(STR); 遗传多态性; 法医学; 河南;