导读:本文包含了异构酶基因论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献,主要关键词:乳酸菌,氟喹诺酮类药物,耐药性,gyrA
异构酶基因论文文献综述
石琳琳,宋晓敏,李少英,李培锋[1](2019)在《乳酸菌Ⅱ型拓扑异构酶基因突变与耐氟喹诺酮类药物的相关性》一文中研究指出[目的]自氟喹诺酮类药物上市并投入使用以来,在兽医临床上和畜牧养殖业上的不恰当使用甚至是滥用导致了细菌对氟喹诺酮类药物的耐药率逐年上升,耐药细菌的种类也逐渐增多。除临床常见致病菌之外,一些常被认为有益生作用的乳酸菌也对氟喹诺酮类药物存在抗性。本文旨在研究乳酸菌Ⅱ型拓扑异构酶基因突变与耐氟喹诺酮类药物耐药性的关系,以了解乳酸菌对氟喹诺酮类药物的耐药机制。[方法]提取标准菌株和耐药菌株的基因组DNA,过其的Ⅱ型拓扑异构酶gyrA、gyrB和parC基因进行PCR扩增、测序,测序结果将碱基序列翻译成氨基酸用DNASTAR—SeqMan软件进行拼接后,在DNAStar—MegAling软件中进行序列比对,分析基因突变与耐药的相关性。[结果]耐药菌株的gyrA和parC基因与标准菌株相比分别有83个和127个位点发生氨基酸突变,但在其QRDR内并无突变;gyrB基因中引入了终止密码子,出现无义突变。[结论]gyrA和parC基因中这些氨基酸的改变可能与菌株耐氟喹诺酮类药物有关,gyrB基因中出现无义突变可能与其耐药性相关,其中哪些位点与乳酸菌对氟喹诺酮类药物的耐药性的产生起决定作用,还有待进一步研究。将乳酸菌对氟喹诺酮类药物产生耐药性的各类机制整合分析,以期阐明其机制,并在此基础上研究其耐药性是否转移甚至消除其耐药性,为乳酸菌的安全应用提供保障。(本文来源于《中国畜牧兽医学会兽医药理毒理学分会第十五次学术讨论会论文集》期刊2019-10-13)
程龙飞,刘荣昌,陈红梅,万春和,傅光华[2](2019)在《禽源多杀性巴氏杆菌拓扑异构酶基因突变与耐恩诺沙星的相关性》一文中研究指出为探讨gyrA和parC基因的突变与禽源多杀性巴氏杆菌耐氟喹诺酮类药的相关性,采用微量稀释法测定84株临床分离菌对恩诺沙星的敏感性,PCR扩增其gyrA和parC基因并测序,分析基因编码的氨基酸序列与耐药表型的关系发现,GyrA发生单点突变(S94→I或S94→R)时,细菌对恩诺沙星的耐受性明显提高,发生双点突变(S94→I和D98→N),细菌则必然获得对恩诺沙星的耐药性。ParC发生单点突变(S84→L)时,细菌对恩诺沙星的耐受性也提高。ParC的变异能与GyrA的变异起协同作用,共同提高细菌对恩诺沙星的耐受性。这些结果为今后以gyrA和parC基因为靶位,建立快速鉴定禽源多杀性巴氏杆菌对氟喹诺酮类药耐药性的方法提供理论依据。(本文来源于《中国家禽》期刊2019年17期)
杨千叶,黄可佳,张阳,李锐[3](2019)在《卷叶贝母异戊烯基焦磷酸异构酶基因(IDI)的克隆与分析》一文中研究指出旨在克隆卷叶贝母(Fritillaria cirrhosa D. Don)生物碱合成过程中的关键酶——异戊二烯焦磷酸异构酶(isopentenyl diphosphate isomerase,简称IDI),并运用生物信息学和荧光定量方法对其功能进行分析,为卷叶贝母甾类生物碱合成途径及其调控机制的研究奠定基础。以卷叶贝母再生鳞茎为试验材料,基于转录组测序结果,通过PCR技术克隆川贝母IDI基因(FcIDI)的开放阅读框(open reading frame,简称ORF)序列,运用生物信息学方法对该基因进行分析,预测其编码蛋白的结构与功能,并通过荧光定量PCR(qRT-PCR)检测FcIDI基因在卷叶贝母根、茎、叶、野生鳞茎、再生鳞茎及愈伤组织中的表达情况。结果表明,FcIDI的ORF片段为885 bp,编码294个氨基酸,与大豆(Glycine max)、杜仲(Eucommia ulmoides)、番薯(Ipomoea)、广藿香(Pogostemon cablin)等植物IDI蛋白的相似性达85%以上;FcIDI蛋白的二级、叁级结构预测结果表明,α-螺旋及不规则卷曲是其整体蛋白质结构中的主要组成结构元件;qRT-PCR试验结果表明,FcIDI在野生鳞茎中的表达量远高于根、茎、叶等其他植物组织,再生鳞茎的IDI表达量高于野生鳞茎,在愈伤组织中的表达量最高。生物信息学分析和不同植物组织部位及组培诱导物的IDI相对表达量差异结果显示,FcIDI是1个生物碱合成途径中的关键蛋白质,并受激素组合诱导表达,研究结果为提高卷叶贝母中的生物碱含量及深入研究植物IDI的功能奠定了理论基础。(本文来源于《江苏农业科学》期刊2019年16期)
