许芸梅:马铃薯红色薯肉调控基因的精细定位与候选基因分析论文

许芸梅:马铃薯红色薯肉调控基因的精细定位与候选基因分析论文

本文主要研究内容

作者许芸梅,李玉梅,贾玉鑫,张春芝,李灿辉,黄三文,祝光涛(2019)在《马铃薯红色薯肉调控基因的精细定位与候选基因分析》一文中研究指出:【目的】薯肉颜色是马铃薯重要的农艺性状,它直接影响马铃薯的营养和商品价值,一直是马铃薯遗传研究和育种改良的重要目标。本研究通过对二倍体红色薯肉分离群体的混池分析、基因精细定位和候选基因表达分析,确定调控红色薯肉的候选基因,为下一步基因功能、遗传调控研究及彩色马铃薯的分子育种奠定基础。【方法】本研究通过向二倍体红色薯肉亲本导入自交不亲和抑制基因Sli获得BC1S1群体,从300个单株中挑选18株红色薯肉和21株黄色薯肉个体提取基因组DNA,分别测序进行混池分析。通过集团分离分析法(bulked segregation analysis,BSA)对基因进行初步定位;在定位区间内开发分子标记,对796份BC1S1植株进行基因型分析,筛选交换单株,并结合表型对基因进行精细定位;借助参考基因组注释信息和qRT-PCR表达量分析确定候选基因。【结果】本研究通过构建薯肉颜色分离的二倍体BC1S1群体,利用BSA-seq分析把调控薯肉花青素合成的主效位点定位在第10号染色体48.70—52.20 Mb。最终,利用分子标记将该基因定位于51.47—51.85Mb的377 kb区间内。基于参考基因组注释信息,此区间包括5个基因,其中2个基因注释为MYB类转录因子,结合表达量数据推测这2个基因为候选基因,编号分别为PGSC0003DMG400013966、PGSC0003DMG400013965。【结论】本研究将调控马铃薯薯肉花青素积累的一个主效位点定位于第10号染色体51.47—51.85 Mb之间,推测PGSC0003DMG400013966和PGSC0003DMG400013965为候选基因。

Abstract

【mu de 】shu rou yan se shi ma ling shu chong yao de nong yi xing zhuang ,ta zhi jie ying xiang ma ling shu de ying yang he shang pin jia zhi ,yi zhi shi ma ling shu wei chuan yan jiu he yo chong gai liang de chong yao mu biao 。ben yan jiu tong guo dui er bei ti gong se shu rou fen li qun ti de hun chi fen xi 、ji yin jing xi ding wei he hou shua ji yin biao da fen xi ,que ding diao kong gong se shu rou de hou shua ji yin ,wei xia yi bu ji yin gong neng 、wei chuan diao kong yan jiu ji cai se ma ling shu de fen zi yo chong dian ding ji chu 。【fang fa 】ben yan jiu tong guo xiang er bei ti gong se shu rou qin ben dao ru zi jiao bu qin he yi zhi ji yin Slihuo de BC1S1qun ti ,cong 300ge chan zhu zhong tiao shua 18zhu gong se shu rou he 21zhu huang se shu rou ge ti di qu ji yin zu DNA,fen bie ce xu jin hang hun chi fen xi 。tong guo ji tuan fen li fen xi fa (bulked segregation analysis,BSA)dui ji yin jin hang chu bu ding wei ;zai ding wei ou jian nei kai fa fen zi biao ji ,dui 796fen BC1S1zhi zhu jin hang ji yin xing fen xi ,shai shua jiao huan chan zhu ,bing jie ge biao xing dui ji yin jin hang jing xi ding wei ;jie zhu can kao ji yin zu zhu shi xin xi he qRT-PCRbiao da liang fen xi que ding hou shua ji yin 。【jie guo 】ben yan jiu tong guo gou jian shu rou yan se fen li de er bei ti BC1S1qun ti ,li yong BSA-seqfen xi ba diao kong shu rou hua qing su ge cheng de zhu xiao wei dian ding wei zai di 10hao ran se ti 48.70—52.20 Mb。zui zhong ,li yong fen zi biao ji jiang gai ji yin ding wei yu 51.47—51.85Mbde 377 kbou jian nei 。ji yu can kao ji yin zu zhu shi xin xi ,ci ou jian bao gua 5ge ji yin ,ji zhong 2ge ji yin zhu shi wei MYBlei zhuai lu yin zi ,jie ge biao da liang shu ju tui ce zhe 2ge ji yin wei hou shua ji yin ,bian hao fen bie wei PGSC0003DMG400013966、PGSC0003DMG400013965。【jie lun 】ben yan jiu jiang diao kong ma ling shu shu rou hua qing su ji lei de yi ge zhu xiao wei dian ding wei yu di 10hao ran se ti 51.47—51.85 Mbzhi jian ,tui ce PGSC0003DMG400013966he PGSC0003DMG400013965wei hou shua ji yin 。

论文参考文献

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  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自中国农业科学的许芸梅,李玉梅,贾玉鑫,张春芝,李灿辉,黄三文,祝光涛,发表于刊物中国农业科学2019年15期论文,是一篇关于红色薯肉论文,花青素代谢论文,精细定位论文,候选基因论文,中国农业科学2019年15期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自中国农业科学2019年15期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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