本文主要研究内容
作者林明德,陈刚,马骞,王忠良,张健东,谢瑞涛,汤保贵,黄建盛,周晖,施钢,潘传豪,邓文鑫（2019）在《杂交石斑鱼和母本褐点石斑鱼转录组测序及差异表达基因分析》一文中研究指出：【目的】筛选褐点石斑鱼(Epinephelus fuscoguttatus)及其杂交子一代(E. fuscoguttatus♀×E. polyphekadion♂,F1)的差异表达基因,探讨褐点石斑鱼及F1代之间的生长差异性。【方法】采用Illumina HiSeq 2000测序平台对同龄的褐点石斑鱼及其杂交F1的脑、肝脏和肌肉组织进行转录组测序,通过edgeR软件包筛选差异表达基因,并对差异表达基因进行GO(Gene Ontology)功能注释和KOG注释,最后通过实时荧光定量PCR验证转录组数据。【结果】测序的原始数据经过质量控制和组装共得到54 610条unigenes。组装的unigenes共有28 832条unigenes得到注释,共获得20234条差异表达基因,其中有10218条上调,10016条下调。GO功能注释显示共34061条unigenes聚类到涉及生物过程、分子功能和细胞组分的53个功能类别,其中被较多基因聚类到的功能类别为细胞过程、结合、单一生物过程、代谢过程和催化活性等。KOG注释发现,42 753 unigenes被注释到25个功能类别中,其中较多涉及信号转导机制、基因功能预测、翻译后修饰,蛋白质周转和分子伴侣、转录等。进一步筛选到一批和生长相关的差异表达基因,如GH、GHRH、PRL、SLP、AVTp等,这些差异表达基因在F1中的表达水平均高于其亲本褐点石斑鱼,与杂交F1相较于褐点石斑鱼生长快速的性状相符。【结论】研究完成了对褐点石斑鱼及其杂交F1的转录组测序、组装,获得了测序数据在不同数据库的功能注释信息,同时筛选了一批生长相关差异表达基因,这些基因在F1中的表达水平均高于其亲本褐点石斑鱼,与现实生长性状相符。
Abstract
【mu de 】shai shua he dian dan ban yu (Epinephelus fuscoguttatus)ji ji za jiao zi yi dai (E. fuscoguttatus♀×E. polyphekadion♂,F1)de cha yi biao da ji yin ,tan tao he dian dan ban yu ji F1dai zhi jian de sheng chang cha yi xing 。【fang fa 】cai yong Illumina HiSeq 2000ce xu ping tai dui tong ling de he dian dan ban yu ji ji za jiao F1de nao 、gan zang he ji rou zu zhi jin hang zhuai lu zu ce xu ,tong guo edgeRruan jian bao shai shua cha yi biao da ji yin ,bing dui cha yi biao da ji yin jin hang GO(Gene Ontology)gong neng zhu shi he KOGzhu shi ,zui hou tong guo shi shi ying guang ding liang PCRyan zheng zhuai lu zu shu ju 。【jie guo 】ce xu de yuan shi shu ju jing guo zhi liang kong zhi he zu zhuang gong de dao 54 610tiao unigenes。zu zhuang de unigenesgong you 28 832tiao unigenesde dao zhu shi ,gong huo de 20234tiao cha yi biao da ji yin ,ji zhong you 10218tiao shang diao ,10016tiao xia diao 。GOgong neng zhu shi xian shi gong 34061tiao unigenesju lei dao she ji sheng wu guo cheng 、fen zi gong neng he xi bao zu fen de 53ge gong neng lei bie ,ji zhong bei jiao duo ji yin ju lei dao de gong neng lei bie wei xi bao guo cheng 、jie ge 、chan yi sheng wu guo cheng 、dai xie guo cheng he cui hua huo xing deng 。KOGzhu shi fa xian ,42 753 unigenesbei zhu shi dao 25ge gong neng lei bie zhong ,ji zhong jiao duo she ji xin hao zhuai dao ji zhi 、ji yin gong neng yu ce 、fan yi hou xiu shi ,dan bai zhi zhou zhuai he fen zi ban lv 、zhuai lu deng 。jin yi bu shai shua dao yi pi he sheng chang xiang guan de cha yi biao da ji yin ,ru GH、GHRH、PRL、SLP、AVTpdeng ,zhe xie cha yi biao da ji yin zai F1zhong de biao da shui ping jun gao yu ji qin ben he dian dan ban yu ,yu za jiao F1xiang jiao yu he dian dan ban yu sheng chang kuai su de xing zhuang xiang fu 。【jie lun 】yan jiu wan cheng le dui he dian dan ban yu ji ji za jiao F1de zhuai lu zu ce xu 、zu zhuang ,huo de le ce xu shu ju zai bu tong shu ju ku de gong neng zhu shi xin xi ,tong shi shai shua le yi pi sheng chang xiang guan cha yi biao da ji yin ,zhe xie ji yin zai F1zhong de biao da shui ping jun gao yu ji qin ben he dian dan ban yu ,yu xian shi sheng chang xing zhuang xiang fu 。
论文参考文献
论文详细介绍
论文作者分别是来自广东海洋大学学报的林明德,陈刚,马骞,王忠良,张健东,谢瑞涛,汤保贵,黄建盛,周晖,施钢,潘传豪,邓文鑫，发表于刊物广东海洋大学学报2019年03期论文，是一篇关于褐点石斑鱼论文,杂交石斑鱼论文,转录组测序论文,比较分析论文,生长相关基因论文,广东海洋大学学报2019年03期论文的文章。本文可供学术参考使用，各位学者可以免费参考阅读下载，文章观点不代表本站观点，资料来自广东海洋大学学报2019年03期论文网站，若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权，请联系我们删除。
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