王辉,叶晓霞,朱宇林,项文化,周兴文[4](2019)在《金花茶异戊烯焦磷酸异构酶基因全长cDNA的克隆与生物信息学分析》一文中研究指出为深入研究金花茶花瓣类胡萝卜素合成的分子机理,在成功提取金花茶花瓣总RNA的基础上,利用同源克隆和RACE技术克隆得到了异戊烯焦磷酸异构酶基因的cDNA序列全长,命名为CnIPI。碱基序列分析表明:CnIPI基因全长916 bp,包含有一个长度为747 bp编码248个氨基酸的开发阅读框。生物信息学分析表明:该基因编码的CnIPI蛋白质分子量为27.97 kD,为稳定亲水性蛋白,无信号肽;CnIPI蛋白的二级结构以无规则卷曲为主,β-折迭所占比例最少;CnIPI蛋白含有一个典型的异戊烯焦磷酸异构酶结构域。氨基酸序列同源性分析结果表明:CnIPI蛋白与茶、月季、杜鹃等植物IPI蛋白的同源性高于86%。CnIPI基因的克隆使全面理解金花茶花瓣类胡萝卜素合成的分子途径取得了新的突破,为进一步深入研究CnIPI基因的功能及金花茶花瓣类胡萝卜素合成的分子机理奠定了良好的理论基础。(本文来源于《中南林业科技大学学报》期刊2019年09期)
蔡雯婷,孙娟,董文华,刘晓言,董清华[5](2019)在《草莓果实查尔酮异构酶基因克隆及表达分析》一文中研究指出【目的】探明查尔酮异构酶基因对草莓果实着色的影响。【方法】从八倍体草莓(Fragaria×ananassa)转录组数据筛选比对出差异表达基因查尔酮异构酶(chalcone isomerase)基因FaCHI,利用RTPCR技术从‘红颜’草莓克隆出CHI基因,测序得到其编码序列并进行生物信息学分析,实时荧光定量qRTPCR分析在草莓着色过程中该基因的表达水平。【结果】FaCHI基因开放阅读框714bp,编码氨基酸237个。生物信息学分析表明:分子量约为25.4kDa,理论等电点(pI)为5.31,该基因具有一个查尔酮合酶超家族保守序列,进化树分析表明‘红颜’草莓FaCHI与八倍体草莓(登录号:Q4AE12.1)亲缘关系最近。qRT-PCR结果显示:FaCHI基因在草莓果实大绿期(花后14d)到白果期(花后21d)表达量下调,随着果实颜色的加深表达量逐渐升高,全红期(花后28d)表达量最高。【结论】FaCHI基因在草莓果实着色过程中发挥重要作用。(本文来源于《北京农学院学报》期刊2019年04期)
申建梅,汪超,钟宏新,胡黎明[6](2019)在《斜纹夜蛾蛋白二硫键异构酶基因的发育表达分析》一文中研究指出【目的】分析斜纹夜蛾蛋白二硫键异构酶基因(SlitPDI)的序列特征和发育表达模式,为解析SlitPDI蛋白在斜纹夜蛾生长发育过程中的生理功能提供依据。【方法】采用DNASTAR对SlitPDI基因序列特征和进化关系进行分析,并以实时荧光定量PCR研究SlitPDI基因在斜纹夜蛾2龄、4龄、6龄幼虫及蛹和新羽化雌、雄成虫共6个不同发育时期的相对表达量。【结果】SlitPDI基因编码494个氨基酸,预测该蛋白分子量约55.3 kD,理论等电点(pI)为4.52。氨基酸序列分析结果表明,SlitPDI蛋白序列具有PDI家族的典型特征:在序列的N端及C端均具有二硫键/巯基氧化还原位点-CGHC-。系统发育进化树分析结果表明,SlitPDI蛋白与意大利蜜蜂(Apis mellifera)的PDI蛋白序列一致性最低,为50.2%;与家蚕(Bombyx mori)的PDI蛋白序列一致性最高,为83.4%。斜纹夜蛾不同发育时期的实时荧光定量PCR分析结果表明,SlitPDI基因在4龄幼虫中的表达量最高,其表达量是基准含量2龄幼虫的1.27倍;在刚羽化雌、雄成虫的表达量也较高,分别为基准含量2龄幼虫的1.03和1.12倍。【结论】SlitPDI蛋白属于I类PDI家族蛋白,SlitPDI基因在斜纹夜蛾4龄幼虫和新羽化成虫中的表达量相对较高。(本文来源于《南方农业学报》期刊2019年05期)
