本文主要研究内容
作者袁婷(2019)在《水稻黑条矮缩病毒(RBSDV)的多层次翻译调控》一文中研究指出:水稻黑条矮缩病毒(Rice black-streaked dwarf virus,RBSDV)是呼肠孤病毒科(Reoviridae)斐济病毒属(Fijivirus)第二组成员,引起水稻黑条矮缩病、玉米粗缩病等。RBSDV基因组包括十条双链RNA(dsRNA),5’端具有帽子结构(m7GPPPN),3’末端没有poly(A)尾结构,共编码13种蛋白;其中S5、S7、S9各自编码两个蛋白,属于双顺反子RNA,其余链是单顺反子RNA,各编码一个蛋白。RBSDV基因组的10条双链RNA的5’和3’末端各自存在十分保守的序列,且紧邻5’和3’端的序列存在潜在的碱基互补配对。本文研究RBSDV单顺反子RNA的非编码区对翻译的调控作用及机制;RBSDV双顺反子RNA的蛋白表达特性以及调控第二个蛋白表达的顺式作用元件。利用萤火虫荧光素酶(Fluc)报告基因载体和定点突变分析,探究RBSDV单顺反子RNA S3和S10的的非编码区对翻译的调控作用及机制。结果表明:(1)S3和S10的5’UTR在有无帽子时均可以正向调控报告基因Fluc的翻译,表现核糖体内部进入位点(IRES)活性;且5’UTR的基因组间保守序列及邻近序列均参与IRES活性;(2)对应的3’UTR则抑制5’UTR对翻译的正调控效应,其分子基础是5’UTR和3’UTR之间的RNA-RNA互作;且该RNA-RNA互作也抑制帽子依赖型翻译的效率。利用35S标记的体外翻译体系同步分析RBSDV基因组双顺反子S7与S9分别编码的两个蛋白的表达情况及比例;然后利用萤火虫荧光素酶(Fluc)报告基因载体和定点突变分析初步定位第二个蛋白翻译调控的顺式作用元件。结果表明:(1)S7和S9各自编码的2个蛋白都可以从基因组表达,暗示这2个双顺反子RNA的第二个蛋白的表达模式是内部起始。S7编码的第二个蛋白P7b的表达量约为第一个蛋白P7a的4.7%;而S9编码的第二个蛋白P9b的表达量约为第一个蛋白P9a的18.8%;(2)S9编码的P9a与P9b的基因间隔区(IGR)中存在2个小的ORF;由于这2个小ORF消失时P9b的蛋白表达量提高约73.4%,表明2个小ORF的存在降低了P9b的蛋白表达效率;(3)S7和S9的IGR具备弱IRES活性;且相应的3’UTR可以协同提高IGR的IRES活性。综合两部分的研究结果,发现3’UTR在单顺反子RNA的翻译调控中起抑制作用,而在双顺反子的第二个蛋白的翻译调控中起促进作用。暗示3’UTR可能是双顺反子RNA调控2个蛋白表达比例的关键区段。
Abstract
shui dao hei tiao ai su bing du (Rice black-streaked dwarf virus,RBSDV)shi hu chang gu bing du ke (Reoviridae)fei ji bing du shu (Fijivirus)di er zu cheng yuan ,yin qi shui dao hei tiao ai su bing 、yu mi cu su bing deng 。RBSDVji yin zu bao gua shi tiao shuang lian RNA(dsRNA),5’duan ju you mao zi jie gou (m7GPPPN),3’mo duan mei you poly(A)wei jie gou ,gong bian ma 13chong dan bai ;ji zhong S5、S7、S9ge zi bian ma liang ge dan bai ,shu yu shuang shun fan zi RNA,ji yu lian shi chan shun fan zi RNA,ge bian ma yi ge dan bai 。RBSDVji yin zu de 10tiao shuang lian RNAde 5’he 3’mo duan ge zi cun zai shi fen bao shou de xu lie ,ju jin lin 5’he 3’duan de xu lie cun zai qian zai de jian ji hu bu pei dui 。ben wen yan jiu RBSDVchan shun fan zi RNAde fei bian ma ou dui fan yi de diao kong zuo yong ji ji zhi ;RBSDVshuang shun fan zi RNAde dan bai biao da te xing yi ji diao kong di er ge dan bai biao da de shun shi zuo yong yuan jian 。li yong ying huo chong ying guang su mei (Fluc)bao gao ji yin zai ti he ding dian tu bian fen xi ,tan jiu RBSDVchan shun fan zi RNA S3he S10de de fei bian ma ou dui fan yi de diao kong zuo yong ji ji zhi 。jie guo biao ming :(1)S3he S10de 5’UTRzai you mo mao zi shi jun ke yi zheng xiang diao kong bao gao ji yin Flucde fan yi ,biao xian he tang ti nei bu jin ru wei dian (IRES)huo xing ;ju 5’UTRde ji yin zu jian bao shou xu lie ji lin jin xu lie jun can yu IREShuo xing ;(2)dui ying de 3’UTRze yi zhi 5’UTRdui fan yi de zheng diao kong xiao ying ,ji fen zi ji chu shi 5’UTRhe 3’UTRzhi jian de RNA-RNAhu zuo ;ju gai RNA-RNAhu zuo ye yi zhi mao zi yi lai xing fan yi de xiao lv 。li yong 35Sbiao ji de ti wai fan yi ti ji tong bu fen xi RBSDVji yin zu shuang shun fan zi S7yu S9fen bie bian ma de liang ge dan bai de biao da qing kuang ji bi li ;ran hou li yong ying huo chong ying guang su mei (Fluc)bao gao ji yin zai ti he ding dian tu bian fen xi chu bu ding wei di er ge dan bai fan yi diao kong de shun shi zuo yong yuan jian 。jie guo biao ming :(1)S7he S9ge zi bian ma de 2ge dan bai dou ke yi cong ji yin zu biao da ,an shi zhe 2ge shuang shun fan zi RNAde di er ge dan bai de biao da mo shi shi nei bu qi shi 。S7bian ma de di er ge dan bai P7bde biao da liang yao wei di yi ge dan bai P7ade 4.7%;er S9bian ma de di er ge dan bai P9bde biao da liang yao wei di yi ge dan bai P9ade 18.8%;(2)S9bian ma de P9ayu P9bde ji yin jian ge ou (IGR)zhong cun zai 2ge xiao de ORF;you yu zhe 2ge xiao ORFxiao shi shi P9bde dan bai biao da liang di gao yao 73.4%,biao ming 2ge xiao ORFde cun zai jiang di le P9bde dan bai biao da xiao lv ;(3)S7he S9de IGRju bei ruo IREShuo xing ;ju xiang ying de 3’UTRke yi xie tong di gao IGRde IREShuo xing 。zeng ge liang bu fen de yan jiu jie guo ,fa xian 3’UTRzai chan shun fan zi RNAde fan yi diao kong zhong qi yi zhi zuo yong ,er zai shuang shun fan zi de di er ge dan bai de fan yi diao kong zhong qi cu jin zuo yong 。an shi 3’UTRke neng shi shuang shun fan zi RNAdiao kong 2ge dan bai biao da bi li de guan jian ou duan 。
论文参考文献
论文详细介绍
论文作者分别是来自山东农业大学的袁婷,发表于刊物山东农业大学2019-07-08论文,是一篇关于水稻黑条矮缩病毒论文,帽子论文,顺反子论文,标记论文,翻译调控论文,山东农业大学2019-07-08论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自山东农业大学2019-07-08论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。
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