谢开会:合作猪IFN-β基因编码区克隆及生物信息学分析论文

谢开会:合作猪IFN-β基因编码区克隆及生物信息学分析论文

本文主要研究内容

作者谢开会,王伟,杨姣姣,闫尊强,杨巧丽,滚双宝(2019)在《合作猪IFN-β基因编码区克隆及生物信息学分析》一文中研究指出:克隆合作猪干扰素β(Interferon-beta, IFN-β)基因的编码区序列(Coding region sequence, CDS),预测分析其结构与功能。以NCBI/GenBank中猪IFN-β(登录号:NM001003923.1)的序列设计特异性引物,通过TA克隆技术得到合作猪 IFN-β基因完整CDS区,用生物信息学方法对其进行分析。结果表明,合作猪 IFN-β基因CDS区全长561 bp,编码186个氨基酸,与参考序列相比,其编码区的第177位点处的C突变为T,为同义突变。分子质量约为21.95 ku,理论等电点(PI)为4.93,不稳定系数为62.91,平均疏水性为-0.172;二级结构主要由α-螺旋和无规则卷曲构成,三级结构与二级结构预测基本一致。合作猪与巴马猪、梅山猪和疣猪 IFN-β核酸序列的相似性为99.47%、99.82%和98.75%。进化树结果表明,合作猪与梅山猪亲缘关系最近。合作猪IFN-β属于干扰素ab超家族,是不稳定的酸性亲水性蛋白,含有信号肽和跨膜区。

Abstract

ke long ge zuo zhu gan rao su β(Interferon-beta, IFN-β)ji yin de bian ma ou xu lie (Coding region sequence, CDS),yu ce fen xi ji jie gou yu gong neng 。yi NCBI/GenBankzhong zhu IFN-β(deng lu hao :NM001003923.1)de xu lie she ji te yi xing yin wu ,tong guo TAke long ji shu de dao ge zuo zhu IFN-βji yin wan zheng CDSou ,yong sheng wu xin xi xue fang fa dui ji jin hang fen xi 。jie guo biao ming ,ge zuo zhu IFN-βji yin CDSou quan chang 561 bp,bian ma 186ge an ji suan ,yu can kao xu lie xiang bi ,ji bian ma ou de di 177wei dian chu de Ctu bian wei T,wei tong yi tu bian 。fen zi zhi liang yao wei 21.95 ku,li lun deng dian dian (PI)wei 4.93,bu wen ding ji shu wei 62.91,ping jun shu shui xing wei -0.172;er ji jie gou zhu yao you α-luo xuan he mo gui ze juan qu gou cheng ,san ji jie gou yu er ji jie gou yu ce ji ben yi zhi 。ge zuo zhu yu ba ma zhu 、mei shan zhu he you zhu IFN-βhe suan xu lie de xiang shi xing wei 99.47%、99.82%he 98.75%。jin hua shu jie guo biao ming ,ge zuo zhu yu mei shan zhu qin yuan guan ji zui jin 。ge zuo zhu IFN-βshu yu gan rao su abchao jia zu ,shi bu wen ding de suan xing qin shui xing dan bai ,han you xin hao tai he kua mo ou 。

论文参考文献

  • [1].感染豆状囊尾蚴家兔血清中IL-10与IFN-γ水平检测研究[J]. 许敬东,冉学丽,孙晓林.  中兽医医药杂志.2017(01)
  • [2].重组大熊猫IFN-γ聚氰基丙烯酸正丁酯纳米球的制备与评价[J]. 杨莎莎,徐志文,王承东,李才武,朱玲,周远成,李新琼,温安祥,李德生.  动物学杂志.2017(02)
  • [3].梅花鹿IFN-β1基因的克隆与分子进化分析[J]. 苏凤艳,李哲,刘存发,宗颖,曾范利,王全凯.  畜牧与兽医.2014(01)
  • [4].polyI:C促进小鼠蜕膜基质细胞死亡和IFN-β的表达[J]. 姜贵梅,雷倩倩,许映雪,杜崇涛,韩文瑜,杨勇军,陈巍.  生命科学研究.2014(02)
  • [5].多浪羊IFN-γ基因克隆及核苷酸序列分析[J]. 左文斌,潘辉,李莲瑞.  塔里木大学学报.2011(02)
  • [6].秦岭大熊猫IFN-γ基因的表达及其生物活性分析[J]. 朱辉,马清义,乔琪,朱小甫,陈德坤.  西北农林科技大学学报(自然科学版).2009(12)
  • [7].小型猪外周血单个核细胞产生IFN-γ频率研究[J]. 魏静,李晋涛,张小萍,吴玉章.  中国预防兽医学报.2008(12)
  • [8].小型猪外周血单个核细胞产生IFN-γ频率年龄依赖性初探[J]. 魏静,李晋涛,张蓓,王靖雪,唐艳,何海洋,费蕾,吴玉章.  中国比较医学杂志.2006(09)
  • [9].民猪IFN-γ基因的克隆及序列分析[J]. 王丽梅,常维毅,李荣权.  黑龙江畜牧兽医.2013(13)
  • [10].翁苋颗粒对鸡白痢IL-2和IFN-γ的影响[J]. 魏薇,莫孔源,刘娟,陈晓.  中国兽医杂志.2017(05)
  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自西北农业学报的谢开会,王伟,杨姣姣,闫尊强,杨巧丽,滚双宝,发表于刊物西北农业学报2019年10期论文,是一篇关于合作猪论文,基因编码区论文,克隆论文,生物信息学分析论文,西北农业学报2019年10期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自西北农业学报2019年10期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

    标签:;  ;  ;  ;  ;  

    谢开会:合作猪IFN-β基因编码区克隆及生物信息学分析论文
    下载Doc文档

    猜你喜欢