郝文文:鸡StAR基因非同义单核苷酸多态性的生物信息学分析论文

郝文文:鸡StAR基因非同义单核苷酸多态性的生物信息学分析论文

本文主要研究内容

作者郝文文,张贝,任一帆,孟婕,张健,耿立英,张传生,李祥龙(2019)在《鸡StAR基因非同义单核苷酸多态性的生物信息学分析》一文中研究指出:以鸡StAR基因为研究对象,在分子水平上探究StAR编码区功能性位点。利用SIFT,PolyPhen-2,PANTHER和PROVEAN等4种方法预测对nsSNPs进行分析预测有害位点,使用SWISS-MODEL, Consurf server,Pymol,I-Mutant 3.0等软件对有害nsSNPs位点进行蛋白质的空间结构、氨基酸间氢键的改变及蛋白稳定性等相关分析。结果表明:从StAR基因的nsSNPs位点筛选出来6个主要有害突变(V125G,M144R,N148T,T204P,C224W和L247Q)。其中,M144R,N148T和T204P这3个位点氢键数目和空间结构发生变化,M144R,N148T,C224W和L247Q这4个位点降低了StAR蛋白质的稳定性,且M144R,N148T,T204P,C224W和L247Q均为高保守性位点。预测M144R,N148T,T204P,C224W和L247Q这5个位点可能为鸡StAR基因的潜在功能性位点。

Abstract

yi ji StARji yin wei yan jiu dui xiang ,zai fen zi shui ping shang tan jiu StARbian ma ou gong neng xing wei dian 。li yong SIFT,PolyPhen-2,PANTHERhe PROVEANdeng 4chong fang fa yu ce dui nsSNPsjin hang fen xi yu ce you hai wei dian ,shi yong SWISS-MODEL, Consurf server,Pymol,I-Mutant 3.0deng ruan jian dui you hai nsSNPswei dian jin hang dan bai zhi de kong jian jie gou 、an ji suan jian qing jian de gai bian ji dan bai wen ding xing deng xiang guan fen xi 。jie guo biao ming :cong StARji yin de nsSNPswei dian shai shua chu lai 6ge zhu yao you hai tu bian (V125G,M144R,N148T,T204P,C224Whe L247Q)。ji zhong ,M144R,N148The T204Pzhe 3ge wei dian qing jian shu mu he kong jian jie gou fa sheng bian hua ,M144R,N148T,C224Whe L247Qzhe 4ge wei dian jiang di le StARdan bai zhi de wen ding xing ,ju M144R,N148T,T204P,C224Whe L247Qjun wei gao bao shou xing wei dian 。yu ce M144R,N148T,T204P,C224Whe L247Qzhe 5ge wei dian ke neng wei ji StARji yin de qian zai gong neng xing wei dian 。

论文参考文献

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  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自河北科技师范学院学报的郝文文,张贝,任一帆,孟婕,张健,耿立英,张传生,李祥龙,发表于刊物河北科技师范学院学报2019年03期论文,是一篇关于基因论文,非同义论文,蛋白质高级结构论文,河北科技师范学院学报2019年03期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自河北科技师范学院学报2019年03期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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