时丽洁,蒋枞璁,王方梅,杨平,冯宗云[7](2019)在《大麦蛋白质二硫键异构酶基因家族的鉴定与表达分析》一文中研究指出蛋白质二硫键异构酶(protein disulfide isomerases,PDIs)是定位于真核生物内质网中的一类蛋白,具有催化蛋白质二硫键氧化还原反应与协助蛋白质发生构型变化、类似分子伴侣的功能,参与生长发育、生物或非生物胁迫应答等方面的调控。真核生物中PDI基因家族的分子鉴定已有报道,但是对大麦PDI基因家族的鉴定分析鲜有报道。本研究利用生物信息学分析手段鉴定了10个大麦PDI-Like基因(HvPDILs),并分析了相应编码蛋白的结构特征。与其他物种PDILs的系统发育分析发现,10个大麦PDILs分处在8个不同的系统分支,与小麦PDILs高度同源。对公共数据库中的组织和时空表达数据分析发现, HvPDILs基因均表达,且具组织和时空表达特异性。对接种大麦温性花叶病毒(BaMMV)之后的叶片样品进行基因表达水平分析,发现其中5个HvPDILs基因出现显着的表达差异,说明其参与病毒感染过程,但参与方式及作用机制还有待后续研究。(本文来源于《作物学报》期刊2019年09期)
张声祥,施圆圆,王晨凯,赵德蕊,杨青山[8](2019)在《异叶天南星查尔酮合成酶和异构酶基因的克隆及蛋白的结构性质分析》一文中研究指出查尔酮合成酶(CHS)和查尔酮异构酶(CHI)是黄酮类物质生物合成途径中的关键酶,该研究从中药异叶天南星(Arisaema heterophyllum Blume,Ah)转录组数据库中筛选出查尔酮合成酶基因(Ah CHS)和查尔酮异构酶基因(Ah CHI),利用RT-PCR技术克隆了它们的开放阅读框(ORF)部分,并对其编码蛋白Ah CHS和Ah CHI的理化性质、表达及结构特点进行分析。Ah CHS的ORF长度为1 176 bp,编码392个氨基酸的蛋白质;而Ah CHI的ORF长度为630 bp,编码蛋白含209个氨基酸。Ah CHS作为对称同二聚体,N端螺旋互相交换,每个单体由2个亚结构域组成,位于2个亚结构域之间交界处的4个保守的氨基酸残基构成了酶的活性中心; Ah CHI的叁级结构采用了开放的β-叁明治褶皱,1个大的β折叠片层(β4~β11)和1个α螺旋片层(α1~α7)组成其核心结构,其中β4,β5,α4和α6在不同物种间高度保守,部分疏水氨基酸形成了酶的活性位点。系统进化树分析发现Ah CHS与火鹤花CHS亲缘关系最近;而Ah CHI与紫牡丹CHI亲缘关系最近。表达分析表明编码Ah CHS的基因在根和块茎中的表达量明显比叶多,而编码Ah CHI的基因在块茎部位的表达量最高。该研究为Ah CHS和Ah CHI功能的进一步研究及植物黄酮类化合物生物合成途径的解析提供了基础。(本文来源于《中国中药杂志》期刊2019年09期)
朱星星,杨培周,杜明睿,吴芸,姜绍通[9](2019)在《根癌农杆菌D-阿洛酮糖-3-差向异构酶基因克隆、结构预测及原核表达》一文中研究指出D-阿洛酮糖-3-差向异构酶能够催化D-果糖转化为D-阿洛酮糖。为实现D-阿洛酮糖-3-差向异构酶的异源表达,设计引物,克隆并分离其序列,通过生物信息学软件分析D-阿洛酮糖-3-差向异构酶DNA和蛋白质的结构特点。结果表明,该基因开放阅读框870 bp,编码289个氨基酸;蛋白质二级结构中α-螺旋占38. 41%,β-折迭占47. 06%,无规则卷曲占14. 53%;该蛋白为亲水性蛋白,不含信号肽,无跨膜区,定位于细胞膜;构建原核表达载体并导入E. coli BL21宿主中,表达的D-阿洛酮糖-3-差向异构酶分子质量约为33 k Da,1 mmol/L IPTG诱导E. coli BL21重组菌28 h后,目的蛋白表达量和酶活分别为0. 32 g/L和3. 8 U/m L。根癌农杆菌D-阿洛酮糖-3-差向异构酶基因能够在大肠杆菌中实现表达。(本文来源于《食品科学技术学报》期刊2019年03期)
顾冰倩,龚奕,何颖芝,张玲莉,何文迪[10](2018)在《金黄色葡萄球菌N-乙酰甘露糖胺-6-磷酸2-异构酶基因的克隆与表达》一文中研究指出目的对金黄色葡萄球菌N-乙酰甘露糖胺-6-磷酸2-异构酶基因(APE)进行克隆、鉴定与表达,为新型抗菌药物的设计提供参考依据。方法采用聚合酶链反应(PCR)扩增APE基因,将扩增产物酶切后与原核表达载体pET-32a(+)连接,构建表达APE的重组质粒,将重组质粒先转化大肠杆菌TG1内并提取质粒,经PCR、双酶切鉴定后再转化表达宿主大肠杆菌BL21(DE3),对转化菌株进行诱导后进行十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳。结果构建了表达载体pET-32a(+)-APE,在37℃经异丙基-β-D硫代半乳糖苷诱导时获得表达,表达的蛋白质相对分子质量为45.2×10~3。结论 APE基因成功克隆到表达质粒内并获得了表达。(本文来源于《国际检验医学杂志》期刊2018年23期)
异构酶基因论文开题报告
(1)论文研究背景及目的
此处内容要求:
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例:
为探讨gyrA和parC基因的突变与禽源多杀性巴氏杆菌耐氟喹诺酮类药的相关性,采用微量稀释法测定84株临床分离菌对恩诺沙星的敏感性,PCR扩增其gyrA和parC基因并测序,分析基因编码的氨基酸序列与耐药表型的关系发现,GyrA发生单点突变(S94→I或S94→R)时,细菌对恩诺沙星的耐受性明显提高,发生双点突变(S94→I和D98→N),细菌则必然获得对恩诺沙星的耐药性。ParC发生单点突变(S84→L)时,细菌对恩诺沙星的耐受性也提高。ParC的变异能与GyrA的变异起协同作用,共同提高细菌对恩诺沙星的耐受性。这些结果为今后以gyrA和parC基因为靶位,建立快速鉴定禽源多杀性巴氏杆菌对氟喹诺酮类药耐药性的方法提供理论依据。
(2)本文研究方法
调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
异构酶基因论文参考文献
[1].石琳琳,宋晓敏,李少英,李培锋.乳酸菌Ⅱ型拓扑异构酶基因突变与耐氟喹诺酮类药物的相关性[C].中国畜牧兽医学会兽医药理毒理学分会第十五次学术讨论会论文集.2019
[2].程龙飞,刘荣昌,陈红梅,万春和,傅光华.禽源多杀性巴氏杆菌拓扑异构酶基因突变与耐恩诺沙星的相关性[J].中国家禽.2019
[3].杨千叶,黄可佳,张阳,李锐.卷叶贝母异戊烯基焦磷酸异构酶基因(IDI)的克隆与分析[J].江苏农业科学.2019
[4].王辉,叶晓霞,朱宇林,项文化,周兴文.金花茶异戊烯焦磷酸异构酶基因全长cDNA的克隆与生物信息学分析[J].中南林业科技大学学报.2019
[5].蔡雯婷,孙娟,董文华,刘晓言,董清华.草莓果实查尔酮异构酶基因克隆及表达分析[J].北京农学院学报.2019
[6].申建梅,汪超,钟宏新,胡黎明.斜纹夜蛾蛋白二硫键异构酶基因的发育表达分析[J].南方农业学报.2019
[7].时丽洁,蒋枞璁,王方梅,杨平,冯宗云.大麦蛋白质二硫键异构酶基因家族的鉴定与表达分析[J].作物学报.2019
[8].张声祥,施圆圆,王晨凯,赵德蕊,杨青山.异叶天南星查尔酮合成酶和异构酶基因的克隆及蛋白的结构性质分析[J].中国中药杂志.2019
[9].朱星星,杨培周,杜明睿,吴芸,姜绍通.根癌农杆菌D-阿洛酮糖-3-差向异构酶基因克隆、结构预测及原核表达[J].食品科学技术学报.2019
[10].顾冰倩,龚奕,何颖芝,张玲莉,何文迪.金黄色葡萄球菌N-乙酰甘露糖胺-6-磷酸2-异构酶基因的克隆与表达[J].国际检验医学杂志.2018